靶向建库

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靶向建库相关的资讯

  • 更高效——微液滴数字PCR在靶向测序建库中的应用
    p style=" text-indent: 2em " 二代测序技术,也称为高通量测序技术,一次可对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定。靶向捕获测序技术是二代测序技术衍生出来的一个重要分支,只对感兴趣的目标基因进行扩增测序,能够更高效经济地测定DNA序列。靶向捕获建库是测序流程中的重要环节,目前具有代表性的方法是罗氏Nimblegen序列捕获芯片、安捷伦Sureselect基于液相靶向捕获系统和基于多重PCR扩增的基因捕获系统。 /p p   目前常用的靶向文库制备方法多样,但在捕获均一性、中靶效率、操作流程、检测成本等方面需要改进。基于PCR扩增引物设计的灵活性及简单的操作流程,多家公司开发了多重PCR扩增的捕获体系。多重PCR扩增体系通过多对引物对基因组进行扩增捕获,但随着引物增加时,扩增引物之间或引物与微量扩增模板之间的相互作用会降低扩增效率。微液滴数字PCR作为一种新兴的检测技术,通过数以万计的微液滴将扩增模板分散到不同微液滴中,降低引物对模板的竞争作用,实现对微量模板如循环肿瘤DNA等有效扩增,获得更高的捕获效率(如下图所示)。 /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/bcef21ce-bed4-40fb-8419-d1eaccc0b6f0.jpg" title=" 1.jpg" alt=" 1.jpg" / /p p   Tewhey最早将微液滴数字PCR平台应用于靶向捕获测序中,该研究先制备包含不同扩增引物和打断基因组DNA的微液滴库,然后将两种不同液滴按照1:1比例融合,PCR扩增后完成捕获(如下图所示)。该方法通过微液滴将不同引物进行分隔,避免了引物之间的竞争作用,提高了目标序列捕获的特异性和均一性。研究结果表明微液滴数字PCR技术适用于高通量测序的文库构建。 /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/501f40e0-1a28-4973-a941-ed9813c483cf.jpg" title=" 2.jpg" alt=" 2.jpg" / /p p   Taylor建立了Digital Deletion Detection(3D)检测方法,通过微液滴数字PCR技术最低可对10-8频率的线粒体DNA突变进行检测。该方法在PCR扩增后将微液滴打破进行测序分析。数字PCR使目标模板在微液滴中进行均一的扩增,提高了对稀有分子的捕获效率。 /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/eeedc0e0-6d46-4404-a3c0-94b7104c6145.jpg" title=" 3.jpg" alt=" 3.jpg" / /p p   微液滴数字PCR技术在遗传病检测、肿瘤液态活检等领域中已经成为极具竞争优势的检测方法。数字PCR技术的下一个爆发点是应用于靶向测序领域,如测序文库的精准定量、靶向捕获扩增等,展示出令人兴奋的结果。微液滴数字PCR与高通量测序技术的完美融合,将更好地推进精准医疗的进步。 /p
  • 院企共建创新靶向药物联合实验室
    癌症患者的治疗过程往往相当痛苦,一些抗癌药物&ldquo 威力巨大&rdquo ,在杀死癌细胞的同时也使大量正常细胞受损,有没有什么药物能只攻击&ldquo 坏细胞&rdquo ,绕过&ldquo 好细胞&rdquo ?记者从中科院合肥物质科学研究院获悉,近日,该院强磁场科学中心药物学研究团队和我市一家医药科技企业共建创新靶向药物联合实验室,重点研发靶向抗癌药物,从而最大程度上降低药物对人体的伤害。   什么叫靶向药物?靶向药物指被赋予了靶向能力的药物或其制剂,其目的是使药物或其载体能瞄准特定的病变部位,并在目标部位蓄积或释放有效成分。靶向制剂可以使药物在目标局部形成相对较高的浓度,从而在提高药效的同时抑制毒副作用,减少对正常组织、细胞的伤害。   对于普通药物而言,通常在进入体内后仅有极少一部分真正作用于病变部位,这是制约药物疗效,并导致药物毒副作用的根本原因。获取具有像导弹一样精准靶向能力的药物是人类的梦想,也是药物开发的终极目标。   据了解,2012年以来,中科院强磁场科学中心药物学研究团队以生命健康为出发点,以肿瘤精准治疗为目标,以转化医学为实施手段,成功建设了以高通量为特色的蛋白层次核磁筛选系统、计算机高通量虚拟筛选系统和常规细胞层次高通量、高内涵筛选系统的药物开发和测试硬件体系。快速开发了研究肿瘤精准治疗所需的单基因依赖性的全细胞筛选库软件体系,建立了不同组织来源和基因背景的癌症细胞系库,构建了包含商业小分子药物和自行设计合成的新型小分子药物库。   据研究团队负责人刘青松研究员介绍,目前,他们已经针对B细胞淋巴癌、前列腺癌、结直肠癌、急性白血病、非小细胞肺癌等研发出一批抗癌抑制剂,有望实现对这些肿瘤的精准靶向治疗。
  • 新品速递|凯杰靶向测序方案,专为液体活检而生
    液体活检技术的不断发展为癌症领域带来了重大突破,这种非侵入性的检测方法凭借其样本可及性、可持续性、可消除异质性等特点,为肿瘤的早期诊断、伴随诊断等带来了新的希望,但其进一步广泛应用仍受制于目前检测灵敏度及精确度的限制。QIAGEN全新推出的QIAseq Targeted cfDNA Ultra靶向测序方案专为液体活检而生,在针对低至0.1%突变的检测上依然可实现99%的特异性。特殊的建库方案实现更低的检测限基于杂交捕获的靶向方案由于步骤较为繁琐,实验过程中起始模板的损失较大降低了灵敏度,因此所需的样本量通常较高。传统多重PCR靶向方案因模板利用率高因此起始样本要求低,但是由于扩增产物的起始位置均相同,很难通过这些“复制的”分子进行等位基因突变频率的计算,也很难排除扩增的错误和偏差。QIAseq Panel基于特殊的单端特异性引物延伸(Single Primer Extension, SPE)技术,作为多重PCR的一种,与一般扩增子技术不同的是扩增产物起始位置并不完全相同,多样性的产物更有利于重复数据的消除,同时对杂交捕获与多重PCR两种技术进行了取长补短,而最低仅需5 ng起始cfDNA样本。均一的覆盖度由于cfDNA较短,传统多重PCR可能出现上下游引物无法同时结合在一个DNA模板上而无法扩增的情况,浪费了大量起始模板,而SPE技术仅需一条引物结合到靶向区域即可扩增,因此也能解决这一难题。同时我们也根据cfDNA片段较短的特点有针对性优化了引物设计,增加了引物密度,结合完善的扩增体系,在实现目标区域扩增特异性90%以上的同时也确保了整体扩增均一性指标(Uniformity)超过97%。特异分子条形码 (Unique Molecular Indices, UMI)的引入也可以有效解决PCR扩增所带来的偏倚,为检测的准确性、灵敏度及全面性提供了前所未有的保障。HiFi Ultra高保真酶助力更高测序品质NGS的理论检测极限受到扩增酶的影响,PCR扩增错误作为背景噪音会极大的影响低于0.3%突变检测的准确性。QIAGEN将原有扩增酶进一步升级为HiFi Ultra高保真酶,同时搭配双端唯一标签(Unique Dual Index, UDI)接头,极大提高了低频突变的检测准确度和灵敏度,进一步提升了NGS分析结果。QIAseq Targeted cfDNA Ultra目前已推出Breast Cancer、Colorectal Cancer、Lung Cancer等多款预制产品可供选择,后续也会推出定制服务。

靶向建库相关的方案

  • 对污泥中的环境污染物同时进行靶向定量和疑似物筛查
    本文介绍了一种使用 Agilent 6546 LC/Q-TOF MS 系统用于环境样品中的污染物定性定量分析的工作流程。该工作流程结合安捷伦环境污染物数据库及谱库 (PCDL) 和新版 MassHunter 定量分析软件,可以同时进行靶向定量和未知物筛查分析,可一次进样在受监管化合物的定量分析的同时,筛查数千种新型污染物。
  • 对污水污泥中的环境污染物同时进行靶向定量和疑似物筛查
    环境污染物列表内容不断增加,法规也日益严格。各种环境监管机构都需要快速、准确且高灵敏度的分析工具。环境实验室经常遇到需要进行一系列分析的样品:从高毒性污染物的痕量分析(以保护生态系统),到筛查庞大的新型污染物(常规生产并超出预期使用期限持久存在)库。目前已经针对数据采集、定量分析和报告结果制定了相应的技术和程序,通常使用靶向 LC-TQ 技术。但监测日益增加的新型环境毒物列表仍在不断向环境科学家们发起挑战。本应用简报使用 Agilent 6546 LC/Q-TOF MS 系统评估定量分析和筛查的综合工作流程。6546 同时具有扩展动态范围和高质量分辨率功能,还具有无与伦比的采集速率。该工作流程结合安捷伦个人化合物数据库和谱库 (PCDL) 中经过高度优化的 MS/MS 谱图和保留时间,以及更新的 MassHunter 定量分析软件,可同时进行无缝靶向定量与疑似物筛查。软件增强功能和硬件功能可快速简化受监管化合物的定量分析,同时根据一次进样即可筛查数千种新型污染物。
  • 基于 Orbitrap GC-MS 的非靶向代谢组学
    本项研究展示了新型 Thermo Scientific? Orbitrap? GC-MS 完整非靶向代谢组学工作流程,检测了大鼠模型中的生物标记物,以判定其死亡时间。死亡时间(PMI)推断是法医调查中一项最关键也是最困难的任务,尤其当尸体温度与周围环境温度达到平衡后。由于当前用于确定 PMI 的方法不精确性且以目视检查尸体为主。因此,建立一种实验方法,使用耐用生物标志物推断死亡时间可辅助法医调查。该 GC-MS 装置使用基于 Orbitrap 的检测器,得到超高质量数分辨率、亚 ppm 质量数精度、宽动态范围以及一定的扫描速度,用于有效定量极复杂代谢组学样品。高分辨率、稳定的质量数精度和快速的扫描速度是进行稳定的数据解卷积的关键因素,以检测重叠 TIC 峰中的化合物,进行非靶向代谢组学分析。电子轰击电离(EI)裂解模式也适合基于应用广泛的 NIST 库和 Wiley 库进行匹配,以识别化合物,同时为更深入的表征提供精确质量数。

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  • 低分辨质谱能进行非靶向分析吗?

    读了篇文献[Targeted and untargeted gas chromatography-mass spectrometry analysis of honey samples for determination of migrants from plastic packages(塑料包装蜂蜜样品中迁移物测定用靶向和非靶向[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]-质谱分析)],[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]分析采用Agilent 6890 N (Agilent, Waldbronn, Germany)[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱仪[/color][/url]与配备惰性离子源的Agilent 5973四极质选谱仪进行。【文献原文:2.2. Instrumentation and software:GC analyses were performed on an Agilent 6890 N (Agilent, Waldbronn, Germany) gas chromatograph coupled to an Agilent 5973 quadrupole mass selective spectrometer equipped with an inert ion source.】在非靶向分析那写的:根据文献,包括目标分析物和其他从塑料到食物的潜在迁移物的数据库,已创建(补充数据表S2)。利用NIST和Wiley质谱文库对所研究的蜂蜜样品中的m/z离子特征进行了监测,并对其进行了鉴定。共检出13种疑似化合物。[文献原文: 3.4.2. Untargeted approach :A database including the target analytes and other potential migrants from plastic into food, based on the literature, has been created (Supplementary data Table S2). Based on their characteristic m/z ions, all these compounds were monitored in the studied honey samples using the NIST and Wiley MS libraries for their identification. A total of 13 putative compounds were found.]文献中用的是低分辨质谱吧?低分辨质谱能进行非靶向分析吗?但是低分辨质谱不是需要标品吗?文献就只有靶向分析的标品,非靶向分析只有数据库也行吗?

  • 靶向和非靶向代谢组学分别需要什么内标和标准品?

    做非靶向代谢组学,没有想要检测的目标物,目的在于尽可能多的检测出样品中的代谢物,在前处理过程中加入内标物质,在数据分析时,根据内标校正数据。。那如果做靶向代谢组学就是需要购买想要分析的目标物的标准品来做标准品对照液,是不是就是外标法? 除了标准品以外还需要在前处理过程中加入内标吗?

靶向建库相关的资料

靶向建库相关的仪器

  • 目前,随着高通量测序在遗传病筛查、肿瘤早筛、肿瘤检测、病原微生物检测、NIPT等临床诊断中的普遍应用,将测序前繁琐的文库构建进行自动化和标准化是一个必然趋势,文库构建工作实现自动化,可以有效保证文库质量的均一性,避免文库的重复构建,节省人力成本和经济成本。Vitae NGS-M 自动化文库构建工作站适用于中通量(1-32个样本/run)的建库需求,自动化完成文库构建和靶向捕获流程。 产品特点 8通道移液头兼具单通道功能,可以实现反应Mix的配置和分装;32通道移液头一次可处理最多32个样品,用于实验流程中的吹吸混匀,磁珠纯化过程中的吸废等;通量高18个SBS标准盘位除功能模块,另有9个SBS标准盘位放置试剂和耗材,大大提高实验通量;安全稳定搭载紫外消毒灯可选配正、负压HEPA过滤装置建库产出稳定,质控符合测序要求一键启动可将验证后的实验流程进行储存按键式启动文库制备实现标准化、经验证的NGS自动化建库流程;操作灵活整合抓板手用于对标准SBS板子的转移;高度集成整合桌面式PCR扩增循环仪自带封膜及热盖功能,实现全自动化;功能一体包含建库所需PCR板加热模块、PCR板制冷模块、定制试剂冷槽、PCR板磁吸附模块、PCR板振荡模块、PCR仪等模块; 应用举例下面以DNA建库、靶向捕获为例,展示可在Vitae NGS上实现自动化的流程:(一)DNA建库 (二)靶向捕获
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  • 代谢组学指对某一生物、组织或细胞在一特定生理时期内形成的各种代谢产物进行全面定性和定量分析的一系列技术,主要研究的是各种代谢途径的底物和产物的小分子代谢物(通常MW<1000),近年来在食品及医药领域都有广泛的应用,如可用于改善食品口味和品质、开发功能保健食品、判别食品真伪及对食品进行质量控制,对血液、细胞和尿液的代谢物进行分析可以阐明生理和病理机制、发现先天性代谢缺陷或癌症的标志物等。代谢组学样品尤其是生物样品通常含有大量的干扰物质,如何从大量检出组分中快速确定哪些化合物是目标分析的关键物质以及如何准确排除干扰组分检测到痕量代谢物是目前研究工作者所面临的挑战。岛津一直致力于为代谢组学研究工作开发配套解决方案,数年前就推出了针对性的专业数据库,并不断进行更新和升级,今年该数据库再一次进行了强有力的扩充和升级,与此同时岛津积极与国内客户开展合作进一步扩充数据库。代谢物数据库包含代谢物组分的各种信息,是代谢物分析的有力手段。Smart Metabolites Database Ver.2化合物数量扩增至600多种,新增植物次生代谢物,如功能性成分儿茶素和绿原酸等代谢物信息,同时提供氨基酸、脂肪酸和糖的专用分析方法,扩展了数据库的适用范围。&bull 自动创建代谢物检测高灵敏度MRM分析方法Scan方法是代谢物分析的传统方式,但是对于痕量组分尤其是代谢物有重叠或是有污染物干扰时灵敏度往往无法满足要求。代谢物数据库包含优化后的MRM分析条件,同时结合AART保留时间校准功能,无需标准品即可轻松创建高灵敏度和高选择性的MRM方法进行代谢物泛靶向分析,即使是痕量组分也能准确定性和定量。&bull 省时、省力代谢物数据库包含600多种化合物信息,适用于各种样品分析,但与此同时数据分析时间也随着可分析化合物种类的增多而延长。为了更好的满足用户需求,新版数据库增加过滤功能,根据不同的样品的类型(植物、动物、血液、尿液、细胞),允许用户只选择和分析给定样品中可能被检测到的代谢物,从而大大节省分析过程中的时间和劳动力。&bull 提供“即时可用”的糖定量分析方法代谢组学分析中常用甲氧肟-TMS衍生化法,但是还原糖会产生多种几何异构体,在色谱上难以实现分离。数据库增加新的糖衍生化方法实现糖的选择性检测,同时包含24种主要糖分析所需的化合物信息和校准曲线信息,无需标准品即可轻松获得糖的半定量结果。&bull 食品代谢组学分析完整解决方案基于新版代谢物数据提供GC/MS食品代谢组学分析从样本制备到多变量分析的完整支持。数据库包含的“代谢组学手册”全方位说明从样品制备到多变量分析的每个步骤,即使是初学者也可以根据手册轻松应对。应用实例——番茄品种间的多变量分析利用Smart Metabolites Database Ver.2 对4种不同番茄的代谢物进行分析,然后利用多组学方法包,观察不同品种之间的差异。从分析结果可以看出,与其它番茄品种相比,A品种含有大量的氨基酸,C品种则含有大量的糖。同时利用糖的专用分析方法对不同番茄品种的糖代谢物进行半定量分析,从而确证每个品种间存在差异。
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  • 果汁筛选分析服务 SGF Profiling SGF Profiling™ 为一种基于核磁的水果果汁筛选方法,它是Bruker BioSpin GmbH和SGF International e.V.联合研发的结果。对于每一种果汁,几分钟内采集一个数据列,同时评估与质量和可靠性相关的大量参数。 特点包括评估和报告在内的400兆核磁自动按键NMR解决方案。可靠的筛选方法,提供靶向和非靶向的多标记物分析统计分析基于从全世界生产线获取超过1万6千种参考果汁的大量核磁图谱数据库,并定期更新。定向分析:参考A.I.J.N. 和NMR分布,同时绝对量化相关有机物。非靶向分析:核磁图与对应的参考图谱组做比较,自动监测浓度偏差(甚至对于未知化合物)。分类分析,如测定水果产地(见规格表)。测定水果含量(监测加入的水,氨基酸或糖 统计分析 靶向性和非靶向性多标记分析 Verification models are used for the non-targeted analysis of even unknown compounds自旋指纹筛选提供标准的靶向性多标记分析,其中包含以下各项的绝对定量:糖分(葡萄糖、果糖、蔗糖)主要果酸(柠檬酸、苹果酸、异柠檬酸、奎宁酸)易腐性指标(乙醇、富马酸、乳酸、HMF)流程控制参数(半乳糖醛酸、氯)此外,该技术允许采用非靶向性多标记方法,该方法则基于上百种化合物的浓度差异同步评估。相比靶向性标准分析常规,它可以检测出意外成分的存在,从而检测出未知欺诈。 光谱数据库在广泛的光谱数据库基础上进行筛选,该数据库包括来自主要正宗果汁的上千种 NMR 光谱。目前,该数据库含有约 40 种不同的水果,来自全球 50 多个产地。此外,该数据库还允许访问上百种小分子化合物,以便进一步分析未知成分。 按键式常规程序自旋指纹筛选是全自动按键式常规程序,无需操作人员之间的互动。从样品条码注册、配制和处理到数据捕获和统计评估,所有步骤都在 Bruker 实验室信息系统 SampleTrack™ 的控制之下。 报告 定量 自旋指纹筛选提供超过 30 种成分的绝对浓度,这对果汁评估非常关键。数值与参考标准相比较,出现偏差则表示特征质量存在问题,例如添加了糖分。 样品分类 样品分类有助于进一步区分类似的水果类型,例如橙子、血橙和柑橘。更专业的模型甚至可以分辨纯果汁和稀释果汁,并且能确定原产地。 验证 进行样品分类后,单变量和多变量验证可提供更多的信息,例如相比参照组别的意外偏差。回归分析 基于定型数据集的回归分析可评估额外的参数,例如滴定酸度。 水果成分估算 最终报告中还包括水果成分的估算SGF Profiling archives all results in the form of a standardized sample quality report
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靶向建库相关的耗材

  • 海荭兴多联农残胶体金检测卡
    产品简介:灵活配置、靶向检测、简便准确、经济适用,可同时检测吡虫啉、噻虫嗪、百菌清等多个项目。适用范围:该产品满足七部委联合发布的《食用农产品“治违禁控药残促提升”三年行动方案》要求,适用于蔬菜、水果、食用菌、茶叶等重点品种禁限用农药残留的快速检测。技术原理:多联胶体金检测卡应用了竞争抑制免疫层析的原理,样本中的农、兽药残留在流动的过程中与胶体金标记的特异性抗体结合,抑制了抗体和 NC 膜检测线(T)上的抗原-BSA偶联物的结合,从而导致检测线颜色出现深浅的变化,而无论样本中是否含有待检测物,质控线(C)都会显色,以示检测有效。特点优势:检测时间短——检测时间短,适用于现场或实验室的快速检测。高准确度——通过省级以上权威认证,准确度高。操作简单——操作简单,非专业人士按照说明书可自主检测。精准检测——可精准检测蔬果中具体某一种农药残留情况。
  • 游离DNA样本保存管,品牌:国盛医学,一文读懂液体活检
    肿瘤的液体活检主要包括循环肿瘤DNA(ctDNA)、游离肿瘤细胞(CTC)及外泌体(exosome)。众多研究表明三者与肿瘤的早诊、治疗、预后等均存在相关性。目前在临床应用最多的当属ctDNA检测。正常人的体液内亦存在来自于机体正常细胞的游离DNA,简称循环游离DNA或cfDNA;在肿瘤患者体内,循环游离DNA不仅仅来自于正常细胞,还有一部分来自于肿瘤细胞,即ctDNA,也是循环游离DNA的一部分,因此我们可以通过检测ctDNA相关变异状态作为来自肿瘤细胞的标志物。目前临床肿瘤ctDNA检测最常见的应用领域为治疗方案选择及耐药监测。 由于ctDNA具有片段化程度高、丰度低等特点,其主流检测方法包括Cobas法、Super-ARMS法、高通量二代测序(NGS)及数字PCR。液体活检的运用与优势液体活检最大的优势在于微创、快捷,易于动态监测;一定程度上全面反映肿瘤整体变异状态,不受肿瘤异质性影响;适用人群更广泛,对于难以取得活检肿瘤组织或取得肿瘤组织不够基因检测的患者,液体活检提供了一个了解肿瘤基因变异状态的有效途径。1. 早期诊断肿瘤的早期诊断最大难点是由于肿瘤负荷很低,可能影像学上没有明确的病灶,此时血液中ctDNA的含量亦极低,普通针对ctDNA突变的检测难以满足早诊的要求。但DNA甲基化改变是贯穿整个恶性转化的表观遗传学改变。即使在肿瘤发展的最早期,DNA甲基化模式也已经与正常细胞存在显著差异;其次,甲基化水平的改变是具有组织特异性的,即对甲基化进行检测及比对,能够进行器官溯源,发现到底是哪里可能会发生或已经发生了肿瘤。 因此,对ctDNA的甲基化水平进行检测,是一种有效的肿瘤早期筛查辅助手段。比如SEPT9基因甲基化检测试剂盒对结直肠癌诊断的敏感度及特异性可达74.8%及97.5%[1],现在已经可以作为一种结肠镜前的初筛手段。2. 指导靶向治疗肿瘤的靶向治疗是目前临床最常见的ctDNA检测应用。根据《非小细胞肺癌血液EGFR基因突变检测中国专家共识》,如果有肿瘤组织,推荐使用肿瘤组织进行驱动基因检测;若无肿瘤组织样本或肿瘤组织样本不足的情况下,液体活检可作为很多患者基因检测的首选。无论何种检测方式,应注意的是若组织活检或者液体活检有任何一个是阳性,患者应当考虑使用靶向药物;当液体活检先行的时候,若液体活检为阴性,应提示患者可能存在假阴性,必要时再取活检,以避免错失可能的靶向治疗机会。 3. 耐药监测靶向治疗终归面临耐药的问题,而液体活检由于微创快捷的优势,是理想的耐药监测材料。对于EGFR一代或者二代TKI用药人群,约半数以上的患者出现EGFR 20号外显子T790M而耐药,因此对于此类患者的耐药监测可使用敏感度高且成本低的数字PCR法对T790M单点进行监测。如果患者已经出现了耐药,亟需探索其耐药机制以更换治疗方案,此时推荐使用NGS对基因变异的整体状态进行检测,以便全面寻找耐药原因。4. 预后评估在预后评估方面,微小残留病变(MRD)是目前研究的热点。MRD指的是治疗后传统影像学和实验室方法无法发现,但通过分子诊断可以发现的肿瘤来源的分子异常。多种肿瘤的相关研究表明,ctDNA突变状态可提示接受根治性治疗的患者的预后复发,并且已经在部分临床实验中得到应用。液体活检的样本采集要求血液的规范化处理是保证液体活检结果准确的基本前提。在血液样本的送检方面应注意:1.采血管的选择ctDNA检测的血液需使用EDTA抗凝管或者cfDNA专用采血管。若使用EDTA抗凝管,血液离体后应尽量保存于4℃,2小时内需尽快进行血浆分离;若使用cfDNA专用采血管,血液可在常温保存3-5天。切记严禁使用肝素抗凝管,因为肝素在后续DNA提取过程中难以去除,并且会抑制PCR反应,导致后续ctDNA检测失败。2.采血量及采血注意事项一般而言,ctDNA检测需要采集8-10ml的全血。采血后严禁剧烈震荡血液,或者使用注射器针头对血液进行转移,因为这样的操作均会导致血液中细胞破裂,从而造成基因组DNA的污染,增加ctDNA检测的假阴性。采血后应轻柔将采血管颠倒8-10次进行混匀。3. 患者采血时间的选择一般建议患者空腹进行抽血,特别是血脂较高的患者。这是由于低密度脂蛋白对荧光有屏蔽和吸收的作用,会干扰后续ctDNA的相关检测;三酰甘油会降低ctDNA的提取率;若使用微滴式数字PCR检测技术,血液中的脂质会影响后续微滴的生成。此外,对于正在进行化疗的患者,一般建议患者化疗结束后进行抽血。 国盛医学分子保鲜系列产品血液样本的保存及运输作为液体活检中一个重要的环节,如何收集保存全血样品中游离cf-DNA和cf-RNA的呢?游国盛医学研发的游离DNA采血管和游离RNA采血管可以满足液体活检中样本保存和运输的需求。 游离DNA采血管 国盛医学游离DNA采血管含有独特的抗凝剂和保鲜试剂,不含干扰游离DNA提取和抑制PCR成分,能稳定有核细胞,防止释放细胞基因组DNA而污染目标游离DNA;抑制核酸酶降解游离DNA,可在常温下稳定运输保存7天以上。 游离RNA采血管 国盛医学游离RNA保存管能稳定血细胞并防止血液凝固,防止血液有核细胞中基因组DNA和RNA的释放;能够有效抑制血浆中的核酸酶,防止游离RNA在体外降解;适合常温运输,储存样本5天及以上。
  • 海荭兴多联兽残胶体金检测卡
    产品简介:灵活配置、靶向检测、简便准确、经济适用,可同时检测磺胺类、氯霉素、甲硝唑等多个项目。适用范围:该产品满足七部委联合发布的《食用农产品“治违禁控药残促提升”三年行动方案》要求,适用于蔬菜、水果、食用菌、茶叶等重点品种禁限用农药残留的快速检测。技术原理:多联胶体金检测卡应用了竞争抑制免疫层析的原理,样本中的农、兽药残留在流动的过程中与胶体金标记的特异性抗体结合,抑制了抗体和 NC 膜检测线(T)上的抗原-BSA偶联物的结合,从而导致检测线颜色出现深浅的变化,而无论样本中是否含有待检测物,质控线(C)都会显色,以示检测有效。特点优势:检测时间短——检测时间短,适用于现场或实验室的快速检测。高准确度——通过省级以上权威认证,准确度高。操作简单——操作简单,非专业人士按照说明书可自主检测。精准检测——可精准检测蔬果中具体某一种农药残留情况。
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