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气相色谱(GC)
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[求助]代谢组学新手,关于compound discoverer结果处理问题
Ins_586a88bd
2023/05/22
私聊
气相色谱(GC)
本人为研一新生,课题组开关于代谢组学新项目,实验室也没有人有经验,做的是关于植物的非靶向代谢组学,平台为uplc-orbitrap exploris 120,原始数据通过compound discoverer 处理,选择了mzcloud、mzvault、chemspider等五个数据库用于代谢物定性,在得到的数据中存在多个相同名称的代谢物数据(如有8个绿原酸),且不是所有数据均有置信度可供参考,这种情况下是否需要只保留一个数据,应该基于什么参数选择呢?
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第1楼
2023/05/22
应助达人
本可以保留多个,CD解析出来的粗暴点的话直接看数据库打分
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