单细胞高通量基因检测

10x Genomics自2016年进军单细胞领域以来，最开始以经典款仪器——Chromium Controller不断开发新应用，解锁单细胞多组学。随后，为了解放科研人员的双手，减少人为误差，又推出了单细胞捕获自动化工作站—— Chromium Connect。然而，就在最近，为了满足科研工作者对更高通量单细胞捕获的需求，10x 推出了Chromium X，即百万单细胞捕获的神器，带您探索更多可能！为什么要用百万单细胞捕获神器——Chromium X？当10x Genomics的Chromium Controller问世以来，科学家就惊叹于它的高通量，一次上机，八个通道，最高通量可做到捕获8万个单细胞。如此高的通量和单细胞分辨率大大提速了科研工作者的研究，新的发现，新的成果层出不穷，高分文章发发发不停！ 但是，通过对近几年单细胞文章捕获的细胞数量的统计，我们也会发现，现在文章中所涉及到的细胞数目也越来越多了，更多的单细胞数据，有助于我们拿到更好的实验结果。并且，在我们面对一些特定的科学问题的时候，我们确实是需要百万级别的单细胞才能解开一个真相，比如说：人类器官图谱构建。对于一个器官而言，其细胞的多样性绝不是几万甚至几十万个细胞就能彻底描绘的，我们需要做到百万级别的细胞数量，才能全面的描绘一个器官所有的细胞类型，这个时候，Chromium X无疑是我们更好的选择！CRISPR筛选。在CRISPR单细胞筛选的过程中，一般需要将一种gRNA导入到80-100个细胞中，然后看其对基因的扰动。如果我们有一个1万条gRNA的库，那么我们就需要捕获百万级别的单细胞来进行CRISPR筛选，这个时候，Chromium X将是我们研究的利器！T/B细胞克隆亚型分析。对于免疫研究的老师，大家都知道TCR/BCR的克隆亚型极其丰富，如果我们只测几万个细胞，是很难覆盖所有的克隆亚型的，这个时候，Chromium X将给您带来更大的帮助！更重要的一点是，如果您使用Chromium X进行高通量单细胞捕获，还可以大大降低单个细胞的捕获成本。Chromium X，捕获原理是什么？ Chromium X的单细胞捕获原理还是基于Next GEM的微流控捕获原理，细胞和反应试剂及Geal Beads被包裹在一个油滴里。每个油滴形成一个微反应体系，同细胞里的RNA被标记上相同的10x Barcoded。测序后，对单细胞数据进行拆分。不过，Chromium X有16个通道，每个通道最多可以捕获2万个单细胞。此外，现在10x Genomics的仪器还支持混样（CellPlex），一个通道最多可以混12个样本，混样后，一个通道最多可以拿到4.6万个单个细胞，一次上机，最多可以拿到73万个单个细胞（该数字是去除双细胞拿到的最终单个细胞数量）。双细胞捕获率为0.4%/1000个细胞。上机一次运行的时间不超过18min。此外，X还加入了温控装置，确保拿到的数据质量更高。Chromium X，可以做哪些应用？ 高通量版本的Chromium X，不仅可以实现之前的Chromium Controller的单细胞3端转录组解决方案，同时还可以进行细胞表面蛋白的检测，CRISPR单细胞大规模筛选，靶向捕获，及混样（CellPlex）；还可以实现基于5端RNA捕获的单细胞免疫组解决方案，检测单细胞全长配对的VDJ序列，细胞表面蛋白检测，抗原特异性检测，靶向捕获，CRISPR筛选（2022年推出），混样（2022年推出）。此外Chromium X还可以兼容Chromium Controller 的试剂和芯片。也就是说，您可以直接将八个通道的Chromium Controller芯片用于Chromium X上，并且这个时候，我们就可以在Chromium X上实现Chromium Controlle的所有应用，如单细胞ATAC，单细胞ATAC+mRNA等。Chromium X 物理参数展示重量 ：18.8 kg体积：宽 x 深 x 高=28.6 厘米x 48.3 厘米x 27.3 厘电气要求：100–240 VAC, 50/60 Hz, 250 W，90–264 V 工作范围（额定值的 +/- 10%），过压类别 II（标准插座）工作温度：18–28°C湿度：30–80% R.H. 非冷凝海拔高度：0-2286 米电源线长度：2 m-包括特定国家/地区的适配器Chromium X 数据展示10x内部数据测试，在Chromium X上用Chromium Controller的芯片和试剂（可以叫做标准试剂芯片）进行单细胞转录组，免疫组，ATAC及ATAC+mRNA的实验，然后与Chromium Controller仪器上获得的数据进行对比，发现二者的相关性系数很高，说明Chromium X完全兼容Chromium Controller的芯片和试剂，所以大家不必有顾虑！此外，10x还在Chromium X上做了使用高通量试剂芯片和标准试剂芯片的数据比较。实验中使用新鲜骨髓穿刺样本，获取单细胞悬液，用130个抗体进行孵育，然后过流式筛选孵育上抗体的细胞，然后分别进行Chromium X高通量单细胞捕获和Chromium X标准通量捕获，最终标准通量捕获到8269个细胞，高通量捕获到17581个细胞，然后进行单细胞转录组，VDJ，细胞表面蛋白的检测。根据检测结果，我们发现，高通量捕获的细胞数量多，更能检测出一些稀有的细胞类型，以及低丰度的TCR克隆亚型。

一、上海保圣高通量单细胞流变仪产品介绍高通量单细胞流变仪，即用于测定聚合物熔体，聚合物溶液、悬浮液、乳液、涂料、油墨和食品等流变性质的仪器。分为旋转流变仪、毛细管流变仪、转矩流变仪和界面流变仪。上海保圣高通量单细胞流变仪可用于测定聚合物熔体，聚合物溶液、悬浮液、乳液、涂料、油墨和食品等流变性质的仪器。上海保圣高通量单细胞流变仪可用于观察高分子材料内部结构的窗口，通过高分子材料，诸如塑料、橡胶、树脂中不同尺度分子链的响应，可以表征高分子材料的分子量和分子量分布，能快速、简便、有效地进行原材料、中间产品和最终产品的质量检测和质量控制。流变性能测量是高聚物的分子量、分子量分布、支化度与加工性能之间构架了一座桥梁，所以它提供了一种直接的联系，帮助用户进行原料检验、加工工艺设计和预测产品性能。二、上海保圣高通量单细胞流变仪主要功能及应用范围上海保圣高通量单细胞流变仪可应用于食品（液态、固态、凝胶、分散体系）、发酵、化工、医药、纺织、农业等行业的多种检测，适合于蛋白、多糖等大分子亲水胶体材料的流变特性测定，包括任何粘度的流体、软固体、聚合物、凝胶和分散液的流变特性研究。由于食品物料的流变特性与食品的质地稳定性和加工工艺设计等有着重要关系，所以通过对食品、化工材料流变特性的研究，可以了解食品、化工材料的组成、内部结构和分子形态等，能为产品配方、加工工艺、设备选型及质量检测等提供方便和依据。通过流变仪检测，可进行食品、医药的质量监控、食品研发以及食品工程设计。1. 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于聚合物领域上海保圣高通量单细胞流变仪应用于微悬浮法PVC增塑溶胶凝胶化和熔化特性的研究；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于PVC物料标准流变曲线；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于聚合物研究，通过记录物料在混合过程中对转子或螺杆产生的反扭矩以及温度随时间的变化,可研究物料在加工过程中的分散性能,流动行为及结构变化(交联,热稳定性等),同时也可作为生产质量控制的有效手段；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于r-PET/ABS复合材料的制备及其结晶动力学研究；{C}2. {C}{C}上海保圣高通量单细胞流变仪应用于食品流域上海保圣高通量单细胞流变仪应用于酱料制品流变性能研究；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于食品配方及工艺研究；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于在馒头品质分析中的应用浅探；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于不同链/支比玉米淀粉的形态及其在有/无剪切力下糊化的研究；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于蕨根淀粉的颗粒形态与糊化特性研究；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于番茄酱制品的流变特性比较；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于蓝莓发酵副产物制作低糖果酱的工艺研究；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于巧克力的粘度测定，用旋转流变仪对巧克力原料进行质量控制；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于旋转流变仪在油脂研究中的应用。3. 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于化妆品领域上海保圣高通量单细胞流变仪应用于凝胶流变性能研究 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于乳状液体系流变性能研究 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于表面活性剂流变性能研究 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于油包水型乳化化妆品 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于普鲁兰多糖对牙膏流变学性能影响的初步研究 4. 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于胶体领域上海保圣高通量单细胞流变仪应用于高分子水凝胶材料的流变学研究方法；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于合成水凝胶的流变学性能及相关生物材料的基础研究；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于新型天然高分子多糖智能水凝胶生物材料的制备及性能研究；上海保圣高通量单细胞流变仪应用于天然蚕丝丝素蛋白在不同油/水界面的粘弹性和稳定性研究。{C}5. {C}{C}上海保圣高通量单细胞流变仪应用于石油领域 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于石油钻井泥浆检测中的应用； 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于生物降解材料流变性能的研究； 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于沥青性能评价方面的应用； 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于含蜡原油触变性实验； 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于胶质液体泡沫的流变性； 上海保圣高通量单细胞流变仪应用于低温凝胶类调堵剂溶液的流变性。

液滴微流控细胞分选仪（Droplet Entrapping Microfluidic cell-sorter）是基于液滴微流控技术开发而成的超高通量单细胞分选平台。通过使用最新的微流控技术，每秒可以发生成千上万的微液滴（pL），细胞包裹于微液滴之中，可进行生长、裂解、代谢、反应等生物生化过程，并与液滴之中的荧光筛子进行充分结合，产生不同强度的荧光信号；之后利用微液滴分选技术将低产出和高产出的细胞通过荧光信号分选出来，实现分选过程的高通量化。高通量皮升级液滴单细胞分选系统DREM cell相比于传统孔板筛选体系，该系统筛选速率提高104倍，试剂消耗量下降至1/106。相比于流式细胞仪，该方法可对酶的各种性质（表达量、活性、稳定性、立体选择性、底物特异性等）、代谢产物、抗体等标靶进行高效分选；仪器操作简单方便，对样本污染风险小，无损害，耗材随用随弃，无污染残留。分类技术参数液滴体积1-1000PL荧光激发与检测液滴生成频率0-10000个/s单波长激发与检测可选波段（二选一）（1）激发波长488nm，检测波长525±15nm，灵敏度1μM荧光素/单液滴（2）激发波长532nm，检测波长578±11nm，灵敏度100nM试卤灵/单液滴液滴分选频率0-1000个/s微注入速度0-1000个/s（选配）样品低温控制系统4℃恒温控制，±0.5℃工作环境常压状态下，室温，30%≤湿度≤80%，洁净暗室整机功率600W应用范围细胞、酵母、细菌、蛋白、核酸等高通量皮升级液滴单细胞分选系统DREM cell应用展望：酶分子进化、抗体筛选、合成途径研究、功能细胞研究、单细胞测序、功能酶挖掘、代谢物筛选、分解途径研究、体外诊断平台、液滴PCR等