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【分享】化合物同位素分布质谱图模拟软件-加深对质谱的理解

液质联用(LCMS)

  • 题目有点复杂了哈!其实就是款软件——IsoPro 3.0,用于化合物质谱图的模拟。

    相信这款软件的使用有助于加深您对质谱的理解,找到质谱带给我们的乐趣,领略化合物的魅力!

    注意啰,这款软件是绿色免安装的,而且很小,放在优盘上就能到处用了。尤其是含多个氯原子或者其他同位素峰的时候,其优势更加明显。

    同位素分布图的作用:
    其实质谱得到都是同位素分布图,只不过由于主峰强度太高,以致我们往往忽视同位素分布图。但实际上化合物同位素分布图在研究领域有着重要的作用。同位素分布图往往是特征的,可以在一定程度上推断化合物的分子组成。比如:

    未知化合物得到一个同位素分布图,可以根据现有资料推断其大致具备哪些元素,组合模拟,可以得到分子式的范围,以供筛查,为进一步探索打好基础。

    对于已知化合物,同位素分布图由于各个化合物的特征性,可以一定程度上作为定性的判据。当知道化合物分子式的时候,通过该软件,设置合适的参数,可以模拟各种情况下的质谱图(其实就是同位素分布图,普及一下质谱理论知识哈),跟得到的实际谱图做对比分析。

    1. 简述整个压缩包解压缩后的内容:软件——Isopro.exe、所有元素同位素数据——Table.txt、软件说明——readme.rtf。在这提一下,table.txt
    里是各个元素的同位素分布图。




    当然,也可以在软件中,单击某元素,然后通过Isotopes查看同位素数据。







    2. 软件的使用。即可以通过菜单也可以通过软件下方的工具条实现分子式到同位素模拟图的转换。需要注意的是使用:菜单Calculate->Contribution或者Display实现计算。
    一般是根据分子式,单击元素周期表上面的某元素,输入该元素原子个数,依次输入其它元素原子个数;单击菜单Calculate->Contribution或者Display,即可以查看该化合物的同位素峰m/z及其比值的列表或者同位素模拟图。
    以O2为例说说吧:






    图谱:按住左键右下拉框可以放大,按住左键左上拉可以缩小。
    放大后,可以看到O2是有三个峰的,当然后两个峰丰度太小,我们往往忽视,而不是没有。



    另外,修改参数如分辨率可以图谱显示为棒状图(分辨率调大)和峰型分布图(分辨率调小)。

    希望这个软件对大家有点用哈,本人精藏!

附件:

  • 该帖子已被版主-小猪飞飞加5积分,加2经验;加分理由:感谢分享
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  • hujiangtao

    第1楼2010/12/29

    应助达人

    很好用的软件 谢谢

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  • 风肃

    第2楼2010/12/29

    分享快乐

    hujiangtao(hujiangtao) 发表:很好用的软件 谢谢

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  • happydog2004

    第3楼2010/12/29

    呵呵,好资源~

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  • api3000123

    第4楼2010/12/30

    绝对精品 楼主威武

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  • wyl1020

    第5楼2011/04/11

    分享快乐,正是我想要的

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  • maldiguy

    第6楼2011/04/11

    布鲁克的软件有这功能

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  • netsking

    第7楼2011/04/12

    好象质谱仪自带的软件都这类功能. 不过还是谢谢分享,十分感谢。

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  • 第8楼2011/04/12

    赞楼主的分享精神,不过这个软件有3.1版了
    http://sites.google.com/site/isoproms/
    另外,这原本是别人的一个publication,如果lz能在转载的时候顺便引用一下就更完美了
    http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6W95-44FFN0H-8K&_user=10&_coverDate=09%2F01%2F1983&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=gateway&_origin=gateway&_sort=d&_docanchor=&view=c&_searchStrId=1714615634&_rerunOrigin=scholar.google&_acct=C000050221&_version=1&_urlVersion=0&_userid=10&md5=2dd934406ad1b66b961126772fa4b58d&searchtype=a

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  • 风肃

    第9楼2011/04/12

    谢谢补充。看来是曾经的同道中人。
    只是有好几年没用了,那天翻出来,回忆了一番然后分享了。

    kreanu(kreanu) 发表:赞楼主的分享精神,不过这个软件有3.1版了
    http://sites.google.com/site/isoproms/
    另外,这原本是别人的一个publication,如果lz能在转载的时候顺便引用一下就更完美了
    http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6W95-44FFN0H-8K&_user=10&_coverDate=09%2F01%2F1983&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=gateway&_origin=gateway&_sort=d&_docanchor=&view=c&_searchStrId=1714615634&_rerunOrigin=scholar.google&_acct=C000050221&_version=1&_urlVersion=0&_userid=10&md5=2dd934406ad1b66b961126772fa4b58d&searchtype=a

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  • 徐好狗

    第10楼2011/04/13

    这个玩意儿不错,不过没有data explorer的分辨力模拟?

    我有空也折腾一个,labview写的。

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