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标签蛋白有哪些?如何选择标签蛋白?
Ins_bf0c01c3
2024/01/24
私聊
生命科学仪器综合讨论
蛋白质的检测在生物科学研究中占据着至关重要的地位。其中,免疫分析方法被广泛应用,包括
Western Blot
、酶联免疫吸附试验(
ELISA
)和免疫沉淀法(
IP
)等。这些方法依赖于抗原
-
抗体间的特异性反应,通过注射目标蛋白作为抗原至动物体内,产生免疫反应后分离抗体,进而进行检测。尽管应用广泛,但这种方法的缺点在于每次更换目标蛋白时都需要制备对应的抗体,操作繁琐且成本高昂。
融合标签技术的出现为蛋白质免疫分析带来了通用化和便利化。通过将特定的标签与目标蛋白融合,两者实现共同表达。通过对融合标签的检测,我们可以了解目标蛋白的表达情况。这种蛋白标签技术利用基因克隆手段,将具有特定功能的多肽、蛋白质结构域甚至完整蛋白质与目标蛋白结合,广泛应用于目标蛋白的表达、纯化、检测和跟踪等方面。经过长期研究,已经发展出一些成熟的检测标签技术。这些标签不仅简化了实验操作,降低了成本,而且为蛋白质研究提供了强有力的工具。下面就挑几个来介绍一下:
①
His
-tag
His
标签
是当前最为热门的标签蛋白之一。
His6
是指六个组氨酸残基组成的融合标签(
HHHHHH
),可插入在目的蛋白的
C
末端或
N
末端。当某一个标签的使用,一是能构成表位利于纯化和检测;二是构成独特的结构特征(结合配体)利于纯化。组氨酸残基侧链与固态的镍有强烈的吸引力,可用于固定化金属螯合层析(
IMAC
),对重组蛋白进行分离纯化。
②
Flag-tag
Flag
标签蛋白
为编码
8
个氨基酸的亲水性多肽(
DYKDDDDK
),同时载体中构建的
Kozak
序列使得带有
FLAG
的融合蛋白在真核表达系统中表达效率更高。
③
AviTag
是一个
15
个氨基酸的短肽,具有一个单生物素化赖氨酸位点,与已知天然可生物素化序列完全不同,可以加在目标蛋白的
N
端和
C
端。融合表达后,可被生物素连接酶生物素化,为了纯化重组蛋白选用低亲和性的单体抗生物素蛋白或抗生物素蛋白衍生物,除了用于蛋白质分离纯化,还用于蛋白质相互作用研究。
④
SNAP-Tag
SNAP-Tag
是从人的
O6
-甲基鸟嘌呤
-DNA
甲基转移(
O6-alkylguanine-DNA-alkyltransferase
)获得。
SNAP
所带的活性巯基位点接受了苯甲基鸟嘌呤所携带的侧链苯甲基基团,释放出了鸟嘌呤。这种新的硫醚键共价结合使
SNAP
所带的目的蛋白携带上了苯甲基基团所带的标记物。
检测:生物素或各种颜色荧光的底物(如荧光素、若丹明)可渗透进入细胞,方便快捷地进行活细胞内
SNAP-Tag
融合蛋白的标记与检测。它们也可特异性地标记大肠杆菌,酵母和哺乳动物等细胞抽提液或已经纯化的蛋白液中的
SNAP-tag
融合蛋白。
⑤
GST
(谷胱甘肽巯基转移酶)
GST
标签蛋白
本身是一个在解毒过程中起到重要作用的转移酶,它的天然大小为
26KD
。
GST
融合表达系统广泛应用于各种融合蛋白的表达,可以在大肠杆菌和酵母菌等宿主细胞中表达。结合的融合蛋白在非变性条件下用
10mM
还原型谷胱甘肽洗脱。
GST
标签可用酶学分析或免疫分析很方便的检测。标签有助于保护重组蛋白免受胞外蛋白酶的降解并提高其稳定性。
纯化:该表达系统表达的
GST
标签蛋白可直接从细菌裂解液中利用含有还原型谷胱甘肽琼脂糖凝胶亲和树脂进行纯化。
如果要去除
GST
融合部分,可用位点特异性蛋白酶切除。
⑥
GFP
GFP
(绿色萤光蛋白)是由下村修等人在水母中发现的。它在蓝色波长范围的光线激发下,会发出绿色萤光。
GFP
标签可位于蛋白质的
C
端或
N
端,该系统已广泛应用于各种细胞类型,包括细菌、酵母和哺乳动物细胞等,相应的
GFP
标签抗体也被广泛应用。
GFP
在检测蛋白表达、蛋白和细胞荧光示踪、研究蛋白质之间相互作用和构象变化中,起到了重要的作用。
该如何选择表达克隆的标签
1
、首先,需要确定融合标签的目的
蛋白纯化
:标签的普遍用途是蛋白纯化。小分子
6XHis Tag
常被用于细胞内源蛋白的纯化。
6XHis Tag
也广泛应用于大肠杆菌的蛋白纯化。可是哺乳动物细胞中因非分泌蛋白自身存在高组氨酸背景,因此极少使用
6XHis Tag
。
Western Blot
检测:若需要做
Western Blot
实验来检测细胞裂解物中蛋白的表达,你可以选择有匹配的抗体的小分子标签。
FLAG® Tag
以其分子量小以及拥有许多与之匹配的商业化的抗体等优势,成为
Western Blot
实验中常用的
Tag
。
免疫沉淀反应:
FLAG® Tag
其分子量小以及拥有大量相匹配的商业用抗体等优势成为免疫沉淀反应中最常用的
Tag.
其他常用的标签有:
HA
和
cMyc.
免疫共沉淀。首先,裂解您的样本,以释放蛋白。向试管中添加裂解液的同时,加入靶向融合标签的抗体,抗体会识别融合标签。然后抗体与蛋白
A
或
G
偶联微珠结合,后者拉出您的目标蛋白,以及与之复合的其他蛋白。
活细胞成像:荧光蛋白(
Fluorescent Proteins, FPs
)是活细胞成像常用的标记蛋白。其中最常用的是绿色荧光蛋白(
GFP
)和它的衍生物(
CFP, YFP, etc.
),以及一些红色变体,如
dTomato
和
mCherry.
2
、考虑融合标签的影响
任何一类标签处于氨基酸序列的任一位置,都具有影响目的蛋白表达或功能的可能性。最主要原因是标签可能会干扰蛋白的正确折叠,致使目的蛋白失活或形成包涵体。其次,标签可能会中断亚细胞定位信号,这种情况下,蛋白能够正确翻译和折叠,但在细胞内所处的位置是错误的。因此,您需要知道添加的标签对目的蛋白的表达是否有影响。
3
、考虑是在
N-
端还是
C-
端标记
N-
端或
C-
端标记的选择还需要根据蛋白结构、定位等特性。然而,倘若你没有确切的蛋白结构,或蛋白功能域图谱,建议分别构建
N-
端标记和
C-
端标记的表达克隆,以检测哪个更有效。
重组蛋白表达
技术现已在生物学各个具体领域应用广泛,尤其是蛋白质的大规模生产和体内功能研究都需要应用重组蛋白表达载体。
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