三代测序必备,为样品质控保驾护航

2021/03/04   下载量: 0

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应用领域 生物产业
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参考标准 GB∕T 34796-2017

三代全基因组测序对基因组 DNA 的浓度、纯度有较高要求,只有质量合格的样品才能进入测序流程,否则将导致错误的产生。特别是植物来源的样品,更易受到多糖及酚类等物质的污染,因此对于提取后纯度的把控至关重要。

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    当前,以 PacBio、Nanopore 为代表的三代测序技术已成为全基因组测序 (WGS)的主流方法。利用无需 PCR 过程的单分子测序技术,进行长读长测序,无 论是对基因组组装还是基因组变异检测,都具有很高的准确率。更可利用测序过程 中聚合酶反应的动力学变化,分析基因组学和表观遗传学数据,适合于基于多组学 研究的应用场景。

    三代全基因组测序对基因组 DNA 的浓度、纯度有较高要求,只有质量合格的 样品才能进入测序流程,否则将导致错误的产生。特别是植物来源的样品,更易受 到多糖及酚类等物质的污染,因此对于提取后纯度的把控至关重要。 本文中样品质控使用了 Implen 的    Nanophotometer®及 Qubit 2.0,分别对提 取的基因组 DNA 进行纯度及浓度检测。     A260/A280、A260/A230 方法为核酸样品质 控的通用方法,同时也是目前的国家标准方法。Nanophotometer®可以准确的测量 A260/A280 和 A260/A230,提供完整的 DNA 纯度数据,完全符合期刊对于数据完 整性的要求。

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