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论坛里有没有人做基于LCMS代谢组组方面的研究,交流一下吧吧

液质联用(LCMS)

  • 我刚刚开始这方面的涉入,很多很多地方都没有弄明白,想问一下下有没有人也做这方面的实验呢?

    我目前使用的是一台热电LTQ-orbitrap质谱,全扫描模式跑全谱之后用基于R的一系列软件包来进行后续数据处理

    简单来说:

    1、MSConvert(这个是独立软件)将热电的raw文件转换为mzXML文件

    2、XCMS软件包进行特征识别、分组、填充缺失组分、寻找差异等工作

    3、CAMERA软件包对特征峰进行同位素峰以及各种离子加成峰的识别

    后面怎么检索库还没搞明白。
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  • yellow47

    第1楼2012/12/27

    thermo自己的exactfinder和massfrontier就可以实现你想要的这些功能了吧,sieve可以用来差异化比较

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  • dark_wzy

    第2楼2013/01/10

    不论是谁家的软件,都是基于多元统计分析,找到差异组分(质荷比),然后结合Chemspider、KEGG、HMDB等数据库或者各家自己的数据库进行检索,在经过未知物解析软件对于同分异构体进行确认。

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  • 1233216

    第3楼2016/10/25

    你好,MSConvert 软件可以发给我一份吗?自己下了好久下不下来,我的邮箱1905878206@qq.com

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  • p3082586

    第4楼2017/02/19

    你好,MSConvert 软件可以发给我一份吗?我的邮箱861020224@qq.com

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