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【原创】化学信息学: (2)-1-3-0 Beilstein 印刷版查找流程介绍

sslin

2011/05/22

北大林崇熙教授专版

化学信息学: (2)-1-3-0 Beilstein 印刷版查找流程介绍

由以下范例, 介绍 Beilstein 印刷版对化合物的查找步骤. 说明如下:

1. 查找目的: 搜寻目标化合物 (target compound I) 的原始文献, 以获得合成制备信息.

2. 第一步, 先经由结构简化规则, 转换成 Register compound:
在 Beilstein 丛书中进行查找的化合物结构, 不是 I, 却是另一个结构 II.

II 为目标化合物 I 的简化形, 称为 "register compound" (母体化合物, 注册化合物). II 可能为真实存在也可能是虚拟无法合成的化合物.
目标化合物 (I), 转成这母体化合物 (II), 涉及到三种简化规则. 详细情况请阅读 "结构简化规则" 章节.
本范例中, 目标化合物 I 的 –C=NOH, 经 "水解" 转换成母体化合物 II 的 –C=O.

3. 查找 Register compound II 在哪一卷中:
Beilstein 每一套书有 27 卷, 每卷又有许多本 (本范例题, 从 H 查找, 指的是第一套丛书, Haupwerk).
查找 II 在哪一卷报导, 涉及到卷数 "定位规则". 由横坐标的骨架类型以及纵坐标的取代基类型, 可以判定化合物 II属于哪一卷报导. 另有章节仔细介绍.
在本范例中, II 为直链形, 含有羰基, 经查表应该在第一卷中..

4. 从已知卷, 进行直接或间接查找.
a. 直接查找: 分子式法, 最简洁.
从第一卷末的分子式索引查找, 如果本卷报导有目标化合物 (I), 可直接快速达到目的. 例如本范例, 分子式索引提示在 798 页可以找到目标化合物 I.
需要注意的是, 查找的是最终目标化合物 (I) 的分子式, 不是母体化合物 (II) 的分子式.
分子式法的缺点: 可能该分子式存在许多同分异构物, 加上德文困难, 查阅存在一定的困难度.
b. 间接查找: 同分异构物法, 为按部就班的方法.
i. 首先查找该卷中的分子式分类位置: 分子式的饱和度类型
母体化合物 II 的分子式为 C₈H₂₄O₂, 按饱和度分类, 属于 C_nH_2n-2O₂ 型. 符合本类型的有 C₃H₄O₂ 等, 按照 C 数目在第 792 页得到 C₈H₁₄O₂ 类型.
ii. 从同分异构物中找到母体化合物 II:
符合此类型的都是同分异构物, 例如范例流程给出的其中 4 个化合物例子.
iii. 从母体化合物 II 中, 由衍生物的身分寻目标化合物 I.
II 是 I 的结构简化化合物, I 则算是 II 的衍生物. 找到 II 后, 查找其衍生物, 在本范例中, 在 798 页找到目标化合物 I.
5. 得到目标化合物, 进一步得到原始文献. 完成目标.

范例流程图最下面的 " Bouveault, Locquin, B1 [3] 35, 653.", 前面是作者名, B1 是期刊的缩写. 其缩写全称可以从 "德国化学文摘" 中查到. 由于缩写过于简捷, 很难推测期刊全名; 第五套 Beilstein 丛书中, 开始使用美国化学文摘 CASSI 的期刊缩写方法.

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yuduoling

第1楼2011/05/22

多谢教授，受教了。

0

大陆

第2楼2011/05/23

根据我粗浅的德语语感，这应拼写为Hauptwerk?
sslin(sslin) 发表:每卷又有许多本 (本范例题, 从 H 查找, 指的是第一套丛书, Haupwerk).

0

sslin

第3楼2011/05/31

谢谢大陆, 你是对的.
第一套书 "正编" 为 Hauptwerk; 以后的套书 "补编" 为 Erganzungswerk.
我德文修了两年半 (包括在美国读的), 到现在仍然差.
修读德文之辛苦, 改天有机会和懂德文的好好聊聊.

0

sslin

第4楼2011/10/31

范例 2

碳上含的基团经水解得到双 –OH, 进一步脱水形成酮类. 属于直链化合物, 含一羰基, 将报导在第一卷. 由简化后化合物 (Registry Compound) 的分子式 (C5H10O), 不饱和度相当于 CnH2nO, 在第一卷 676 页找到 C5H10O 的各种同分异构物, 其中包括有醛类同分异构化合物, 找到目标化合物后, 从其各种衍生物中, 找到所要的目标化合物. 快速从第一卷的分子式索引, 查找目标化合物 (非简化的化合物) 的分子式 (C5H13O4P), 在 677 页找到所要的信息.

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