【第四届原创】中药指纹图谱相似度分析之TXT文本导入

中药指纹图谱相似度分析之TXT文本导入

附上药典版《指纹图谱相似度分析》软件，仅供参考学习使用。

话说很多同行都无法将高效液相，气相，气质联用跑出来的色谱图导入到指纹图谱相似度分析软件进行分析。目前对谱图相似度分析的软件也只有接下来几个版本：、B版》、药检所版的《中药色谱图分析和数据管理系统》、浙大版的《中药指纹图谱相似度计算软件》及中南版的《相似度分析软件》，在写这边帖子之前，前三个版本我都反复安装试过很多次，第四个一方面需要matlab的只是、另一方我也没有在网上找到资源。最后我选择了使用药典版的《中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版》，以下简称（《A系统》）。
药典版的《中药色谱指纹图谱相似度评价系统》有A，B版两个版本，即：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对照图谱的功能。软件就不详细介绍了，直接进入主题——如何将得到的TXT文件转换成能够导入《A系统》的TXT文件。
本系统支持三种格式文件的导入：AIA(*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（如图1）。建议采用通用的AIA（*.cdf）格式文件导入（但是我试过导出的AIA依然无法导入，并且AIA文件没办法编辑，也许是能力不够，至今没有找能编辑AIA文件的方法）。注意AIA（*.cdf）文件中应包含样本图谱的峰面积信息，在色谱工作站导出AIA（*.cdf）文件前应现进行积分。否则导出的AIA（*.cdf）文件可能因不包含峰面积信息而无法导入（我用TXT文件试了，没有积分依然可以导入，只是无法匹配，也就是无法进入下一步相似度分析）。文本文件（*.txt）的导入需要采用特殊的格式，可以参考本系统导出的文本文件格式【文后附上标准文本文件格式】。Scp(*.Scp，即Standard Chromatographic Project的简写)是本系统为生成的对照图谱的导入提供的一种特殊的文件格式。我用的是岛津GC-MS跑出来的质谱图试验的，文后附三个版本的分析软件及需要的文档，其他液相气相的没有使用过，也不知道如何导出TXT或者AIA文件，如有知道的，还希望您不吝赐教）
第一步，导出text文件，做好准备工作
打开GCMSSolution软件，导出你需要处理的图谱（如图2），当然如果要导出AIA文件，也可以如图3那样导出。但是只能导出AIA文件，无法导出TXT文件。