不同分光光度计间细菌光密度测定的差异分析

2022/02/25   下载量: 0

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应用领域 生物产业
检测样本 生物发酵
检测项目 表征
参考标准 -

背景 细菌培养基的光密度( OD) 测定是微生物学中使用的 一种常见技术。 研究人员主要依靠分光光度计来进行 这些测定, 然而实际上这个测定是基于培养基的光散 射量而不是光吸收量。 在其标准配置中, 分光光度计 并未对光散射测定进行优化, 这通常会导致仪器间所 测得吸光度上的差异。 方法 该研究调查了不同的分光光度计光学配置对在分批培 养基中生长的大肠杆菌JM109光密度测定的影响。 分光光度计检测包括了使用阵列检测的反向光学系 统、 基于单色器的传统系统以及一种配备积分球配件 ( ISA) 的单色器系统。 在每个仪器上测定OD600生 长曲线, 同时, 对McFarland进行CFU/mL计数来进一 步对每个光学系统进行鉴定。 结果 来自相同光学配置类别的分光光度计其OD数据是相当 的。 用反向光学系统测定较高OD时数据变化更大, 这是由较低杂散光所导致。 基于单色器的系统测试较 高OD时准确度较高, 主要是因为与来自反向光学系统 的多色光相比, 单色光具有更好的杂散光去除能力。 然而, 反向光学系统测定OD时却有具有良好的动态 范围。 使用ISA产生出的数据与用其它系统产生出的 数据不同, 这是因为其具有捕捉几乎所有前向散射光 的能力。 而对McFarland标准品的测定确认了这些现 象。 结论 分光光度计进行可靠的光散射测定的能力在很大程度 上取决于其光学配置; 因此, 具有不同光学配置的分 光光度计会呈现出不同的OD测定值。 理想状态下, 高 度散射样品( 如细胞培养基) 的吸光度是使用ISA进 行测定的, 目的是为了捕捉几乎所有的散射光。 培养 基生长可使用OD600测定, 然而每当改变分光光度计 时, 就应该计算和应用一个换算因数。

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引言

培养基中细菌生长迟缓期对数生长期稳定生长
期和衰亡期
各个阶段都能记录下来其中对数期被
认为是细菌分裂最快的阶段
1)。 使用分光光度计
测定细菌培养基在
600nmOD600时的光密度
而监控细菌生长一直是微生物学中的一种核心技术

使用细菌OD600的三种更为常见的应用如下:( a
在细菌表达蛋白质时找到诱导蛋白的最佳时间
b用于最小抑菌浓度MIC实验的接种体浓度的
确定和标准化
c收获和制备感受态细胞的最
佳时间的确定
研究人员继续依靠分光光度计进行这
OD测定然而光密度不是一个吸光度指标而是
细菌混悬液的一种光散射指标
将其自身作为吸光度
显示
1)。 分光光度计光学配置对光密度测定的
影响得到了很好的记录
2-4)。 具有不同光学配置
的仪器对同一细菌混悬液测定得到了不同的光密度

分光光度计光学配置上的差异对观察到的差异影响最
前向光学系统采用单色光来进行吸光度的测定
而反向光学系统则利用多色辐射进行测定光在其穿
过样品后再区分成单独波长
2)。 前向光学系统
的一些要素导致了测得
OD值上的差异:( a样品与
检测器之间的距离
,( b聚光透镜的尺寸和焦距大
小不同
c检测器的面积和灵敏度5)。 尽管
现在都知道不同的光学配置会产生不同的
OD但是
研究人员仍继续关注在不同分光光度计间发现的
OD
差异
在本研究中我们分析了多种光学配置分光光
度计测出的
OD值差异我们在分批培养基中培养大肠
杆菌
JM109并监控OD9.5小时在测定之前稀释
培养基
并将由于不同分光光度计光学元件差异造成
的不同
OD值进行换算


材料和方法
菌株E.coli JM109-endA1,recA1, gyrA96, thi, hsdR17
(rk–, mk+), relA1, supE44, (lac-proAB), [F
traD36,
proAB, laqlqZ M15] (Promega, L2001)
分光光度计所使用的Thermo Scientific 分光光度计
会在表
1中描述
生长曲线50mL过夜大肠杆菌JM109250mL带挡
板的培养瓶中培养
Luria BertaniLB培养液中
生长
16小时250rpm37℃ )。 12mL的过夜菌
液转移至一个
2L带挡板培养瓶中培养加入37预热
LB培养基600ml培养9.5小时
培养基取样所有分光光度计均使用LB培养液做空白
对照
每隔30分钟从分批培养基中取一个5mL等份试
3mL等份的未稀释培养基转移至一个10mm
色皿中
并采用表1中列出的所有仪器测定600nm
的光密度
LB培养液稀释过的等份分批培养基加入第
二个
10mm比色皿中进行此第二次OD测定是为了确
保培养基的光密度保持在分光光度计的动态
OD范围

活菌计数每隔30分钟也将一等份样品进行一系列
稀释
将稀释液涂在LB琼脂板上并在37下过夜培
对菌落进行计数来测定各时间点的细菌细胞计
CFU/mL)。
McFarland标准品通过使用1cm路径长度的比色皿
在各仪器1上对来自四个McFarland标准品 

(Remel, R20421, 1.0-4.0)进行OD600值测定


结果
从未稀释和稀释的培养基中收集的OD600数据如图3
所示将来自稀释溶液的OD600值乘以稀释因数
与未稀释的样品进行对比
两张图的分歧表明不同
的光学配置在光密度测定方面会有不同的动态范围

当对比每个分光光度计的校正OD值与细胞计数时
们发现
随着时间的推移具有相似光学系统的仪器
产生了相似的
OD曲线4)。 具有前向光学系统
但却是双光束光学几何结构的BioMate 3S与仪器组
的差异最大
McFarland数据呈现出一种与大肠杆菌
生长相似的曲线
5)。 ISA使用McFarland标准品
产生了更低的光密度
6)。


结论
计算OD测定值时确定您所用分光光度计的光密度
性能和动态范围是至关重要的
为获得有关生长曲
线的最准确信息
稀释细胞混悬液是很重要的
• OD测定在很大程度上取决于光学系统和几何学
于相同的混悬液
具有不同光学系统和配置的分光
光度计会读出不同的
OD例如在反向光学系统
Evolution Array和前向光学系统双光束BioMate 3S
之间有实质性的分歧
积分球配件ISA可捕捉几乎所有的前向散射光
从而产生了更低的光密度这是因为通常看起来被
样品吸收的散射光实际上是被
ISA配件所收集ISA
对测定高度散射溶液中分析成分的吸光度是理想之
然而在测定细胞混悬液的光密度时其是无
效的

最后我们提出了如何计算一个可用于使OD数据标
准化
以便能在不同分光光度计间进行适当比较的
换算因数
值得注意的是这个换算因数是针对一
种特定的有机体
因为微粒的尺寸和形状会影响换
算因数

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