瓢虫
第1楼2006/04/05
16. 如下一张投影片所示,〔材料与方法〕应该以过去式来写,你已经做了这些实验,既然做完了,就照着写。要写得够完整、详细,让别人在有必要的时候能够重复实验。有新的做法,就要提供所有必需的细节,如果是已提出并实行过的做法,你可以只要说明是什么样的做法,同时提供参考资料的文献。还有,记得千万不要在〔方法〕里提到任何结果,绝对不行。
17. 下一张投影片里提到,呈现论文的方式要一致,这一点适用于论文的每一个部分,在〔材料与方法〕中尤其重要。,例如,当在叙述一个离心分离的步骤时,我会说:‘and the sample was clarified by centrifugation (10,000 x g for 30 minutes at 4°C)’,你应该在论文中维持这样的参数顺序:每次描述离心分离步骤时,都是‘G-force、时间、温度’的顺序,下一次我再提到时候,我就会写:‘the protein was recovered by sedimentation in a bench-top centrifuge (5,000 x g for 10 minutes at room temperature).’。如果你顺序不一样,读者会看出来,他不会感到困惑,但是一般读者会开始将注意力放在你写〔方法〕的方式,而不是内容,这也是我在这一系列讲座中不断强调的重点,把要描述的事物合理地排列,如果你以一种特殊的方式来呈现,那之后只要碰到同样的地方,无论是程序或是概念,都要用同样、合理的顺序来呈现,不然读者会质疑你呈现事物的方式,渐渐偏离论文的主题和内容,而把焦点放在写作上。
18. 下一张投影片强调一个也许琐碎、但是必须知道的重点,就是我们绝对不能用数字做句子的开头,举个错误的例子:‘3 ml of reagent A was mixed.’,你可以把3用英文拼出来让句子变成‘three milliliters of reagent A was mixed’,但是我的做法是写出reagent A,将3ml写在括号中,并且是用数字‘3’,然后再说它们混合在一起,这样的用法就可以。所以。你可以在论文里善用括号来加强呈现的方式。
19. 在下一张投影片要讨论〔结果〕的部份,因为你已经得到结果了,所以用过去式来写,以合乎逻辑的顺序呈现,把结果的解释说明留到〔讨论〕。图表应该以出现的顺序来编号,图和表格要分开编号:图一、图二、表一、图三,而不是图一、图二、表三、图四,也就是说,这是图和表第一次出现的时候,不要把它们凑在一起,要分开编号。
20. 统计学在判断我们的结果是否有意义时,扮演一个十分重要的角色,所以在提及有意义的结果或是声明某项有显著意义的事物时,一定要附上统计学的说明。在叙述统计学,将变量的相关测量写出,如‘数+标准差’;在推论统计,像卡方检验,T检验,F检验等,一定要报告检验的大小、自由度,机率水准,影响的方向等等,都要明确地标示出来。
21. 在下一张投影片里我们到了〔讨论〕的部份,这里应该尽量用现在式来写,因为这是读者第一次拿起你的原稿阅读〔讨论〕部份,对他来说是现在发生的事,相对的,结果是已经得到的,做法是已经完成的,但是现在好比是读者坐在你旁边和你一起讨论一样,所以最好使用现在式。不要反复重申你的结果,避免大胆、荒唐的推测或是过度推测,常常有人问我,什么是过度推测?所谓过度推测就是你对推测做推测,这样就是过度推测。我们手里一定要有某些让我们用脑筋思考、推论的事物,譬如实验产生的结果就是铁证,单纯这样叫做推测。在〔讨论〕中,提及你发现的结果对这个科学领域有什么样的贡献。
22. 下一张投影片,在〔讨论〕的最后一段做结论,用你发现的结果来提出新的问题是一个常用的做结论的方法,告诉你的读者你是如何追求真象,把研究主要结果再声明一次,并讨论更广泛的含意。所以不论你用什么样的方法把结论和结果与现有的文献资料做 连结,用最好的方式表达。
23. 〔参考资料〕和〔志谢〕是论文中较小、但仍然颇重要的部份,参考资料代表论文中阐述内容的证据,所以要小心地选择,正确地引用类似或相关研究。注意,如果你的是高品质论文,你所使用的参考资料应该要出自高品质的期刊,我会花一点时间来讨论这点,因为有些人不了解这个道理。原则上,高品质的期刊比低品质期刊被审查得较严格和仔细,尤其是〔方法〕的部份,高品质期刊比低品质的优秀多了,在高品质期刊的论文内容及声明,都是以几乎无法驳斥的实验结果做基准,所以这些陈述都是非常地精准、几乎可以说是完全正确的。低品质的期刊有较拙劣的实验方法,所以如果你在设计实验方法时是以低品质期刊做参考,你的实验结果就会被归类为同等级、也就是低品质。所以,在研究方案刚开始比在所有实验结束后容易选择我们要的实验方法,在研究刚开始时,慎重为你的研究方法挑选参考资料。参考资料会影响论文审稿员,因为审稿员应该是这个研究领域里的专家,所以几乎可以肯定他们曾发表过许多这方面的研究报告。当他们翻开你的论文时,会直接到〔参考资料〕的部份找他们的名字,如果他们的名字没在上面就会生气,心里想说‘这个人觉不觉得我很不错?我做的研究有什么问题?’,他们感觉好象被侮辱,所以仔细考虑你要投稿给谁、哪一份期刊,要选择哪些审稿员,并且提到他们的名字至少一次,也不要太离谱,反复提起5到10次,只要一次就够了。还有,记得,在这个研究领域中最重要的人不会审查你的论文,因为他太忙,太重要了,要做其它的事。所以我给的建议是,在论文中几个地方,必须要有大概20个文献资料可以支持我们所做的某陈述,所以分散开来用,不要只选择一个作者的研究,即使他有最好的作品;提到其它实验室,搞清楚它们的PI是哪些人,并在你的论文里提到他们的名字至少一次。Endnote这个软件,对管理你的参考资料非常有帮助,在他们的网站上(www.endnote.com)有免费30天的试用期。〔志谢〕虽然占非常小的部份,但是在适当的时候在论文里表达你的谢意也是很重要的。
24. 在下一张投影片:参考资料应该要以概念为中心,而不是作者,当你在引用一个参考资料的时候,把焦点放在它的概念上。以下面这个句子为例,‘growth rates of > 80cm are common in populations in Alberta,’,接着我们就会写在括号里写Marx 1982,如(Marx 1982),括号是用来降低一个陈述的重要性,不管你要写什么,要表达什么样的讯息都可以,但是不是在句子的主体里面。如果你说:‘Marx found growth rates of >80cm to be common in populations in Alberta.’,读者会开始去想Marx这个人,尤其是如果他是一个很特别的人,因此,不要强调人,不要写出他们的名字,也不要以他们的名字做参考资料。当然,期刊会限制我们在论文中列出参考资料的方式,也因为这个原因,用数字比作者名字好。
25. 在这堂课和接下来的几堂课中,我会陆陆续续列出ESL作者常犯的错误来做讨论,给所有的作者做参考。一个对ESL作者来说很琐碎但是颇困难的问题,是如何选择a、an、the等冠词,包括定冠词和非定冠词。
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第2楼2006/04/05
26. 在下一张投影片里有‘a’和‘an’的比较,‘a’使用在所有以子音开始的字之前,除了不发声的H以外。‘An’用在所有以元音开始的字之前,除非是U发Y在‘you’中的音,或是如果O是发w在‘won’里的音,这是有点复杂,在写的时候,你必须要知道一个字的发音,但是有时候字的发音和ESL作者所想的不同,也就是为什么我常看到这样的错误。不论是什么样的错误,当我在阅读或是审查ESL作者写的论文时,看到不正确的用法,我的注意力就会被分散。好好地思考这个要点,在下一张投影片中我举了几个例子:cat、dog、unicorn、union、apricot、one。我认为如果你会正确地发这些字的音,如下一张投影片所示,就能轻易地找到答案。有陷阱的例子如‘an honest error’、‘an honorable peace’和‘a union’。这些应该都很明显,‘u’发‘y’的音,如‘a united front’也是一样,是用u拼字但是发出来的音是‘y’的音。
27. 有各种不同的资源和书可以帮助于你的写作,投影片中所推荐的特别不错,其中一个作者的名字是Strunk,S-t-r-u-n-k,书名为‘The Elements of Style’,是一流的书刊,几乎有100年的历史了,但是书里提供的范例并不会改变,这些问题也是至今仍让作者深感头痛,你可以在amazon.com上找到,我也把网页写了下来,只要查询Strunk这个名字就可以找到这本书,一本大约美金十元,不算太贵。其它可能有用的书也列在这张投影片上,但是通常只有书的30%对科学家有所帮助,其中好几本像‘Chicago Manual of Style’,就以小说家的角度详细讨论了很多论文过程。
28. 在下一张投影片里,我说到用平凡普遍的口气来写论文,原则上,你用的普通字越多,论文越容易被理解。
29. 下一张投影片讨论如何清楚地写论文。标题让读者知道你所要讨论的方向,‘明确性’意思是指使用有精确意义的字,换掉‘give important insight into…’这种句型,‘give important insight into…’听起来让人摸不着头脑,像什么都没说一样。直接说你这句话要表达的内容,说你的结果的意义,‘give important insight into…’是一句没有意义的词型。当作者在相邻的句子、段落或章节中间做连接时,论文就会流畅,所以我们要想想如何将句子和段落连接起来。每一个句子都有一个声明点或是概念,一个段落里有好几个句子组合起来来解释一个较复杂的概念,也就是所谓的主题句,每一个段落都有一个主题,我们把句子连在一起来组成一个段落,将段落连在一起来构成一篇论文。要如何连接句子?我们从这一点开始讨论,请看下一张投影片。
30. 句子和句子间是用转换字或词来做连接,转换代表着关系,不论是句子和句子间,或是段落与段落间,圆滑的转换可让读者从论文第一个重点流畅地读到最后一个重点,接下来我们来看看一些转换字。
31. 下一张投影片里有一些‘附加性’的字,当我在一个句子里说一件事,然后在下一句里我再声明另一件是来支持或是呼应前一句的内容或想法,就可以用‘also’、‘furthermore’、‘in addition’等字词。你们大部份、甚至全部的人,都会在论文里用这些字词,也知道这样做是对的,但是我希望你们在用的时候能多加思考你为什么要用这些字。举例说,当我说‘Kainate was not neurotoxic to cells treated with IGF-1. Furthermore, these cells were much larger than control neurons.’,经IGF-I处理过的细胞比控制组的脑细胞大很多,这是IGF-I好的影响,它防止细胞在过度刺激下被kainate杀死,所以这些细胞并不会受有神经毒素的kainate的影响,这些是好的影响,所以是IGF-I另外的好处。
32.
下一张投影片中我们看到了转换词和表示后果的字,在以下的例子里都是10到12字的词,记得两个原则:一,我们绝对不可以在同一段里重复一个字;第二,要限制比较凸显的字的使用,论文中不要用超过2到3次。如果我开始一直用一样的字,像‘furthermore’,‘furthermore’、‘furthermore’,很快地当读者再看到的时候,便开始数我用了几次,而不是专心在我的论文内容中,只是一直在心里算我用了几次,到最后他还是不了解我在论文中想要表达的想法。我小学的时候,学校有一个老师很喜欢说uh-huh、uh-huh、uh-huh、uh-huh,那时候我们这些小朋友下课后都会说:‘喔!他今天说了57次了!’,‘不,他今天说了56次!’,根本没人专心听他讲的课,反而都在注意他的演讲技巧。同时,也要分清楚各字词的意思,有时候你以为一样意思的字,其实是有非常细微的差异,所以要在适合的地方使用。
33. 下一例句:‘Wortmannin blocked the activation of PDK and P6K by IGF-I. Consequently, kainate toxicity developed 5-6 days following the medium switch.’,如果我没在介质中加入wortmannin,kainate的毒效就不会产生,因此,IGF-I处理过的细胞会发展出kainate中毒,是加入wortmannin的后果。
34. 下一张投影片中显示一些总结性的转换字词。通常在段落的尾端,我们有一长串的实验结果,所以必须要扼要地重述那些结果或想法。这种以总结一个段落的内容为下一段要描述的重点做铺陈,是一个很实用的写作技巧,若在设计和架构句子的时候将这个道理铭记在心,我们更能轻易地把句子连接起来。一些转换字的例子包括after all、in conclusion、to summarize、all in all、in short等等,而在这些词组里,你可以发现‘all and all’和‘in any case’或‘indeed’的意思皆不尽相同;‘indeed’的用法比较明确,‘in any case’比较缓和。‘Wortmannin blocked the activation of PDK and P6K by IGF-I. To summarize, IGF-I operates through a signal cascade involving PDK and P6K.’在前一句之前有很多的想法和概念,但是我将前后这些句子以‘to summarize’连接,接着总结整段内容,如果我希望,我也为下一段的内容铺好了路。
35.
在下一张投影片有其它转换用的词组:‘contrast and comparison’、‘by the same token’、‘conversely’、‘nevertheless’、‘in spite of’等等,这些词组都给文风的语调带来巧妙的变化。‘In spite of’蛮实用的,‘Coversely’、‘similarly’都有细微但不同的意义,因此要小心地使用。这些词组都能有效地将相对或相似的概念连接起来。‘Generalizing as a rule’、‘as usual’、‘generally’、‘generally speaking’等,这些也都有些许不同的意思,但是都可以帮助我们做事物的综合,从一句话流畅地接当下一句话。对于一些相似的事物,我们就可以用‘likewise’、‘moreover’、‘similarly’和‘also’。
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第3楼2006/04/05
36. 我在这一张投影片中再一次强调,这些词组皆有细微但是不同的意思,所以一定要准确地知道各相似字真正的意思,或是一些有相似意思的特殊字。我再说一遍,对于一些有相似意思的相似字,我们要很准确地知道每一个字的意思,才可以正确无误地在句子里使用,同义字字典是一个提供字的定义、和有相似意思的字的工具,譬如说我在同义字字典中查询‘diminished’这个字,看到它的意思是‘to reduce, to lessen, to make smaller, or to weaken’,但这些解释各有不同的意思,所以要特别注意这些解释的用法,要确切知道他们的意思并且恰当地使用。
37. 在下一张投影片里我要讨论如何正确地建立段落的结构,一个段落应该以一个主题句来做开始,为接下来的内容创造出一个背景或是舞台,主题句要简洁有力,并且要让读者了解。从你的主题句中的想法来建造出这个段落的内容,句子的连接要顺畅并且遵照合逻辑的顺序,然后用一个可以和下一段内容搭成‘桥梁’的句子做结尾。换句话说,引进你的主题,提供你有的证据,最后用扼要重述的句子来连接到下一个段落。
38. 连接段落和连接句子有些许的不同,在这张投影片里我们看到,有效的段落连接和好的概念组织及顺序有密切的关系。如果你把一篇论文里所有的主题句结合在一起,就可以组成一个未修饰的段落,如果有不符合上下文关系的地方,或是把错误的段落放在错误的位置,这样我们在列出主题句的时候,句子就不会合理,并且会让读者混淆,如果你是这样架构你的论文,就会有这样的后果。
39. 在这一张投影片中要教你如何连接段落,包括代名词的使用,如this、that、these等,一定要小心的使用这些字,我稍等会做更多的说明。可以重复使用,同样的字或词如果重复的话,可以有效地连接段落与段落,合理的连接词尤其实用。
40. 所以说使用代名词,我举个例,在一段的结尾时我说:‘IGF-I prevents kainate neurotoxicty from developing in cortical neurons by activating p70S6K and protein synthesis.’在下一段的开头我便说:‘These results support the hypothesis that IGF-I prevents kainate neurotoxicity from developing by stimulating translation of SOD1, thereby decreasing levels of ROS.’。
41. 下一张投影片强调使用重复的方法来连接段落,在两个句子里用同样的字或词,譬如说A段的结尾是:‘Thus IGF-I prevents kainate neurotoxicty from developing’,在B段的开头我便说:‘We speculate that IGF-I may prevent or slow the onset of Alzheimer’s Disease’,这样一来,读者就可以做连接,本来是讨论IGF-I的某一方面,现在要讨论IGF-I的另一方面。
42. 在连接段落时要有逻辑,如这张投影片所示,一个段落是这样结尾的:‘These results indicate that IGF-I prevents kainate neurotoxicty from developing in cortical neuron.’,下一段的开头是‘Since excitotoxicity contributes to neuronal loss in the frontal cortex, we speculated that IGF-I may prevent or slow the onset of Alzheimer’s Disease.’
43. 在下一张投影片中我提出另一个ESL作者常犯的错误,就是标点符号的使用,这是Strunk里的规则3到5。
44. 下一张投影片里我们看到,不正确的标点符号用法会让作者混淆。看看以下的例子:‘for example, (逗号) vgb promoter allowed the transcription of target gene to be activated by the shift of oxygen concentration; (分号) the expression of vgb could lead to enhanced activity of foreign protein to be expressed by the same host (分号); the presence of par region stabilized plasmids in E. coli (句点).’,这是一句很长、包含很多想法的句子,要如何改进它呢?答案很明显,下一张投影片中就可以看到,我们可以把那些分号都以句点来替代,再将每一句修改一下,改进后的句子如下:‘For example, the vgb promoter coupled transcriptional activation of a target gene with an increase in oxygen concentration (句点). In addition, the expression of VHb enhanced the activity of a foreign protein expressed by the same host (句点). Furthermore, addition of the par region stabilized plasmids in E. coli.’,这样一来,读者可以在每一个句子的结尾稍作暂停、喘口气,这也是使用句点的原因。
45. 在下一张投影片里有一些写作技巧,将段落想成是图形,在这张投影片右手边的图,显示一个有精确结构的段落图例,句子1、2、3、4、5都是用来缩小讨论焦点,在左手边是这个段落的图解,表示一个主题句下分出了五个句子,如箭头所示,每一个箭头都代表一个有关连但些微不同的想法或概念,不论用任何顺序排列它们都不会失去段落的重点,譬如说把句子2挪到句子5的位置,这样的用法容许较大的弹性以便连接下一段。右手边这个例子,倒三角形表示缩小焦点一直到句子5的时候,然后到下一段再说出重点。
46. 下一张投影片里说到,以平行的方式表达事物,这一点我之前有提过。当我说有三个假设可以解释这些结果:假设一、假设二、假设三,确认当你在讨论这些想法的时候,以同样的顺序和格式呈现。如果一开始是以1、2、3、4的顺序呈现,但后来的顺序是1、4、3、2,读者便会感到混淆和沮丧。
47. 驳斥对立者论点也是写作的技巧之一,如果你的对立者有个有力的论点,在论文中就先做讨论,然后再表达你的论点。通常人们都会比较偏袒两个相似论点的第二个,没什么太大的影响。还有,如果你先陈述你的论点然后才说对立者的论点,最后还是要回到你自己的部份做整合和连接;那如果你先讨论对立的立场,然后你自己的论点,接下来在论文里便能顺势把你的想法做一个总结。如果你的对立论点颇为软弱或不够充分,可以在稍后论文里声明。
48. 现在讨论断断续续、结构拙劣的段落,只有一到两句的段落几乎都不好,因为无法适当地发展概念,只有两句话的段落通常代表着其它段遗漏的部份、或是被删除掉或被延伸的想法。
49. 将你的论文分成几个部份或是章节,一段一段地来写,不要一次写整篇论文,也不要等到你认为所有的分析都做完了才着手开始写。
50. 下一张投影片中,我建议先着手写〔方法〕,然后写〔结果〕、准备图表,当得到更多结果,就开始写〔讨论〕,接着是〔前言〕,然后将结果再整理,做个连结,最后才写〔摘要〕、还有〔前言〕与〔讨论〕的最后一段。
51. 所以,为你的读者写作,遵照你要投稿的期刊所订定的‘投稿指南’,这能帮助你。选择这些期刊中较高声誉的论文。如果你这些都做到了,便能写出一篇好的论文,并能在审稿时受到青睐。谢谢。