医疗大数据

很多人都思考过这样一个问题：假如生命只剩下三天，应该怎样去过?　　从生命价值角度考虑，这只是一种“假设” 但从生命本身来看，我们之所以这样假设，是因为人类对自己的生命充满了未知，谁都无法预测自己的生、老、病、死。而在信息技术推动下，人类基因其实可以告诉我们很多关乎生命的秘密。　　从生命诞生的那天开始，每个人都有自己的基因，如果我们对这些潜在的基因数据进行分析，就能够精准的诊断出病源，比如：有人是癌症潜在患者，还有人是心、脑血管疾病易发人群。。。需要明确的是，知道这个结果并不重要，重要的是我们如何解决很多不确定性问题，说服患者接受这个结果，让其更好地去生活和工作，提高生命质量。　　在欧美一些国家，个人基因组检测已非常流行。从一个人的出生到死亡，每一个过程的基因变化都很大，医疗机构通过追踪整个过程的基因数据，可以对人们进行健康指导或者用药指导，从而降低患病风险，也就是我们常说的“精准医疗”、“个性化医疗”等概念。在中国，个人基因组检测的普及程度还不够高 但未来，在信息技术的推动下，生命科学必然会成为新的爆发点，尤其是医疗大数据，将带来不可估量的价值。　　为什么大数据会成为医疗行业关注热点?　　“医学大数据的特点与其他领域一样，也是大、多、快。不同的是，医学大数据的‘大’要体现出‘全’，即全样本、全流程，全生命周期 多，是指‘内容多元、数据多态’ 快，则是要具备较高水平的采集、存储、处理能力，更强调在线、时效性，并且在运用方面还要具备非常强的关联分析能力。” 上海儿童医院院长于广军，分析了医疗大数据的复杂性。　　在上海儿童医院，医疗大数据平台正在成为其重点构建对象，而上海儿童医院院长于广军本人就是“跨界操刀员”。去年12月，上海儿童医院成立了上海市转化医学协同创新中心分中心,主要做生物信息和大数据的处理平台。于广军还有另外一个身份，是国家卫生信息共享工程技术研究中心副主任。　　那么，上海儿童医院为什么要关注大数据?肯定不是为了大数据而大数据，而是因为医院本身就是大数据的发源地!　　首先，EMR电子病历系统的发展，不仅取代了传统纸质病历，更产生了大量和医疗相关的检查、化验数据，尤其是类似于医学影像这种非结构化信息，必须有效管理。其次，RHIO区域健康信息组织也让医院从单个机构发展到公共卫生、区域卫生信息化的更高层次，这其中也会产生大量的医疗数据。其三，omics组学时代的到来也进一步推动了大数据的发展。Omics组学不仅包括基因组学(Genomics)，还有蛋白组学(Proteinomics)，代谢组学(Metabolomics)，转录组学(transcriptomics)，脂类组学(lipidomics)， 免疫组学(Immunomics)，糖组学(glycomics )和 RNA组学(RNomics)学等，这些数据对医学研究将带来重大变革。　　正是基于这些大数据，精准医疗才会成为可能。如果说我们之前的研究是基于医学问题、科学问题 而大数据时代，我们要关注基于数据驱动的研究。当然，大数据也涉及很多技术难点，包括机器学习、认知计算等，都要努力去跨域。为了实现精准医疗目标，我们需要进行全基因关联分析，这就需要临床决策支持系统必须给力，基于大量的临床数据建立个性化的治疗，要做特征值挖掘与高相似性的匹配。　　上海儿童医院在2006年开始就在建设国内第一个大型跨医院的区域信息中心，该中心覆盖了38家三级医院，18个行政区，600多所公立医疗机构，诊疗事件累计2.1亿。基于这个平台，上海儿童医院可以开展大规模的数据研究，可以构建资源中心，同时要创建相应的知识库，做相应的服务系统研发。上海儿童医院还承担了科技部863计划，主攻是区域医疗、健康分析和应用系统的部分。比如，环境、气候与儿童就医是怎样一种关系。其实，儿童看病难不只是和医院的儿科医生短缺有关，和外部环境也有直接关系，季节更替会让很多儿童易患过敏性疾病、感染性疾病等，大数据会提供非常好的预测模型。　　我们如何看待生命科学领域的未来?　　毫无疑问，精准医疗一定是生命科学领域的未来。无论是产业界、医疗界、信息技术界，每个人都对这样的未来充满期盼。作为生命科学领域信息技术的提供者和创新者,英特尔一直在精耕细作，并在实践中不断突破。　　2016年6月，英特尔携手合作伙伴推出了“英特尔精准医疗伙伴计划(Intel BioIT Partners)”，共同推进计算技术在生命科学和医疗领域的创新和应用。同时，英特尔公司与上海交通大学、上海市儿童医院，香港大学，北京诺禾致源生物信息科技有限公司，以及北京荣之联科技股份有限公司签署战略合作备忘录，合力推动精准诊断、疾病预防等创新服务的落地和实践。　　“我们正在建设属于中国人自己的数据库 未来，我们可以不依赖美国或者欧洲人的数据库” 作为英特尔精准医疗伙伴之一，香港大学教授林德华，非常看好精准医疗未来发展前景。　　香港大学与诺禾致源、英特尔等企业在生命科学研究领域已成为深度战略合作伙伴。香港大学的索引技术可以用在生物医学上，来处理序列数据。未来三家将创建一个联合实验室，对生态数据分析以及生物研究型数据进行深度研究。　　作为行业创新和转型的引领者，英特尔致力于联合合作伙伴构建和完善精准医疗生态系统，以加速创新模式的落地。在今年4月深圳举办的英特尔信息技术峰会上，英特尔宣布基于阿里云平台部署的华大基因BGI Online实现全平台打通，并发布了针对英特尔至强E5处理器进行了优化的BGI Online基因计算一体机，帮助医疗机构更加高效、快捷的分析病患的基因数据。此次活动上，英特尔联合上海交通大学、上海市儿童医院签署战略合作备忘录，合作开发并培育“儿童健康协作云”(Collaborative Children’s Health Cloud, CCHC)平台，部署基于英特尔架构的浪潮基因组一体机及英特尔领导开发的研究工具。　　英特尔公司生命科学事业部总经理Ketan Paranjape认为，在2020年实现24小时之内完成包括基因序列检测、数据分析、疾病诊断，以及制定个性化治疗方案在内的精准医疗的主要过程，并进而让精准医疗早日惠及大众，这是英特尔在精准医疗领域持续努力的方向。“为了促成这一愿景的实现，英特尔期待通过领先的云到端技术创新优势、丰富的产业协作经验和用户支持策略，加速生物信息技术与云计算、数据分析等先进信息技术的融合，并支持产业伙伴进行解决方案创新”，Ketan表示。　　从大数据到海量数据，再到精准医疗 从计算到存储，再到医疗数据传输、医疗数据协同，信息技术和生命科学的结合已越来越紧密。相信，未来五到十年内，人类在很多不能跨越的领域会有新的突破，比如：癌症、心血管等疾病等，信息技术会帮助医疗行业突破挑战，给人类健康带来新的福音。

p 　　6月3日上午，由北京常春藤医学高端人才联盟、药明康德新药开发有限公司、中国行为法学会养生保健行为研究会主办，武汉国家生物产业基地建设管理办公室协办的2017北京常春藤医学高端人才联盟健康产业论坛正式开幕。本次论坛的议题是“医疗大数据的现在和未来”。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/c67742ec-7be4-4be8-8707-0094e827797b.jpg" title=" 201706061346185182_副本.jpg" / /p p 　　北京大学医学部主任、中国工程院院士詹启敏讲述了他对大数据与现代医学的理解。 /p p 　　演讲全文如下(有删减)： /p p 　　发言人：詹启敏 北京大学医学部主任、中国工程院院士 /p p 　　尊敬的各位专家，各位领导，各位朋友： /p p 　　大家下午好!非常高兴来参加第三届常春藤的健康产业大会。今天的主题是大数据，全世界都在关注大数据，而大数据也是中国健康事业发展的一个重要支撑。根据会议主题，我想从科技创新、精准医学、大数据三个方面来谈一下我对健康大数据的一些感想。 /p p 　　实际上今天所谈的健康是一个大健康的概念，首先，应该关注全生命周期，全民族覆盖，也就是从生命形成的第一天起一直到灵魂关怀，这就是大健康发展战略。 /p p 　　其次，大健康战略要关注健康全过程，从一个人的健康到他的亚健康、出现疾病高危因素、疾病前的症状、疾病的管理、康复和养老等健康的全程观念。 /p p 　　再次，大健康的策略要关注健康管理，要关注个人健康、家庭健康、事业健康、医院健康。今天中国一带一路以及中国的国际战略让医疗领域还要关注全球健康。 /p p 　　大健康是我国经济可持续发展的一个重要支撑，从2015年开始，中央审改小组启动一批国家重大工程，要解决三个95%的问题，第一个目前我国临床药物95%以上都是国外知识产权 第二是现在大型的医疗装备95%都是国外的 第三是现在一个疾病来了，怎么治?临床标准指南95%是国外的。 /p p 　　我国卫生健康事业主要分为四个部分，分别是医学科学研究、疾病的预警和监控、临床治疗以及健康管理和服务。健康大数据不是简单的收集过程，都暗含着科学的思维，同时还要研究产生这些数据的标准，数据的分析、伦理、安全等。更重要的是，以大数据为代表的科学研究，需要与社区健康需求紧密整合，这是大数据产生的主要来源——从临床和社区的问题或需求入手，进行转化研究，形成科学成果，在通过新的干预手段和管理措施，或者新的分子标记物和早期诊断方法等，回馈到服务临床和社区健康服务中去。 /p p 　　过去的发展模式很大程度上是基于环境污染和资源消耗在维持，这种方式不可持续，所以我国一直在寻新的经济增长模式。根据战略的研究，我国已经确定经济发展中的一个新亮点，就是健康经济。目前健康经济对于我国的贡献约为百分之七点几，发达国家一般在12%以上，美国是24%，所以我国健康经济推动我国总体发展仍存在很大的空间。 /p p 　　之所以说精准医学是健康大数据的源泉，是因为精准医学将一般信息的分析包括家庭信息、遗传信息、生活环境、生活方式等，与蛋白质组、基因组、代谢组、微生物组、分子影像、分子应用等多数据的信息精准整合在一起，所以有了精准的医疗，给健康医疗数据提供大量的、高质量的、结构化的数据。 /p p 　　人群发生的所有疾病，即使是一个资历很深的专家从医60年活到80岁，从医80年要活100多岁，但是对于整个临学来讲，我们看到的病是非常一线的。就像我们看的一个病不太清楚，我们所做的就是现在不行的话我们进行专家会诊，本院的专家会诊不行，我们请国际的专家会诊。这样做是为了什么? /p p 　　医生遇到不清楚的病情，目前能做的是上网查资料，无法解决时要进行本院专家会诊，甚至国际专家会诊。但是未来的智能医学数据库中会存在几百万、几千万、上亿万份的病例，包括从来没有见到过的疑难杂症，而且运算速度很快，随时为医生诊治提供线索。在知识量和判断速度方面，人都是无法与大数据库相比拟的，因此未来大数据会对医疗做出精准的决策。 /p p 　　这不是替代，而是为医生做出精准的医疗方案发挥重要的科技支撑。因此大数据是一个支撑，为精准医学数据发挥保驾护航的作用，像“惠民工程”，“大病不出县”等。智能医学支持国家的战略，人工智能已经成为国家重大的战略，未来智能医学是推动中国发展，支撑中国健康发展建设的重要组成部分。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/39588880-d0cc-49c0-b2e8-477832527758.jpg" title=" 201706061346466824_副本.jpg" / /p p 　　大数据为精准医学提供重要的支撑，精准医学可以提供海量优质的健康医疗大数据，基于健康医疗大数据的人工技术，可以促进精准医学的发展，最终实现精准医学服务于健康的目的。总结而言，完整的临床信息、多种形式的分析数据以及分子影像、分子病理、临床药物等数据，最后汇总形成大数据，它给医疗提供一个支撑，实现个性化的治疗，提高疗效，降低副作用，降低费用，这也就是我国医改的目的，通过这种方式可以支撑我国健康中国2030目标的实现。支撑伟大中国梦，中华民族的伟大复兴。 /p

事件:3月7日,科技部发布了国家重点研发计划,将“精准医学研究”列为2016年优先启动的重点专项之一,并发布了项目申报指南,实施周期为2016-2020年。被业界解读为标志着行业期待已久的精准医疗国家战略部署终于揭晓。 对此我们邀请了参与2016年项目指南编制的专家,中科院上海生命科学研究院马普计算生物学研究所生物医学大数据中心主任,上海生物信息技术研究中心主任李亦学教授,针对指南的意义、特点、产业影响等进行解读。主要结论如下: 国家重点研发计划“精准医学研究”专项的意义重大。1)顺应医药研发的国际发展趋势的国家战略部署 2)希望通过新的国家项目推动生物医学大数据的共享 3)设计原则是要发挥我国自身优势。 此次专项的性质和特点有别于以往专项。公益性(平台建成后数据共享)、系统性(闭环设计,涵盖范围、技术体系设计的完备性均超过了美国计划)、强制性(设置了一些约束条件以规避以往国家专项在共享机制上的缺陷)、中国特色(建立中国人群典型疾病精准医学临床方案)。 精准医学大数据平台的建设是精准医疗能否实现的重要关键。平台功能上,类似于美国的NCBI数据库,但内容和功能上有拓展 数据收集对象上,以科研院所和医院为主 数据质量上,指南有明确的考核指标 约束力上,将对申报单位提出数据汇交的强制性要求。将通过这些措施推进和保证平台顺利建设。 此次专项对精准医疗产业的影响总体积极,归根结底是国家层面在医疗大数据方面的一个前瞻性的布局。1)短期来看,专项对企业大数据将形成一定冲击,但长期来看,其通过推动数据链的整合服务于科研和产业创新链,将加速检测技术在临床的转化应用,企业可在自身技术和分析体系基础上,借助公共数据平台的支持,进行整合与价值挖掘 2)对整个产业链上下游都将是积极的带动作用。a、将带动检测行业上游分子检测诊断设备、试剂的研发与产业转化 b、利好中游提供基因检测服务、数据解读的公司。此项目将会产生大量测序和解读的需求,科研院所和医院很有可能通过与高质量的第三方公司合作提高进度和效率 c、将催化生物样本库、大型人群队列、生物医学大数据的深度发展。