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单抗CE-SDS分析结果解读

  • threetigers107
    2012/12/18
  • 私聊

毛细管电泳(CE)

  • 如题,用CE-SDS方法分析单抗,做了一段时间,也有了一些数据,但不知道该怎样准确理解这些数据。

    首先Becman提供的一个文献里(见附件),作者测了一个已知NG(non-glycosilation)含量为9%的IgG,分别在reduced和Non-reduced条件下测定。结果是,两个条件下测出的NG含量基本一致,接近理论值,并且重链和轻链的比例也是接近2.

    而我现在做的那个抗体,在reduced条件下和在non-reduced条件下测得的NG含量差异较大,reduced条件下的要明显低于non-reduced的。并且重链和轻链的比值不是接近2,而是2.5。我用PNG酶切过之后,NG出峰位置含量明显增加。另外我还做了几个stressed的样品,比如双氧水氧化的,比较明显的是在Intact-mAb(non-reduced条件)和重链前(reduced)出现很大的峰。

    下面是几个问题:

    1. 理论上,reduced条件下测得的NG含量应该是和Non-reduced条件下测得的接近(同文献)还是说其实这是CASE BY CASE的?因为是和UV吸收有关,如果几个有紫外吸收的氨基酸在轻重链上的分布不均衡,比如在轻链上更多,那轻链的响应值就会比较高,这样轻重链的比值就不是简单的1:2了。而NG的含量在两个条件下也就不一定相关了。

    2、双氧水处理之后产生了Mw不一样的峰,可能是什么东西,是破坏了什么键产生的?

    3.为什么单抗的CE-SDS分析通常都做还原和非还原的条件,二者所得的数据是怎样互补的?

    谢谢大家的答疑解惑,欢迎交流!

    补充一个疑问,是关于还原和非还原条件的。还原条件用的是巯基乙醇,打开二硫键;非还原条件用的是250mM的碘乙酰胺。我经常在文献上看到是这么说的:还原时先用巯基乙醇打开二硫键,然后再加烷化剂碘乙酰胺保护已生成的巯基,避免重新生成二硫键。然后我就很纳闷,那为什么再做CE-SDS的时候,还原时用了巯基乙醇后不再加烷化剂保护巯基,而非还原的时候为什么要加碘乙酰胺,是要保护单抗中的游离巯基么(没理由啊??)
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  • nini2006

    第1楼2012/12/19

    1 不认为是 case by case, 应该是固定值: 2. 如果因为氨基酸分布不均衡的原因,那也只是响应值上的差别而不应该是轻重链数目之间的差别。既然有这个怀疑你就需要确定他们的氨基酸序列,然后选用合适的定量方法(内标或者外标法)。
    2 monoclonal antibody 前面的未知峰,个人认为是 反应后的副产物。如果不是你要分析的对象无需去纠结它。
    3 Non-reduced就是保持它的立体结构,reduced就是破坏其三四级结构成为一级结构。至于为什么要同时比较这两者的差别,没做过,真心不懂。

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  • nini2006

    第2楼2012/12/19

    non-glycosilation是否应该为non-glycosylation?

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  • threetigers107

    第3楼2012/12/21

    是的,我拼错了,抱歉~

    nini2006(nini2006) 发表:non-glycosilation是否应该为non-glycosylation?

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  • irisqk

    第4楼2015/07/23

    学习了 最近在做CE-SDS 100ug蛋白上样 但是峰高总是很低 不知道为什么T_T

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  • momoiro

    第5楼2015/12/15

    可能是你的样品中盐离子浓度有点高,在盐离子浓度高于50mM时是需要换液的。

    irisqk(v2915173) 发表:学习了 最近在做CE-SDS 100ug蛋白上样 但是峰高总是很低 不知道为什么T_T

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  • CEcret

    第6楼2015/12/21

    回答你的问题:
    1. 首先你确定你已经使用了迁移时间校正过的峰面积来计算百分含量.这个方法的测定波长为220nm/214nm,所有的氨基酸在这样的低波长条件下的吸收系数近似。不存在你说的那种情况。
    2。HC或者Intact前面的峰,通常是由于stress条件,完整蛋白裂解的产物,例如HH, 或者HHL等。如nini斑竹所说,这样的组分峰在你的研究中无太大的实际意义。因为你采取的处理条件不同,所得到的裂解产物及含量也会不同。
    3。从法规角度来说,Red是研究单抗的异质性,重点考察NG所占有的比例。而Non Red考察的可以认为是纯度相关的信息。但是由于反应条件是高温且存在其他试剂,此测定结果并非Natural状态下单抗的纯度。如果希望研究Natural条件下的纯度,请寻求合适的CZE或者MEKC方法。
    4。Red时,还原剂是过量的,因此没有必要加IAM保护。Non Red时加IAM确实是为了保护可能存在的活性基团。在高温时你知道,一切皆有可能的。。。。

    希望对你有所帮助。。。。

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  • CEcret

    第7楼2015/12/21

    就目前来说,CESDS做单抗是研究得比较多也比较透彻的。而采用这个方法作某些其他蛋白(例如糖蛋白)时,可能会存在相互作用等某些问题。导致你的峰比较胖。

    irisqk(v2915173) 发表:学习了 最近在做CE-SDS 100ug蛋白上样 但是峰高总是很低 不知道为什么T_T

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  • p3163167

    第8楼2016/11/24

    你好!我想问一下,你所说的样品离子浓度高于50 mM时需要换液。那这个50 指的是最终进样时的盐离子浓度吗?

    momoiro(momoiro) 发表: 可能是你的样品中盐离子浓度有点高,在盐离子浓度高于50mM时是需要换液的。

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  • p3163167

    第9楼2016/11/25

    你好!我想问一下,你所说的样品离子浓度高于50 mM时需要换液。那这个50 指的是最终进样时的盐离子浓度吗?

    CEcret(v2812644) 发表: 就目前来说,CESDS做单抗是研究得比较多也比较透彻的。而采用这个方法作某些其他蛋白(例如糖蛋白)时,可能会存在相互作用等某些问题。导致你的峰比较胖。

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