靶向序列捕获

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靶向序列捕获相关的资讯

  • 安捷伦科技针对台式测序仪推出靶向序列捕获平台
    安捷伦科技针对台式测序仪推出靶向序列捕获平台 2012 年 2 月 14 日,佛罗里达州马科岛(基因组生物学和技术,AGBT)- 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)推出SureSelect 靶向序列捕获系统,支持台式测序仪的HaloPlex 靶向序列捕获系统。该产品将于明日在基因组生物学技术进展年会上正式亮相。 独特的HaloPlex 技术完美融合了聚合酶链反应系统的速度和特异性以及基于液相杂交体系的可扩展性和捕获片段大小的灵活性。该实验方案无需文库构建,利用单管操作,从而解决了多重 PCR 由于存在交叉杂交问题而使靶向序列数量受限的问题。该方案使样品制备时间缩短到不到一天,适用于 Illumina MiSeq 台式测序仪以及 HiSeq 和 GAIIx 测序仪。 &ldquo 虽然新一代测序技术使全基因组分析成为可能,但是当我们想要在数量庞大的个体中测定少部分基因时,我们通常会遇到如何富集的问题。&rdquo Hubrecht 研究所基因组生物学首席研究员 Edwin Cuppen 说,&ldquo 对于几个到几十个范围的目标基因捕获,当前的杂交捕获技术有其局限性。HaloPlex 技术很好地填补了这个空白,可以帮助我们实现了在单次反应中捕获 2 至 20 个基因的完整编码序列,而且其在目标序列片段的的测序效率超过 90 %。 &ldquo HaloPlex 富集技术与 Ion Torrent 半导体测序技术联用,这种灵活高效的组合非常适用于高通量的小片段靶向基因重测序。&rdquo Cuppen 博士参与了安捷伦针对Ion Torrent 平台推出的 HaloPlex 技术的早期测试项目。 &ldquo HaloPlex只是我们为进一步巩固 SureSelect市场 领先地位而制定雄心勃勃的产品开发项目的一个例子。&rdquo Olle Ericsson 说道。他是 Halo Genomics 创始人,目前在安捷伦担任 DNA 测序市场总监一职。&ldquo 面世后的短短两年时间内,SureSelect 就已被超过200 篇的重要学术论文引用,在研究领域发挥了重要作用。在台式测序和靶向序列捕获技术通往临床研究的道路中,HaloPlex 这一创新技术使安捷伦成为领跑者。 HaloPlex 是一款定制产品,用户使用免费的在线设计向导(Web Design Wizard),在不到 10 分钟时间内就可完成设计,富集数以千计的目标基因组序列。 安捷伦于 2011 年 12 月收购了位于瑞典乌普萨拉的 Halo Genomics,从而获得了该产品。HaloPlex 技术完美补充了 Agilent SureSelect 靶向序列捕获系统。这项新产品如今也受益于安捷伦强大的研发、生产和分销资源。 要了解更多信息,请访问 www.agilent.com/genomics/ngs。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18,700 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2011 财政年度,安捷伦的业务净收入为 66 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn
  • 安捷伦科技推出新一代测序产品,完善靶向序列捕获系统
    安捷伦科技推出新一代测序样品制备、靶向富集和自动化方案,完善靶向序列捕获系统 2010 年 11 月 3 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日发布新一代测序产品的新成员——安捷伦 SureSelect XT 靶向序列捕获系统,继续保持快速的新产品推出步伐。SureSelect XT 在成熟可靠的 SureSelect 靶向序列捕获系统的基础上,整合了测序文库制备系统和基因组 DNA 制备试剂。将该系统与安捷伦自动化产品搭配使用,即可畅享高性能靶向富集方案带来的超高效率和前所未有的便捷操作。 安捷伦SureSelect XT 靶向序列捕获系统 “安捷伦一直致力于帮助科学家简化样品制备流程,”安捷伦 SureSelect 平台业务经理 Fred P. Ernani 说道,“SureSelect XT 系统配备完全整合并经过验证的试剂,使工作流程效率达到一个新的水平。这套系统使研究人员有理由相信,他们的样品和资源必能产生高质量的数据。” 靶向富集使研究人员可以仅对目标基因组区域(而非整个基因组)进行测序,从而简化了工作流程。结合先进的新一代测序系统不断提升的性能,SureSelect XT 平台的多样本检测能力使基因学家可以在一次实验中相比以前探索更多样品的基因组。文库制备和靶向富集步骤一直是限制此类实验速度的瓶颈之一。为了实现高通量样品处理,安捷伦现已发布综合式工作站,用于SureSelect XT 文库制备和靶向富集工作流程的自动化。 “我们将安捷伦的自动化液体处理平台与 SureSelect XT 工作流程相结合,创造出了充分优化且成熟可靠的解决方案,从而使科学家能够平行处理多个操作步骤,最大程度地实现无人干预的自动化,”安捷伦全球自动化解决方案业务部营销经理 Todd P. Christian 说道,“这套系统的通量高于以往,每个工作站每周可处理 192 个样品,并可快速生成数据,显著提高实验室工作效率,其强大的性能有目共睹。” 安捷伦的自动化液体处理平台与 SureSelect XT 工作流程相结合 SureSelect XT 发布后,安捷伦 SureSelect 试剂盒的种类升至 32 种(第一种试剂盒于 2009 年 2 月发布)。本年内就有 17 篇文献引用了该系统,涉及多种遗传性疾病研究。与此同时,安捷伦“通过指定元素降低序列复杂性的方法”的专利申请获得美国专利局通过,专利号为 10/927809,从而进一步扩大了靶向富集知识产权的范围。该专利包括了一种制备指定核酸混合物的方法。在某些实例中,该方法使用与固相载体相连的寡核苷酸探针作为序列特异性亲和物,来分离指定核酸片段混合物并促使其扩增。多年以来,安捷伦不遗余力地在基因组学研究领域进行突破性的技术创新,获得该项专利授权实至名归。 安捷伦 SureSelectXT 靶向序列捕获系统提供目前市场上最全面的靶向富集产品以及针对多种不同测序方法和平台的最优化方案。SureSelect XT 产品实现在单管中富集从 200 Kb 到超过 50 Mb 的靶向序列。本方案除了可以支持Illumina单末端测序、双末端测序和索引方案外,还支持SOLiD系统上的片段文库格式、双末端测序和条形码方案。 SureSelect XT 还为客户提供高度灵活的定制化产品。用户使用安捷伦eArray xD桌面设计工具,可以轻松设计出在单管中捕获任意目标基因组的定制产品,从而提高研究效率。安捷伦还提供eArray在线设计工具,用户使用该工具可定制和安捷伦目录SureSelect试剂盒类似的产品,例如 SureSelect 人全外显子系列产品。 关于安捷伦科技公司 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18500 名员工在 100 多个国家为客户服务。2009 财政年度,安捷伦的业务净收入为 45 亿美元。要了解更多安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn
  • 安捷伦科技针对新一代测序仪的靶向序列捕获技术提速四倍
    安捷伦科技针对新一代测序仪的靶向序列捕获技术提速四倍 2012 年 3 月 26日,加利福尼亚州圣克拉拉市&mdash &mdash 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)推出了 HaloPlex 靶向序列捕获系统的加速版本,该版本适用于台式测序仪。使用该系统后,从前需要大约 24 小时才能完成的实验方案,现在不到 6 小时便可轻松结束。这就意味着,用户可在一个工作班次内完成从样品制备到测序的一系列流程。 &ldquo 我们近期有机会参与了6小时操作流程的早期测试。应用这一新流程,我们在早晨开始准备文库,下午就可以开始测序。&rdquo Ontario癌症研究所Andrew Brown说:&ldquo 实验结果表明,无论是血液还是石蜡包埋样本,也不论是900ng还是100ng的gDNA起始量,我们都可以清晰无误地检测出变异。&rdquo 新的 HaloPlex 系统只需要 200 ng DNA,仅仅是以前用量的四分之一,可以大大节省珍贵的样品。HaloPlex 也可用于石蜡包埋样本。该产品随试剂盒配有 96 种不同的索引序列,支持同时对多个样品进行平行测序。 独特的 HaloPlex 技术完美融合了聚合酶链反应系统的速度和特异性以及基于液相杂交体系的可扩展性和捕获片段大小的灵活性。该实验方案无需文库构建,利用单管操作,从而解决了多重 PCR 由于存在交叉杂交问题而使靶向序列数量受限的问题。该实验方案适用于 Illumina MiSeq 台式测序仪以及 HiSeq 和 GAIIx 测序仪。该工作流程比杂交捕获和微流体 PCR 方法更加简便快捷。 Halo Genomics 创始人、现安捷伦 DNA 测序市场部主管 Olle Ericsson说道:&ldquo HaloPlex 是一项创新技术,在台式测序和靶向序列捕获广泛用于临床研究的当今,使用该系统能够产生巨大价值。这个版本运行周期短、定制简单,能够完全满足行业需求。&rdquo HaloPlex 是一款定制产品。用户使用免费的在线设计向导(Web Design Wizard),在不到 10 分钟时间内就可完成设计,富集数以千计的目标基因组序列。 安捷伦于 2011 年 12 月收购了位于瑞典乌普萨拉的 Halo Genomics 公司和 HaloPlex 平台。这项新产品如今也受益于安捷伦强大的研发、生产和分销资源。HaloPlex 技术完美补充了安捷伦 SureSelect 靶向序列捕获系统。 要了解更多信息,请访问 www.agilent.com.cn/genomics/ngs。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18,700 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2011 财政年度,安捷伦的业务净收入为66 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn. 编者注:更多有关安捷伦科技公司的技术、企业社会责任和行政新闻,请访问安捷伦新闻网站:www.agilent.com.cn/go/news。

靶向序列捕获相关的方案

  • 靶向序列捕获和新一代测序前对福尔马林固定石蜡包埋组织及新鲜冷冻组织进行 DNA 质量控制
    本文将介绍利用 Agilent 2100 生物分析仪系统的微流控芯片电泳,在新一代测序工作流程的 SureSelect 靶向序列捕获之前或期间,对福尔马林固定石蜡包埋组织及新鲜冷冻组织的 DNA 样品进行质量控制。借助 2100 生物分析仪系统可靠的 DNA 电泳技术,可提供弥散条带谱及详细的文库统计信息,例如峰高、平均弥散条带分子量、分子量分布和 DNA 浓度。FFPE DNA 样品的结果与新鲜冷冻组织和对照 DNA 的 DNA 分析结果具有可比性。
  • 六种不同文库制备试剂盒用于 FFPE 样品外显子序列捕获应用的比较
    外显子组测序和靶向基因组合测序是常用的新一代测序 (NGS) 方法,用于鉴定和表征科研与临床样品(如癌症样本)中的不同基因突变。基因组合靶标设计、实验室处理操作和生物信息学分析等许多因素都会影响变异/畸变检测的灵敏度和准确性。本文展示相同 FFPE 样品在多个供应商的六种不同文库制备试剂盒中得到的对比结果。在 100X 原始测序深度下,Agilent SureSelectXT HS 文库制备试剂盒在四个关键指标上表现出最佳性能,即在靶率、平均读出序列深度、20X 读出序列深度下的靶标碱基覆盖率以及捕获前文库产率。供应商 A 试剂盒在 20X 读出序列深度下的靶标碱基覆盖率和捕获前文库产率两个指标中排名第二;供应商 E 在在靶率和平均读出序列深度两个指标中排名第二。总体来说,Agilent SureSelectXT HS 试剂盒的性能优于评估的其他 5 种试剂盒。
  • 利用 Agilent 2200 TapeStation 系统为新一代测序文库制备及 SureSelect 靶向 序列捕获进行全程样品质量控制
    Agilent 2200 TapeStation 系统可对新一代测序 (NGS) 工作流程中的样品进行全程分析,从最初的起始材料一直到测序前的最终 DNA 文库质量控制 (QC)。本应用简报遵循 SureSelect 文库制备实验方案,展示了基因组 DNA ScreenTape、D1000 ScreenTape 及高灵敏度 D1000 ScreenTape 分析方法对该工作流程中样品的分析性能及适用性。数据证明了 2200 TapeStation 系统是可靠的文库分子量测定及定量分析 QC 平台。数据还证明了这些 DNA ScreenTape 分析方法与 Agilent 2100 生物分析仪的相应分析方法具有可比性,并在其性能指标内。

靶向序列捕获相关的论坛

  • 岛津气相序列不运行

    岛津[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相[/url]编好序列之后,点击开始运行,但是并没有抓取任何试剂,是怎么回事?

靶向序列捕获相关的资料

靶向序列捕获相关的仪器

  • Applied Biosystems Arcturus Cellect激光捕获显微切割系统专为激光捕获显微切割而打造,采用双重激光器设计,让您在精准捕获分析所需细胞的同时,不用担心污染问题或对细胞形态的影响。温和的红外激光器与强大的紫外切割激光器相结合,完善了下游研究分析所需的精度和性能。主要功能和优势:双激光器 - 支持从单细胞分离到大规模活检提取等各种应用,增加可用性,确保能可靠地捕获各类型样本中的细胞。直观的软件 - 只需五个简单步骤即可快速分离特定细胞,直观地进行质量控制,简化记录和样本保管工作。服务和支持 - 提供培训和 48 小时响应内响应服务,确保您的工作不间断。灵活的样本制备 - 支持多种载玻片和样本制备方法。可配合现有工作流程或者经我们验证的工作流程使用。紧凑的设计 - 与同类显微镜和激光系统相比,占用空间缩小约32%,为您节省工作台空间。双激光器,功能加倍Arcturus LCM系统独有的固态红外激光器提供温和的捕获技术,可保持细胞的整体生物分子完整性,是单细胞和少量细胞分析的理想选择。固态紫外激光器具有卓越的速度和精度特性,非常适用于致密组织结构的显微切割和大量细胞的快速捕获。易用型Arcturus软件仪器随附的Arcturus软件简化了LCM工作流程。只需点击鼠标,即可控制所有系统操作,包括载物台移动、载玻片和物镜选择、聚焦/光强度、激光参数、收集帽转移、QC转移和确认以及摄像头设置。该软件五步简化LCM工作流程,支持快速分离特定细胞,并通过直观地质量控制,简化记录和样本保管工作。多种解决方案,辅助下游分析无论您是需要应用在大片组织富集、厚硬组织切割、还是混合样本捕获,都能在LCM系统找到合适的解决方案。根据样本类型,提供多种耗材,可搭配常规载玻片、玻璃膜玻片、非接触式的金属框架膜玻片、无污染细胞培养皿/腔等;或是需要搭配不同的上下游试剂进行染色、纯化或扩增,您的每步都能找到所需的试剂耗材。自90年代问世以来,Arcturus LCM系统全球各地实验室提供卓越的细胞富集技术,至今已有超过1400篇Arcturus应用文献发表。即使是不同应用方向也能通过LCM平台,获取出色的富集结果,揭示准确的细胞特异性分子特征,并将精准富集的蛋白或核酸分子,进行后续质谱、基因芯片、二代测序(NGS)、一代测序(毛细管电泳)、qPCR分析等。
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  • 安捷伦微电子捕获检测器 (micro-ECD) 作为安捷伦气相色谱系统的一部分,可提供卤代有机化合物和芳香族污染物的痕量分析。重要的设计革新使其在拥有耐用性与可靠性的同时,享有出色的灵敏度和线性。凭借安捷伦的微电子捕获检测器,您可以花费更少的时间用于维护而将更多的时间用于样品分析。 特性:检测区域的体积较小,可实现出色的灵敏度8890 气相色谱仪对林丹的 MDL 为 3.8 fg/mL宽动态线性范围,可对每毫升含飞克到纳克级未知浓度化合物的样品进行准确定量,例如林丹的线性 5 x 10^4符合 U.S. EPA 合同实验室计划对农药 1 到 500 pg/µ L 的线性要求以更高的线性流速通过检测区域,可以减少分析物停留时间、降低对检测池的污染,并延长正常运行时间隐性阳极大大地降低了污染物接触阳极的机会优化的电场大大减少了对检测池的污染5 到 500 Hz 的采样速率使其成为快速色谱分析的理想选择
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  • 果汁筛选分析服务 SGF Profiling SGF Profiling™ 为一种基于核磁的水果果汁筛选方法,它是Bruker BioSpin GmbH和SGF International e.V.联合研发的结果。对于每一种果汁,几分钟内采集一个数据列,同时评估与质量和可靠性相关的大量参数。 特点包括评估和报告在内的400兆核磁自动按键NMR解决方案。可靠的筛选方法,提供靶向和非靶向的多标记物分析统计分析基于从全世界生产线获取超过1万6千种参考果汁的大量核磁图谱数据库,并定期更新。定向分析:参考A.I.J.N. 和NMR分布,同时绝对量化相关有机物。非靶向分析:核磁图与对应的参考图谱组做比较,自动监测浓度偏差(甚至对于未知化合物)。分类分析,如测定水果产地(见规格表)。测定水果含量(监测加入的水,氨基酸或糖 统计分析 靶向性和非靶向性多标记分析 Verification models are used for the non-targeted analysis of even unknown compounds自旋指纹筛选提供标准的靶向性多标记分析,其中包含以下各项的绝对定量:糖分(葡萄糖、果糖、蔗糖)主要果酸(柠檬酸、苹果酸、异柠檬酸、奎宁酸)易腐性指标(乙醇、富马酸、乳酸、HMF)流程控制参数(半乳糖醛酸、氯)此外,该技术允许采用非靶向性多标记方法,该方法则基于上百种化合物的浓度差异同步评估。相比靶向性标准分析常规,它可以检测出意外成分的存在,从而检测出未知欺诈。 光谱数据库在广泛的光谱数据库基础上进行筛选,该数据库包括来自主要正宗果汁的上千种 NMR 光谱。目前,该数据库含有约 40 种不同的水果,来自全球 50 多个产地。此外,该数据库还允许访问上百种小分子化合物,以便进一步分析未知成分。 按键式常规程序自旋指纹筛选是全自动按键式常规程序,无需操作人员之间的互动。从样品条码注册、配制和处理到数据捕获和统计评估,所有步骤都在 Bruker 实验室信息系统 SampleTrack™ 的控制之下。 报告 定量 自旋指纹筛选提供超过 30 种成分的绝对浓度,这对果汁评估非常关键。数值与参考标准相比较,出现偏差则表示特征质量存在问题,例如添加了糖分。 样品分类 样品分类有助于进一步区分类似的水果类型,例如橙子、血橙和柑橘。更专业的模型甚至可以分辨纯果汁和稀释果汁,并且能确定原产地。 验证 进行样品分类后,单变量和多变量验证可提供更多的信息,例如相比参照组别的意外偏差。回归分析 基于定型数据集的回归分析可评估额外的参数,例如滴定酸度。 水果成分估算 最终报告中还包括水果成分的估算SGF Profiling archives all results in the form of a standardized sample quality report
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靶向序列捕获相关的耗材

  • 高分辨率微阵列扫描仪 G2565CA
    产品特点:安捷伦微阵列解决方案采用SureScan 高分辨技术的安捷伦DNA 微阵列扫描仪工作流程解决方案* 基因表达谱 — 支持多种模式生物,在全基因组水平上研究基因转录* 比较基因组杂交 — 支持从多种样品类型及 FFPE 组织中进行高分辨率的全基因组水平的DNA 拷贝数变化的分析* 小 RNA — 提供最完善的实验室操作流程和及时更新的微阵列设计方案,分析小 RNA 表达谱并研究其在基因调节中的作用* 染色质免疫沉淀法 — 探讨蛋白质 — DNA 相互作用在转录、复制、修饰和修复过程中的作用* DNA 甲基化 — 提供高分辨率的全基因组甲基化谱,进一步了解哺乳动物 DNA 甲基化和基因调节的机理* 靶向序列捕获 — 结合下一代测序技术,关注感兴趣的关键基因组区域,解决费用问题,实现对基因多样性更加深入的研究订购信息:采用 SureScan 高分辨技术的安捷伦 DNA 微阵列扫描仪产品描述部件号高分辨率微阵列扫描仪系统G2565CA扫描仪升级,从 G2565BA 到 G2565CAG2539A 附件杂交炉旋转架G2530-60029杂交芯片夹(不锈钢)G2534A芯片固定夹, 1 阵列/片5 片/包*G2534-60003 芯片固定夹 , 2 阵列/片5 片/包*G2534-60002 芯片固定夹, 4 阵列/片5 片/包*G2534-60011 芯片固定夹, 8 阵列/片5 片/包*G2534-60014 *提供大包装的同样产品
  • Human Fab 捕获试剂盒
    可直接捕获人抗体Fab片段,用于筛选和鉴定通常由噬菌体展示产生的含有人 Fab片段的样品。样品可包括粗细胞裂解物、提取物或纯化的Fab片段。
  • Dionex 氨基酸捕获柱 046122
    Dionex 氨基酸捕获柱对于单糖分析,使用的Thermo Scientific 戴安AminoTrap柱,直到单糖被洗脱,保留干扰氨基酸。在地方保护柱和一个分析碳水化合物单糖柱,如戴安CARBOPACPA20或PA10 CARBOPAC柱之前安装此在线预处理列。在此配置中,AminoTrap柱消除了对样品如糖蛋白水解产物或含有赖氨酸的食物来源的工作电极的结垢。
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