我觉得,主要看你用着仪器干什么。
做色谱的人觉得,质谱就是一个检测器,虽然这个检测器比色谱本身还贵很多倍。做质谱的人觉得色谱就是一个样品的前处理装置。
在兼容性方面,我个人觉得这不是问题,现在的质谱厂商和液相厂商之间都有协议,尤其没有自己液相的厂商,如ABI,Bruker,Thermo,这些厂家的质谱基本上可以和所有知名液相相连。但waters和aglient的质谱,和液相的兼容性就不好。另一方面,质谱厂商得到的只是接口方面的资料,在处理液相数据(DAD等)方面,功能肯定不如专业的液相色谱软件强大。但一般情况下,既然都液质联用了,还有多少人重点关注液相数据呢。