方案摘要
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参考标准 | 不同质量检测范围和不同培养时间 |
不同质量检测范围和不同培养时间。基于微生物的蛋白指纹图谱,使用全自动微生物质谱检测系统(CMI-1600)结合分型算法建立了沙门氏菌分型模型并对分型能力进行了验证
食品安全一直是人们最为关注的重大问题之一。随着我国食品工业快速发展, 食品生产模式已经发生了巨大的转变, 由此引发的食源性疾病突发事件不断增加, 食源性致病菌也从地域性问题向全国、全球性问题转变。
食源性致病菌多种多样,广泛存在于人们生活的各个角落。其中,沙门氏菌是一种最常见的食源性致病菌,据统计我国内陆地区乃至在世界各国的种类细菌性食物中毒中,沙门氏菌引起的食物中毒常列榜首。
沙门氏菌(Salmonella)是一大群寄生于人类和动物肠道内,生化反应和抗原构造相似的革兰氏阴性杆菌。按照生化特性,基于O抗原、H抗原、Vi抗原其血清型主要分为三类,2007年统计血清型数量已高达2579种。
沙门菌不同血清型的区分令检验人员十分头痛,传统沙门氏菌鉴定方法,包含选择培养基法、免疫方法学、PCR等,这些技术有的不能区分不同的血清型、有的操作流程比较复杂且报告结果时间较长。
广州禾信康源医疗科技有限公司(简称:禾信康源)利用本公司高灵敏度和高分辨的微生物质谱检测系统(CMI-1600)开展了快速分辨沙门氏菌不同血清型的研究。
本研究探索了不同质量检测范围和不同培养时间对分型准确率的影响。
1、不同质量检测范围对分型准确率的影响
2、不同培养时间对分型准确率的影响
培养不同时间对甲型副伤寒沙门菌分型准确率基本无影响,培养时长过高或过低对汤卜逊沙门菌和鼠伤寒沙门菌分型准确率有一定程度影响。从下图可知,培养时间在16-72 h范围内,对沙门氏菌分型准确率影响不显著。
结论
基于微生物的蛋白指纹图谱,使用全自动微生物质谱检测系统(CMI-1600)结合分型算法建立了沙门氏菌分型模型并对分型能力进行了验证。所采集的蛋白图谱质量范围对分型准确率有一定影响,训练模型图谱质量范围设置在800-20000 Da分型准确率最佳。不同培养时间对沙门氏菌分型准确率影响差异不显著,培养时间在16-72 h内,分型准确率波动性较小。通过考察各因素的影响,优化条件建立模型,对不同血清型的沙门氏菌进行预测验证,分型结果的准确率良好。
CMI-1600是由禾信康源在全面掌握核心技术和先进制造工艺下,历时5年,完全自主研发的一款基于基质辅助激光解析电离法的质谱检测系统。可用于临床诊疗,疾控中心,科研院所,食、药监局,出入境检验检疫等领域微生物精准鉴定。
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