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ChemStation格式谱库和MassHunter格式谱库的转换应用

  • symmacros
    2020/09/08
    Science
  • 私聊

气质联用(GCMS)

  • ChemStation格式谱库和MassHunter格式谱库的转换应用



    近期想合并修改一个MS ChemStation格式谱库(XXX.L),发现MS ChemStation自带的谱库编辑器只能一个个逐个打开并进行编辑,比较麻烦,费时间。发现MassHunter所带的谱库编辑器编辑比较方便,和excel一样方便。但只能对Masshunter格式(XXX.mslibrary.xml)进行编辑,无法对XXX.L格式的压缩库进行编辑,也无法另存为XXX.mslibrary.xml格式,均不支持这种功能。仔细看了一下Masshunter谱库编辑器的帮助和其它资料,才得以解决。和大家分享一下流程。

    方法是先将XXX.L谱库条目复制到XXX.mslibrary.xml谱库里面,修改条目后另存为XXX.L数据库格式。就可以使用了。注意需要同时打开并使用两个谱库编辑器操作。

    打开谱库编辑器,在文件菜单打开XXX.L数据库。



    例如打开demo.l数据库。



    在化合物表里面任何地方点击鼠标右键,添加需要的列,或进行删除,检索,新建质谱或化合物。



    添加谱库需要的列,后面才可以复制这些列了,没有哪个列项目,就无法进行复制那个列等操作。



    选定添加列后,确定。



    选定需要复制列,复制。



    然后另外打开一个谱库编辑器,在谱库编辑器里面新建谱库,例如Test_demo.mslibrary.xml。

    不要在原来的谱库编辑器里面新建谱库,可能会无法复制原来的列。



    保存。右键点击,然后粘贴。注意在一些化合物数目较大数据库复制—粘贴时候,如果进行多次复制—粘贴操作,例如每次1000个化合物,进行复制—粘贴10次,会把最后一行覆盖。所以需要多重复复制一行或新建立一行,然后粘贴,就避免覆盖了。并且及时保存谱库。



    这样就把demo.l数据库转移到新建的Test_demo.mslibrary.xml了,即XXX.L格式转换XXX.mslibery.xml格式。如果无法粘贴,可以回到第一个打开的谱库编辑器里面重新复制,重复选定列复制。



    就可以在化合物表里面对列进行编辑,例如把原来ID 1的化合物名称dodacane修改成C12 Alkane。然后保存。



    然后把数据库Test_demo.mslibrary.xml另存为Test_demo.L。即XXX.mslibrary.xml转换成XXX.L格式。



    这样就把修改后的demo.l返回到MS ChemStation的格式了。就可以在MS ChemStation或MassHunter上面使用已经修改过的谱库了。



    用上述方法,省了很多事,节约很多时间。
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  • symmacros

    第1楼2020/09/08

    应助达人

    欢迎拍砖批评指正!

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  • m3336169

    第2楼2020/09/08

    谱库编译器真的方便了很多。尤其是修改或者添加信息。比化学工作站方便的太多了。EXCEl的操作逻辑也很让你容易上手。

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  • symmacros

    第3楼2020/09/08

    应助达人

    感觉有点可视化操作,excel操作方式方便快捷。

    m3336169(m3336169) 发表:谱库编译器真的方便了很多。尤其是修改或者添加信息。比化学工作站方便的太多了。EXCEl的操作逻辑也很让你容易上手。

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  • lzq168

    第4楼2020/09/11

    应助达人

    朱老师,试了-下可以,但保存不了.L文件了,化学工作站用不了

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  • symmacros

    第5楼2020/09/11

    应助达人

    直接另存为xxx.l就行。文章里面有一段话的,可能你没有注意到,

    lzq168(lzq168) 发表:朱老师,试了-下可以,但保存不了.L文件了,化学工作站用不了

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  • lzq168

    第6楼2020/09/14

    应助达人

    我的另存为没有你那选项,版本6.0.

    symmacros(jimzhu) 发表: 直接另存为xxx.l就行。文章里面有一段话的,可能你没有注意到,

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  • symmacros

    第7楼2020/09/14

    应助达人

    直接输入XXX.L (全部文件)就行。没有.L文件格式选项,没关系。

    lzq168(lzq168) 发表: 我的另存为没有你那选项,版本6.0.

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  • lzq168

    第8楼2020/09/15

    应助达人

    朱老师我试了各种弄不出来,另不会产生一个.L的交件夹,还是一个后缀带.mslibrary.xml的单个文件

    symmacros(jimzhu) 发表: 直接输入XXX.L (全部文件)就行。没有.L文件格式选项,没关系。

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  • symmacros

    第9楼2020/09/15

    应助达人

    格式选全部文件

    lzq168(lzq168) 发表: 朱老师我试了各种弄不出来,另不会产生一个.L的交件夹,还是一个后缀带.mslibrary.xml的单个文件

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  • lzq168

    第10楼2020/09/15

    应助达人

    试过,还是不行.不知那岀问题了

    symmacros(jimzhu) 发表: 格式选全部文件

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