测定蛋白分子量

应助达人

应该是MALDI好一些

1.你的蛋白纯吗，纯度大概有多少？
2.你的样品在什么缓冲液中？
3.你的蛋白上有翻译后修饰吗？比如是否有糖基化位点，有几个？
4.你想得到的结果允许的误差是多大？

你的蛋白分子量大概范围是多少啊？

我们这边分子量大的蛋白不是用质谱来测的。

ESI源和MALDI源都可以做，各有优势。
ESI源的质谱做的结果更加准确，但是数据处理比较复杂，需要对多电荷的质谱图进行去卷积处理才能得到分子量。
MALDI源的质谱数据更加直观，但是误差会稍微大一点。

专业回答

我们实验室常用ESI-TOF做蛋白质分子量测定，但ESI对于膜蛋白这样的溶解度极小的样品用Maldi-TOF更合适一些。高分辨质谱质量做的是否准确与校正有关系，ESI可实现多点校正，而Maldi-TOF通常只用某几个分子量相近的蛋白做标样，因此，ESI准确度通常要好一些。