差异代谢物

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差异代谢物相关的耗材

  • 呋喃它酮代谢物残留化学发光检测试剂盒
    呋喃它酮代谢物(AMOZ)检测试剂 盒(化学发光免疫分析法)使用说明书【产品名称】 呋喃它酮代谢物检测试剂盒(化学发光免疫分析法) 【包装规格】 100T/盒 【概述】 硝基呋喃类药物因有非常好的抗菌作用和药动力学的特性, 曾被广泛应用,作为禽类、水产和猪促生长的添加剂。但在长时 间的实验研究过程中发现,硝基呋喃类药物和代谢物均可以使实 验动物发生癌变和基因突变,正因为如此才导致此类药物禁止在 治疗和饲料中使用。 由于硝基呋喃类药物在体内很快就能被代谢,而在组织中结 合的代谢产物则能存留较长的一段时间,所以在分析此类药物的 残留时经常要分析其代谢后的产物,管理部门就以检测代谢产物 为手段达到检测硝基呋喃类残留的目的。呋喃唑酮代谢产物 AOZ; 呋喃它酮代谢产物 AMOZ;呋喃妥因代谢产物 AHD;硝基糠腙 (呋喃西林)代谢产物 SEM。 【检测原理】 试剂盒采用竞争法进行检测,温育结束后,加磁场沉淀,去 掉上清液,用清洗液清洗沉淀复合物,并吸干废液,除去未与磁 性微粒结合的物质,再将反应杯送入测量室中。仪器自动泵入两 种激发液,使复合物产生化学发光信号,通过光电倍增器测量发 光强度。仪器自动通过工作曲线计算得出检测结果。 【适用范围】 可定性、定量检测组织样品中呋喃它酮代谢物的残留量。 【检测方法】 1.试剂盒为即用型,不能分开使用。 2.使用本试剂盒前请仔细阅读试剂说明书以及全自动化学发光 免疫分析仪的使用说明书,按照相关要求进行测定操作。试剂使 用时,测定仪会自动搅拌磁性微粒,使其处于悬浮状态,如果想 快速进行检测,上机前请手动摇匀磁性微粒。试剂的相关信息可 以自动读取,一次读取相关信息即存入测定仪器,不需反复读取。 3.定标:通过测定高、低值校准品,将预先定义的主曲线上的每 个定标点调整(重新定标)为一个新的、仪器特异的测量水平, 即工作曲线。 4.定标频率:每天进行一次定标,更换不同批号试剂或者激发液 需要重新定标。 【注意事项】 1.使用前请详细阅读说明书,并将试剂水平摇匀。 2.请按照储存方法保存试剂,避免冷冻,冷冻后的试剂质量会发 生变化,请勿使用。 3.避免试剂接触皮肤、眼睛和粘膜,一旦接触,应立即用清水冲 洗接触部位。 4.不同试剂盒中各组分不能互换。 【储存条件及有效期】 1.试剂盒于 2~8℃避光未拆封状态下竖直保存,禁止冷冻。 2.有效期为 12 个月,在 2~8℃环境下保存时,稳定性可持续至所 标示的日期;开瓶后低温避光(2~8℃)可保存 1 个月。
  • 瑞思泰康 Allure AK代谢物乙醛类和酮类化合物专用柱
    Allure AK代谢物乙醛类和酮类化合物专用液相色谱柱产品特点:粒径(μm):5,球型孔径(A):60封尾:是PH范围:2.5 - 8 温度上限(°C):80 这种高保留,高选择性的柱子-独特的Restek柱-是专门为分析醛和酮的二硝基苯腙(DNPH)类衍生物所开发的。Allure? AK 是一种反相高效液相色谱材料,这种填料在乙腈/水为流动相,梯度洗脱的条件下,对加州空气资源委员会(CARB)方法#1004中提到的13羰基化合物具有独特的分离能力。其他色谱柱分析时间长或者需要使用四氢呋喃。产品应用: DNPH代谢物乙醛类和酮类化合物的分析专用订货信息:货号粒径长度内径包装9159523-7005 μm200 mm3.2 mmea.9159525-7005 μm200 mm4.6 mmea.
  • PRP-X400草甘膦及代谢物分析柱
    Hamilton液相色谱柱§ Hamilton 系列色谱柱产品综合了硅胶和聚合物填料柱的最佳特征,提供色谱峰的最佳对称性类型固定相粒径内径长度150mm价格长度250mm价格反相柱PRP-15μm4.1mm794446060 798207916 4.6mm794236683 795718234 10μm4.1mm794254893 794276206 4.6mm793515516 793816829 无机和有机离子分析PRP-X10010μm4.1mm794346511 ————4.6mm791748234 7918110339PRP-X20010μm4.1mm794416511 794427916 4.6mm793847134 793578539 分析结构相似的醇和有机酸PRP-X3007μm4.1mm794646206 794658075 4.6mm794757094 79386询价分析草甘膦及代谢物PRP-X4007μm4.1mm797177532 794739163 4.6mm————793877916

差异代谢物相关的仪器

  • 代谢组学指对某一生物、组织或细胞在一特定生理时期内形成的各种代谢产物进行全面定性和定量分析的一系列技术,主要研究的是各种代谢途径的底物和产物的小分子代谢物(通常MW<1000),近年来在食品及医药领域都有广泛的应用,如可用于改善食品口味和品质、开发功能保健食品、判别食品真伪及对食品进行质量控制,对血液、细胞和尿液的代谢物进行分析可以阐明生理和病理机制、发现先天性代谢缺陷或癌症的标志物等。代谢组学样品尤其是生物样品通常含有大量的干扰物质,如何从大量检出组分中快速确定哪些化合物是目标分析的关键物质以及如何准确排除干扰组分检测到痕量代谢物是目前研究工作者所面临的挑战。岛津一直致力于为代谢组学研究工作开发配套解决方案,数年前就推出了针对性的专业数据库,并不断进行更新和升级,今年该数据库再一次进行了强有力的扩充和升级,与此同时岛津积极与国内客户开展合作进一步扩充数据库。代谢物数据库包含代谢物组分的各种信息,是代谢物分析的有力手段。Smart Metabolites Database Ver.2化合物数量扩增至600多种,新增植物次生代谢物,如功能性成分儿茶素和绿原酸等代谢物信息,同时提供氨基酸、脂肪酸和糖的专用分析方法,扩展了数据库的适用范围。&bull 自动创建代谢物检测高灵敏度MRM分析方法Scan方法是代谢物分析的传统方式,但是对于痕量组分尤其是代谢物有重叠或是有污染物干扰时灵敏度往往无法满足要求。代谢物数据库包含优化后的MRM分析条件,同时结合AART保留时间校准功能,无需标准品即可轻松创建高灵敏度和高选择性的MRM方法进行代谢物泛靶向分析,即使是痕量组分也能准确定性和定量。&bull 省时、省力代谢物数据库包含600多种化合物信息,适用于各种样品分析,但与此同时数据分析时间也随着可分析化合物种类的增多而延长。为了更好的满足用户需求,新版数据库增加过滤功能,根据不同的样品的类型(植物、动物、血液、尿液、细胞),允许用户只选择和分析给定样品中可能被检测到的代谢物,从而大大节省分析过程中的时间和劳动力。&bull 提供“即时可用”的糖定量分析方法代谢组学分析中常用甲氧肟-TMS衍生化法,但是还原糖会产生多种几何异构体,在色谱上难以实现分离。数据库增加新的糖衍生化方法实现糖的选择性检测,同时包含24种主要糖分析所需的化合物信息和校准曲线信息,无需标准品即可轻松获得糖的半定量结果。&bull 食品代谢组学分析完整解决方案基于新版代谢物数据提供GC/MS食品代谢组学分析从样本制备到多变量分析的完整支持。数据库包含的“代谢组学手册”全方位说明从样品制备到多变量分析的每个步骤,即使是初学者也可以根据手册轻松应对。应用实例——番茄品种间的多变量分析利用Smart Metabolites Database Ver.2 对4种不同番茄的代谢物进行分析,然后利用多组学方法包,观察不同品种之间的差异。从分析结果可以看出,与其它番茄品种相比,A品种含有大量的氨基酸,C品种则含有大量的糖。同时利用糖的专用分析方法对不同番茄品种的糖代谢物进行半定量分析,从而确证每个品种间存在差异。
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  • Agilent Bravo 代谢组学样品前处理平台配备有专为自动化代谢组学样品前处理流程而设计的台板附件和软件,是最先进的液体处理平台。以 Bravo 液体处理器可靠、一致的性能为基础。开展代谢组学研究时,如果进行手动样品前处理,则不同批次和不同用户之间可能存在较大差异。样品前处理自动化可提高通量、一致性和重现性,从而减少重复测定需求。安捷伦代谢组学样品前处理自动化系统为代谢组学研究提供可靠且简单易行的标准化血浆样品前处理流程。仅限研究使用。不可用于诊断目的。特性:专为血浆代谢组学设计,所有硬件、附件和软件专为血浆代谢组学样品前处理而设计,整个平台体积小巧、紧凑标准化、可重现的流程可实现实验间和用户间的数据一致性和更低的 CV 值可扩展性可在不影响结果质量的前提下提高通量软件具有简单直观的用户界面,可帮助不同技术水平的用户快速启动和运行流程与支持孔板形式的任意 LC/MS 系统兼容
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  • Agilent 6546 Q-TOF 液质联用系统通过全面的工作流程,提升实验室在代谢组学研究、食品安全、食品真伪检测和环境筛查方面的分析能力。其同时具备出色的灵敏度、动态范围、分辨率、同位素保真度和精确质量测量,所得高质量数据可为快速、简化的数据审查流程提供满足您需求的可信度。采用 Q-RAI(四极杆分辨全离子)或全离子采集功能后,现可将食品安全筛查与片段信息结合用于鉴定,让您执行目标物和疑似物的同步筛查。此外,高分辨率、宽动态范围与高同位素保真度使 6546 LC/Q-TOF 成为了代谢组学研究的理想平台。 特性- 同时提供 5 个数量级的谱内动态范围和超过 60000 的质量分辨率,不论分析物浓度高低,均能获得可靠结果- 亚 ppm 级的质量数准确度和 5% 以内的同位素保真度,有利于未知物鉴定时缩小可能化合物的范围- 无需放空即可维护离子源和进样口,更方便快捷- 通过农药、兽药、真菌毒素、可萃取物与可浸出物以及水污染物的精确质量谱库,摆脱了化合物数量和耗时的方法维护对靶向筛查分析的限制- 代谢组学工作流程可用于代谢谱、脂质组学和定性代谢流分析- 全新的食品真伪检测工作流程,简化了食品原产地和食品掺假分析流程性能指标:MS 灵敏度S/N (RMS) 500:1. Measured with 1pg reserpine on columnMS 质量准确度(正离子)0.8 ppm RMSMS 质量准确度(负离子)0.8 ppm RMSMS 采集速率50 幅谱图/秒MS/MS 灵敏度S/N (RMS) 1500:1。测量柱上进样 1 pg 利血平MS/MS 质量准确度(正离子)2 ppm RMSMS/MS 质量准确度(负离子)2 ppm RMSMS/MS 采集速率30 幅谱图/秒TOF 质量分辨率 (FWHM) 在 m/z 118 处为 30000,与采集速率无关 在 m/z 2722 处为 60000,与采集速率无关TOF 质量范围m/z 20-10,000同位素保真度5 %四极杆分离质量范围m/z 20-4000四极杆分辨率 (FWHM)1.3 Da(自动调谐)支持的附加软件MassHunter BioConfirmClassifierMassHunter VistaFluxLipid AnnotatorMass Profiler Professional无需放真空的维护毛细管插板阀极性切换占空比1.5 s温度质量稳定性1 ppm / 3 °C离子源Dual-AJSMultiMode (ESI+APCI)Dual-ESIGC/APCIAPCINanoESI谱图内动态范围5 个数量级软件平台MassHunter工作原理:确保准确的同位素比并进行稳定同位素示踪同位素比值保真度、高分辨率和质量数准确度对化合物的确切鉴定至关重要。Q-TOF 模拟数字 (ADC) 检测系统可提供准确的稳定同位素比值。ADC 检测能够记录多离子事件,可在宽质量范围和宽浓度动态范围内进行准确的质量分配。Agilent 6546 LC/Q-TOF 的高分辨率使大肠杆菌提取物中分析物密集区域的 13C 和 2H 同位素实现了明显分离。通过四极杆分辨全离子 (Q-RAI) 提高可信度和通量在 Q-RAI 采集模式下,在离子进入碰撞池之前,四极杆会分离出一个宽 m/z 谱带,每个谱带对应一个或多个碰撞能量。因此,低能量分子离子对应于高能量谱图中的定性碎片离子,同时消除来自分离窗口外化合物的干扰离子。Q-RAI 的优势在于简单、非靶向的方法设置,可以进行回顾性分析、碎片离子确认,并减少了来自共流出碎片离子的噪声和干扰。通过四极杆分辨全离子 (Q-RAI) 提高可信度和通量为了尽可能扩大动态范围,安捷伦 Q-TOF LC/MS 系统通过两种不同的通道设置(高增益和低增益)采集数据。在创建谱图之前,由低增益通道定义的高强度点与来自高增益通道的信号对齐,这类似于高动态范围摄影,即组合不同曝光度的图像以创建一个具有更多细节的图像。通过 6546 LC/Q-TOF,使用两个 10 GHz 通道,该过程可结合高分辨率与更宽的动态范围。基于 SLIM 技术的 MOBIE 高分辨率离子淌度质谱分析MOBIE 可直接与 LC/Q-TOF 系统整合,为需要快速获得实用性见解的研究人员提供更深入的生物学相关分子信息。MOBIE 利用基于 SLIM(无损离子操纵结构)的高分辨率离子淌度质谱 (HRIM-MS) 弥补当前生物制药表征工作流程中的不足。这项颠覆性技术在缩短液相色谱分离时间的同时更全面地监测关键质量属性 (CQAs),可实现生物治疗药物的快速可重复表征。应用:利用 6546 LC/Q-TOF 的宽动态范围获得高数据采集速率在复杂的生物系统中分析内源代谢物具有挑战性。发现代谢组学依赖于通过宽代谢组覆盖范围收集定量和定性数据。6546 LC/Q-TOF 提供快速数据采集速率和宽动态范围,这是研究宽浓度范围代谢物的关键要求。与 VistaFlux 软件相结合,可以简化定性代谢流分析。食品安全、环境和法医学应用中的疑似物筛查食品安全、环境检测和法医学应用中的分析物数量不断增加,需要有效的筛查方法。配备 LC/Q-TOF Screener 软件的 6546 LC/Q-TOF 可在同一工作流程中对同一样品进行可靠的目标物定量和疑似物筛查,从而获得出色的重现性、质量准确度和线性。这种设置极大降低了数据分析的复杂性以及农药、PFAS 以及其他环境和食品污染物分析数据审查的负担。使用 6546 Q-TOF LC/MS 进行可萃取物和可浸出物 (E&L) 分析使用 LC/MS 进行 E&L 分析的一项主要挑战是鉴定复杂混合物中具有不同响应因子、分子量和浓度的疑似物、目标物和未知化合物。6546 LC/Q-TOF 具有较宽的谱图内动态范围、高质量分辨性能(在 MS 和 MS/MS 模式下)、亚 ppm 质量精度和同位素保真度,可提高鉴别提取物中这些已知或未知化合物的可靠性。MassHunter 软件可进行无看管数据挖掘和差异分析,用于化合物鉴定。
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  • 使用初级代谢物的相关性分析研究衰老的性别差异
    根据日本总务省统计局的调查,截至2023年,在日本1.25亿的总人口中,65岁以上的老年人所占比例达到29.0%,每3个人中就有1个是老年人1)。1947年至1949年出生的“婴儿潮一代”在2022年开始迎来75岁,75岁以上(高龄老年人)的人口与其他年龄层相比呈显著增加的趋势,2023年占总人口的15.5%(上一年14.9%)1)。高龄老年人的疾病发病风险高,而且容易出现长期化趋势,因此,日本专为高龄老年人制定了不同于其他年龄段的医疗制度。有论文报告称,衰老导致的身体功能变化是患病率增加的原因之一,由于衰老导致的糖代谢异常造成糖耐量下降,餐后血糖容易升高,而且,脂肪代谢异常导致肝脏中贮存的脂肪酸容量减少2)。同样是高龄老年人,不同性别的人在与年龄相关的健康状况方面也存在差异:男性更容易罹患与生活方式相关的疾病,如心脏病和中风,需要护理的情况较多,而女性则因骨骼和肌肉力量的衰退存在运动功能和独立性下降的趋势3)。推测代谢物的数量变化也对这些差异造成了影响,因此,阐明老年人代谢物数量性别差异是一个紧迫的课题。在本应用中,使用气相色谱质谱联用仪(GC-MS)检测了70至84岁的健康者血清中所含的初级代谢物。为了从检测结果中发现性别之间的差异,我们使用“多组学分析软件包”进行了分析(图1)。多组学分析软件包是一种具有多变量分析(如主成分分析、聚类分析)和数据可视化功能(如火山图和代谢图)的分析软件。下面介绍将初级代谢物检测数据转换为代谢途径图,通过不同年龄段分析和相关性分析进行性别差异分析的案例。
  • 应用代谢组学技术研究不同品质白茶的代谢物与风味特征
    本应用通过基于 UHPLC-Q-TOF/MS 的非靶向代谢组学分析方法探讨了白茶中非挥发性化合物对茶叶风味特征的影响。使用 UHPLC-Q-TOF/MS 分析茶叶的提取物,然后进行特征化合物的提取和比对,得到 1915 种化合物。基于这些化合物的主成分分析 (PCA) 和有监督的偏最小二乘差异分析 (PLSDA) 表明,三种不同品质白茶样品可以很好地分离。通过与标准品和数据库进行匹配,鉴定出多达 99 种代谢物。经由显著性检验和相关性分析发现,有显著差异的代谢物中有 41 种与风味高度相关;其中,茶氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺和 AMP 与鲜味呈正相关,而黄烷-3-醇、聚酯型儿茶素、原花青素 B3 和可可碱与苦味和涩味呈正相关。结果表明,代谢组学技术是一种有效的发现茶叶中特征代谢物的手段,这些特征代谢物有望作为潜在标记物用来区分不同品质的白茶,以应对人为掺假和标签错贴的现象。
  • 应用代谢组学批量数据分析工作流程表征细菌中的差异代谢物
    本文应用发现代谢组学的精确质量Q-TOF LC/MS 工作流程,研究了处于早稳定期和晚稳定期的细菌。所采用的软件可批量处理数据,使得数据分析更高效且实现了自动化。应用Agilent MassHunter Profinder(批量特征提取软件)总共从正离子数据中获得了488 个特征,从负离子数据中获得了623 个特征。采用Mass Profiler Professional (MPP) 进行的统计学分析揭示了细菌在早稳定期和晚稳定期丰度具有显著差异的特征。在正离子数据中,有57 个特征在早稳定期中的丰度要高于晚稳定期。而在负离子数据中,有52 个特征在早稳定期中的丰度要明显高于晚稳定期。为了理解这些代谢组学数据的生物学和生物化学背景,我们通过数据库搜索、精确质量MS/MS 谱库匹配,以及MS/MS 分子结构关联对超过100 个差异特征进行了标注和鉴定。

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  • 【讨论】农药代谢物

    请教各位,在哪里可以查到关于农药代谢物的限量标准?看过NY1500和GB2763,在前者里看到有关于克百威等少数几种农药,其残留限量中提到了它们的代谢物,其他农药则没有以前看到一个帖子说有些农药在检测时也要求检它们的代谢物,请问有没有相关的标准规定了那些农药要检代谢物?另外,国外很多农药都有代谢物的限量标准,这个标准制定的依据是什么?哪里可以得到比较全的这样的标准?先谢谢了~

  • 呋喃西林代谢物

    我们做呋喃代谢物的时候,当样品为虾时呋喃西林代谢物总是有很高的浓度,哪位高手能给解答一下。

  • 硝基呋喃代谢物的检测过柱与不过柱

    我的硝基呋喃代谢物的检测前处理一直没有过柱子,回收率一般在80%-120%之间,觉得还可以,但是商检部门还有好多检测机构都加过柱净化这一项。我曾经做过实验,发现过柱之后回收率不稳定,我觉得过柱子的过程会随着操作人员的操作有差异,进而产生误差,增加了不准确度,所以,我现在倾向于不过柱子。大家的检测都是怎样的呢?过柱净化的话用的是哪家的柱子呢?

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  • 文献解读丨基于LCMS-IT-TOF的中药同系物代谢物鉴定方法的建立:五味子木脂素在大鼠体内代谢的性别差异
    本文由中国药科大学药物代谢与药代动力学重点实验室所作,发表于DRUG METABOLISM AND DISPOSITION 38:1747–1759, 2010。 中药通常被定义为一种治疗方案,它不是由单一化合物与单一靶点相互作用组成的,而是几种化合物与多个靶点相互作用的协同药理干预。由于天然产物具有多种多样的生物活性和药用潜力,几乎每个文明都积累了使用它们的经验和知识。 最近,西方制药公司开始更喜欢用纯净的天然产品,而不是粗提取物作为药物原料。然而,在识别通过联合用药来有效对抗疾病的天然化合物或受自然启发化合物方面存在巨大的挑战。此外,体内可能存在的大量代谢物、有害药物相互作用的固有风险以及多组分制剂不可预测的药代动力学特性仍需解决。因此,中药代谢研究不仅是中药现代化的关键,而且对新药的开发具有重要意义。 中药代谢研究是一项艰巨的任务,由于中药成分复杂,代谢途径复杂,缺乏标准品,目前尚处于起步阶段。本研究基于液相色谱-离子阱-飞行时间质谱技术,建立了快速鉴定和分类中药成分代谢物的技术平台。 以五味子木脂素提取物为例,完成了体外和体内代谢研究。在体外研究中,对五种典型五味子的代谢产物进行了鉴定和结构表征。主要的代谢途径有去甲基化、羟基化及去甲基-羟基化。在体内研究中,在大鼠尿液中检测到44种代谢物。根据体外代谢规律,对这些代谢产物进行了快速鉴定和分类,并证实羟基化是木脂素在大鼠尿液中的主要代谢途径。 此外,根据在0 - 12、12 - 24和24 - 36小时采集的尿液样本的相对强度,计算雌性和雄性大鼠代谢产物的“相对累积排泄”(RCE)。结果发现,RCE存在很大的性别差异。对于大多数代谢物,雌性大鼠的RCE显著低于雄性大鼠。综上,目前开发的木脂素五味子代谢研究方法和途径将在中药代谢研究中得到广泛应用。 图1 基于液相色谱-质谱联用技术开发的中药代谢平台和工作流程图2 用LC-IT-TOF/MS测定NADPH存在时,五味子木脂素A及其代谢物在雌性(A)和雄性(B)大鼠肝脏S9中的EICs,以及五味子木脂素A可能代谢物的裂解途径(C-F)。虚线方块:潜在的去甲基化位点 虚线圆圈:潜在的羟基化位点。 综上所述,本研究基于LC-IT-TOF/MS单一平台,为解决中药代谢领域的关键问题——包括代谢产物的鉴定和分类,开发了一套系统方法论(图1)。在此基础上,利用LC-IT-TOF/MS平台对五味子木脂素的代谢产物进行了系统鉴别和分类。 首先,利用基于诊断片段离子的扩展策略对五味子木质素提取物中的五味子木脂素进行快速鉴定,并在此过程中对31种五味子木脂素进行了结构特征鉴定。 其次,基于LC-IT-TOF/MS,对5种五味子木脂素成分的标准品在肝脏和肠道S9系统中的代谢命运进行逐一研究,其主要生物转化方式包括去甲基化(-CH3)、羟基化(+OH)和去甲基化-羟基化(-CH3+OH)。 文献题目《Development of a Systematic Approach to Identify Metabolites for Herbal Homologs Based on Liquid Chromatography Hybrid Ion Trap Time-of-Flight Mass Spectrometry: Gender-Related Difference in Metabolism of Schisandra Lignans in Rats》 使用仪器岛津LC–IT-TOF/MS 作者Yan Liang, Haiping Hao, Lin Xie, An Kang, Tong Xie, Xiao Zheng, Chen Dai, Kun Hao, Longsheng Sheng, and Guangji Wang Key Laboratory of Drug Metabolism and Pharmacokinetics, China Pharmaceutical University, Nanjing, People’s Republic of China
  • 农产品加工研究所构建苹果时空品质评价代谢物数据库
    我国是世界第一大苹果生产国和消费国,2022年全国苹果产量约3500万吨。随着消费习惯的改变,人们对果实品质和营养健康效益也越来越重视,而不同品种果实在食用品质、贮藏特性、营养品质等方面存在差异。果实特征与代谢物直接关联,建立基于营养代谢物的时空品质评价数据库是提升果实品质的基础,这不仅是满足人民对美好生活向往的需要,更是农业高质量发展、乡村振兴和改善人民生命健康的重要举措。农产品加工研究所基于广谱代谢组技术构建了苹果时空品质评价代谢物数据库,包含类黄酮、酚酸、有机酸、脂质、生物碱、单宁、氨基酸、核苷酸、糖及糖醇、萜类等2575种营养代谢物。对来自全球的292份自然群体苹果品质与代谢物含量进行分析,比较了不同族系差异代谢物及其营养特征,鉴定了特征代谢物对不同品种果实鲜食、加工、贮藏等特性的影响。在此基础上,基于全基因组关联分析鉴定了222877个与2205种苹果营养代谢物显著关联的位点。这是目前最大的苹果时空品质评价代谢物数据库,从基因组层面系统解析物质代谢调控位点,为我国果实品质改良、加工适宜性和营养品质评价等提供数据支撑,将极大地促进果实品质的数字化、标识化、优质化和加工原料品种专一化,为打造农产品品牌和提升生产加工标准化提供了技术支撑。该研究成果在国际顶级期刊《Genome Biology》(IF5-y=20.366)在线发表。农产品保鲜与物流创新团队林琼副研究员、研究生陈静、果蔬加工与品质调控创新团队刘璇研究员、迈维代谢王彬博士为论文共同第一作者,毕金峰研究员为通讯作者。研究材料采自国家苹果梨种质资源圃。研究得到了国家重点研发计划(2022YFD2100100)、国家苹果产业技术体系(CARS-27)、中国农科院农产品加工研究所创新工程院所重点任务(CAAS-ASTIP-G2022-IFST-02)等项目支持。原文链接:https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-023-02945-6图 基于群体代谢视角揭示苹果品质改良机制
  • 青岛能源所提出“拉曼组内关联分析”揭示代谢物转化网络
    细胞内代谢物之间是否正在发生相互转化,是细胞代谢活动最重要的动态特征之一,但其检测方法一般极为繁琐。针对这一瓶颈,青岛能源所单细胞中心提出了名为“拉曼组内关联分析”(Intra-Ramanome Correlation Analysis IRCA)的理论框架与算法,并示范了细胞工厂功能测试等方面的应用。在无需标记或破坏细胞的前提下,IRCA仅仅基于一个拉曼组数据点(即一个样品的一个状态),利用其中不同单细胞拉曼光谱的差异,就能推测该状态下的代谢物相互转化网络。相关工作于8月31日发表于《mBio》。图 拉曼组内关联分析(IRCA)仅需一个细胞群体的一个状态,即可预测其代谢物转化网络  代谢物相互转化网络的构建,传统上基于质谱或色谱等代谢组学方法。它们通常必须破坏细胞,每次分析需要大量的细胞,而且要求基于一系列不同代谢状态的实验样品进行关联比较,这导致整个过程非常繁琐与耗时。针对这一瓶颈问题,单细胞中心提出了基于“拉曼组”(ramanome)的原创解决方案。拉曼组,是一个细胞群体在特定状态下单细胞拉曼光谱的集合。这些单细胞,尽管遗传背景与环境条件等均一致,其代谢状态却可各不相同,导致其拉曼光谱之间具有细微但显著的差异。一个“遗传同质性”样品中细胞间具有“代谢异质性”,是生命体系最本质的特性之一。  利用该本质特性,单细胞中心何曰辉博士带领的研究小组提出了命名为“拉曼组内关联分析”(Intra-Ramanome Correlation Analysis IRCA)的思路。首先,一张单细胞拉曼光谱中数百乃至数千的拉曼谱峰中,每个谱峰(或其组合)可潜在代表一个代谢表型,如一类化合物的种类与含量。其次,把每个细胞作为一个独立的生物学重复,在不同细胞之间,将同一位置的谱峰与其它任一谱峰进行两两关联分析,如果发现呈现“负关联”的峰-峰组合,即意味着其对应的两类化合物之间存在相互转化的关系。最后,将该分析拓展到单细胞拉曼光谱中所有可能的峰-峰组合,则能建立一个该状态下之胞内化合物相互转化(或代谢表型相互关联)的“网络”。  该研究小组以各种光合微藻为模式,通过一系列系统性的生物化学与遗传学实验,验证了IRCA预测结果的准确性和可靠性。这些实验证明,仅仅需要一个样品(即一个拉曼组数据点)中的数十个细胞,通过IRCA算法,就能够揭示该特定条件与时间下,细胞中蛋白、多糖、油脂、色素、核酸等各种储碳物质的相互转化规律。这些规律的快速探测,对于光合固碳细胞工厂的筛选与表征至关重要。  最后,研究人员还通过IRCA,构建了微藻、酵母、大肠杆菌等物种在多种状态下的代谢物转化网络,验证了该方法的广谱适用性,并证明这种名为IRCN(Intra-Ramanome Correlation Network)的网络有望成为一种极为灵敏、信息量丰富的代谢表型组学数据类型,来定义、表征乃至监测任何细胞体系的代谢功能。  相对于质谱、色谱等分析手段,IRCA具有超灵敏、快速、高通量、低成本(无需试剂耗材)等核心优势,因此IRCA将在合成生物学、精准医学、生态监控、生物制造等广阔领域开辟一系列全新的应用。同时,基于拉曼组概念和单细胞拉曼分选等核心器件的创新,单细胞中心发明和产业化了临床单细胞拉曼药敏快检仪CAST-R、单细胞拉曼分选-测序文库耦合系统RACS-Seq、高通量流式拉曼分选仪FlowRACS等。IRCA将通过这些原创国产的单细胞科学仪器,服务于广大的科学与产业用户。  该工作由单细胞中心徐健研究员主持完成,获得了国家自然科学基金、中国科学院先导专项、山东省自然科学基金、中国博士后科学基金的支持。  原文链接:https://journals.asm.org/doi/10.1128/mBio.01470-21  Yuehui He, Shi Huang, Peng Zhang, Yuetong Ji, Jian Xu. Intra-Ramanome Correlation Analysis unveils metabolite conversion network from an isogenic population of cells. mBio 2021, 12(4): e01470-21.
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