皮氏罗尔斯通氏菌

范欣, 肖盟, 徐志鹏, 张戈，陈欣欣，徐英春. （中国医学科学院　北京协和医学院北京协和医院检验科） 国产基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱系统Clin－TOF－Ⅱ MS与Bruker Biotyper质谱系统在革兰阴性菌的鉴定效能评估 [J]. 中华检验医学杂志,2017,40( 1 ): 41-45. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2017.01.009 编者按北京毅新博创生物科技有限公司是国内首家自主研发临床质谱的企业，也是第一家国产质谱走出国门走向世界的企业。该公司研发的clin-tof质谱系统是国内第一个通过CFDA认证的质谱系统。本文节选北京协和医院检验科徐英春主任最新发表在《中华检验医学杂志》上的研究论文，该研究验证了国产Clin-TOF质谱系统在革兰阴性菌方面的鉴定能力与Bruker质谱系统相当，都有非常好的鉴定效能。 该研究旨在评估国产基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱系统Clin－TOF－Ⅱ型仪器及其搭载的BioExplorer V2.3鉴定数据库(简称Clin－TOF质谱系统)对革兰阴性菌的鉴定效能。共纳入1999至2000年及2014至2016年北京协和医院革兰阴性菌1025株，分属32个属，56个种或种复合体。其中，肠杆菌科细菌覆盖13个菌属；非发酵菌覆盖7个菌属；以及其他12个菌属的少见革兰阴性菌。另外，该研究纳入了临床常用的革兰阴性ATCC标准菌株，包括大肠埃希菌ATCC 8739、ATCC35218、ATCC25922、流感嗜血杆菌ATCC 49247、ATCC 49766、铜绿假单胞菌ATCC 27853。对照方法为Bruker Biotyper质谱系统：Bruker Autoflex Speed型号仪器及其搭载的Biotyper v3.1数据库(简称Bruker质谱系统)。采用直接涂抹法平行使用2套质谱系统对研究纳入菌株进行菌种鉴定。结果显示，Clin－TOF质谱系统准确鉴定率为98.05%(1 005/1 025)。该研究表明国产Clin－TOF质谱系统在鉴定革兰阴性菌方面有临床效能。 1.鉴定准确性Clin-TOF质谱系统临床菌株准确鉴定率为98.05%（1 005/1025）。2.肠肝菌科细菌对于689株肠杆菌科细菌来讲，包括埃希菌属、克雷伯菌属、肠杆菌属、沙雷菌属、枸橼酸杆菌属、变形杆菌属、摩根菌属、沙门菌属、普罗威斯登菌属、柔特勒菌属、多源菌属等，Clin-TOF质谱系统能够准确鉴定98.98%（682/689）的肠杆菌科细菌。3.非发酵菌对于306株非发酵菌，包括假单胞菌属、不动杆菌属、无色杆菌属、窄食单胞菌属、金黄杆菌属、莫拉菌属、产碱杆菌属等，Clin-TOF质谱鉴定系统准确鉴定率达到97.71%（299/306）。4.少见革兰阴性菌该研究纳入的30株少见格兰阴性菌，包括苍白杆菌属、伊金菌属、嗜血杆菌属、气单胞菌属、罗尔斯通菌属、勒克菌属、巴斯德菌属等。Clin-TOF质谱系统准确鉴定率为80%（24/30）。 Clin-tof质谱系统搭载的最新的BioExplorerV2.3数据库是我国自主研发建立的数据库，因此对我国临床病原菌鉴定有一定的针对性。Clin－TOF质谱系统与Bruker质谱系统的鉴定准确率均为98%以上， 国产clin-tof质谱系统在革兰阴性菌方面的鉴定能力与bruker质谱系统相当，都有非常好的鉴定效能。 Clin－TOF质谱系统简介Clin－TOF飞行时间质谱系统由国内首家自主研发临床质谱的企业——北京毅新博创生物科技有限公司生产。该公司的Clin－TOF－Ⅰ质谱系统于2012年即通过了欧盟 CE IVD 认证和美国FDA 认证，2014 年通过中国 CFDA 认证 。Clin－TOF－Ⅱ 临床质谱仪于 2016 年通过欧盟 CE IVD 认证，具有1200mm长度的飞行管，因此，比Clin－TOF－Ⅰ（飞行管长度800mm）具有更高的灵敏度、分辨率和精准度：在蛋白组学、基因组学应用基础上，拓展了微生物组学应用领域，拥有超过370属、2200种、7900株的微生物谱库，可对临床样本或培养后临床样本进行细菌、真菌、分支杆菌鉴定。Clin－TOF临床质谱仪，在蛋白组学研究方面，可进行生物样品的蛋白、多肽及蛋白糖基化修饰检测，是蛋白组学研究的有效技术手段；在基因组学研究方面，直接以核酸片段的分子量为标记，对核酸进行精确的定性定量分析，适用于各种类型的SNP基因型核酸分析实验，可用于肿瘤ctDNA、药物基因、遗传代谢疾病基因检测。Clin－TOF质谱系统是目前应用质谱技术对疾病蛋白质组、基因组、微生物组进行全方位研究的先进技术平台。 Clin－TOF质谱系统特点Clin－TOF飞行时间质谱系统具有功能多样及高通量的特点，可实现蛋白质及多肽检测、核酸检测、微生物检测多种功能，且具有快速检测大样本量标本的特点，该系统适合应用于临床检验项目。不同分析目标要求不同的样品处理及研究方法。疾病蛋白质组研究：样品（体液/组织/细胞）中的蛋白、多肽提取（液相色谱/固相芯片/液相芯片）→质谱检测→软件分析图谱→多肽鉴定→临床模型建立。基因组学研究：样品中的DNA提取→PCR扩增→SAP消化→单碱基延伸→树脂纯化、上样→质谱检测→核酸分型。微生物组学研究：菌种分离→菌种培养→样本提取、上样→质谱检测→微生物谱库检索、鉴定。

据物理学家组织网9月4日(北京时间)报道，英国伍尔弗汉普顿大学科学家9月3日在普通微生物学会秋季会议上报告的一项研究结果称，借助一种细菌，用俗称地沟油的废弃食用油作为原材料就能以较高效率合成可降解生物塑料，一旦实现规模化生产，不仅可减少环境污染，还可为医疗植入物提供合适的高品质塑料。 　　不可降解的塑料在废弃后处置过程中会造成重大的环境问题。过去二十年来，在英国海滩上的废塑料只增不减，现已占到海洋垃圾约60%。而由多种细菌合成的聚羟基脂肪酸酯(PHA)家族是可降解生物塑料，其中的聚3-羟基丁酸酯(PHB)最常用，推广这种可生物降解塑料将有助于减少环境污染。 　　目前，细菌在大型发酵罐中生成这种高质量生物塑料所用的原料是葡萄糖，成本较高，严重制约了生物塑料的商业化。而新研究表明，使用废食用油作为原料可以降低塑料的生产成本。 　　研究人员解释说：“我们生产生物塑料的细菌——罗尔斯通氏菌菌株H16，在油中超过48小时时间里比在葡萄糖中产生3倍之多的PHB。与英国伯明翰大学研究合作的电纺丝法实验结果表明，产生于油中的塑料纳米纤维，具有很低的结晶，这意味着该塑料更适合于医疗应用。”以前的研究表明，PHB因生物降解性和无毒特性，可在肿瘤治疗中用作传输药物的微胶囊，也可作为医用植入物。 　　采用地沟油制造生物塑料，对环境的好处可谓一举两得。因为它不仅可以产生可以降解的生物塑料，也减少了地沟油对环境的污染。该研究团队的下一个挑战是，适当扩大试验规模，以在工业领域实现生物塑料的规模化生产。 　　总编辑圈点 　　地沟油回流餐桌着实让人伤透脑筋，在地沟油人人喊打的今天，如何将其合理利用，成为新一轮的热点。不论是将其生产出生物柴油，还是制造出生物塑料，最好的解决办法就是进行循环利用，变废为宝。随着国家打击力度的加大，地沟油渐渐地无处遁形，而相较于德国每桶泔水有身份证、英国专设废油垃圾桶，我国的地沟油“战争”还有很艰巨的任务要完成。

当通用电气与西门子在收购阿尔斯通一役闹得不可开交时，因西门子的忽然退出而出现了转折。未来通用电气是否能够顺利收购阿尔斯通，还存在一系列的变数。 　　收购失败 　　西门子在上周末表态，将放弃西门子-三菱重工财团(下称&ldquo 西门子&rdquo )对阿尔斯通业务的收购，从而给了通用电气机会。而这也是因为法国政府对外正式表态支持通用电气之后，西门子所作出的最新回应。 　　法国经济部长阿诺· 蒙特堡(Arnaud Montebourg)说，无论是通用电气还是西门子的要约，都没有达到法国政府的要求，不过法国政府将会把这个机会给通用电气，并合作确定一个新的收购方案。另外，该部长还说，很感谢西门子提交的竞购要约，尽管该要约是很严肃的，但政府心意已决。法国政府将以市场价格从阿尔斯通的大股东(布伊格集团)手里收购该公司20%的股份，并且表示，让该公司的关键决策中心留在法国非常重要。 　　有媒体报道称，西门子的首席执行官Joe Kaeser说，他们尊重且理解法国政府在能源技术领域的利益。但是，若是从工业和战略可持续性、从财务和社会的角度看，西门子与三菱重工的联合竞购都可被证明是更加优厚的收购要约。 　　西门子提高价码仍未果 　　西门子宣布进入阿尔斯通收购战的时间大约在4月底。而在6月16日，其又表示，与日本三菱重工联合提交一份价值70亿欧元的收购方案。 　　该方案其实就是现金收购。按照计划，西门子计划39亿欧元接手阿尔斯通燃气轮机业务，包括与该业务相关的服务合同。三菱重工则会出价31亿欧元，参与40%的阿尔斯通蒸汽涡轮机业务、20%的网络技术业务和20%的水力业务，并希望以股东身份最高持有阿尔斯通10%的股份。当时西门子的总收购价码在142亿欧元左右(含现金收购)。而紧接着的6月20日，西门子再度提高自己的收购出价，总额达到146亿欧元，现金部分增加至82亿欧元。 　　在这种情况下，先期提出收购的通用电气也很快做出回应。 　　该公司的新方案是，将原来的170亿美元收购价格降低 GE和阿尔斯通分别设立三家合资企业，双方在合资企业的持股比例各占50%，主要负责两家企业的电网、阿尔斯通的离岸风电和水电、核电等业务。上述做法可能也是最终打消法政府对于核电业务被出售的担心，以实际行动向法政府示好。事实上，通用电气CEO杰夫· 伊梅尔特就在上周频繁会见法国政府官员，希望得到对方的支持。伊梅尔特强调，新收购条件使得法国的决策地位得以保留，而且阿尔斯通也将会保留自己的运输业务。同时通用电气还称，未来会在法国创造千个工作岗位。不过这一方案尚未得到法政府的最后确认，法政府强调会继续修改收购方案。 　　西门子、法国阿尔斯通及通用电气在华相关人士都未对该事件予以评论。 　　阿尔斯通目前处在业绩下滑的境遇下，给予了收购方绝好的时机。2013财年，阿尔斯通实现了215亿欧元的新订单额，同比下降10% 营业利润率为7%。而受到较高的结构重组开支和财务费用、特定的销账及拨备影响，其净收益为5.56亿欧元，比上一年的7.68亿欧元下滑了27.6%，全年的现金流为-1.71亿欧元。