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有没有哪位大神愿意分享一下DM软件的一些操作

透射电镜(TEM)

  • 悬赏金额:20积分状态:未解决
  • 如题,我们得到的高分辨的图片,都会用DM软件进行处理,有没有哪位大神,愿意分享一下自己用DM软件进行数据分析的一些经验?
    如,1. HAADF image经常会漂移,如何用DM软件进行校正?2. 图像信噪比低,如何提高信噪比?(据说DM里有个PCA降噪插件,目前还不知道怎么用)
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  • 小M

    第1楼2018/12/25

    应助达人

    前排搬个小板凳学习

    楼主说的PCA降噪插件是不是FFT后加mask,再iFFT?

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  • Jin

    第3楼2019/03/12

    HAADF的图像漂移,首先需要从源头解决。简单方法如下:
    1) 需要用短驻留时间多次扫描同一区域,然后需要用image alignment或类似的插件将多张照片对齐(最好是sub pixel对齐),最后将多张照片加和。达到提高信噪比,降低漂移的目的
    2) 需要在扫描时,改变电子束的扫描方向。比如0度(相对于笛卡尔坐标系)时扫描一张,45度时扫描一张,90度扫描一张,设样品漂移是系统漂移且沿着笛卡尔坐标系的t方向。 解方程组可以得到这个系统漂移并校正。 可参看:Ultramicroscopy 138 28-35 (2014)。APL 106 061913 (2015)
    3) 对于一个正常扫描的HAADF图像,假设图中有已知的块体结构,那么可以先找到该区域,然后将原子柱位置测出,对比测得的原子柱位置和已知晶体的坐标位置,可以拟合出一个矩阵,将测得的位置映射到已知晶体的坐标位置,随后将该矩阵作用于整张HAADF图像,可以进行一定的校正
    4) 还有一些non rigid的校准方法,可以搜索文献看看

    PCA: principle component analysis, 有用来处理HAADF图像的吗,不是特别清楚,貌似用在EELS上比较多

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  • TEM

    第4楼2019/03/12

    PCA用在EELS上,失真多吗?

    Jin(querida) 发表:HAADF的图像漂移,首先需要从源头解决。简单方法如下:1) 需要用短驻留时间多次扫描同一区域,然后需要用image alignment或类似的插件将多张照片对齐(最好是sub pixel对齐),最后将多张照片加和。达到提高信噪比,降低漂移的目的2) 需要在扫描时,改变电子束的扫描方向。比如0度(相对于笛卡尔坐标系)时扫描一张,45度时扫描一张,90度扫描一张,设样品漂移是系统漂移且沿着笛卡尔坐标系的t方向。 解方程组可以得到这个系统漂移并校正。 可参看:Ultramicroscopy 138 28-35 (2014)。APL 106 061913 (2015)3) 对于一个正常扫描的HAADF图像,假设图中有已知的块体结构,那么可以先找到该区域,然后将原子柱位置测出,对比测得的原子柱位置和已知晶体的坐标位置,可以拟合出一个矩阵,将测得的位置映射到已知晶体的坐标位置,随后将该矩阵作用于整张HAADF图像,可以进行一定的校正4) 还有一些non rigid的校准方法,可以搜索文献看看PCA: principle component analysis, 有用来处理HAADF图像的吗,不是特别清楚,貌似用在EELS上比较多

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  • TEM

    第5楼2019/03/12

    遇到专家了,厉害!

    Jin(querida) 发表:HAADF的图像漂移,首先需要从源头解决。简单方法如下:1) 需要用短驻留时间多次扫描同一区域,然后需要用image alignment或类似的插件将多张照片对齐(最好是sub pixel对齐),最后将多张照片加和。达到提高信噪比,降低漂移的目的2) 需要在扫描时,改变电子束的扫描方向。比如0度(相对于笛卡尔坐标系)时扫描一张,45度时扫描一张,90度扫描一张,设样品漂移是系统漂移且沿着笛卡尔坐标系的t方向。 解方程组可以得到这个系统漂移并校正。 可参看:Ultramicroscopy 138 28-35 (2014)。APL 106 061913 (2015)3) 对于一个正常扫描的HAADF图像,假设图中有已知的块体结构,那么可以先找到该区域,然后将原子柱位置测出,对比测得的原子柱位置和已知晶体的坐标位置,可以拟合出一个矩阵,将测得的位置映射到已知晶体的坐标位置,随后将该矩阵作用于整张HAADF图像,可以进行一定的校正4) 还有一些non rigid的校准方法,可以搜索文献看看PCA: principle component analysis, 有用来处理HAADF图像的吗,不是特别清楚,貌似用在EELS上比较多

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