奈非那韦砜标准品

导 读弧菌是一种普遍存在的革兰氏阴性菌属，广泛存在于温带水生和海洋环境中，随着水温升高，给人类健康带来新的问题，弧菌由100多种弧菌属组成，其中12种可致人类感染，其中霍乱弧菌最为常见，可引起严重腹泻病，其他两种常见的非霍乱弧菌是副溶血性弧菌和创伤弧菌，与弧菌病有关，例如伤口感染、败血症和胃肠炎，主要通过接触受污染的水和食用受污染的海产品（主要是牡蛎）传人。弧菌的表征与检测正在从基于培养的传统方法转向新方法的应用，如定量PCR，数字PCR，NGS等。瑞士科学家发表于BMC Genomics的文章“Vibrio-Sequins - dPCR-traceable DNA standards for quantitative genomics of Vibrio spp”建立Vibrio-Sequins的DNA标准使用数字PCR（dPCR）进行绝对定量，再通过DNA标准品对弧菌属进行NGS测序定量分析，降低文库制备和测序的技术偏差。应用亮点：▶ 开发六种DNA标准品，命名为Vibrio-Sequins ，同时配套优化的 TaqMan检测方法，用于dPCR方法进行DNA文库绝对定量拷贝数浓度（cp/μL）的检测。定量限LOQ 范围：20-120 cp/μL，检测限LOD均为 ~ 10 cp/μL。▶ 数字PCR作为更精准的方法，用于验证NGS定量方法的准确性。▶ 通过DNA标准品将NGS和dPCR两种技术串联应用，提高基于NGS测序定量分析的精密度和准确度。研究成果：dPCR方法验证（A）三种用于定量弧菌DNA基质中Vibrio-Sequins的双链dPCR 方法（HC1-LC1、rplA-xni、ushA-valS）拷贝数浓度对数的线性拟合分析。（B）用于定量弧菌DNA 基质中Vibrio-Sequins的三种 dPCR 方法（HC1-LC1、rplA-xni、ushA-valS）的未转化的线性关系。斜率表示标准品的Qubit和dPCR 测量值之间的差异。（A-B）测量相应标准品的PCR扩增子的拷贝数范围为3–50000 cp/μL。数据表示扩展测量不确定度（±MU）的平均值 （n = 10 nruns= 3）。（C）Vibrio-Sequins标准品的dPCR方法验证的相关结果。显示的数据是三次dPCR实验总体平均拷贝数浓度（cp/μL）和总体CV值（%），重复性（%），批间重复性（%），标准不确定度（%），以及k=2的MU不确定度。Vibrio-Sequins进行归一化和定量NGS分析（A） 散点图显示单DNA文库中Vibrio-Sequins标准品的预期拷贝数浓度 （cp/μL）与测量拷贝数浓度 （cp/μL） 的线性关系。预期拷贝数浓度是指在对样品进行加标后为每个标准品计算的拷贝数浓度，基于Vibrio-Sequins的dPCR定量结果。测得拷贝数浓度是指样品经过文库制备后dPCR测得的拷贝数浓度。图中显示了Vibrio-Sequins混合物（1 = 圆形和 2 = 正方形）的六种标准品 HC1（紫黑色）、LC1（深蓝色）、rplA（青蓝色）、ushA（绿色）、valS（浅绿色）和 xni（黄色）中每个标准品的单个重复的拷贝数 （cp/μL）（1 = 圆形），以及变异系数（黑色）±变异系数 （%CV n = 10）。（B） DNA 文库中Vibrio-Sequins测序定量的准确性。散点图显示了Vibrio-Sequins中（1 = 圆形和 2 = 正方形）六种标准品 HC1 （蓝色）、LC1 （紫色）、rplA （粉红色）、ushA （红色）、valS （橙色） 和 xni（黄色）中每个标准品单个重复的非归一化覆盖率 （1 = 圆形和 2 = 正方形） 与Vibrio-Sequins的投入浓度 （attomoles/μL）。（C） DNA 文库 （S28-S47） 内Vibrio-Sequins测序定量的准确性。散点图显示了两种Vibrio-Sequins（1 = 圆形和 2 = 正方形）中六种标准品 HC1（淡紫色）、LC1（紫色）、rplA （粉红色）、ushA（红色）、valS（橙色）和 xni（黄色）中每个标准品单个重复的归一化覆盖率 （1 = 圆形和 2 = 正方形） 与Vibrio-Sequins的投入浓度 （attomoles/μL）。通过对DNA文库中Vibrio-Sequins的最低覆盖率进行子采样读取，进行归一化。（D） 三种不同的弧菌DNA混合物（A、B 和 C）由 Qubit 定量，包括来自霍乱弧菌、副溶血性弧菌、创伤弧菌和梅茨尼科维弧菌的不同量的DNA，并以 2%的丰度加入Vibrio-Sequins混合物 1（混入 A 和 B）或Vibrio-Sequins混合物 2（混入C）。（E） 采用 [23] 中开发的方法，使用DNA文库（S28、S29和S38 = 弧菌混合物A-C）中Vibrio-Sequins的dPCR拷贝数浓度（cp/μL），针对三种弧菌DNA混合物（A、B 和 C）中的对弧菌来源的DNA进行定量。微生物DNA的基因组分析和定量越来越多地应用于弧菌属的基础研究和诊断。与传统的基于培养的方法相比，基于测序的方法的显著优势是不需要任何关于样品的前期信息。此外，可以检测到非常少量的弧菌衍生DNA以及不可培养的弧菌菌株。然而，尽管（宏）基因组学具有不可或缺的技术优势，但由于文库制备、测序和比对过程中出现的技术偏差，很难对结果数据进行定量分析和样本间比较。Vibrio-Sequins可用于确定和减少误差源和DNA文库间的差异，也可用于在不同的文库制备和测序方法之间、实验和批间以及单个 DNA 文库之间进行归一化，保留生物学上有意义的差异的同时，显著减少技术变量来源的偏差。除了质量标准化外，Vibrio-Sequins还是弧菌属 DNA定量的重要工具。作者已经证明，通过将NGS与可量值溯源标准品的 dPCR 方法串联，并通过使用Vibrio-Sequins标准品，实现了混合样本中几种弧菌 DNA 的精确定量。因此，该方法可能应用于定量宏基因组样品中未知数量的DNA，从而能够检测痕量的弧菌DNA。Vibrio-Sequins的实施以及NGS与dPCR的联合应用，将提高现有宏基因组测序方法的准确性。结论：通过参考标准品将NGS和dPCR联合应用，提高基于NGS的定量方法的精密度和准确度，为测序定量的计量可追溯性提供了途径，为将测量科学整合到基于NGS的方法中开辟了新思路。原文链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10318669/艾普拜生物为您提供标准品开发和定值服务，针对您的需求全程定制化服务，满足您的实验需求。目前已服务几十家客户，广受好评。

有人举报，汉阳墨水湖北路一超市内，10.8元一袋的核桃豆腐花，标有“低糖”字样，其实不然。工商人员到超市调查发现，该产品由佛山市碧泉食品公司生产，厂家提供的“低糖豆腐脑”鉴定报告显示：每100克含糖68.9克，符合该企业在当地备案的企业标准，却不符合低糖标准。 　　根据规定，强调某种或数种配料的含量较低或较高时，应标识所强调配料在产品中的含量。就“低糖”而言，每100克食品内，蔗糖含量不超过5克，才能称得上“低糖” 含量低于0.5克的，才能叫“无糖”或“不含糖” 蔗糖含量比一般基准食品，减少25%以上的，才能称作“减糖”食品。 　　工商人员在抽查中还发现，维维豆奶的“高钙低糖”豆奶粉，100克产品中，钙≥450毫克，符合“高钙”食品的规定(每100克固体食品中，钙含量≥240毫克)。可是总糖标称小于45克，大大超过了5克的“低糖”标准。厂方说，他们执行的是企业标准，也达到了企业标准――总糖含量为40-70克的要求。 　　被抽查的荔波牌的中老年“高钙”核桃粉和众德牌的牛奶“高钙”燕麦片，标称的钙含量，也没达到相关“高钙”的标准。 　　目前，工商部门已责令商家整改，昨日，又对涉嫌虚假宣传的厂商，立案调查。

OMP是未纳入我国食品卫生标准管理的食品原料 　　专家目前分析认为OMP牛奶尚属安全 　　近一段时期以来，蒙牛公司特仑苏牛奶中OMP安全性问题受到社会广泛关注。卫生部有关部门负责人昨天接受本报记者采访时表示，虽然不会对人体造成健康危害，但是 OMP不属于我国批准使用的食品添加剂，也不属于申报新资源食品的范围，而是未纳入我国现行食品卫生标准管理的食品原料。蒙牛公司进口该产品作为食品原料使用，应依照《食品卫生法》第三十条的规定，提供输出国(地区)的卫生部门或者组织出具的卫生评价资料，经口岸进口食品卫生监督检验机构审查检验，并报国务院卫生行政部门批准。 　　这位负责人介绍，特仑苏牛奶事件发生后，政府有关部门高度重视，为此，卫生部会同工业和信息化部、农业部、商务部、工商总局、质检总局共同组织召开了专家研讨会，对OMP牛奶安全性问题进行专门研讨，尽快做出是否安全的评估，以便及早解答消费者对OMP牛奶健康风险问题的关心。 　　据悉，专家对提交的有关OMP的来源、生产工艺、添加量、检验报告以及国际同类产品政府许可和国外使用情况进行综合分析后，认为饮用蒙牛OMP牛奶不会产生健康危害。一是OMP的来源是牛奶经脱脂、膜过滤等物理方法获得的乳清蛋白组分，如乳铁蛋白、乳过氧化物酶，本身就是牛奶的正常成分。二是国内检验机构出具的关于OMP的食品安全毒理学检验报告表明，经急性毒性试验、致突变试验、30天喂养试验和致畸试验均未见不良影响。三是产品中OMP含量为8毫克/100克，低于权威机构认定的一般安全添加水平。四是关于消费者普遍关注的OMP与胰岛素样生长因子(IGF-1)是否为同一物质问题，胰岛素样生长因子是机体自身分泌的一种激素样蛋白质，广泛存在于机体组织和体液中，是母乳和牛乳中的正常组成成分，一般牛乳中含量为1毫微克/毫升~9毫微克/毫升，母乳中含量为5毫微克/毫升~10毫微克/毫升。有关机构对蒙牛提供的不同品牌未添加OMP的牛奶和特仑苏OMP牛奶中IGF-1含量进行了检验，结果表明均在牛乳IGF-1正常含量水平范围内。 　　这位负责人说，蒙牛公司具体违法行为的认定和处理，将由具有管辖权的执法部门负责。