1.目的
对QTRAP5500定期(每次关机后开机,或每3个月)进行PPG质量校正,保证该仪器处于精确度、灵敏度、分辨率高的状态。
2.适用范围
适用于华大基因质谱分析实验室
3.责任
设备负责人应根据维护计划定期对QTRAP5500进行离子阱质量校正;
所有操作人员必须严格按照本操作规程所规定操作,如遇到特殊情况需要修改操作方法,需经分管领导批准;
质量监督员、质量负责人负责监督操作规程的执行与实施。
4. 操作步骤
4.1正离子模式下PPG质量手动校正
4.1.1 Q1 Positive MS 校正
1) 在硬件配置Hardware Configure 菜单下Active 激活MSOnly (质谱仪和注射泵);
2) 点击,确认压力在0.4~1.1×10-5torr之间,打开“Installtion”Project;
3) 点击左边导航栏Navigation Bar 的Tune and Calibrate进入手动调谐模式,点击,
点击进入ready状态;
4) 双击Mannul Tuning,进入手动调谐模式;
5) 打开Q1 PosPPGs.dam文件;
6) 调整Scan rate为10Da/s;
7) 进PPG Positive 溶液(2.0×10-7M),Stringe Pump Method,勾上use(),先
以大流速(如30μl/min)跑1min,点击Start Syringe;
8) 开针泵,稳定后改为5μl/min的流速;选一个质量的峰优化喷雾针伸出的长度,连续扫描5min,一边调喷雾针伸出的长度,一边看Intensity,取Intensity强度最大值时喷雾针伸出的长度(开始时喷雾针伸出的长度可以设为2mm左右,通过左右调位置看哪个时候Intensity最大);---该步是换过喷雾针才需做的,一般省略不做,调节TIS electrode 位置方法也一样。
9) 用MCA方式采集10 Cycles , 右键Open file,点击任一质谱峰,右键list Data,切换到Calibration Peak list,按表1 看Intensity 、Peak width、Mass shift 各项指标是否符合;
表1
Mass(Da) | Intensity(cps) (10 MCA scans) | Peak width(Da) | Mass shift(amu) |
59.050 | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
175.133 | >=1.2×106 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
500.380 | >=9.0×106 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
616.464 | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
906.673 | >=1.4×107 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
10) 如果不符合表1的指标,通过调节offset参数去优化,具体步骤为:
11) 回到Mass Method 界面,切换到Resolution,点击Advanced,通过修改offset值,优化各项指标(一般地,提高offset,Resolution会上升,Peak width会减小,Intensity会下降);
12) 当Intensity和Peak width的指标符合后,点击任一质谱图,点击(Callibrate From Spectrum), 出现MassCallibration options窗口,在Standard项选择PPGs POS
13) (),查看Reference中各个离子的质荷比是否是59.050、175.133、500.380、616.464、906.673,不是的话Edit,各项参数都符合后,点击;
14) 得到一个校准结果图,看所有的点是否在红线范围内,即Mass shift是否<=0.1,是的话,点击update,优化结束,不是的话,点击update,再重新打一次质谱;
15) 若手动校正不能达到指标,则按照4.3仪器自动校正的步骤进行校正后,再按照手动校正的步骤进行验证是否满足仪器指标的要求;
16) 达到指标后,更新数据,不保存方法;
17) 调整Scan rate为200 Da/s;
18) 用MCA方式采集50 Cycles ,右键Open file,点击任一质谱峰,右键list Data,切换到Calibration Peak list,按表2 看Intensity 、Peak width、Mass shift 各项指标是否符合;
表2
Mass(Da) | Intensity(cps) at 200 Da/s (50 MCA scans) | Intensity(cps) at 1000 Da/s (50 MCA scans) | Intensity(cps) at 2000 Da/s (100 MCA scans) | Peak width(Da) | Mass shift(Da) |
59.050 | n/a | n/a | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
175.133 | >=6.0×106 | >=6.0×106 | >=1.2×107 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
500.380 | >=4.4×107 | >=4.4×107 | >=9.0×107 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
616.464 | n/a | n/a | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
906.673 | >=6.8×107 | >=6.8×107 | >=1.4×108 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
19) 如果不符合表2的指标,通过调节IE1和offset去优化;
注:一般先调节offset值,达不到指标再调IE1,上述措施无效,则先自动校正
20) 达到指标后,更新数据,不保存方法;
21) 重复步骤13到15,以1000 Da/s的Scan rate用MCA方式采集50Cycles;
22) 重复步骤13到15,以2000 Da/s的Scan rate用MCA方式采集100Cycles。
4.1.2 Q3 Positive MS 手动校正
1)打开Q3 PosPPGs.dam文件;
2)调整Scan rate为10Da/s;
3)进PPG Positive 溶液(2.0×10-7M)以5μl/min 的流速;
4)用MCA方式采集10 Cycles , 右键Open file,点击任一质谱峰,右键list Data,切换到Calibration Peak list,按表3 看 Intensity 、Peak width、Mass shift 各项指标是否符合;
表3
Mass(Da) | Intensity(cps) (10 MCA scans) | Peak width(Da) | Mass shift(amu) |
59.050 | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
175.133 | >=1.2×106 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
500.380 | >=9.0×106 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
616.464 | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
906.673 | >=1.4×107 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
5)如果不符合表3的指标,通过调节offset参数去优化;
6)达到指标后,更新数据,不保存方法;
7)调整Scan rate为200 Da/s;
8)用MCA方式采集50 Cycles , 右键Open file,点击任一质谱峰,右键list Data,切换到Calibration Peak list,按表4 看Intensity 、Peak width、Mass shift 各项指标是否符合;
表4
Mass(Da) | Intensity(cps) at 200 Da/s (50 MCA scans) | Intensity(cps) at 1000 Da/s (50 MCA scans) | Intensity(cps) at 2000 Da/s (100 MCA scans) | Peak width(Da) | Mass shift(Da) |
59.050 | n/a | n/a | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
175.133 | >=6.0×106 | >=6.0×106 | >=1.2×107 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
500.380 | >=4.4×107 | >=4.4×107 | >=9.0×107 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
616.464 | n/a | n/a | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
906.673 | >=6.8×107 | >=6.8×107 | >=1.4×108 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
注:一般建议先调节offset值,实在达不到指标再调IE3
9)如果不符合表4的指标,通过调节IE3和offset去优化;10)达到指标后,更新数据,不保存方法;
11)重复步骤8到10,以1000 Da/s的Scan rate用MCA方式采集50Cycles;
12)重复步骤8到10,以2000 Da/s的Scan rate用MCA方式采集100Cycles。
4.2负离子模式下PPG质量手动校正
4.2.1Q1 Nagative MS 校正
1)打开Q1 NegPPGs.dam文件;
2)调整Scan rate为10Da/s;
3)进PPG Nagative溶液(3.0×10-5M),以10 μl/min的流速;
4)用MCA方式采集10 Cycles , 右键Open file,点击任一质谱峰,右键list Data,切换到Calibration Peak list,按表5看Intensity 、Peak width、Mass shift 各项指标是否符合;
表5
Mass(Da) | Intensity(cps) (10 MCA scans) | Peak width(Da) | Mass shift(amu) |
44.998 | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
411.259 | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
585.385 | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
933.636 | >=1.0×107 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
5)如果不符合表5的指标,通过调节offset参数去优化;
6)达到指标后,更新数据,不保存方法;
7)调整Scan rate为200 Da/s;
8)用MCA方式采集50 Cycles , 右键Open file,点击任一质谱峰,右键list Data,切换到Calibration Peak list,按表6 看Intensity 、Peak width、Mass shift 各项指标是否符合;
表6
Mass(Da) | Intensity(cps) at 200 Da/s (50 MCA scans) | Intensity(cps) at 1000 Da/s (50 MCA scans) | Intensity(cps) at 2000 Da/s (100 MCA scans) | Peak width(Da) | Mass shift(Da) |
44.998 | n/a | n/a | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
411.259 | n/a | n/a | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
585.385 | n/a | n/a | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
933.636 | >=4.0×107 | >=4.0×107 | >=8.0×107 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
9)如果不符合表6的指标,通过调节IE3和offset去优化;
注:一般建议先调节offset值,实在达不到指标再调IE1
10)达到指标后,更新数据,不保存方法;
11)重复步骤8到10,以1000 Da/s的Scan rate用MCA方式采集50Cycles;
12)重复步骤8到10,以2000 Da/s的Scan rate用MCA方式采集100Cycles。
4.2.2Q3 Nagative MS 手动校正
1)打开Q3 NegPPGs.dam文件;
2)调整Scan rate为10Da/s;
3)进PPG Nagative溶液(3.0×10-5M),以10 μl/min的流速;
4)用MCA方式采集10 Cycles , 右键Open file,点击任一质谱峰,右键list Data,切换到Calibration Peak list,按表7查看Intensity 、Peak width、Mass shift 等各项指标是否符合;
表7
Mass(Da) | Intensity(cps) (10 MCA scans) | Peak width(Da) | Mass shift(amu) |
44.998 | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
411.259 | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
585.385 | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
933.636 | >=8.0×106 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
5)如果不符合表7的指标,通过调节offset参数去优化;
6)达到指标后,更新数据,不保存方法;
7)调整Scan rate为200 Da/s;
8)用MCA方式采集50 Cycles ,右键Open file,点击任一质谱峰,右键list Data,切换到Calibration Peak list,按表8看Intensity 、Peak width、Mass shift 各项指标是否符合;
9)如果不符合表8的指标,通过调节IE3和offset去优化;
注:一般建议先调节offset值,实在达不到指标再调IE3
10)达到指标后,更新数据,不保存方法;
11)重复步骤8到10,以1000 Da/s的Scan rate用MCA方式采集50Cycles;
表8
Mass(Da) | Intensity(cps) at 200 Da/s (50 MCA scans) | Intensity(cps) at 1000 Da/s (50 MCA scans) | Intensity(cps) at 2000 Da/s (100 MCA scans) | Peak width(Da) | Mass shift(Da) |
44.998 | n/a | n/a | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
411.259 | n/a | n/a | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
585.385 | n/a | n/a | n/a | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
933.636 | >=4.0×107 | >=4.0×107 | >=8.0×107 | 0.6 to 0.8 | <=0.1 |
12)重复步骤8到10,以2000 Da/s的Scan rate用MCA方式采集100Cycles。
4.3 PPG质量自动校正
4.3.1 双击左边导航栏Navigation Bar 的Instrument Optimization进入自动调谐模式;
4.3.2 选择“Adjust instrument settings”,再点击“Next”,进入“Select a tuning mode”页面
图1
图 2
4.3.3 选择“Approved Tuning”模式,再点击“Next”,进入“Select the Scan modes”,并如图 1所示选择相匹配的“Tuning Solution”(PPG或者PPG 3000)、“Polarity”以及需要校正的参数,再点击“Next”后进入图 2所示的页面,在该页面修改喷雾电压、Gas1、注射泵的类型和流速等相关参数后,点击“Go”按钮,仪器开始进行自动校正,仪器在校正过程中的状态如图 3所示;
图3
4.3.4 校正自动完成后,会出现“Result Summary”的页面,点击“Finised”结束自动校正;
4.3.5 自动校正的结果以优化起始时间命名,默认保存在Project-“API Instrument”的“Data”文件夹下,可以进行查看;
4.3.6自动校正完成后,进入手动调谐模式,验证仪器状态是否符合各项指标;
5. 注意事项
5.1仪器正常运行时,禁止接触离子源,避免受到高温、高压的伤害;
5.2仪器停止工作后半小时内,禁止接触离子源,避免受到高温的伤害;