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【求助】目前质谱分析软件有哪些?有相关学习教程吗?

生物质谱

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  • 金水楼台先得月

    第1楼2011/05/06

    不同厂家的仪器有不同的分析软件,而且操作方法都不一样。
    搂主问这个问题问的,你做哪个型号的仪器呢

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  • yuduoling

    第2楼2011/05/06

    买了仪器就有相关软件,也有相关的操作培训的

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  • lucia_J

    第3楼2011/05/06

    这个应该是买的时候看你买哪些软件吧,至于相关的操作培训,软件分析好像很多都没有免费的培训,只有一些资料,其余都是收费的。

    yuduoling(yuduoling) 发表:买了仪器就有相关软件,也有相关的操作培训的

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  • 无机麦地

    第4楼2011/05/19

    软件啊,尤其是数据库还需要收费?
    生物质谱方面的数据库成熟么

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  • lucia_J

    第5楼2011/05/20

    软件可是很多公司或者仪器的一大卖点呢,不过没看到有生物质谱方面成熟的数据库。

    无机麦地(shuiyang88) 发表:软件啊,尤其是数据库还需要收费?
    生物质谱方面的数据库成熟么

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  • 金水楼台先得月

    第6楼2011/05/21

    没有成熟的数据库是如何进行数据处理的/。

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  • 去年冬天

    第7楼2011/05/25

    各种不同类型的质谱针对的操作软件都是不一样的

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  • monod

    第8楼2011/05/31

    生物质谱,国内主要侧重于蛋白质/多肽及代谢组学。
    代谢组学:
    代谢物工具包括代谢物预测和代谢物检测两部分。代谢物预测模块可根据原药的结构和选定的可能代谢途径,自动预测可能的多代代谢物;代谢物检测与鉴定模块可以自动比较两个LC/MS测定结果在每个时间点的质谱数据之间的差异,并进行鉴定。该软件不仅可以用来监测代谢物,同时也可以用于药物或化合物产品的质量监控。通过相应软件将两组LC-MS数据进行统计分析,从而找出两组数据之间具有统计学意义上的差异。具体功能包括:LC-MS数据分段(分桶),主成份分析(PCA)包括试验数据组和交叉验证,储存、加载和输出;用户友好界面包括:相关联的显示样品表和数据桶表格、统计学图表、数据桶密度图,分组显示和放大图表等。
    多目标筛查软件可用于自建目标化合物数据库,数据库包含了待测目标化合物的名称,分子式,准确分子量和保留时间。目标化合物数据库自动生成相应的数据处理方法和流程,全自动地提取并识别目标化合物的离子色谱图,同时目标化合物的鉴定通过质量准确度,同位素分布模式和保留时间三重信息的确认来完成。可明显缩短复杂样品的测试分析时间。可在没有数据库的情况下,对LC/MS中的所有组分进行分子式自动预测。

    蛋白质组学:
    通过分析蛋白/多肽的质谱数据从而鉴定和表征蛋白质的工具,可用于数据库检索、蛋白翻译后修饰和蛋白变异位点的鉴定和确认和未知多肽从头测序,支持各种top-down分析技术获得的数据的标释和数据库检索。
    包括海量数据的筛选方法和对单个或者少量蛋白质深入研究,如蛋白质修饰、蛋白质多样性或者拼接变异体。并且对布鲁克独特的WARP技术中起重要作用。

    在通过数据库比对的全自动蛋白质鉴定中的特色:
    用MALDI-TOF指纹图谱,PSD和LC-MS/MS数据,实现全自动的蛋白质鉴定
    用模糊逻辑判定搜库结果
    批处理结果报告,包括可视化MALDI-TOF结果
    支持从头序列分析

    在蛋白质精细结构解析方面的特色:
    MS和MS/MS数据的无缝连接,以及在线数据库检索
    自动对MS和MS/MS图片进行注解
    对交叉连接和修饰的完全支持
    翻译后修饰的筛选工具
    蛋白质精细结构表征
    支持MS-BLAST同源性搜索

    提供多肽的部分氨基酸序列信息,用于未知多肽从头测序分析,为同源性搜索如MS-BLAST提供序列标签,从而达到鉴定蛋白的目的。

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  • monod

    第9楼2011/05/31

    国内国际上目前不少人在做这方面的工作。其实质谱也好,色质联用也好,都是很强大的硬件平台,根据各自的需要,通过可行的原理结合IT或者信息处理技术,可以DIY一定的应用方案出来的。目前比较给力的是在质谱平台上开发出来的微生物鉴定应用,不考虑国情等其他因素,这方面的市场还是很巨大的。

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