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新手求助Q-TOF的数据采集与定量的问题

  • steven_sela
    2012/11/25
  • 私聊

液质联用(LCMS)

  • 小弟刚接手学校的一台agilent的LC-Q-TOF,准备测蛋白质和氨基酸等物质的分子量。

    仪器之前已有老师使用过,但数据采集的条件老师没有优化过,所以每张图的数据要近400Mb。一旦分析量大,机器就容易死机。(已经被学生弄死过一次了。。。)

    求问各位大大,一般做样仪器数据采集的频率一般设为多少?如果做MS/MS 碰撞池能量设多少比较合适?谢谢

    PS:求问Q-TOF能否做定量?精度好不好?(从培训资料里看需要优化色谱条件,感觉这么做不如直接用LC定量)
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  • dark_wzy

    第1楼2012/11/26

    采集频率一般在每秒钟10张左右;碰撞池的能量需要优化,化合物性质不同,能量差异较大;早期的QTof是不能做定量的,重现性很差。现在随着技术的发展,也可以采用QTof进行定量了,但是灵敏度肯定没有四极杆质谱高。色谱条件当然要优化,直接用LC定量也是要优化色谱条件的。

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  • steven_sela

    第2楼2012/11/27

    谢谢,那看来我现在设置的每秒1张偏低了。关于定量这一点,我看培训材料中的介绍也是根据TIC图计算峰面积,会不会没有HPLC来的那么准确?

    dark_wzy(dark_wzy) 发表:采集频率一般在每秒钟10张左右;碰撞池的能量需要优化,化合物性质不同,能量差异较大;早期的QTof是不能做定量的,重现性很差。现在随着技术的发展,也可以采用QTof进行定量了,但是灵敏度肯定没有四极杆质谱高。色谱条件当然要优化,直接用LC定量也是要优化色谱条件的。

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  • dark_wzy

    第3楼2012/11/27

    QTof使用提取离子流图(EIC或XIC)来进行峰面积积分计算的,理论上应该比HPLC准确,尤其是在色谱分离不太好的情况下。

    steven_sela(steven_sela) 发表:谢谢,那看来我现在设置的每秒1张偏低了。关于定量这一点,我看培训材料中的介绍也是根据TIC图计算峰面积,会不会没有HPLC来的那么准确?

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  • gosome

    第4楼2012/11/27

    一张TIC图就400M,是不是LC的时间很长,如果出峰时间知道你可以采集中标某部分的数据就可以了
    另外,不会用的是轮廓图模式吧...

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  • steven_sela

    第5楼2012/12/02

    LC的时间是挺长的,大约30分钟左右。轮廓和质量图两种模式都保存的

    gosome(gosome) 发表:一张TIC图就400M,是不是LC的时间很长,如果出峰时间知道你可以采集中标某部分的数据就可以了
    另外,不会用的是轮廓图模式吧...

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  • winner20091212

    第6楼2012/12/07

    我以前用Agilent的Q-TOF,主要是做蛋白质。看你在采集样品的时候是保存什么样的图,都可以选择的。再者换一个好点的电脑完全不会出现死机的现象。这款仪器做定性非常不错,因为分辨率特别高!然而定量却没那么完美,仪器的脾气你需要摸清楚,很多的paper里都是用EIC进行定量的,因为这个比TIC来的准确。碰撞池的能量就要根据具体的物质进行优化!

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  • steven_sela

    第7楼2012/12/07

    谢谢,不知道您有没有用Q-TOF做过多肽?初始的质谱参数(比如Fragmentor,Skimmer,Oct RF)您通常都是怎么设的?我现在做多肽总是找不到想要的离子,在不断的尝试方法和参数,但都没有成功,很痛苦。。。

    还有我想问一下Q-TOF定性的最低检出浓度一般为多少?我现在做多肽ug级的基本看不到峰,mg级才能找到像样的离子峰。。。

    winner20091212(winner20091212) 发表:我以前用Agilent的Q-TOF,主要是做蛋白质。看你在采集样品的时候是保存什么样的图,都可以选择的。再者换一个好点的电脑完全不会出现死机的现象。这款仪器做定性非常不错,因为分辨率特别高!然而定量却没那么完美,仪器的脾气你需要摸清楚,很多的paper里都是用EIC进行定量的,因为这个比TIC来的准确。碰撞池的能量就要根据具体的物质进行优化!

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