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新药研发——数据库

中药/天然药检测

  • 在研发新药时,一般会做一些前期的准备工作,查询有关的毒理,药理等资料,这里介绍一些常用的数据库。
    1 急性毒性数据库 http://www.cerc.usgs.gov/data/acute/acute.html
    简介:本数据库为哥伦比亚环境研究中心(CERC)自1965年起对410种化学物质和66种水域动物所进行的4,901项急性毒性测试结果,并分析了各种不同因素(温度、水硬度、pH值等)对结果的影响。检索者可通过“Searchable Database of Acute Toxicity Data”直接检索,也可在“ID Database”中先下载ID数据库(其中包括物质的化学分类名、化学名称、用途、毒性剂量单位、CA登录号)再编辑查寻。

    2 化合物毒性相关数据库 Toxnet http://toxnet.nlm.nih.gov/
    Toxnet是美国国家医学图书馆(nlm)的化合物毒性相关数据库,包括药品毒理学、危险化学品和其它相关领域的信息,从Toxnet可对下列子数据库进行检索: HSDB (危险化合物数据库):内含4500种毒性(或可能具有毒性的)化学药品,以及其毒性、对环境的影响、化学安全性、废弃物处置等相关领域的信息。 TOXLINE? :包括药物和其它化学物质的生物化学、药理学、生理学、毒理学的文献数据库。其中有300万条引文、几乎都有摘要和/或检索条、以及CA登录号。 ChemIDplus :对NLM数据库中的化学物质提供结构式和专业信息。 IRIS (综合风险信息系统):由美国环保署 (EPA)建立的在线数据库,内含500多种化学物的EPA致癌和非致癌性健康危险评估。 TRI (毒性化学药品的排放调查) :内含1995-1999年每年向外界排放的毒性化学药品估计量,其中包括这些化学物质的名称、性状描述,以及排向大气、水域或土地的毒性化学物质量。
    CCRIS (化学致癌作用研究信息系统) :内含8,000多种化学物质短期或长期生物分析所得的评估数据及信息。这些分析涉及到致癌物、诱变剂、辅致癌物质和肿瘤启动物质、致癌物的抑制剂和代谢物。 GENE-TOX:内含 3,000 多种化学物质的基因毒理学测试结果。 DART?/ETIC (发展与再生毒理学/环境畸形学信息中心):本库收录了自1950年来 发表的有关畸形学和发展毒理学的文献
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  • 儒雅凤

    第1楼2012/10/25

    3 SpectraOnline,Galact http://spectra.galactic.com/SpectraOnline/ Default_ie.htm
    可在线检索各类图谱。检索方式有:化合物名称(Compound name)、CA登记号(CAS number)、分子式(Molecular formula)、分子量(Molecular weight)、通过图谱的匹配。检索得到的结果有以下内容:化合物名称、分子式、分子量、摘录号、熔点、沸点、同义词、结构式。收录的图谱有:红外图谱(FT-IR)、碳谱(13CNMR Spectrum、氢谱(1HNMR Spectrum、质谱Mass Spectrum、拉曼光谱(Raman Spectrum)、紫外图谱(UV/Vis spectrum)。并介绍各试验样品的来源、图谱的出处等。如果是该数据库的注册用户,还可以向数据库上传自己的图谱或文件。

    4 临床药物试验研究信息 http://clinicaltrials.gov/
    ClinicalTrials.gov给病人,病人家属,卫生保健专业人员及公众提供有关在各种疾病中进行的药物临床研究信息。美国国立卫生研究院(NIH)与所有的NIH研究所和FDA合作,通过其国立医学图书馆(NLM)建立了这个网站。 ClinicalTrials.gov于2000年2月开通,目前包含由NIH、其他联邦机构及遍布全球75000多个地方的制药企业发起的约6800项临床研究。数据库中列出的临床研究主要在美国和加拿大进行,但包括在约80个国家中的临床研究点。
    从ClinicalTrials.gov中可以获得的一项临床研究资料有:临床研究方案摘要包括:研究目的概述;参与者招募情况;病人参与标准;研究地点和具体联系方式;其它信息包括:研究设计;研究阶段;研究中使用的药物或疗法及用于何种疾病;并与包括MEDLINEplus和PubMed在内的医药网站中的相关疾病主题链接。

    5 化学数据库
    NIST的Chemistry WebBook http://webbook.nist.gov/chemistry/
    它是美国国家标准与技术研究院NIST的基于Web的物性数据库,Chemistry WebBook可以看作是NIST的标准参考数据库Standard Reference Data中一部分与化学有关的数据库的Web版本,可通过分子式检索、化学名检索、CAS 登录号检索、离子能检索、电子亲和力检索、质子亲和力检索、酸度检索、表面活化能检索、振动能检索、电子能级别检索、结构检索、分子量检索和作者检索等方法,得到气相热化学数据、浓缩相热化学数据、相变数据、反应热化学数据、气相离子能数据、离子聚合数据、气相IR色谱、质谱、UV/Vis色谱、振动及电子色谱等。

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  • 儒雅凤

    第2楼2012/10/25

    6 有机合成手册数据库(OS) http://www.orgsyn.org/
    简介:Organic Syntheses作为有机化学的重要参考丛书,以标准格式阐述了有机化合物合成的详细实验方法,由John Wiley & Sons, Inc公司出版,至今已有79年度卷和9卷累积合订本。Organic Syntheses中收录的化合物制备方法以及新的反应等,自1921年开始均由Roger Adams of the University of Illinois的科研领域的研究生及化学专业人员进行重复,确保稳定的反应收率。现在Organic Syntheses在网上拥有了对所有化学家免费的数字版本,OS Board of Directors由DataTrace和CambridgeSoft公司资助,摘录已经、现在或是将要出版的Organic Syntheses各卷,制作成网络版的可检索全部记录的累积合订本。用户必须事先在可上网的计算机上安装CambridgeSoft公司的Chemdraw Ulta7.0版,然后登录该网站,经过免费注册,即可通过文本、结构式以及图片来检索所需合成化合物的制备方法。

    7 化合物基本物性库 http://chemfinder.camsoft.com
    简介:该库除提供化合物的基本物性如熔点、沸点、闪点、密度、在水中的溶解度等外,更重要的是它建立了与Internet上其他节点的索引,通过查询该库,除获得基本物性外,还得到一些链接。通过这些链接,获得其他节点的数据库或Web页面所包含的关于被查化合物的有关信息

    8 溶剂数据库SOLV-DB http://solvdb.ncms.org/solvdb.htm
    简介:美国非赢利组织National Center of Manufacturing Sciences的溶剂数据库提供了100余种常用溶剂的数据,虽然数据库不大却很实用。从中可检索到溶剂的物性数据、安全使用溶剂的数据、对健康是否有害的数据、对大气等环境影响的有关数据以及供应商。如果知道特定溶剂的供应商,可以得到下述内容:此供应商的联系方法;此供应商可提供的所有溶剂列表。

    9 三维结构数据库NCI-3D http://chem.sis.nlm.nih.gov/nci3d/
    简介:美国癌症研究所NCI建立,可通过数据库进行化学结构的检索和三维化学结构的显示。可通过记录号、NCI标号、CAS登录号及分子式检索NCI-3D数据库中213628条记录的3D模型,也可以显示其类似结构。也可以通过结构检索,分为含有此结构及其它原子的结构检索、相似的结构检索和精确结构检索。

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  • 儒雅凤

    第3楼2012/10/25

    10 化合物信息资源库 http://www.chemacx.com/
    简介:该数据库收集了全球300多个化学试剂供应商的产品目录,由CambridgeSoft公司提供。用户无需注册,通过化合物的CAS登录号查询所需化学试剂的供应商,包装及价格。在2002年12月31日之前,经过注册可以利用该站点提供的电子商务直接购买所需化学试剂,从2003年开始,chemacx只提供化学试剂的查询服务。

    11 有机合成文献综述数据库 http://www.thieme-chemistry.com/ ... als/info/index.html
    简介:Synthesis Reviews收录了有机合成化学领域中来自期刊或书籍的专业综述性文章,从1970年到2001年,共收录了14,792篇英文综述记录。该数据库由Georg Thieme Verlag公司开发,该网络版本包括先前作为赠品送给SYNTHESIS全年订户的70年至1994年磁碟版和后来1995年至2001年的增补版的数据,数据每半年更新一次。数据记录为压缩文件,可从该站点直接下载。

    12 预测LogP和LogW http://www.logp.com/
    简介:Interactive Analysis LogP and LogW (water solubility) predictor基于MolconnZ分子索引238个化合物的基础之上,从理论上精确计算了一些已知化合物的13,000多个油水分配系数LogP值以及4300个化合物在25°C下非缓冲体系的水溶液中溶解度LogW。该数据库由Syracuse Research Corporation, SciVision, Albany Molecular Research, Inc., eduSoft LC, Cambridge Soft.等公司协作开发,用户可通过输入the SMILES编码来查询这些化合物LogP和LogW计算值。

    13 Chemical Information http://chem2.sis.nlm.nih.gov/chemidplus/chemidlite.jsp

    14 FDA (www.fda.gov)

    15 SFDA (www.sda.gov.cn

    16 国家科技图书文献中心 http://www.nstl.gov.cn/index.html

    17 中国医药信息网数据库 http://www.cpi.gov.cn
    18 中国中医药信息网数据库 http://www.cintcm.ac.cn

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  • 阿三

    第4楼2012/10/25

    这些数据库真的很有用

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  • xiaowang268

    第5楼2012/10/25

    不错,太有用了

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  • xiaowang268

    第6楼2012/10/25

    这些数据库收费吗?

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