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请问如何用JEMS建立两相界面模型

透射电镜(TEM)

  • 比如GaN/AlN界面的高分辨如何模拟,求高手解惑,自己试了半天,只能有一种物质的高分辨,根本没有界面结构出现,无头绪。
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  • 洪星二锅头

    第1楼2012/06/18

    JEMs的模拟,USTB他们几位比较在行,等待他们的回复吧

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  • yihuiiii

    第2楼2012/06/18

    挂了几天了,莫非问题太简单,求解惑或科普。

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  • 洪星二锅头

    第3楼2012/06/18

    应该是问题太专业了,涉及模拟这一块,需要专门做这个的才能给予比较准确的答复,我的模拟是半路出家,不能给予你准确而全面的答复,抱歉

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  • yihuiiii

    第4楼2012/06/18

    哦,那就等高手吧,话说看了好几天manual了,只找到了grain boundry,但是位置的详细定义怎么写,难道每个点的坐标都要输入不成,

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  • perpetualcat68

    第5楼2012/06/18

    会一相,就会二相。看看介绍就行了。

    实在怕麻烦,就看看stem cell 里的介绍,两个一拼就出来了。

    看过一大师写的,就是把人家的翻译一下,怎么就成了自己写的了。

    满世界到处都有的东西,大师还要如此沾光。

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  • yihuiiii

    第6楼2012/06/18

    楼上要是会的话,就指导个步骤出来,别看着我们这些摸不着门的干着急啊。

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  • yihuiiii

    第7楼2012/06/18

    楼上要是会的话,就指导个步骤出来,别看着我们这些摸不着门的干着急啊。

    perpetualcat68(perpetualcat68) 发表:会一相,就会二相。看看介绍就行了。

    实在怕麻烦,就看看stem cell 里的介绍,两个一拼就出来了。

    看过一大师写的,就是把人家的翻译一下,怎么就成了自己写的了。

    满世界到处都有的东西,大师还要如此沾光。

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  • w4m0330

    第8楼2012/06/18

    我的做法是,用建立一个大的单胞,P1空间群,每个原子的坐标位置自己用excel等表格工具算出来。(这个方法其实JEMS的web help文档里头有提到,以及它支持的文件说明都有,自己耐心找找吧)有些小麻烦,不过可以大概看看拿来用。这个方法简单,但是要研究界面的话就没有太大作用了,因为所有原子的位置都是你自己手动输入的,界面模型也是你假定的。
    要精确一些的,可以找Molecular Dynamic (MD)的合作者,帮你建大的单胞,然后弛豫结构。要是复杂一些的结构,MD没有现成经验参数的,某些参数可能还需要DFT之类的ab initio方法先算出来。

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  • yihuiiii

    第9楼2012/06/18

    是这样么,那就麻烦的多了。以前用过crystalkit,建两个单胞,然后interface,可以手动设定弛豫,然后从大的范围内选定包含界面上下信息的二维单胞另存为一个超原胞,直接就可以导入mactempsx模拟了,对于原子的坐标信息没有直接的认识,导致了理解不深入,楼上提到的方法我也有想过,但是对于每个原子的位置都手动输入,这个有点头疼。你所说的坐标位置能计算出来,是根据方法,能详细说说么,另外一般界面为二维的,z方向的坐标怎么设置,要不要特殊考虑。

    w4m0330(w4m0330) 发表:我的做法是,用建立一个大的单胞,P1空间群,每个原子的坐标位置自己用excel等表格工具算出来。(这个方法其实JEMS的web help文档里头有提到,以及它支持的文件说明都有,自己耐心找找吧)有些小麻烦,不过可以大概看看拿来用。这个方法简单,但是要研究界面的话就没有太大作用了,因为所有原子的位置都是你自己手动输入的,界面模型也是你假定的。
    要精确一些的,可以找Molecular Dynamic (MD)的合作者,帮你建大的单胞,然后弛豫结构。要是复杂一些的结构,MD没有现成经验参数的,某些参数可能还需要DFT之类的ab initio方法先算出来。

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  • w4m0330

    第10楼2012/06/18

    z方向就是电子穿透的方向。比如Si[110]方向投影,简化到P1群的话,就是4个原子:
                x            y                z

    1 0.0000000 0.0000000 0.0000000
    2 0.0000000 0.2500000 0.5000000
    3 0.5000000 0.7500000 0.5000000
    4 0.5000000 0.7500000 0.0000000
    复杂的系统就是在这种简单的基础上搭建起来的。
    yihuiiii(yihuiiii) 发表:是这样么,那就麻烦的多了。以前用过crystalkit,建两个单胞,然后interface,可以手动设定弛豫,然后从大的范围内选定包含界面上下信息的二维单胞另存为一个超原胞,直接就可以导入mactempsx模拟了,对于原子的坐标信息没有直接的认识,导致了理解不深入,楼上提到的方法我也有想过,但是对于每个原子的位置都手动输入,这个有点头疼。你所说的坐标位置能计算出来,是根据方法,能详细说说么,另外一般界面为二维的,z方向的坐标怎么设置,要不要特殊考虑。

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