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  • 全球新冠持续多久?梅奥顶级专家给出答案
    新冠出现动物感染,或将无休止传播  日前,科学期刊《疫苗》主编、梅奥诊所顶级流行病学家格雷戈里波兰博士 (Gregory Poland) 在接受媒体采访时对疫情的走势作出最新研判:新冠疫情将持续到下个世纪,后代将持续接种疫苗。根据微信公众号「加拿大家园」摘引外网,Gregory Poland作为美国疫苗接种和免疫学方面的顶级专家之一,他结合研究和疫情实际情况对这一结论给出了详述。  他指出:尽管许多人做出了乐观的预测,但现在认为新冠病毒将成为地方性流感病毒还为时过早。它对一些全球卫生专家所指出的「新冠病毒大流行转变为地方性流感病毒」的说法表示不认同。  此前,有不少专家表示,奥密克戎变种病毒虽然有快速传播的特征,也有温和的性质,新冠病毒的模式将稳定且可预测,但Gregory Poland博士并不持有同样乐观的观点。  「我们还没有处于可以预测流行病的任何阶段,我们无法根除它。」需要特别强调的是,Gregory Poland博士指出:新冠病毒已显示出感染动物的能力,这意味着它可能跨物种传播,并继续变异、无限期地传播。这种病毒会传播很长时间,以至于人们仍然会在未来几代人中接受新冠疫苗。  不管是已接种疫苗还是未接种疫苗甚至动物之间,新冠都能如此猖獗的传播,Gregory Poland博士和其他专家都在担心未来几十年内无法控制住,如果一定要作出一个预测,他指出,子子孙孙都将接种新冠疫苗。  对于这个结论,Gregory Poland博士给出了一个类比:如果你今年秋天接种了流感疫苗,那么这针流感疫苗其实是针对1918年出现并引起大流行的流感病毒株。央视新闻客户端消息:1月23日据美国有线电视新闻网报道,斯坦福医学院流行病学家和传染病研究学者伊芳马尔多纳多(Yvonne Maldonado)表示,奥密克戎变异株过后,另一个全新的新冠病毒毒株或将袭来,随之奥密克戎变异株则被代替,但新冠病毒可能永远不会完全消失。  世卫组织发言人:可能永远也无法消灭病毒  疫情严峻对社会的影响似乎已经渗透多个角落。  2月6日,央视新闻客户端消息:为了掌握美国新冠病毒扩散程度,美国疾控中心从1月17日至31日的15天里,要求全美各地400多个废水监控站点每天对当地公共废水系统进行新冠病毒监测。  当地时间4日,美国疾控中心在媒体简报会上公布了这一监测数据,结果显示,在这15天中,废水监控系统一共收集了代表约5300万美国人的34000多份废水样本,其中98%的监测站点在其所有收集的样本中都检测到了新冠病毒。与此同时,美国国家环境保护局还指出,由于大约五分之一的美国家庭房屋没有连接公共下水道,只使用当地化粪池系统,这意味着利用废水监测以评估全美新冠病毒传播水平,仍有一定的局限性,并不能完全反映出美国疫情的严重程度。  如果病毒已经覆盖地球多个角落,那么人类下一步的策略是什么?  日前,世卫组织在2022年世界经济论坛上举行了有关疫苗公平问题的会议。在发言中,世界卫生组织卫生紧急项目负责人迈克尔瑞安表示,新冠病毒可能最终会成为这个地球生态系统的一部分,同时他还呼吁,应保证新冠疫苗的公平分配。  迈克尔瑞安:我们今年不会消灭新冠病毒,人们可能永远也无法消灭新冠病毒,我们可以结束的是公共卫生紧急状态。  「目前人们要做的是降低发病率,最大限度地为所有人接种疫苗,这需要更加公平的疫苗分配。截至目前,全世界已有一半以上的人口接种了两剂新冠疫苗,但在非洲地区,这个数字只有7%。」迈克尔瑞安还表示。  世卫组织也仍建议对新冠病毒感染者进行14天隔离。  新华社日内瓦1月12日电,世界卫生组织指出,新冠变异病毒奥密克戎毒株在几乎所有国家正迅速取代德尔塔毒株,各国应做好准备,谨防在即将到来的春季新冠和其他呼吸道疾病同时暴发。  世卫组织新冠病毒技术负责人玛丽亚范克尔克霍夫当天在记者会上说,随着人们社交活动的增加,以及春季流感病毒等其他呼吸道病原体的流行,预计未来将出现新冠和其他呼吸道疾病同时暴发的状况。她呼吁各国为此做好准备,确保呼吸道疾病监测系统的一体化运行。  世卫组织表示,住院人数没有出现之前激增的情况可能是由于奥密克戎毒株的毒性程度降低,以及人们因接种疫苗或感染后康复而产生的广泛免疫力。但世卫组织警告说,庞大的新增病例数正在给医疗系统带来沉重负担。  吴尊友:全球新冠大流行,3月不可能结束  新冠肺炎疫情已连续两年打乱全球民众的正常生活,如何彻底终止这场大流行成为人们心中越来越强烈的期盼。近段时间,一些来自国外的研究不断传递出这样的声音——“奥密克戎传播力强但毒性弱的特点已呈现出‘流感化’的趋势,新冠病毒给全人类造成的危害似乎在逐渐降低”。我们是否有理由对在不远的将来彻底终结新冠疫情抱以乐观的态度?就相关问题,《环球时报》记者近日独家专访了中国疾控中心流行病学首席专家吴尊友。  “奥密克戎不可能是‘大号流感’”  环球时报:国外现在有种声音,认为奥密克戎传播力强但致病力弱,越来越像是“大号流感”。对此,您怎么看?  吴尊友:奥密克戎不可能是“大号流感”,因为它感染的部位和流感是不一样的,它造成临床症状的严重性和流感完全是两个级别。流感病毒的感染部位是上呼吸道,而新冠病毒的感染部位是下呼吸道。上呼吸道感染很少会引起肺炎,除非久病不治,拖了很长时间,这种情况下少数患者会引起肺炎。而下呼吸道感染多数人会出现肺炎,包括感染奥密克戎毒株。此前天津的数据显示,在361例感染病例中,有42%的感染者有不同程度的肺炎症状,这个比例已经很高。  出现这么高比例的肺炎患者,如果不是因为我们的疫苗发挥了保护作用,病人病情的严重性会大得多。因为有疫苗“打底”以后,感染者具有一定的免疫力,所以症状就会轻很多。此外,就是我们国家的反应比较快,当病人刚刚确诊尚未出现症状,或是仅仅是轻症的时候,所有病例都会住院治疗,这和欧美国家不一样。在国外,没有症状或者症状较轻的,根本就不会安排住院治疗。这也就是我们国家从2020年6月北京新发地出现疫情后几乎没有死亡病例的原因——因为我们治疗的早。  放眼世界,奥密克戎造成肺炎的比例较高,除中国外,其他国家因奥密克戎导致的重症率、病死率远比流感要高得多。以美国为例,奥密克戎毒株流行期间,其造成的死亡人数,甚至远远高于德尔塔毒株流行期间造成的死亡人数。流感造成死亡的比例还是比较小的。所以奥密克戎不可能是一个“大号流感”。如果把它当成“大号流感”来看的话,会淡化疫情,削弱人们对它的重视程度,对疫情防控非常不利。  环球时报:1月19日,顶级医学学术刊物《柳叶刀》发表了美国(华盛顿大学)健康指标与评估研究所(IHME)主任默里的一篇论文。该论文预测,新冠病毒全球大流行即将结束,3月将成为关键时间点。请问您如何看待这种观点?  吴尊友:我认为这篇论文中表达的观点不太准确。这篇论文的作者是一名统计学家,是数学模型领域的全球顶级专家,他对生物学以及病毒的了解并不是特别清楚。他是根据流感来提出这种假设——如果此前的流感能在两年之内结束,那么新冠已流行两年,应该到了要结束的时候。他是基于这种逻辑来展开分析的,但因为流感和新冠有很多不同,他的这种假设有一些要接受现实挑战的地方。首先就在于感染流感后免疫力维持时间通常能达到一年,而感染新冠后免疫力维持时间一般在3到6个月左右。其次就在于新冠病毒的变异很快,差不多每天都在变。而流感病毒的变异是有规律性的,且变异周期较长,通常是一年一变或几年一变,在这一年或几年内,病毒的变异若仅在“亚型”内,不会影响交叉保护。所以,从病毒变异的特点以及从新冠流行两年的规律来看,“3月份成为新冠疫情世界大流行结束的关键时间点”这种观点,科学的依据是不充分的。  “新冠病毒流行的趋势肯定会减弱”  环球时报:您的判断呢?  吴尊友:今后一段时间内新冠病毒流行的趋势肯定会减弱,因为每一种新毒株的流行在到了高峰以后总会下降,奥密克戎在南非已开始出现下降趋势,在其他国家经过一段时间流行后也有下降迹象。如印度在去年4月、5月德尔塔毒株大流行后,有一段时间处在较低的流行水平,我们当时还在研究为什么印度的疫情突然就降低了,现在第四波疫情发生以后,印度的疫情又升上来。再如日本,在去年东京奥运会期间,疫情比较严重,但在奥运会结束后,疫情一下子呈现大幅度下降趋势,我们也试图解释为什么日本的疫情突然就平缓了,然而,全球第四波疫情来袭时,日本的疫情突然又升上来。新冠病毒就呈现这样一个流行规律,它一波流行峰过去后必然有下降的时候,所以从全球角度而言,3月或者未来一段时间流行趋势减弱,这种可能性是存在的,而且这种可能性是很大的。  全球新冠这一轮的大流行是有几个重要因素促成的,一个是冬季比较适合新冠病毒的生存和传播;第二个是冬季的节日比较多,感恩节、圣诞节以及新年,人们都会聚集,等到冬季过去,人们回到工作岗位,促进流行的因素也就减少了;第三个因素就是变异毒株的奥密克戎传染性比较强,特别是既往感染过或接种过疫苗的人也会感染、传播。  环球时报:有观点认为,根据病毒进化的特点,病毒的传播力越强,其毒性越弱,致病力也就越弱,到最后会呈现“强弩之末”的态势,直至与寄主和谐共生,请问这种观点是否科学?  吴尊友:这种观点把几个问题混淆而谈了。新冠病毒的传染性与致病性,在生物学上并没有必然的联系,它更多的是从社会学的角度来看这样一个问题。以我个人理解,这种传染性越强,致病性越弱的反向关系,更多的是社会性因素。以新冠病毒、“非典”还有中东呼吸综合症这三种呼吸道传染病为例,它们都是冠状病毒,但病死率是完全不一样的。新冠的病死率不到2%,非典的病死率大概在10%左右,中东呼吸综合症的病死率大概在34%,在三种冠状病毒当中恰恰是病死率最低的新冠,对人类造成的影响最大。  为什么会出现这种情况?主要是因为病人的症状如果比较轻的话,就不容易去就诊,就像我们前面讲的奥密克戎一样,它造成症状较轻的患者不容易去就诊,反而更容易传染给家人,传染给社会。但如果感染以后就出现重症的情况,病人很快就会去住院,病毒传染给他人的机会自然就会降低,病毒的传染性就减弱了。传染性是和人的社会行为有关的,交流越频繁,人口越密集,传染性就越强,而患病的严重性会限制病人和社会之间的互动能力。  所以,“传播力越强,其毒性越弱,致病力也就越弱”这种说法在生物学上基本是不可能实现的,它更多的是从社会学的角度来看这样一个问题。我个人不认为新冠的流行最终会呈现这种趋势,新冠病毒的变异,至少到目前为止也看不到这种规律,未来会不会出现呢?我想这种观点可能过于乐观了。  “对付新冠病毒,要通过综合的方法”  环球时报:新冠病毒不仅可以感染人类,还可以在动物中传播,因此有观点认为,人类可能永远也无法彻底终结新冠的流行,将与病毒长期共存,请问您如何看待这种观点?  吴尊友:应分为两个层面来表述这一问题。第一个就是新冠与人类共存,目前看来应是永久性的。第二个就是新冠流行的严重程度和规模将取决于人类与新冠斗争的程度。应该说新冠病毒会永远存在,只是流行水平会不一样。  现在难以判定的是,它是像目前这样维持一个高水平的流行,持续影响人们的生活和社会经济的发展,还是可以通过人类的智慧,运用科学技术能够把它控制在一个地方性传染病的流行水平,不再影响人们的生活和工作及社会活动。我们现在难以确定未来新冠流行的程度,这要依赖于我们对新冠科学认识的水平,以及人类防控疫情的技术水平和能力。  环球时报:近一段时间以来,在我国多地暴发的疫情中,感染者基本上都是轻症和无症状感染者,为什么会出现这样的情况?  吴尊友: 近期轻症和无症状感染者的增多有两方面的原因,其中一部分是由于奥密克戎的感染者其本身的症状可能相对比较轻,但不论是感染奥密克戎,还是德尔塔毒株,感染者都出现症状比较轻的情况,这是由于我国的疫苗接种,在70%到80%的接种人群中已产生一定免疫力,虽然这种免疫力不能完全阻止感染,但却使得感染者的症状大大减轻,或者根本就不显示症状。  无症状感染者的增多确实也增加了防控工作的难度,因为在发现疫情后想要把传播链理清楚就更难了。但应该看到,疫苗在控制疫情方面发挥的作用是巨大的,感染者的症状减轻了,需要医疗照顾或者发生重症、危重症甚至死亡的病例大幅度减少,也就减少了医疗的负担。所以疫苗仍然是我们控制新冠,包括奥密克戎最重磅的“武器”。  环球时报:世卫组织相关发言人1月24日在回复《环球时报》记者问询时表示,当全球疫苗接种率达到70%时,就意味着大流行最关键时期已过去,请问中国是否有这样的时间表?  吴尊友: 目前看来,世卫组织这一说法是值得商榷的。在第四波新冠疫情大流行发生以前,德法英等欧洲多数国家的两针疫苗接种率都已超过70%,包括美国的疫苗总体接种率也是在70%以上。这里就存在一个问题。原来我们所说的接种疫苗实现群体免疫的概念,在奥密克戎出现以后,因为突破病例的发生使得群体免疫的概念受到挑战。  如果新冠的变异毒株,多数都具有免疫逃逸能力的话,想要通过接种疫苗实现群体免疫从而终止新冠疫情的大流行,这个方法就不再适用了。所以说“70%的疫苗接种率就意味着大流行最关键时期已经过去”这个说法本身就是有问题的,我们国家已经达到70%了,但只要有病毒具有逃逸性,还是会感染,这一轮天津疫情感染的病例当中多数都是接种过疫苗的,疫苗只是让感染者的症状更轻了。现在已不能用疫苗接种率这样一个指标来制定新冠大流行终止的时间表,因为它是很复杂的,没有一个单独的方法能把新冠控制住。现在要通过综合的方法,疫苗毫无疑问是对付包括奥密克戎在内的新冠病毒最重要的重磅武器。还有严格的公共卫生措施,良好的个人卫生习惯,及时的医疗干预,中西医结合,预防加治疗这些手段综合的应用才能够控制住新冠的大流行。  “‘动态清零’是到目前为止最佳的防控方式”  环球时报:国外媒体一直试图从各种角度攻击中国的“动态清零”政策,为什么说中国的“动态清零”仍然是应对疫情最佳方式?如果要调整目前的“动态清零”,可能将会依据什么标准?  吴尊友: 实际上中国的“动态清零”政策使得中国的疫情比全世界的平均水平低出几百倍。全球目前因为新冠流行失去生命的人数很多,仅美国一个国家因为新冠累计死亡人数就达到了92万余人,而我们只是在早期武汉暴发新冠疫情时出现了几千死亡患者,在武汉的疫情结束以后,几乎再未出现感染新冠死亡的病例。这些数据足以证明“动态清零”不仅对疫情防控、减少死亡病例行之有效,同时对社会经济的发展也是非常有效的。中国人民现在的生活应该说是非常幸福的,人民普遍有安全感,虽然说局部疫情的暴发会对少数人造成一些影响,但是从全国一盘棋的角度而言,疫情的防控,世界上没有哪个国家能像中国这样成功,应该说“动态清零”政策是到目前为止最佳的防控方式。如果我们没有找到一个新的方法能够确保病毒输入后不造成大范围传播,没有一个更好的办法能够控制住疫情的话,动态清零的策略暂时也不会调整。
  • 施一公的第二个“黄金十年”:在清华发了近60篇顶级期刊论文
    p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201702/insimg/0747f7a4-dfd4-4bc0-8d19-fb49d1791ad8.jpg" title=" 201702270905596183_副本.jpg" / /p p   身材高挑瘦削,行色匆匆,记者在教学楼一层咖啡厅偶遇施一公。他刚出差回来,喝杯咖啡稍作休息,准备下一场活动。“给我打电话吧,”他低头一看表,边说着“我要去开会了”,边在楼梯上一路小跑。 /p p   出差、做实验、辅导学生、开会,施一公每天工作10个小时以上。 /p p   中科院院士、赛克勒国际生物物理学奖得主、美国科学院外籍院士、首位获得瑞典皇家科学院爱明诺夫奖的中国科学家???岁的施一公有很多故事,2008年从海外归来,是其职业生涯第二个“黄金十年”的开始。 /p p    strong 第一个“黄金十年”:大洋彼岸的他有一个中国梦 /strong /p p   学术研究的第一个重要十年,施一公是在普林斯顿度过的。那是他攀登事业高峰的历程,也是他从一名博士后到世界结构生物学领域顶尖科学家的“黄金十年”。 /p p   名校毕业,普林斯顿大学分子生物学系最年轻的正教授,拥有全校最大的实验室??这些“重量级”的待遇勾勒出一个学术“大牛”,一个生活优渥、前途大好的科学家形象。施一公离开美国时,每年的研究经费是200万美元。 /p p   人在海外,但在施一公心里,祖国的分量很重。 /p p   “科学无国界,但是科学家有自己的祖国。”施一公说,他回国的念头在读博士期间就有了。在外多久,对家的思念和对国家的责任感就积蓄多久。2006年,清华大学邀请施一公回国任职,施一公经过一晚上的思考就答应了。2007年,他正式调入清华大学,被聘为清华大学生命科学与医学研究院副院长,生物科学与技术系副主任。 /p p    strong 第二个“黄金十年”:在清华发了近60篇顶级期刊论文 /strong /p p   作为国家首批“千人计划”的一员,施一公身负重任。回国至今,已经累计以清华大学为第一单位发表顶级论文近60篇。 /p p   2015年8月21日,《科学》发表了施一公研究组两篇题为《酵母剪接体激活状态3.5埃的结构》、《第一步催化反应后的酵母剪接体3.4埃的结构》的长文,被认为是RNA剪接研究领域的又一突破性进展。“这项研究成果的意义很可能超过了我过去25年科研生涯中所有研究成果的总和!”施一公说。 /p p   继2015年率先解析剪接体的结构之后,施一公团队在2016年又相继解析了3个关键工作状态下剪接体以及组装过程中一个剪接体复合物的原子级高分辨率结构,这极大地推动了RNA剪接这一基础研究领域的发展。 /p p   2017年2月20日,科技部发布2016年度中国科学十大进展,清华大学生命科学学院施一公实验室的成果赫然在列。 /p p    strong 为更多学子创造灿烂的“黄金时代” /strong /p p   就任清华大学副校长后,施一公依然带领他的实验室团队隔天下午4点在操场跑步,每次5到6公里。 /p p   “你问我最初回国最想做什么,我想教书育人。”十年过去了,这句他当年说过的话言犹在耳。他的身影经常会出现在实验室和教学楼,坚持日常教学工作,包括给本科生上基础课。 /p p   施一公的学生闫创业从2008年就加入团队,对老师行事风格深有体会,“他做研究不怕困难,敢于争先。” /p p   施一公“走路快、说话快,做事雷厉风行”“对数字有着超乎常人的记忆力”。对学生来说,他却是“从不发脾气的老师”。“他能够看到我们实验中的不足和被忽略的细节。”他的学生万蕊雪说。 /p p   2016年12月,施一公领衔成立浙江西湖高等研究院,成立大会上他说出了自己的愿景:这里,将拥有世界上最杰出的一批科学家,培养最优秀的青年人才,从事最尖端的基础和应用研究,探索适合中国国情的科研教育体制机制,为中国的高科技可持续发展提供强大的引擎和支撑,为世界文明做出无愧于中华民族的贡献。 /p p   想必,施一公的第三个黄金十年将为更多学子创造灿烂的“黄金时代”?? /p p br/ /p
  • SCIEX祝贺韩家淮院士实验室发表蛋白质组学顶级研究成果
    p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" strong 厦门大学韩家淮院士实验室在Nature Methods上发表了基于SCIEX TripleTOF& nbsp 5600+高分辨液质系统的新型SWATHTM蛋白质组定量技术数据处理方法。 /strong /span /p p br/ /p p style=" TEXT-ALIGN: center" & nbsp & nbsp img style=" WIDTH: 413px HEIGHT: 281px" title=" 1.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201510/uepic/ee308b77-9492-4124-b435-cb773c50aca3.jpg" / /p p 左一是文章通讯作者钟传奇博士,左二是SCIEX公司组学应用支持经理郭立海博士,左三是实验室仪器管理员谢昌传博士,左四是分析测试中心副主任陈晋安高级实验师。 /p p br/ /p p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 中国科学家开展蛋白质组研究已走过十几年历程,在此领域取得了重多成就,然而在里程碑式的学术刊物Nature或Nature系列刊物上发表有关蛋白质组学的文章还是凤毛麟角,完成这个目标一直是从事蛋白质组学研究的中国学者心中的愿望。就在此时,我们得到喜讯,厦门大学韩家淮院士实验室5年磨一剑,高效的团队,在短短的时间内就取得了非常骄人的成果,令所有从事蛋白质组研究的工作者为之骄傲,利用SCIEX的TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 高分辨液质系统将其蛋白质组研究推到了世界顶级水平,并于2015年10月6日在Nature Methods(2014年影响因子32)上发表了他们的成果。成功的在他的实验室开发出新型蛋白质组定量技术SWATH sup TM /sup 的数据处理软件。 /p p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp SCIEX公司得知用户的工作达到如此高的国际水准非常高兴,这也是对SCIEX公司产品和技术最大的肯定和鼓励。为了解更多韩院士实验室的工作, 我们专门采访了该文的通讯作者之一,韩家淮院士的博士后钟传奇博士,了解他们实验室的工作内容和该文章的核心思想,以便给我们广大的质谱工作者和SCIEX质谱仪器用户有所启发。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 1 韩院士实验室的主要研究内容是什么?有哪些方向? /span /p p 答:韩老师实验室主要研究内容是在先天性免疫反应中细胞内信号的传导,具体有细胞程序性坏死的机制,p38信号通路在细胞应激反应中的调控机制等等。但是,蛋白质组并不是主要研究方向,只是其中一小部分,只有3-4个人在做这方面的研究,都是在我的带领下进行的。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 2 实验室开展蛋白质组研究的历史或历程?蛋白质组平台是怎样的构成? /span /p p 答:我(钟传奇博士)在2010年来到韩老师实验室做博士后,韩老师觉得蛋白组是一个强有力的工具,所以要我来负责蛋白组学的研究。现在平台只有2台SCIEX公司的质谱仪,一台TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 5600和一台TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 5600+。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 3 为什么连续购买SCIEX的TripleTOF?怎样评价现在的平台? /span /p p 答:主要是因为TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 5600是一个高分辨率高灵敏度的质谱,扫描速度快,而且5600可以实现新型的蛋白质组定量技术---SWATH sup TM /sup 。购买之后用了差不多4年,一直运行很稳定,数据产出也很多,我们使用比较满意,所以考虑到生科院的使用情况就又买了一台。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 4 蛋白质组学平台取得了哪些科研成果? /span /p p 答:蛋白组学平台还是取得了比较多的成绩,在纯蛋白组领域,我们在如下杂志Molecular Cell Proteomics (2012),Proteomics(2014)和Nature Methods (2015)发表了一系列文章. 在其他领域,我们利用蛋白组为工具推进了其他课题研究的进步,在如下期刊JBC (2013), Cell Host Microbe(2015)和Nature Cell Biology (2015)发表了一系列文章。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 5 怎么评价这种SWATH sup TM /sup 全新的蛋白质组定量技术?和其他定量技术比较有什么好处?未来期望哪些地方可以进一步提升? /span /p p 答:SWATH sup TM /sup -MS 是一个全新的蛋白质组定量技术,是DIA技术的一种。虽然DIA很早之前就出现了,但是SWATH sup TM /sup -MS是第一个把灵敏度和可使用性结合的最好的技术。相比基于IDA的定量技术如SILAC、iTRAQ和label-free,其优点在于能在多个样品之间对肽段进行良好的一致性定量,即SWATH sup TM /sup 的定量准确性、重现性和全面性是其他方法无法比拟的。我觉得,SWATH sup TM /sup -MS的灵敏度还可以再进一步地提高。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 6 为什么仅仅一个软件就可以发表在Nature Methods上? /span /p p 答:SWATH sup TM /sup -MS是一个全新的,并且拥有很多优点的蛋白组定量技术,已经被该领域广泛接受和应用,其应用有非常好的前景。但是其后续的信息学处理软件却非常缺乏,尤其是SWATH sup TM /sup 数据直接做蛋白质鉴定。所以这个软件开发解决了一个大家都比较关心的问题。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 7 文章里说的Group-DIA的设计思路是什么,比其他的处理软件有哪些优势? /span /p p 答:SCIEX的SWATH sup TM /sup 2.0商业化软件和Open-SWATH sup TM /sup 在做定量时,需要构建Library,而Group-DIA想解决的主要问题是不需要建library就可以直接实现定量,即对SWATH sup TM /sup 数据同时做蛋白鉴定和定量。其主要的思路是Group-DIA软件在发现母离子和其子离子对的时候,整合了多个样品的信息,故Group-DIA软件能在SWATH sup TM /sup -MS数据里鉴定和定量到比其他软件如DIA-Umpire更多的肽段。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 8 这个软件SCIEX的其他用户可以免费试用吗?到哪里可以下载? /span /p p 答:当然可以,我们非常欢迎同行来使用这个软件,Group-DIA是开源软件。我们会对软件进行持续更新。我们的Nature Methods文章有提供下载地址。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 9 SCIEX自去年就已经将SWATH sup TM /sup 升级到了2.0,定量数据质量的提升很大,您怎么看待SCIEX公司的商业化SWATH sup TM /sup 2.0数据处理软件?咱们的Group-DIA软件和这个有比较吗?是一个互补吗? /span /p p 答:我们也购买了SCIEX公司的商业化SWATH sup TM /sup 2.0数据处理软件,用起来很方便。SCIEX公司的SWATH sup TM /sup 2.0数据处理软件是基于库的SWATH sup TM /sup 分析软件,Group-DIA是不依赖于库的SWATH sup TM /sup 分析软件,不是很好比较。这两个软件是很好的互补。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 10 SCIEX公司已经推出了OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 云端多组学数据分析平台,可以在云端来做SWATH sup TM /sup 数据分析,并可以进行后续的生物信息学分析,同时可以和基因组学数据进行整合分析,帮助科学家更方便的一站式挖掘深层次的生物学意义,您怎么看待OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span ? /span /p p 答:SWATH sup TM /sup 的数据处理是一个较复杂的过程,OneOmics sup ? /sup 是一个很好的平台,可以将很多的复杂的过程简单化,处理速度要比本地快很多,利于科学家使用。而且可以在一个云环境里做好多生物信息学分析,非常方便,很容易找到一些有意义的信息。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 11 OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 是一个开放式的云端计算平台,科学家可以将自己开发的软件APP放上去,让更多的人使用,咱们有兴趣将Group-DIA代码放进OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 平台吗? /span /p p 答:我当然希望能将Group-DIA整合到OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 平台,但是中间可能会有一些兼容问题,我们可以和SCIEX合作解决这些问题,将Group-DIA代码放到OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 平台,让更多的同行来应用。 /p p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 韩院士实验室在钟博士的带领下,蛋白质组研究能取的这么好的成绩,就像钟博士讲的质谱平台是基础,对质谱和蛋白质组学的技术深入理解是关键,抓技术热点是捷径。所以,我们也希望广大的SCIEX用户能够充分发挥仪器的优势,做出更多更杰出的科研成果,让中国科学家在国际同行中产生更大的影响力。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" strong 韩家淮教授 /strong /span /p p & nbsp /p p img title=" 2.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201510/uepic/3c3e81b6-c28c-4891-a225-03442b0d6d10.jpg" / /p p br/ /p ul style=" LIST-STYLE-TYPE: disc" class=" list-paddingleft-2" li p 厦门大学生命科学学院教授 /p /li li p “千人计划”特聘教授 /p /li li p 长江学者特聘教授 /p /li li p 中国科学院院士 /p /li /ul p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 韩家淮教授是先天性免疫信号传导领域的世界知名学者,在世界上率先发现p38信号通路。细胞内存在多条信号通路以介导不同的生物学反应。p38信号通路是细胞内最重要的信号通路之一,它在许多生物学反应包括细胞周期调控、细胞增殖、发育、分化、衰老、凋亡、免疫反应及肿瘤发生中起重要作用。韩家淮教授领导的实验室在p38信号通路的研究领域一直保持世界领先地位。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 细胞应激生物学国家重点实验室 /span /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" br/ /span /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp “细胞应激生物学”国家重点实验室(厦门大学)于2010年9月在原“细胞生物学与肿瘤细胞工程”教育部重点实验室和“福建省癌症生物学”重点实验室的基础上申请建设,于2011年10月获科技部批准建设。现任国重实验室主任为韩家淮教授,学术委员会主任为王志新院士。 /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 实验室以细胞应激反应为主线,重点围绕着细胞应对外界刺激的应激反应生物学、细胞应对自身癌变的应激反应生物学、细胞应对代谢状况变化的应激反应生物学这三个方向开展研究。实验室秉承“边建设边运行”的方针,以基础理论研究为根本,结合应用基础研究,从分子、细胞和个体水平上深入地研究炎症应激反应、肿瘤胁 迫应激反应和代谢应激反应等细胞应激生物学研究领域的关键科学问题。通过多方位、多学科、多层次的联合研究,力求全面提高实验室在细胞应激生物学研究领域的综合实力,为国家人口与健康领域的需求做出重大贡献,并以优秀的原创性成果和高水平人才队伍跻身国际知名研究中心和人才培养基地之列。 /p p br/ /p

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