TOPAS 处理原位XRD数据

Ins_8fab540d

2021/09/18

私聊

X射线衍射仪（XRD）

我们实验室想尝试使用TOPAS批量精修原位XRD数据结果，顺序是先精修一个图谱（使用hkl+峰型），导出相应的INP文件，再编辑INP文件（修改衍射源文件地址，导出a、c，晶胞体积以及误差），再通过使用bat脚本文件，使用TOPas里面的TC程序，复制源文件和INP文件，输出，但是老是失败，是哪一步出了问题，代码是之前的博士留下来的，现在没人会，所以求助，谢谢。

问题一，怎么修改inp文件，按照留下来的程序是

xdd"D实验数据\sanyuan\insitu _ sanyuan_0.raw %这行也不知道是不是删除，没看明白。

RAW(Filename) out"D:实验数据\sanyuan(results. txt" append

Out String("File: ") Out_String(Filename)

问题二，脚本文件问题，

cd c: \ topas6

for /l %%i in(0,1,50) do(

c:\topass\tc"D\实验数据\sanyuan\sanyuan"" macro Filename{ Insitu_sanyuan%%y

copy"D\实验数据\sanyuan\sanyuan.out""D:实验数据\Sanyuan\sanyuan_%%i.out"

copy"D\实验数据\sanyuan\sanyuan.out""D:实验数据\sanyuan\sanyuan.inp"

)

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疑问就在于，明明选择的是hkl拟合（因为只根据位置和面积，精修晶胞参数），哪来的out文件，然后就是输出结果

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iangie

第1楼2021/09/18

应助达人

你这种用CMD调用TC.EXE的方法是TOPASV5以前的老方法
TOPAS v6 自带有num_runs 和 Run_Number关键字可以一个inp执行num_runs遍. 只需要把Run_Number写进文件名里, 比你这种用CMD调用tc.exe快得多

> 代码是之前的博士留下来的，现在没人会
不知道是该吐槽老板没经验还是你就这么放你师兄走了只能说你们组没人会

>%这行也不知道是不是删除，没看明白。
这行是方便精修单个衍射数据的 batch运行的时候要注销掉

>疑问就在于，明明选择的是hkl拟合（因为只根据位置和面积，精修晶胞参数），哪来的out文件，然后就是输出结果

只要运行了tc.exe就会生成.out文件

你这么光描述问题没用把数据和inp bat打包发上来不然这么知道哪里少了分号........

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Ins_8fab540d

第2楼2021/09/18

好的，十分谢谢回帖，我等下就把INP和BAT文件打包上传。
iangie(iangie) 发表:你这种用CMD调用TC.EXE的方法是TOPASV5以前的老方法
TOPAS v6 自带有num_runs 和 Run_Number关键字可以一个inp执行num_runs遍. 只需要把Run_Number写进文件名里, 比你这种用CMD调用tc.exe快得多

> 代码是之前的博士留下来的，现在没人会
不知道是该吐槽老板没经验还是你就这么放你师兄走了只能说你们组没人会

>%这行也不知道是不是删除，没看明白。
这行是方便精修单个衍射数据的 batch运行的时候要注销掉

>疑问就在于，明明选择的是hkl拟合（因为只根据位置和面积，精修晶胞参数），哪来的out文件，然后就是输出结果

只要运行了tc.exe就会生成.out文件

你这么光描述问题没用把数据和inp bat打包发上来不然这么知道哪里少了分号........

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Ins_8fab540d

第3楼2021/09/18

我附近已经上传了，但是显示未验证。

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Ins_8fab540d

第4楼2021/09/18

真的太感谢老师了

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iangie

第5楼2021/09/19

应助达人

玩原位电池的啊~ 你这块铍窗已经氧化了哈手套箱里擦干净或者直接换块新的每次用完及时擦干净不然氧化很快的哈

17度两个峰至少两个相一个高Li 一个低Li 不知道你的三元是不是NMC 我就用LiCoO2代替了哈

你给的INP里面物相都没找对... 给你重新写了个INP 我的V6跟你的安装位置不一样脚本文件里换成你的TC.exe的安装路径
Ins_8fab540d(Ins_8fab540d) 发表: 好的，十分谢谢回帖，我等下就把INP和BAT文件打包上传。