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求助QE和Q-TOF探究非靶向代谢组学,找寻未发现物质

液质联用(LCMS)

  • 本人是一个刚刚研一的代谢组学研究的小白,实验室中也没有有经验的学长学姐,有几个问题想向各位大佬求助一下:
    1.如果想探究某一类代谢小分子物质的异构体,是使用QE更好,还是Q-TOF更好?(横向研究,并且想定量)
    2.如果想探究某一个种类中,有多少种小分子物质代谢,使用QE更好,还是Q-TOF更好?(纵向研究,并且想定量)
    3.QE和Q-TOF的不同侧重点在哪里?
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  • 歌名

    第1楼2023/04/14

    应助达人

    1.如果想探究某一类代谢小分子物质的异构体,是使用QE更好,还是Q-TOF更好?(横向研究,并且想定量)---------------------------------------两个都没差异,对弈小分子异构体研究最好的选择是waters的离子淌度
    2.如果想探究某一个种类中,有多少种小分子物质代谢,使用QE更好,还是Q-TOF更好?(纵向研究,并且想定量)-----------------------------QE更棒点,QE的数据库和同级别设备的分辨率更好,但是同类型小分子难点在于分离,否则定量不好做
    3.QE和Q-TOF的不同侧重点在哪里?----------------------------------------对于同级别设备简单点说QE分辨率更高,数据丰度更优异,QTOF相对来说优势覆盖范围更广
    但其实对于出入门的人来说这些设备基本都能满足

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  • 小高药

    第2楼2023/04/14

    好的,谢谢您,我还有几个问题想要求助您,能否给我一定建议:
    1.Q-TOF如果要自建补充数据库信息,需要提供多少信息,除了离子碎片,保留时间等信息,还需要什么精细化的信息吗?
    2.C18、Amide和T3色谱柱之间的区分点在哪里呢?(因为自身实验室中只有Amide色谱柱,想要探究的不只是极性胺类物质,还有肽类物质。)
    3.我看到的文献不止有DDA,DIA采集模式,还有SWATH模式,SWATH目前好像比较针对蛋白质和肽类物质,可以兼顾小分子物质检测吗?

    歌名(Ins_eedcdc41) 发表:1.如果想探究某一类代谢小分子物质的异构体,是使用QE更好,还是Q-TOF更好?(横向研究,并且想定量)---------------------------------------两个都没差异,对弈小分子异构体研究最好的选择是waters的离子淌度
    2.如果想探究某一个种类中,有多少种小分子物质代谢,使用QE更好,还是Q-TOF更好?(纵向研究,并且想定量)-----------------------------QE更棒点,QE的数据库和同级别设备的分辨率更好,但是同类型小分子难点在于分离,否则定量不好做
    3.QE和Q-TOF的不同侧重点在哪里?----------------------------------------对于同级别设备简单点说QE分辨率更高,数据丰度更优异,QTOF相对来说优势覆盖范围更广
    但其实对于出入门的人来说这些设备基本都能满足

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  • hujiangtao

    第3楼2023/04/14

    应助达人

    小分子代谢物的话还是QE分辨率高有优势

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  • Leuchi666

    第4楼2023/04/14

    1.异构体QE和QTOF都不是很好,可以试下3Q,MRM比较方便一点,定量也更准确一点,但是需要摸方法,楼上说的离子淌度也可以,但是好像比较贵一点
    2.3看法基本一致,比较推荐三杆

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  • 歌名

    第5楼2023/04/14

    应助达人

    1.Q-TOF如果要自建补充数据库信息,需要提供多少信息,除了离子碎片,保留时间等信息,还需要什么精细化的信息吗?---------------------------------------------------,看你的需求是怎么样的,自建数据是一个比较漫长且成本庞大的活,基于少量样本的数据库很多意义不是很大
    2.C18、Amide和T3色谱柱之间的区分点在哪里呢?(因为自身实验室中只有Amide色谱柱,想要探究的不只是极性胺类物质,还有肽类物质。)--------------------------------------------------------------------------------------C18就是最常用的反相柱,AMI的基于HIIC的强极性氨基柱,T3是比C18极性更强一点的反相柱,做肽类的话可以试下AMI,基本只要有氨基,保留都还可以
    3.我看到的文献不止有DDA,DIA采集模式,还有SWATH模式,SWATH目前好像比较针对蛋白质和肽类物质,可以兼顾小分子物质检测吗----------------------------这种就是不同的仪器对不同的采集数据模式的不同叫法而已,根据你对应的设备去了解会更好点

    小高药(Ins_b8603de6) 发表: 好的,谢谢您,我还有几个问题想要求助您,能否给我一定建议:
    1.Q-TOF如果要自建补充数据库信息,需要提供多少信息,除了离子碎片,保留时间等信息,还需要什么精细化的信息吗?
    2.C18、Amide和T3色谱柱之间的区分点在哪里呢?(因为自身实验室中只有Amide色谱柱,想要探究的不只是极性胺类物质,还有肽类物质。)
    3.我看到的文献不止有DDA,DIA采集模式,还有SWATH模式,SWATH目前好像比较针对蛋白质和肽类物质,可以兼顾小分子物质检测吗?

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  • 小高药

    第6楼2023/04/16

    好的,谢谢

    Leuchi666(Ins_0bb5bacc) 发表:1.异构体QE和QTOF都不是很好,可以试下3Q,MRM比较方便一点,定量也更准确一点,但是需要摸方法,楼上说的离子淌度也可以,但是好像比较贵一点2.3看法基本一致,比较推荐三杆

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  • Insp_2be455b9

    第7楼2023/04/16

    进来看看学习一下

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  • Insm_225995ca

    第8楼2023/04/16

    进来看看学习一下

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