单细胞蛋白质

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  • Whatman 903蛋白质存储卡
    产品描述Whatman 903蛋白质存储卡经验证可用于收集血液、尿液和其他生物样品。设计的灵活性使它可以用于科研、实验室分析和现场采样。无需对纤维素基质进行预处理。903蛋白质存储卡由100%纯棉纤维制造，未经化学处理，不含湿强型添加剂。严格确保采血滤纸的纯度、一致性和吸收性符合临床要求。903蛋白质存储卡特别适用于小分子和蛋白质分析工作流程。- 样品储存和分析（少量血液、唾液和尿液）- 病毒载量监测 (例如HIV, HBV, HCV)- 进行氨基酸类疾 病的分析，如半乳糖血症等- 传染病普筛- Biobank研究(例如DNA和抗体)- 封闭研究(例如非临床)- 医疗设备使用前的实验技术参数样品吸收均匀轻松打孔打孔时纤维脱落zui少基本重量(g/m2)样本量(μL)血斑直径(mm/100mL)血吸收时间(s/100mL)170-188 75-80 15-17 5-30特点和优势- 经验证可用于化验前的血液采集，无需通过细胞裂解使生物材料失活- 可与定制的程序包结合在一起，其中包含生物样品采集所需的所有必要组件- 室温运输，无需昂贵的冷链运输物流- 提供一系列预打印和定制设计，用于样品收集、数据记录和条形码识别产品列表 903蛋白质存储卡 & CF12 :货号描述10534320903蛋白质存储卡SNAP APART 4 SPOT 100/pk10534795903简单筛选5 SPOT 1/pk10534612903蛋白质存储卡 US版 5 SPOT 100/pk10531018903蛋白质存储卡 EU版 5 SPOT 100/pk10530154903蛋白质存储卡5 SPOT 5000/pk10530072903预冲孔型蛋白质存储卡5 SPOT 100/pk10530131903预冲孔型蛋白质存储卡5 SPOT 50/pk10530138903预冲孔型蛋白质存储卡5 SPOT 20/pk10534737903 CDC专用 100/pk10538018CF12 58x58cm 100/pk10535097CF12 210x297mm (A4) 100/pk10538017CF12 46x57cm 100/pk10538019CF12 8x10in 100/pk配件货号描述10548239干燥剂100/PK10539521干燥架，含粘胶10/PK10548232塑料保护袋100/PK10534321铝箔袋
    供应商： 广州绿百草科学仪器有限公司
    品牌： 沃特曼
    价格： 面议
  • 安捷伦蛋白质 230 试剂
    使用 2100 生物分析仪系统进行蛋白质电泳是快速、自动进行蛋白质和肽谱表征、质量控制和杂质检测的一种客观、灵活的解决方案。Agilent Protein 80 和 Protein 230 分析可提供与考马斯亮蓝染色法相当的灵敏度。该系统无需 SDS-PAGE 平板凝胶处理、染色或成像步骤，使工作流程更加高效。使用生物分析仪系统评估的样品类型包括蛋白质裂解物、纯化蛋白质和多肽、还原态和非还原态抗体以及蛋白质的稳定性检测。 可根据分子量测定范围灵活选择合适的试剂盒。样品消耗量极少，仅需 4 µL 样品即可完成准确分析。可在约 30 分钟内自动分析 10 个样品，快速得到分析结果。可在一次分析中进行完整的数据分析，提供分子量、定量和纯度信息。可在整个宽线性动态范围内提供与考马斯亮蓝染色法相当的灵敏度。可利用安全包满足 GMP 和 GLP 要求，安全包是一款可选的附带软件，满足 21 CFR Part 11 法规认证的要求。
    供应商： 安捷伦科技（中国）有限公司
    品牌： 安捷伦
    价格： 面议
  • 安捷伦蛋白质 80 试剂
    使用 2100 生物分析仪系统进行蛋白质电泳是快速、自动进行蛋白质和肽谱表征、质量控制和杂质检测的一种客观、灵活的解决方案。Agilent Protein 80 和 Protein 230 分析可提供与考马斯亮蓝染色法相当的灵敏度。该系统无需 SDS-PAGE 平板凝胶处理、染色或成像步骤，使工作流程更加高效。使用生物分析仪系统评估的样品类型包括蛋白质裂解物、纯化蛋白质和多肽、还原态和非还原态抗体以及蛋白质的稳定性检测。 可根据分子量测定范围灵活选择合适的试剂盒。样品消耗量极少，仅需 4 µL 样品即可完成准确分析。可在约 30 分钟内自动分析 10 个样品，快速得到分析结果。可在一次分析中进行完整的数据分析，提供分子量、定量和纯度信息。可在整个宽线性动态范围内提供与考马斯亮蓝染色法相当的灵敏度。可利用安全包满足 GMP 和 GLP 要求，安全包是一款可选的附带软件，满足 21 CFR Part 11 法规认证的要求。
    供应商： 安捷伦科技（中国）有限公司
    品牌： 安捷伦
    价格： 面议
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单细胞蛋白质相关的仪器

  • 布鲁克timsTOF SCP单细胞质谱系统 400-860-5168转0230
    timsTOF SCP—— 拓展单细胞研究视野timsTOF SCP 专为无偏深度 4D-定量单细胞蛋白组学、免疫肽组学、表观蛋白质组学和翻译后修饰组学（ PTM ）设计，和 scRNA-seq 技术形成补充，从而拓展单细胞研究的视野。重新定义单细胞蛋白质组学 —— 发现真正的蛋白质组异质性拓展单细胞研究视野超高灵敏度：开创性的新的离子源几何设计，让离子传输效率提高 5 倍，并带来更高的稳定性。数据更完整：数据非依赖性采集 —— 平行累积连续碎列（ dia-PASEF ）超越定量重复性的极限，为大规模研究细胞异质性铺平道路。超快采集速度：高采集速度与 dia-PASEF 灵敏度相结合，可采用短色谱梯度进行样本分析，从而减少极低的样本量分析时的色谱稀释效应。更稳定：经过双正交反射后，离子再进入捕集离子淌度谱（ TIMS ）中，连续分析数千个样本也无需仪器的清洗。重新定义单细胞蛋白质组学先进的离子透镜和 PASEF 技术，可从单个细胞中发现细胞异质性和生物学特性基于质谱的蛋白质组学已成为现代研究理解生物功能和疾病机制的主要工具。健康或疾病组织看起来是同质的，但其蛋白质组是非常不同的。破解每个细胞中的蛋白组的差异（ 细胞异质性 ）是充分理解其功能的关键。timsTOF SCP 采用了一个全新改进的离子源概念，结合平行积累连续碎裂（ PASEF ）采集方法的优势，提供了极高的速度和灵敏度，以应对单细胞的蛋白组或后几个细胞的翻译后修饰的分析挑战。开创性的离子传输技术发现真正的蛋白质组异质性timsTOF SCP 采用经过改进的离子源几何设计，包括 1 毫米离子传输毛细管可将离子传输提升五倍，更高压力级的离子漏斗和八级真空系统。更大的离子传输毛细管带来超高灵敏度，额外的正交离子反射和高压离子漏斗，提供独立的、差分真空系统，依然维持了 timsTOF 仪器系列所固有的系统稳定性。蛋白质组学性能的显著提升timsTOF SCP 全新的设计提高了离子在离子源里的传输，更高的真空度维持了仪器的稳定性，这些改进让离子传输提升近 5 倍。当与以 100 nL/min 流速运行的 Evosep One Whisper 方法和 dia-PASEF 方法相结合时，Evosep One 的灵敏度比以前的高流速方法提高了约 100 倍，这使得单细胞水平的无偏蛋白质组学具有非常好的重现性和稳定性，并首次实现每个细胞覆盖约 1,500 种蛋白质。双 TIMS，CCS 支持的分析捕集离子淌度谱（ TIMS ）首先是前级的气相分离技术，在高性能液相色谱（HPLC）和质谱分离的基础上，离子淌度带来的额外的一个维度分离，降低了样品的复杂离，提高了峰容量和分析的可靠性。同样重要的是，TIMS 还对特定质量和淌度值的离子进行累积和聚焦，从而实现灵敏度和速度的独特提升。通过双 TIMS 技术，前部 TIMS 进行离子累积的同时，后部 TIMS 跟据离子淌度对离子进行释放，这样的设计可以实现近 100% 的离子利用率。这个过程也即为碰撞横截面（ CCS ）辅助的平行累积连续碎裂（ PASEF ）分析。支持 CCS 的分析为数据进一步的分析提供了很多的可能性，从更可靠的化合物鉴定到更可靠的数据库比对，以及的更大确定性到自信的库匹配，以及降低大型数据集中的误发现率（ false discovery rates，FDRs ）。免疫肽组学和其它富集工作流程的理想检测工具除了无偏真单细胞蛋白质组学应用外，timsTOF SCP 还提供了出色的灵敏度，可用于一些需要进行肽段富集的工作流程，比如免疫肽组学研究就需求从血浆或组织中纯化免疫肽开始。由于免疫多肽在这些样本中以相对较低的丰度存在，timsTOF SCP 是理想的免疫肽组学分析，在可用材料有限的情况下进行新生抗原发现，比如生物活检的样本。timsTOF SCP 突破性的灵敏度还可用于在癌症信号通路的研究中的磷酸化蛋白质组学研究。PASEF肽段离子通过捕集离子淌度谱（ TIMS ） 分离，洗脱（ ~ 100 ms ），并在四极杆飞行时间质谱（ QTOF ）上进行检测，生成 TIMS MS 热图。在 PASEF 方法中，相同的 TIMS 分离后的离子又通过四极杆对特定离子进行逐一隔离。母离子和碎片离子谱图按离子淌度值进行对齐。平行积累序列碎片（ PASEF ）技术实现了 120 Hz 的扫描速度， 使用 PASEF 通过多次选择低丰度肽来提高低丰度肽的 MS/MS 谱图质量。PASEF ：鸟枪法蛋白质组学的完美选择由 PASEF 驱动的 timsTOF SCP 提供 120 Hz 的扫描速度，而不会牺牲灵敏度或分辨率，这是通过四极杆筛选离子和碰撞池中的离子碎裂与 TIMS 中肽段离子包释放保持同步而实现的。PaSER Run & Done —— 无偏单细胞分析数据的实时质量控制imsTOF SCP 可以以超过 120 Hz 的扫描速度，对数百个微量样本（ 200 ng ）进行分析。这改变了蛋白质组学的研究方式，但增加的数据量对数据分析提出了新的要求。数据分析已经成为许多工作流程中常见的瓶颈。现代分析方法经常需要在 timsTOF SCP上生成数百个数据，布鲁克已经推出的实时数据库搜索功能 —— 实时并行数据库搜索引擎（ PaSER ），从而消除了这一障碍，使用 PaSER， LC-MS 运行一旦完成，结果就即使呈现 —— 也就是 “ Run & Done ”。MaxQuant/Perseus 和 PEAKS Studio 数据处理开放式数据格式允许研究人员直接使用原始数据，并使用自己选择的先进软件。MaxQuant 软件通过保留时间、离子淌度、质量和信号强度来提取 4 维（ 4D ）特征。这有利于肽、蛋白质和翻译后修饰的鉴定和定量。PEAKS Studio 将 de novo 测序与传统数据库搜索相结合，并对 timsTOF 原始数据的处理进行了优化。超高灵敏度的 dia-PASEF 加持的 4D-蛋白质组学CCS 支持的分析使鉴定更可靠timsControl 允许针对感兴趣的离子进行 dia-PASEF 窗口的自定义，并能调整质量隔离窗口，TIMS 的扫描范围，和循环时间，以使 dia-PASEF 方法适应不同的色谱方法有趣的离子。结合 Evosep One 系统的低流速方法与 timsTOF SCP 高灵敏度的 dia-PASEF 方法，可从 500pg 细胞消化液内鉴定出超过 2,000 个蛋白质，从 250pg 的细胞被鉴定出超过 1,500 个蛋白质。这展示了真正的单细胞蛋白质组学所需的灵敏度。从 250pg 中鉴定出的蛋白质的丰度范围约为 4 个数量级，可以在单细胞水平上进行蛋白质组定量分析。探索肿瘤微环境理解 TME 及其浸润性免疫细胞可被认为是影响疾病进展、治疗反应和患者生存的关键步骤。凭借其高灵敏度，timsTOF SCP 能够在 FFPE 组织样本的激光捕获显微切割（ LMD ）获得的细胞上获得足够的蛋白质组深度。典型的工作流如图所示。在 timsTOF SCP 仪器上，细胞标记物用于识别肿块中的黑色素瘤癌细胞和那些与基质密切相关的细胞，随后通过 LMD 对这两个群体分割，然后进行无偏 4D-蛋白质组学分析。关键发现：富集分析揭示了中枢和外周黑色素瘤细胞之间的差异调控蛋白，有可能进行疾病分型以指导临床决策。结果由 Matthias Mann 教授提供。
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    厂商： 布鲁克道尔顿(Bruker Daltonics)
    品牌： 布鲁克/Bruker
    型号： timsTOF SCP
    价格： 面议
  • 蛋白质，核酸纯化产品 400-886-5615
    仪器简介：作为全球最大的实验室过滤及超滤产品供应商，Millipore 可为您提供 l. 0.5mL至1000L处理量的实验室除菌过滤装置，可用于血 清、组织培养基及其他溶液的除菌过滤。高通量，低吸附的除菌滤膜，使蛋白质损失最少。可选择即用式过滤器或可更换膜的过滤装置。 2. 0.5mL至3000mL处理量的实验室超滤装置，用于蛋白质，核酸的分离、纯化、浓缩和脱盐，专利 的结构设计和新型的超滤膜，使超滤速度更快，产物回收率更高。单片超滤膜和膜包可清洗并反复使用。 3. 高通量纯化系统，特别适合大规模样品纯化实验室的应用，可快速有效地同时处理多达96个样品，大大减轻了实验室的负担。 主要产品包括： * Amicon 系列超滤离心装置： 浓缩，脱盐一部到位, * DNA Extraction Kit： 从琼脂糖凝胶中回收DNA,只需10分钟即可回收100bp-10,000kb DNA * Micropure -EZ：从DNA中去除常用的42种限制性内切酶，可与Amicon超滤离心装置连用，一步离心即可完成去酶，浓缩及脱盐。 * Immobilon 系列转印膜： Ny+ 用于Southern和Northern Blotting PVDF 用于Western Blotting * ZipTip 微量固相萃取吸嘴：只需数秒即可纯化fmol至pmol的蛋白质样品，提高质谱分析的灵敏度 * Montage Plasmid kit:用于质粒DNA纯化 2 Montage BAC kit:用于BAC DNA纯化 2 Montage SEQ kit:用于测序反应后PCR纯化 * Montage In-Gel Digest Kit: 同时处理96个1-D或2-D胶中的蛋白质样品 * Millex GP33: 超大面积，超高流速的针头式除菌过滤器。 技术参数：1.96孔PCR 纯化板---纯化96个样品只需10分钟 2.无须离心，只需真空抽干 3.不需要使用任何有机试剂及任何盐溶液，也无须洗涤步骤 4.纯化后的PCR样品回收率90%（500bp以上） 5.纯化后的DNA纯度极佳--Primer的去除率98% 主要特点：1.Albumin Deplete Kit--有效去除人血清中65%以上的白蛋 2.预装好亲和层析小柱，只需15分钟离心，洗脱操作 3.非特异性蛋白吸附极低 4.提高低峰度蛋白质在电泳，层析及质谱分析中的解析度 5.此Kit同样可适合于其他多种哺乳动物
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    厂商： 默克化工技术（上海）有限公司
    品牌： 未知
    型号： 纯化产品
    价格： 面议
  • Milo 单细胞蛋白质表达定量分析系统 400-860-5168转2472
    细胞异质性存在于生命医学研究的各个领域，包括肿瘤学，干细胞分化发育，免疫学等。重大生命医学问题的解决，必须首先解决细胞异质性的问题。通过单细胞检测技术，对异质性细胞进行分类，是细胞异质性分析的主要手段。单细胞测序技术实在基因层面的单细胞分析，但是所有生物学效应，包括生理学效应，病理学效应，药物反应等，最后都是通过特定蛋白质来发生和调控的。Milo单细胞蛋白质表达定量分析系统，技术来源自美国著名大学加州大学伯克利分校Amy E. Herr教授实验室，该实验2014年原创性技术发表在Nature Method，题目Single cell western blot。ProteinSimple借助强大的软件及硬件研发实力，将其开发为单细胞蛋白质表达定量检测系统，用于细胞异质性及稀缺细胞样本（比如循环肿瘤细胞等）研究。检测流程Milo单细胞蛋白质定量表达分析系统，是第一款单细胞水平，蛋白质表达定量分析系统。Milo系统采用专利的微流控western blot芯片，通过单细胞微孔设计，采集单细胞，然后原位裂解细胞，释放蛋白，进行蛋白质电泳，将不同分子量蛋白进行分离，提高免疫学检测特异性。之后，采用专利技术进行蛋白质原位捕获，使用western blot验证抗体及荧光标记二抗直接杂交，扫描仪进行芯片扫描后，Scout软件对扫描结果进行深度定量分析。因为Milo对单细胞蛋白质表达分析的独特优势，在7月份上市之后，连续获得了MIT technology review 年度创新奖，美国著名杂志 The Scientist 年度创新产品第一名。 Milo具有极其强大的功能： 1. 单张芯片可进行1000-2000个单细胞western blot检测 2. 单个细胞可进行数十个靶蛋白检测 3. 仅需使用western blot验证抗体 4. 基于western blot技术，蛋白质分离后检测，提高免疫学检测特异性 5. 全程检测4-6小时 6. 适用于：细胞异质性研究及稀缺样本检测。 5. Single cell–resolution western blotting，1508 | VOL.11 NO.8 | 2016 | Nature protocols
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    厂商： ProteinSimple
    品牌： ProteinSimple
    型号： Milo
    价格： 100万 - 200万元
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  • Nature Communications |PiSPA平台：单细胞蛋白质组分析新工具

    近日，[b]科创中心生物与分子智造研究院分子智造研究所所长方群教授团队[/b]再出新成果！团队[b]开发了“点取式”单细胞蛋白质组分析（PiSPA）工作流程和基于纳升级微流控液滴操控机器人，实现了单细胞的精准捕获、前处理以及自动进样，并首次在单个哺乳动物细胞中实现了高达3000种蛋白质的超高定量深度[/b]。目前，相关研究成果以“ Pick-up single-cell proteomic analysis for quantifying up to 3000 proteins in a Mammalian cell ”为题在国际权威期刊《自然通讯》上发表。[b]这项成果也再次向我们证明了单细胞蛋白质组学在诊疗和预防、药物开发、癌症基因组学等精准医学研究中的应用潜力。[/b][align=center][img=,700,444]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/a2bc5a12-447c-42f5-901c-d7cd2ada8821.jpg[/img][/align][align=center]团队自研的探针式微流控液滴操纵机器人系统[/align][color=#0070c0][b]更强大的单细胞蛋白质组分析工具：PiSPA工作流程[/b][/color]单细胞蛋白质组学技术是近年来生命科学领域研究的热点。因单个细胞中的蛋白质含量极微（仅约0.2 ng）且无法扩增，单细胞蛋白质组分析极具挑战性。目前传统蛋白质组分析技术仅能在每个细胞中鉴定1000种左右的蛋白质，而这在单细胞分析领域显得有些“力不从心”。此外，传统的样本前处理操作大多在微升级反应器中进行，在样品处理和转移的过程中会出现明显的样品损失，这会限制单细胞蛋白质组学的鉴定深度，难以满足生命科学研究的迫切需求。“想要突破单细胞蛋白质组学鉴定深度的障碍，有两种策略。一是在足够小的微反应器中进行样品前处理，利用微尺度效应提高反应效率；二是将所有操作整合在一起，降低样品损失，但这两种策略对技术与设备的要求都很高”，本项成果第一完成人王宇博士解释道，“我们利用微流控技术将商品化的内插管改造为阵列化的纳升级微反应器，解决了纳升级样品反应与自动进样的问题。PiSPA平台可自动完成细胞捕获、样品前处理、色谱分离、质谱检测、数据处理等操作，进一步降低了样品损失。”[align=center][img=,700,303]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/63b80008-6467-4583-b1b7-147e9680c481.jpg[/img][/align][align=center]“点取式”单细胞蛋白质组分析流程示意图[/align][b]PiSPA工作流程使得高精度的液体操控、单细胞的精确处理以及先进的LC-TIMS-QTOF MS技术融为一体，重新定义了单细胞蛋白质组学分析。[/b]“在研究中，我们将该平台应用于三种哺乳动物细胞（HeLa、A549和U2OS细胞）的单细胞蛋白质组分析，以及HeLa细胞迁移过程中的细胞异质性研究中，均实现了超高深度定量分析”，王宇博士说。同时，迁移细胞的单细胞蛋白质组分析也证实了PiSPA平台具有识别细胞迁移关键分子以及有价值靶点的应用潜力。[align=center][img=,700,394]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/b4d136ba-e078-4fc6-b59d-911f8f0abfcc.jpg[/img][/align][align=center]哺乳动物细胞的单细胞蛋白质组分析结果[/align][color=#0070c0][b]单细胞的定量深度：从3000+走向全蛋白质组测序[/b][/color]PiSPA平台集成了基于序控液滴（SODA）技术的自动化液滴操纵机器人，能够在“点取式”操作模式下实现纳升级的细胞分选、多步样品前处理和自动进样操作。相比于其他单细胞分析方法，[b]PiSPA平台的优势主要体现在与成像技术结合，能够灵活地选择任意单个细胞进行分析，目标细胞的捕获指向性强，具有很高的捕获准确性和成功率，并可保留目标细胞的表观和空间信息，显著增加了单细胞分析的信息维度[/b]。其次，PiSPA平台采用针对单细胞样品的“定制化”分析条件，实现了蛋白质鉴定深度的大幅提升，能够为生物医学研究提供更多有效的基础数据。这些优势对推动单细胞蛋白质组分析的实际推广应用具有重要意义。“目前的单细胞定量深度只是一个起点”，方群教授分享道，在该项研究中，可从单个哺乳动物细胞中可定量多达3000种蛋白质，约占人类基因编码蛋白质总数（约20,000种）的15%，其鉴定深度已经达到10年前单细胞转录组测序技术的相近水平。类比单细胞转录组测序技术的发展历史，可以预见当前已处于单细胞蛋白质组分析技术的爆发阶段，随着技术的快速革新，单细胞的定量鉴定深度还将得到史无前例的提升。“这意味着单细胞蛋白质组学技术已进入在广泛的生物医学研究领域中实际应用的阶段。”[align=center][img=,700,315]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/0ff9f496-19a8-4d58-a0de-a5d54a37ad74.jpg[/img][/align][b]团队表示，未来，他们将进一步提高单细胞蛋白质组分析的鉴定深度和通量，以持续推进该技术实用化和应用拓展的水平[/b]。此外，在上述成果基础上，目前团队还在利用iChemFoundry平台的自动化机器人技术和机器视觉技术构建能够完成单细胞蛋白质组分析全部流程操作自动化的分析平台，很快会有新的成果发布，这些都将为人们了解生命活动中细胞异质性的变化带来更有力工具。[来源：浙大杭州科创中心][align=right][/align]

  • 奥素科技完成近亿元A轮融资|启动单细胞蛋白组学领域加速键

    1月2日，佛山奥素博新科技有限公司（以下简称奥素科技）宣布完成近亿元A轮融资。本轮融资由鲁信创投领投，老股东启明创投、线性资本、同创伟业等持续加码，凯乘资本（WinX Capital）担任财务顾问。本轮融资后，奥素科技将进一步加速在单细胞蛋白组学领域的商业化推广，提供差异化的产品和服务，填补实验室样本预处理、功能发现及验证等需求的空白，力争将中国制造的先进生命科学仪器推向全球市场。奥素科技成立于2021年，具有全球领先的有源数字微流控液滴操控平台，在两年多时间内已连续获得四轮融资，股东包括诸多顶级VC及知名产业投资人。公司推出的第一款商业化产品Boxmini? SCP，是全球首款全流程微流控片上单细胞蛋白组学样本前处理工具，高效协助用户实现高通量、快速、精确的微量样本控制，一站式完成复杂的单细胞蛋白质样本前处理工作，且对无标记和TMT标记处理方案均可适配，产品推出后备受市场关注。[img=图片]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/ea05f042-359a-4e3c-a6db-2edf2fa796f0.jpg[/img]对于本次融资，[b]奥素科技创始人兼CEO马汉彬博士[/b]表示：“将消费电子半导体技术引入到生命科学领域，奥素团队已经完成了0到1的积累：特别是在单细胞蛋白质组学样本前处理应用场景，我们通过有源数字微流控微芯片上纳升样本精准操控及全流程集成能力，获得了海内外多位头部PI的认可并产生了对整个领域有促进意义的实验结果；在单细胞多组学、微生物及合成生物学等其他领域，奥素也将与不同的下游伙伴携手前行，加速新产品的开发及商业化落地。我们将在新老股东的支持下，利用产品技术优势，迅速开拓海内外市场，以单细胞蛋白质组学产品为突破点，通过开放式数字微流控共享平台打造半导体技术的生物芯片生态，让生命科学实验室及医疗检验自动化快速迈入消费电子时代。”此前，在仪器信息网[url=https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/icca2023][font=arial][color=#000000]第六届细胞分析网络大会（iCCA2023）的【单细胞分析技术】专题会场中，[/color][/font][/url][url=https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/icca2023]马汉彬[/url]研究员分享《[url=https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/icca2023][font=arial][color=#c00000] [/color][/font][color=#c00000]基于有源数字微流控的单细胞分选和操控系统[/color][/url]》的主题报告。[url=https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/icca2023][i]（详情点击）[/i][/url][align=center][url=https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/icca2023][img=,200,200]https://img1.17img.cn/17img/images/202308/uepic/34781884-5a9f-4e5a-b5df-03783a77c663.jpg[/img][/url][/align][align=center][url=https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/icca2023]马汉彬 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 研究员[/url][/align]马汉彬研究员课题组也在2023年成功研发出了一套基于大面积薄膜晶体管开关阵列的有源数字微流控平台，在Analytical Chemistry发表并被选为当期的封面论文。[url=https://www.instrument.com.cn/news/20230817/680090.shtml][i]（详情点击）[/i][/url][align=center][img=7872d6238fc05517bb5f145142a71dee_7b4ffe77-43f0-48a2-886a-b31b248d32ca.jpg,350,465]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/e362de5d-8580-4bc7-baf3-7272a8a7d52c.jpg[/img][/align]本轮领投方，[b]鲁信创投副总经理邱方[/b]表示：“鲁信创投作为国有控股的专业创投机构，一贯秉持以创业投资形式，支持我国自主的研究平台、仪器设备成果应用转化，将实现我国高水平科技自立自强的任务放在首位。奥素科技掌握有源数字微流控的核心底层技术，有潜力将实验室自动化推进到一个全新的局面，形成新的研究平台。公司推出的单细胞蛋白组学产品，为单细胞多组学等前沿研究提供先进工具，在包括鲁信已投企业在内的下游客户中引起强烈关注，体现出国产科学仪器的高水平自立自强，即将迎来新的局面。鲁信创投将支持奥素科技，打好科学仪器设备国产化攻坚战。”[b]启明创投合伙人陈侃[/b]表示：“启明创投作为上轮领投方，已连续两轮增资奥素科技。公司凭借强大的研发能力和优秀的执行力，快速的推出了单细胞领域的尖刀产品，面向一片蓝海市场。我们对公司未来充满信心，继续助力公司海外市场的商业化，期待奥素科技将“中国智造”先进科学仪器推向世界。”[b]线性资本董事总经理郑灿[/b]表示：“线性资本作为天使轮领投方，坚定认为投资要找到正确的人。我们亲眼见证了马汉彬博士从一名科研工作者向现代企业家的转变。马汉彬博士的为人、科学素养、前沿视野和企业家精神令我们印象深刻。在他带领下，公司首先推出了具有划时代意义的单细胞蛋白质组学解决方案，为全球蛋白组学领域研究再填一把火。我们本轮继续增持，推动奥素科技向先进科学仪器标杆企业迈进。”[b]同创伟业北京医药基金合伙人郗砚彬[/b]表示：“我们始终认为，奥素科技的数字微流控芯片系统，有望成为下一代生命科学微反应器的关键载体，持续为科学研究、医药工业等提供创新解决方案。公司的单细胞蛋白组学产品，将蛋白组学研究推进到了切实可行的单细胞颗粒度，使客户能够不再受工具所限，以全新的角度验证所知和探索未知。我们本轮继续增持，期待奥素科技能够让先进技术在应用层面全面开花。”[b]凯乘资本创始合伙人邹国文[/b]表示：“凯乘资本很荣幸连续第三轮担任奥素科技融资的财务顾问，见证了奥素从初创、一路飞速发展及商业化；作为数字微流控行业头部企业，奥素能够穿越市场周期，在不到三年的时间连续获得四轮融资，充分体现了资本端对公司的高度认可。期待奥素在下游领域的进一步拓展，成为世界领先的生命科学工具企业。”[b]关于鲁信创投：[/b]鲁信创投是山东省鲁信投资控股集团有限公司控股的省内最大、国内具有重要影响力的专业创投机构，是国内资本市场首家上市的创投机构（股票代码：600783.SH）。成立20余年以来，管理运作各类基金已达40余只，基金规模约200亿元，覆盖医疗健康、军民融合、先进制造、电子信息、新能源、新材料等细分产业，境内外上市公司40余家，在医疗健康领域先后投资了思路迪、硅基仿生、中科新生命、爱博泰克、唯迈医疗、美东汇成、英赛斯、荣昌生物等一批优秀企业。[来源：仪器信息网] 未经授权不得转载[align=right][/align]

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  • “真”单细胞蛋白质组学引领者，“真”不是吹的
    1. “真”单细胞蛋白质组学引领者2019年8月12日，Nature Methods编辑Vivien Marx在Nature Methods上在线发表了题为“A dream of single-cell proteomics”的文章，蛋白质组学领域的领军人物之一苏黎世联邦理工学院Ruedi Aebersold教授在文章中评论到“It’s early days, but it’s not a distant dream to be able to tally the proteins in single cells” 。巧合的是，2019年也是基于timsTOF Pro的4D-蛋白质组学技术开始腾飞的一年。 2020年12月蛋白质组学领域两大领军科学家Matthias Mann团队（Max Planck Institute of Biochemistry)和Ruedi Aebersold团队（ETH Zurich）在Nature Methods发表题为“diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition”的文章，其共同开发的基于4D平台的DIA技术——diaPASEF，能够全面提升蛋白质鉴定覆盖率、重现性和定量准确性。因此，4D-DIA技术大幅提升的可靠性，之前不太被大家认可的DIA（数据非依赖性采集）技术真正开始大步向前，也是从此刻开始，4D-蛋白质组学技术的发展一发不可收拾。2021年11月2日，在第69届ASMS会议上，布鲁克公司发布第一代单细胞蛋白质组学质谱timsTOF SCP，“真”单细胞蛋白质组学方案横空出世，全球首台商品化timsTOF SCP落户于广州，表明在单细胞蛋白质组学领域中国研究者的前瞻性。在timsTOF SCP发布的第一年，单个HeLa细胞蛋白质鉴定已经接近2500种，即使在现在，这个单细胞鉴定深度也是其它质谱仪所不能企及的。这也让蛋白质组学领域领军科学家之一Matthias Mann教授发出了"I always said that single cell proteomics would not happen in my lifetime, but I'm happy to have been proven wrong。" 这样的感叹。2. “真”单细胞蛋白质组学质谱进化到第二代，可以上车了 2023年6月5日，在第71届ASMS会议上，布鲁克公司继续在“真”单细胞蛋白质组学上发力，重磅发布了timsTOF Ultra，“真”单细胞蛋白质组学质谱发展到第二代。timsTOF Ultra配备新型Captive Stray（CSI）Ultra离子源，第四代TIMS（捕集离子淌度）XR离子淌度和14位数模转换器，MSMS扫描速度提升到300Hz，继续占据MSMS扫描速度的头把交椅。 以HeLa细胞为例，人们一般认为单个细胞的蛋白质含量为200-250pg，于是有人将250 pg的进样量的蛋白鉴定数目等价于单细胞蛋白质组鉴定数目，但实际上系列稀释样本可以用来部分表现仪器灵敏度，无法代表真正单个细胞蛋白鉴定水平，“真”单细胞蛋白质组学的数据才是检验质谱灵敏度的唯一标准。布鲁克公司在第一代“真”单细胞蛋白质组学质谱timsTOF SCP上积累的宝贵经验和技术，在第二代timsTOF Ultra上完全得到了释放，通过CellenOne对HeLa细胞分选，获取1个、5个和10个细胞，采用dia-PASEF方法进行数据采集，Spectronaut 18数据分析，单个细胞22min可以鉴定超过3700种蛋白质（每个样本3针重复），1个HeLa细胞两次重复所鉴定的蛋白质强度相关系数0.95，显示出低至1个细胞的进样量也能得到高重复性。 德国柏林马克斯德 尔布吕克分子医学中心空间蛋白质组学研究小组负责人Fabian Coscia博士采用第一代“真”单细胞蛋白质组学质谱timsTOF SCP进行FFPE组织的单细胞分析，单个肝细胞当量的组织可以定量1500-2000种蛋白质。timsTOF Ultra灵敏度的提升，必将在FFPE组织的单细胞分析中发挥更强大的威力。3. “真”单细胞蛋白质组学主打“成熟可复制”单细胞蛋白质组学研究是一项复杂而前沿的科研领域，涉及许多挑战和门槛，比如用什么技术进行单个细胞的分选、分选后对单个细胞操作时怎么尽可能将低样本损失、质谱的灵敏度能否达到单细胞蛋白质组学所需灵敏度，这些挑战和门槛让很多研究者对单细胞蛋白质组学望而却步。布鲁克推出的一套完整的“真”单细胞蛋白质组学方案，把单细胞蛋白质组学研究的这些挑战和门槛全部打破，主打一个“成熟可复制”，甚至没有蛋白质组学经验的人也可以快速上手，短时间内就可产生高质量单细胞蛋白质组学数据。小结得益于质谱技术的进步，单细胞蛋白质组学领域将很快迎来爆发，布鲁克timsTOF Ultra的发布，必将成为单细胞蛋白质组学领域爆发的强劲动力。timsTOF Ultra超越了传统的限制，为新的科学可能性打开了大门。无论是单细胞蛋白质组学、免疫肽组学或者血浆蛋白质组学，timsTOF Ultra提供了无与伦比的扫描速度和灵敏度，帮助研究人员打破工作的界限并取得突破性成果。参考文献1. Marx, V. A dream of single-cell proteomics. Nat Methods 16, 809–812 (2019). 2. Meier, F., Brunner, AD., Frank, M. et al. diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition. Nat Methods 17, 1229–1236 (2020). 3. Brunner, AD., Thielert, M., Vasilopoulou C. et al. Ultra-high sensitivity mass spectrometry quantifies single-cell proteome changes upon perturbation. Molecular Systems Biology (2022)18:e107984. Makhmut, A., Qin, D., Fritzsche, S., et al. A framework for ultra-low input spatial tissue proteomics. bioRxiv 2023.05.13.540426
    时间： 2023-09-15
    作者： 布鲁克道尔顿
  • 一次性单细胞蛋白质组和代谢组同步分析策略
    细胞异质性作为细胞系统中一种普遍存在的现象，受到生物研究领域的日益关注。在传统的群体分析中，单个细胞的独特差异往往被整体的平均值所掩盖，而这些被忽略的细节恰恰构成了细胞分化过程中的关键线索。随着微阵列芯片、核酸测序、质谱等技术的进步，对单一细胞进行基因组、转录组、代谢组和蛋白组分析已不再遥不可及。特别是核酸扩增技术的进步极大地推动了基因组、转录组在单细胞层面的测序技术的应用。尽管取得了这些进步，但在单细胞层面对蛋白质和代谢物的分析仍然面临重大挑战，这主要是由于它们的量有限且缺少有效的扩增手段。本文提出了一种新的策略，通过一次性单细胞蛋白质组和代谢组分析（scPMA），可以在单次LC-MS/MS分析中同时获取单个细胞的蛋白质和代谢物信息。通过这种策略，研究人员能够整合单个细胞的多组学数据，以深入理解细胞内部相互作用的网络和调控细胞状态的复杂机制。scPMA策略共包括以下三个部分（图1）：单细胞捕获及分离、纳升级样品预处理、一次性LC注入和质谱检测。前两个环节都是基于课题组前期自制的机械装置操作完成的，最后一部分才是scPMA策略的亮点。在常规分析流程中，由于蛋白质组和代谢组在物理化学特性上的根本差异，它们通常需要匹配不同的质谱检测技术。因此，在传统的样本预处理阶段，蛋白质和代谢物会被分离，随后各自经历特定的处理流程，并最终分别进行LC-MS/MS检测。然而，这些额外的分离和处理步骤不仅增加了分析的复杂性，而且往往不可避免地会导致样本的损失，特别是在处理单细胞水平的微量样本时，这种损失尤为显著，可能对研究结果的准确性和可靠性造成影响。基于此，作者希望能够开发一种易于使用的方法来实现同一单细胞个体的蛋白质组和代谢组同步分析。图1 一次性单细胞蛋白质组和代谢组同步分析示意图实际上，代谢物和蛋白酶切后的肽段在C18反相色谱柱上的保留时间是存在差异的。如图2所示，在作者设置的45 min梯度下，大部分A549细胞酶切的肽段在9至17 min的范围内就已流出（图2a），而此时流动相中乙腈的最高含量仅为40%。而A549细胞产生的代谢物则主要分布在17 min之后，只有极少部分是在17 min以前流出（＜10）（图2b）。导致这些现象的根本原因是肽段与代谢物之间疏水性的差异，因此，该策略更适合蛋白组与有一定疏水性的代谢物分析。得益于C18的有效分离，可以在色谱梯度的不同时间段针对不同的样本成分（肽段/代谢物）设置不同的质谱检测参数（图2c）。有效的色谱分离加与之匹配的双区域质谱检测便可实现一次性单细胞蛋白质组和代谢组双重分析。与之前的单组学的结果相比，scPMA策略在定量深度上并无明显差异（图2d-f）。图2 单蛋白质组和代谢组分析与scPMA的性能比较 通过scPMA策略，研究者们能够对单个肿瘤细胞（包括A549、HeLa和HepG2细胞）进行双重组学分析，平均定量了816、578和293个蛋白质以及72、91和148个代谢物。并利用UMAP聚类和随机森林机器学习模型，基于单细胞的蛋白质组、代谢组和双重组学信息，实现了对细胞类型的初步分类（图3、4）。根据结果可得知，细胞在代谢组中的异质性要大于蛋白组。图3 scPMA策略分析单个肿瘤细胞（包括A549、HeLa和HepG2细胞）图4 基于单细胞的蛋白质组、代谢组和双重组学信息对细胞进行分类随后，作者还利用scPMA方法在单细胞水平上研究了多柔比星对肿瘤细胞的诱导作用（图5）。对比药物处理组的各个单细胞样本发现给药后不同的单细胞在蛋白质表达上存在着异质性，这也是在群体分析中无法观察到的现象。与未给药的细胞相比，给药组共鉴定出255个差异蛋白(图5b、c)，一些肺癌细胞中过表达的蛋白显著降低。大部分的差异蛋白涉及的通路与DNA、染色质、核小体的合成有关（图5g）。同样，给药组和未给药组中鉴定出的代谢物也被用于UMAP聚类(图5d)和差异分析。差异分析结果(图5e、f)显示，93种代谢物有差异表达。其中，多柔比星仅在给药组检测到。值得注意的是，在给药组的各个细胞中，多柔比星丰度有明显的离散分布，甚至有10倍的丰度差异。这一结果表明不同的细胞个体具有不同的药物吸收水平，从而表现出明显的细胞异质性，这可能为进一步深入探索提供启发。基于差异蛋白质组和代谢组信息，利用MetaboAnalyst 5.0进行联合通路分析，分别富集出62条和234条相关通路。其中有37条显著相关的通路涉及的差异蛋白和代谢物与核糖体、DNA复制等药物作用机制有关（图5i）。图7.氘代差异分析流程示意图这些结果展示了scPMA策略在单细胞分析中的潜力，尤其是在药物干预研究中的应用前景。同时，这项工作也证明了一次性获取单细胞蛋白质组和代谢组信息的可行性，为未来在细胞分化、衰老和肿瘤免疫等领域的研究提供了新的工具。本文2024年发表在Analytical Chemistry上，One-Shot Single-Cell Proteome and Metabolome Analysis Strategy for the Same Single Cell。该文章的通讯作者是来自浙江大学化学系微分析系统研究所的方群教授。
    时间： 2024-07-12
    作者： lirui
  • 会议邀请 | CNHUPO-单细胞蛋白质组学研究专题卫星会
    基于单细胞层面的研究为生物系统中细胞间的同质性和异质性提供了更精准的信息，随着蛋白质组学技术的快速发展，检测技术和灵敏度的提升，使实现单个体细胞的蛋白质组学分析成为可能。 为推动单细胞蛋白质组学的发展，拓展单细胞研究的视野，布鲁克和景杰生物将于2021CNHUPO会议期间联合举办“单细胞蛋白质组学专题卫星会”，线上线下同步进行，诚邀您与会。会议时间：2021年10月14日12:30-13:35 现场参会地点：武汉 东湖宾馆 1楼 晴川厅 网络同步直播：请加微信报名 13370119923特 邀 嘉 宾会 议 日 程12:30 - 12:35 欢迎致辞及公司介绍 何磊 布鲁克道尔顿中国区经理12:35 - 12:50 timsTOF SCP 带您突破单细胞蛋白质组学研究极限 刘先明 布鲁克道尔顿中国区蛋白质组学及生物制药应用经理12:50 - 13:20 单细胞高维度蛋白检测技术及临床应用 丁显廷 教授 上海交通大学生物医学工程学院13:20 - 13:35 真于心，单于一，基于质谱的单细胞蛋白质组学 顾宏博 博士 杭州景杰生物科技股份有限公司线下注册参会：请加微信报名 13370119923* 本次卫星会将为现场参会人员提供午餐和礼品！抽奖活动在线上和线下同步进行！ 会议咨询：13370119923 期待您的参与！
    时间： 2021-10-09
    作者： 布鲁克道尔顿
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