内标法的优点是测定的结果较为准确，由于内标物与被测组分的峰面积的比值不受进样量波动影响，因而在一定程度上消除了操作条件等的变化所引起的误差。内标法的缺点是操作程序相对烦琐，每次分析时内标物和试样都要准确称量，有时寻找合适的内标物也有困难。
外标法简便，但要求进样量十分准确，要严格控制在与标准物相同的色谱条件下进行，否则造成分析误差。
应用外标法能够满足要求时，首选外标法。对于精密度要求比较高、结果准确度要求高时用内标法还是必要的。气相色谱进样重现性不如高效液相色谱，内标法定量较多，液相色谱大多采用外标法定量。
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