韩家淮

2月8日，国际知名学术刊物Nature Communications在线发表了韩家淮教授课题组的最新研究成果“RIP1 Autophosphorylation Is Promoted by Mitochondrial ROS and Is Essential for RIP3 Recruitment into Necrosome”，揭示了活性氧簇(ROS)通过直接特异地氧化受体相互作用丝氨酸/苏氨酸激酶1(RIP1)上的三个关键的半胱氨酸，进而特异地增强RIP1在S161上的自磷酸化，从而促进坏死小体的形成和程序性细胞坏死的发生。　　程序性细胞坏死是一种高度受调控的细胞死亡方式，它参与到机体的多种病理过程中，因而受到学术界的广泛关注，比如细菌和病毒感染，或者动脉粥样硬化等无菌损伤导致的炎性病变。程序性细胞坏死在生理病理上的重要性决定了它在调控上的复杂性。因此，尽管关于它的机制研究被频繁报道，仍然有许多重要的科学问题尚未解决。其中，线粒体ROS在程序性细胞坏死中的作用和分子机制，是近20年内该领域一个长期存在且有争议的问题。另一个长期存在的问题是，RIP1作为程序性坏死通路上的核心蛋白，它的激酶活性是行使功能所必需的，但是RIP1的激酶活性在程序性细胞坏死中起了什么样的作用仍然未知。　　韩家淮教授课题组的这项研究表明，这两个科学问题是相关联的。研究人员利用质谱技术首次证实，RIP1通过其上的三个关键的半胱氨酸(C257，C268和C586)直接接受ROS的氧化调控，进而增强激酶活性，发生第161位丝氨酸(S161)的自磷酸化。他们证实了RIP1的激酶活性在程序性细胞坏死中的主要功能是自磷酸化S161，且S161就是人们长期寻找的RIP1上与坏死相关的功能性磷酸化位点。坏死小体的形成是程序性细胞坏死发生的必要复合物，而S161的磷酸化是RIP1有效募集RIP3形成有功能的坏死小体所必需的。由于ROS的产生依赖于坏死小体里的RIP3的功能，因此ROS介导了程序性坏死通路里的正反馈调控。　　韩家淮教授课题组的研究阐明了ROS促进程序性细胞坏死的分子机制，回答了领域内长期存在的两个科学问题，对全面解析程序性坏死机制并协助疾病治疗具有重要意义。　　张荧荧和苏晟为该论文的共同第一作者。该项研究得到了973计划和国家自然科学基金委员会重点和重大研究计划项目的经费支持。　　论文原文链接：http://www.nature.com/articles/ncomms14329

p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" strong 厦门大学韩家淮院士实验室在Nature Methods上发表了基于SCIEX TripleTOF& nbsp 5600+高分辨液质系统的新型SWATHTM蛋白质组定量技术数据处理方法。 /strong /span /p p br/ /p p style=" TEXT-ALIGN: center" & nbsp & nbsp img style=" WIDTH: 413px HEIGHT: 281px" title=" 1.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201510/uepic/ee308b77-9492-4124-b435-cb773c50aca3.jpg" / /p p 左一是文章通讯作者钟传奇博士，左二是SCIEX公司组学应用支持经理郭立海博士，左三是实验室仪器管理员谢昌传博士，左四是分析测试中心副主任陈晋安高级实验师。 /p p br/ /p p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 中国科学家开展蛋白质组研究已走过十几年历程，在此领域取得了重多成就，然而在里程碑式的学术刊物Nature或Nature系列刊物上发表有关蛋白质组学的文章还是凤毛麟角，完成这个目标一直是从事蛋白质组学研究的中国学者心中的愿望。就在此时，我们得到喜讯，厦门大学韩家淮院士实验室5年磨一剑，高效的团队，在短短的时间内就取得了非常骄人的成果，令所有从事蛋白质组研究的工作者为之骄傲，利用SCIEX的TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 高分辨液质系统将其蛋白质组研究推到了世界顶级水平，并于2015年10月6日在Nature Methods（2014年影响因子32）上发表了他们的成果。成功的在他的实验室开发出新型蛋白质组定量技术SWATH sup TM /sup 的数据处理软件。 /p p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp SCIEX公司得知用户的工作达到如此高的国际水准非常高兴，这也是对SCIEX公司产品和技术最大的肯定和鼓励。为了解更多韩院士实验室的工作, 我们专门采访了该文的通讯作者之一，韩家淮院士的博士后钟传奇博士，了解他们实验室的工作内容和该文章的核心思想，以便给我们广大的质谱工作者和SCIEX质谱仪器用户有所启发。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 1 韩院士实验室的主要研究内容是什么？有哪些方向？ /span /p p 答：韩老师实验室主要研究内容是在先天性免疫反应中细胞内信号的传导，具体有细胞程序性坏死的机制，p38信号通路在细胞应激反应中的调控机制等等。但是，蛋白质组并不是主要研究方向，只是其中一小部分，只有3-4个人在做这方面的研究，都是在我的带领下进行的。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 2 实验室开展蛋白质组研究的历史或历程？蛋白质组平台是怎样的构成？ /span /p p 答：我（钟传奇博士）在2010年来到韩老师实验室做博士后，韩老师觉得蛋白组是一个强有力的工具，所以要我来负责蛋白组学的研究。现在平台只有2台SCIEX公司的质谱仪，一台TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 5600和一台TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 5600+。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 3 为什么连续购买SCIEX的TripleTOF？怎样评价现在的平台？ /span /p p 答：主要是因为TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 5600是一个高分辨率高灵敏度的质谱，扫描速度快，而且5600可以实现新型的蛋白质组定量技术---SWATH sup TM /sup 。购买之后用了差不多4年，一直运行很稳定，数据产出也很多，我们使用比较满意，所以考虑到生科院的使用情况就又买了一台。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 4 蛋白质组学平台取得了哪些科研成果？ /span /p p 答：蛋白组学平台还是取得了比较多的成绩，在纯蛋白组领域，我们在如下杂志Molecular Cell Proteomics （2012），Proteomics（2014）和Nature Methods (2015)发表了一系列文章. 在其他领域，我们利用蛋白组为工具推进了其他课题研究的进步，在如下期刊JBC (2013), Cell Host Microbe(2015)和Nature Cell Biology (2015)发表了一系列文章。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 5 怎么评价这种SWATH sup TM /sup 全新的蛋白质组定量技术？和其他定量技术比较有什么好处？未来期望哪些地方可以进一步提升？ /span /p p 答：SWATH sup TM /sup -MS 是一个全新的蛋白质组定量技术，是DIA技术的一种。虽然DIA很早之前就出现了，但是SWATH sup TM /sup -MS是第一个把灵敏度和可使用性结合的最好的技术。相比基于IDA的定量技术如SILAC、iTRAQ和label-free，其优点在于能在多个样品之间对肽段进行良好的一致性定量，即SWATH sup TM /sup 的定量准确性、重现性和全面性是其他方法无法比拟的。我觉得，SWATH sup TM /sup -MS的灵敏度还可以再进一步地提高。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 6 为什么仅仅一个软件就可以发表在Nature Methods上？ /span /p p 答：SWATH sup TM /sup -MS是一个全新的，并且拥有很多优点的蛋白组定量技术，已经被该领域广泛接受和应用，其应用有非常好的前景。但是其后续的信息学处理软件却非常缺乏，尤其是SWATH sup TM /sup 数据直接做蛋白质鉴定。所以这个软件开发解决了一个大家都比较关心的问题。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 7 文章里说的Group-DIA的设计思路是什么，比其他的处理软件有哪些优势？ /span /p p 答：SCIEX的SWATH sup TM /sup 2.0商业化软件和Open-SWATH sup TM /sup 在做定量时，需要构建Library，而Group-DIA想解决的主要问题是不需要建library就可以直接实现定量，即对SWATH sup TM /sup 数据同时做蛋白鉴定和定量。其主要的思路是Group-DIA软件在发现母离子和其子离子对的时候，整合了多个样品的信息，故Group-DIA软件能在SWATH sup TM /sup -MS数据里鉴定和定量到比其他软件如DIA-Umpire更多的肽段。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 8 这个软件SCIEX的其他用户可以免费试用吗？到哪里可以下载？ /span /p p 答：当然可以，我们非常欢迎同行来使用这个软件，Group-DIA是开源软件。我们会对软件进行持续更新。我们的Nature Methods文章有提供下载地址。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 9 SCIEX自去年就已经将SWATH sup TM /sup 升级到了2.0，定量数据质量的提升很大，您怎么看待SCIEX公司的商业化SWATH sup TM /sup 2.0数据处理软件？咱们的Group-DIA软件和这个有比较吗？是一个互补吗？ /span /p p 答：我们也购买了SCIEX公司的商业化SWATH sup TM /sup 2.0数据处理软件，用起来很方便。SCIEX公司的SWATH sup TM /sup 2.0数据处理软件是基于库的SWATH sup TM /sup 分析软件，Group-DIA是不依赖于库的SWATH sup TM /sup 分析软件，不是很好比较。这两个软件是很好的互补。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 10 SCIEX公司已经推出了OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 云端多组学数据分析平台，可以在云端来做SWATH sup TM /sup 数据分析，并可以进行后续的生物信息学分析，同时可以和基因组学数据进行整合分析，帮助科学家更方便的一站式挖掘深层次的生物学意义，您怎么看待OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span ? /span /p p 答：SWATH sup TM /sup 的数据处理是一个较复杂的过程，OneOmics sup ? /sup 是一个很好的平台，可以将很多的复杂的过程简单化，处理速度要比本地快很多，利于科学家使用。而且可以在一个云环境里做好多生物信息学分析，非常方便，很容易找到一些有意义的信息。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 11 OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 是一个开放式的云端计算平台，科学家可以将自己开发的软件APP放上去，让更多的人使用，咱们有兴趣将Group-DIA代码放进OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 平台吗？ /span /p p 答：我当然希望能将Group-DIA整合到OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 平台，但是中间可能会有一些兼容问题，我们可以和SCIEX合作解决这些问题，将Group-DIA代码放到OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 平台，让更多的同行来应用。 /p p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 韩院士实验室在钟博士的带领下，蛋白质组研究能取的这么好的成绩，就像钟博士讲的质谱平台是基础，对质谱和蛋白质组学的技术深入理解是关键，抓技术热点是捷径。所以，我们也希望广大的SCIEX用户能够充分发挥仪器的优势，做出更多更杰出的科研成果，让中国科学家在国际同行中产生更大的影响力。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" strong 韩家淮教授 /strong /span /p p & nbsp /p p img title=" 2.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201510/uepic/3c3e81b6-c28c-4891-a225-03442b0d6d10.jpg" / /p p br/ /p ul style=" LIST-STYLE-TYPE: disc" class=" list-paddingleft-2" li p 厦门大学生命科学学院教授 /p /li li p “千人计划”特聘教授 /p /li li p 长江学者特聘教授 /p /li li p 中国科学院院士 /p /li /ul p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 韩家淮教授是先天性免疫信号传导领域的世界知名学者，在世界上率先发现p38信号通路。细胞内存在多条信号通路以介导不同的生物学反应。p38信号通路是细胞内最重要的信号通路之一，它在许多生物学反应包括细胞周期调控、细胞增殖、发育、分化、衰老、凋亡、免疫反应及肿瘤发生中起重要作用。韩家淮教授领导的实验室在p38信号通路的研究领域一直保持世界领先地位。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 细胞应激生物学国家重点实验室 /span /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" br/ /span /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp “细胞应激生物学”国家重点实验室（厦门大学）于2010年9月在原“细胞生物学与肿瘤细胞工程”教育部重点实验室和“福建省癌症生物学”重点实验室的基础上申请建设，于2011年10月获科技部批准建设。现任国重实验室主任为韩家淮教授，学术委员会主任为王志新院士。 /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 实验室以细胞应激反应为主线，重点围绕着细胞应对外界刺激的应激反应生物学、细胞应对自身癌变的应激反应生物学、细胞应对代谢状况变化的应激反应生物学这三个方向开展研究。实验室秉承“边建设边运行”的方针，以基础理论研究为根本，结合应用基础研究，从分子、细胞和个体水平上深入地研究炎症应激反应、肿瘤胁 迫应激反应和代谢应激反应等细胞应激生物学研究领域的关键科学问题。通过多方位、多学科、多层次的联合研究，力求全面提高实验室在细胞应激生物学研究领域的综合实力，为国家人口与健康领域的需求做出重大贡献，并以优秀的原创性成果和高水平人才队伍跻身国际知名研究中心和人才培养基地之列。 /p p br/ /p

7月7日，京东拍卖网预告了“德淮半导体有限公司整体资产”拍卖项目，包含德淮全部动产和不动产，但不含芯片成品和芯片原材料。（拍品详情 - 破产拍卖 (jd.com)）拍卖预告信息显示，德淮半导体有限公司破产管理人将于2021年8月6日10时至2021年8月7日10时止（延时除外）在京东拍卖破产强清平台（处置单位：德淮半导体有限公司破产管理人，监督单位：淮安市淮阴区人民法院）。竞拍产品德评估价：238021.838845万元，起拍价：166616 万元，保证金：33323.2 万元，增价幅度：1000万元及其整数倍。在标的物描述中，可以看到德淮本次拍卖的动产、不动产详细清单，包括Fab1、动力中心、气体房倒班宿舍、变电站、办公楼等18项建筑，应用材料、尼康、KLA、TEL、LAM等设备62套，17.13万平方米的工业用地，以及其他电子设备和车辆等。机器设备清单：机器设备清单.doc实际上，德淮半导体在一年前就被媒体指出两年烧光153亿，是一场半导体骗局。去年武汉弘芯暴雷后，众多半导体项目都被媒体爆料出是骗局。这些层出不群的半导体项目骗局不仅伤害了国民情感，更是沉重打击了我国半导体产业发展，浪费了大量资源和国力。中国弹药充足，而骗子也目标明确，这几年，至少有六个大型半导体项目成了笑话。2020年，投资200亿的德科码正式宣告破产，并且成为欠薪、欠款、欠税的垃圾项目；2020年，投资近700亿的成都格芯厂，正式宣布遣散员工，全部停工停业；2019年，投资近40亿的华芯通”正式停工关闭，前期投资尽打水漂；2020年，投资超400亿的“坤同柔性半导体”，停工、停薪、停产；投资超170亿的德淮半导体现在也土崩瓦解；投资超1280亿的武汉弘芯半导体宣告破产。实际上这些烂尾项目背后存在多个职业“芯”骗团伙，武汉弘芯幕后黑手曹山还在济南做局欺骗地方政府立项了泉芯半导体，辛亏在弘芯暴雷后，泉芯半导体幕后黑手被挖出才避免了造成更大的损失。半导体产业已经成为了骗子的游乐园，这些幕后黑手甚至可以全身而退，立法打击诈骗团伙已刻不容缓。