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非共价相互作用

  • aeolian1985
    2011/09/14
  • 私聊

生物质谱

  • 想做小分子和蛋白的结合,看文献非共价相互作用常用Q-TOF,我们这边有一太Bruker的MALDI不知道能不能做呢?如果做应该咋做呢?还有,MALDI测大分子量的蛋白漂的很严重,如果我蛋白有二聚体,但是不是很能确定,想通过质谱验证一下,但是担心经gel fitration纯化后的二聚的蛋白在质谱中也会被打断测不到,因为我现在想知道蛋白活性中心究竟是二聚的形式还是单体形式,希望能看到二聚和单体的蛋白和那些cofactors的作用,不知道能不能实现啊?
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  • liufeilzu

    第1楼2011/09/15

    感谢楼主的发帖。一般通过调节ESI的参数,如锥孔电压,喷雾气流等在尽量小的离子化能量下电离分析物,这样有可能检测到小分子和蛋白质的结合,我只见过文献做过,一般很难重复,这个很科研的,做出来就是大文章,现在流行用NMR研究蛋白质与小分子相互作用。
    至于MALDI因为参数多也很难调啊,脉冲激光能量高了人家说你源后裂解,低了没有信号。
    蛋白纯化这个我没有做过,尤其多聚体,如果楼主有兴趣可以到生物质谱板块分享。

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  • daoyuanli

    第2楼2011/09/15

    关于聚体以及非共价结合的复合物在MALDI源中的行为确实是一个比较有意思的东西,以前在学校的时候做过一段时间的MALDI,但是都是集中在单体蛋白的检测,不晓得板块里面有没有做过这方面的专家可以分享一下这方面的经验。

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  • maldiguy

    第3楼2011/09/16

    不鼓励用MALDI做这方面,虽然也有人发过相关的文章

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  • liufeilzu

    第4楼2011/09/17

    楼上有什么好的意见没?我替做蛋白质谱的兄弟姐妹谢谢你了

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  • aeolian1985

    第5楼2011/09/23

    谢谢斑竹和ls各位!MALDI做这个好像还是有点悬的~~~

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  • winner20091212

    第6楼2011/11/01

    我就是做非共价键复合物。。。用的是Agilent的Q-TOF,不过很不稳定!

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  • frappuccino

    第7楼2011/11/18

    这个实验不是很好做吗?MALDI这是特长啊。你做了吗?有具体问题吗?

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  • frappuccino

    第8楼2011/11/18

    蛋白只要是低温就是很稳定的,别温度太高了。

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