评估单克隆抗体

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  • 单克隆抗体带电异构体分析柱
    Agilent Bio MAb 液相柱 填料担体由硬质球形、高度交联的聚苯乙烯二乙烯基苯(PS/DVB)无孔微球组成 填料表面结合了亲水聚合物层,避免抗体蛋白的非特异性结合 填料的弱阳离子交换固定相层采用了不同工艺,使其比Agilent Bio WCX 柱填料的密度更高 专为单克隆抗体基于带电异构体的分离而设计单克隆抗体的全面表征,包括酸性和碱性亚型的鉴定和监测。Agilent Bio MAb 液相柱填充了专为单克隆抗体基于带电量的高分离度分离而设计的特殊树脂。与水性缓冲液、乙腈/丙酮/甲醇和水混合溶液兼容。常用缓冲液为:磷酸盐、三羟甲基氨基甲烷、MES 和醋酸盐。Bio MAb 柱有1.7、3、5 和10 μm 粒径可供选择,较小的粒径能够提供较高的分离度。订货信息:
  • SCX-10 RS 单克隆抗体分析柱 082675
    产品特点:MAbPac™ SCX-10 RS 单克隆抗体分析柱,5 μm为了高分辨率、高效率地分析单克隆抗体 (mAb) 和相关变异体,请使用 Thermo Scientific™ MAbPac™ SCX-10 RS 单克隆抗体分析柱 (5 μm)。独特的无孔薄膜树脂可提供足以将差异仅为一个带电残基的 mAb 变体分离开来的分辨力。亲水层环绕在聚合物珠周围,可避免其与树脂发生疏水相互作用,从而可使色谱柱达到超高柱效。一种获得专利的接枝型阳离子交换表面可提供 pH 选择性控制功能,从而实现高分离度分离。mAb 变体分析性能卓越对 mAb 变体表现出超高分离度非常适合 mAb 的表征和质控评估特别适合用来进行稳定性研究、mAb 治疗方法开发和高通量筛选无与伦比的柱到柱和批到批的可重现性避免了在稳定性和 QA/QC 测试中对色谱柱变异性的担忧。符合生物制药表征的法规要求在标准规格和 UHPLC 规格中,可选粒径为 3 μm、5 μm 和 10 μm。粒径减小的色谱柱不但可提供与 10 μm 色谱柱相同的分离度,而且还能显著缩短分析时间。MAbPac SCX-10 RSBioRS (Rapid Separation), strong cation exchange column designed for monoclonal antibodies and associated charged variants* UHPLC, high throughput analysis* Specially developed bio-inert PEEK lined stainless steel column hardware * High pressure compatibility* Suitable for operation up to 7,000 psiHigher resolution and throughput of mAb charge variant UHPLC separations can be achieved using the MAbPac SCX-10 RS strong cation-exchange phase with specially developed bio-inert PEEK lined stainless steel column hardware. These columns are designed to be used at higher UHPLC conditions to maximize the resolution of mAb variant separation. Higher pressure compatibility of the column hardware allows use of high flow rates for faster separation.订购信息:MAbPac SCX-10RSParticle Size (μm)FormatLength (mm)2.1mm ID4.6mm ID5UHPLC Column50082675082674150088242085209250082515082673
  • Thermo/热电 用于单克隆抗体和相关变异体的强阳离子交换色谱柱
    MAbPac SCX-10 RS 色谱柱BioRS, 用于单克隆抗体和相关变异体的强阳离子交换色谱柱 UHPLC,高通量分析 特殊开发的生物惰性的、PEEK衬里的不锈钢色谱柱管 兼容高压力 可在 7,000 psi 条件下使用使用小粒径的 MAbPac 强阳离子交换色谱柱以及特殊设计生物惰性的 PEEK 衬里的不锈钢柱管,可以实现MAb 变体的高分离度、高通量分析。该色谱柱使用更小粒径的色谱填料以及更长的柱子,提高 MAb 变体的分离度,可以在高达 7000 psi 的压力下进行分析。耐高压的柱管使快速分析变为可能。订货信息:

评估单克隆抗体相关的仪器

  • 多功能全自动细胞克隆分析及分离系统CellCelector Flex 将高内涵成像系统,高精度全自动细胞挑取机械臂和强大的成像处理分析软件相结合,可对单细胞、细胞团、球体、类器官、单细胞克隆以及贴壁细胞进行全自动检测、筛选、挑取和分离。挑取技术:已经获得专利的挑取技术支持极快的细胞扫描和挑取,从而快速分离细胞。温和地进行细胞转移,保证高度的细胞完整性和生长速率。对于一些应用,如单细胞克隆,可以实现高达 100% 的挑取/转移效率。CellCelector Flex关键特征多功能 &bull 适用于贴壁细胞、悬浮细胞或半固体培养基中的细胞 &bull 单细胞、细胞团、球体或菌落 &bull 原代细胞或细胞系 &bull 活细胞或固定细胞灵活 &bull 明场、相差和荧光成像 &bull 自动、半自动或手动细胞筛选,以供挑取分离 &bull 兼容标准或定制源容器和目标容器,如微孔板、培养皿、载玻片、过滤器、芯片、PCR板或管&bull 可升级的定制解决方案,可整合至大平台可靠 &bull 对特定细胞亚群超过95%的挑取准确性 &bull 对移动的检查对象进行自动重新定位 &bull 如果挑取失败,可重新挑取 &bull 软件自动检测是否成功挑取温和挑取 &bull 不影响细胞特性 &bull 可分离准备用于分子表征或下游培养的纯完整细胞 &bull 挑取后的细胞完整性和存活率高(包括单细胞克隆应用中高达95%及以上的存活率)快速 &bull 实验操作时间短 &bull 每次挑取仅20至30秒上游|下游兼容 &bull 无需复杂的样本制备,无需昂贵的耗材 &bull 与多个上游富集技术(免疫磁珠富集、基于尺寸的分离等)兼容 &bull 抽吸和点样体积小(降至约1 nL) &bull 单细胞PCR、NGS、RNA-Seq、细胞克隆、滴度分析、放大工艺等记录 &bull 符合GLP和GMP标准的完整工作流程记录 &bull 通过在每次挑取事件前后拍摄的实时、高质量图像进行质量控制 &bull 每一个被检测/捕获的对象都可以通过其唯一的ID进行识别,并可以在整个过程中从源板到终板进行完整的追踪,方便导出所有捕获的图像和数据 CellCelector Flex 关键应用单细胞分离&bull 稀有单细胞分离&bull 循环肿瘤细胞CTCs分析和分离&bull 胎儿细胞cbNIPT&bull 精子细胞分离&bull 原生质体/植物细胞&bull 单细胞异质性分析&bull CRISPR单细胞克隆细胞系开发&bull 用于细胞系开发的单细胞克隆 &bull mini Pool建立及筛选 &bull 从半固体培养基中进行菌落挑取及转移抗体发现&bull 单B细胞筛选 &bull 基于纳米孔的杂交瘤筛选 &bull 来自半固体培养基的杂交瘤克隆的筛选和挑取 &bull 杂交瘤亚克隆 &bull 基于微球的检测干细胞&bull iPS单细胞克隆 &bull 干细胞克隆挑取 &bull 造血干细胞克隆挑取 &bull 球体分离 CellCelector Flex 挑头我们根据CellCelector Flex 在不同领域的应用提供多种挑头。针对特定的细胞类型和挑取捕获模块对所有毛细管和挑头进行了优化,以保证温和、精准地挑取挑取细胞、细胞团以及克隆,整个过程无污染。CellCelector Flex 纳米孔板CellCelector Flex 纳米孔板含有十万到数百万个纳米孔,将细胞悬液接种后,数万个纳米孔有效地将细胞隔离开来,并确保共培养环境以促进单克隆生长。有效替代有限稀释法,FACS。&bull 高通量:每孔可获得400-600个单细胞(相当于有限稀释法25块96孔板!)&bull 高效节约:避免重复稀释,单次试验即可获得单克隆性、活力且高产的克隆&bull 100%单克隆性:自动图像鉴别单细胞并跟踪其生长到克隆,避免交叉污染&bull 单细胞活率超95%,无需昂贵外源生长因子CellCelector 机柜当处理活细胞时,无菌条件和经过调节的生理相关环境是关键因素。FlowBox 孵育箱可提供以下独特组合: &bull 经过HEPA过滤的垂直层流 &bull 对温度、湿度和CO2水平的精确控制 &bull 即使在检修门打开时,也能智能控制风速和排气量 &bull 高能紫外线灯,用于表面灭菌 &bull 源板和终板的最优细胞存活率 &bull 用户友好型控制面板 &bull 在不失去受控条件的情况下,充分方便地接触放置在里面的仪器和实验装置
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  • maXis II 开启精确质量 LC-MS/MS 分析的新时代  maXis II 在广泛的应用领域展现出前所未有的性能和解决更具挑战性分析难题的能力,这预示着maXis II 正在开启QTOF技术新时代。maXis II 同时提供全方位市场先进的性能指标。布鲁克公司超高分辨QTOF技术在提供准确质量的LC-MS/MS领域已经达到新高度。另外,maXis II 提供电子转移解析(ETD)功能,能够分析包括单克隆抗体亚基在内的整体大蛋白序列分析。可选功能“HighMass”有利于表征大分子和天然状态的蛋白质复合物如抗体药物偶联物。  无与伦比的多功能性  配备上TOF创新技术,布鲁克 maXis II 拥有创纪录的全灵敏度分辨率( FSR ) 80,000。这预示着QTOF技术迎来了一个新时代,在应用领域有着前所未有的性能来解决极具挑战性的分析难题。maXis II 做到了只有TOF才能做到的整合解决方案:灵敏度、光谱精确度和动态的范围、横跨整个仪器的质量范围。  分子分析确定  来自于 maXis II 的高质量数据,有准确的质量和真实的同位素模型(TIP),结合布鲁克的独特的从头计算公式发现工具,SmartFormula™ 和SmartFormula 3D™ ,提供了更大程度的准确分子式。  增强分辨率、TIP和质量精确性的好处  增强分辨率和质量精确性与单克隆抗体异质亚单位的完整表征密切相关。MaXis超强性能增强了单抗亚基小分子修饰检测中单一同位素质量的准确性,例如脱酰胺。  maXis II 适用范围:  抗体表征(完整蛋白与亚基)  分析整蛋白和蛋白质组  蛋白复合物  小分子鉴定与定量  采用High Mass可选功能,获取天然态质谱图  电子转移解析(ETD)功能(可选)
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  • 欢迎使用 Thermo Scientific&trade Orbitrap Exploris&trade MX 质量检测器,该产品非常适合希望部署常规质量监测的生物制药实验室。除了 Thermo Scientific&trade Orbitrap&trade 质量分析仪在高分辨率准确质量数检测方面享有盛名,这款量身定制的系统不仅操作简单,还兼容 Thermo Scientific&trade Chromeleon&trade 色谱数据系统(CDS) 软件。高分辨率准确质量 (HRAM) 数据为序列确认、肽段监测、完整蛋白质分析(从小分子到大分子,包括天然和变性条件下的单克隆抗体亚基、还原单克隆抗体和完整单克隆抗体)、聚糖谱分析以及寡核苷酸及其杂质质量确认提供了极高的可信度。Thermo Scientific&trade Orbitrap Exploris&trade 240 质谱仪和 Orbitrap Exploris MX 检测器之间的一致性能确保了从开发到质量控制的无缝方法转移。
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  • 单克隆抗体的应用你知道多少?

    [font=宋体][font=宋体]单克隆抗体是由单一[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞克隆产生的高度均一、仅针对某一特定抗原表位的抗体。通常采用杂交瘤技术来制备,杂交瘤([/font][font=Calibri]hybridoma[/font][font=宋体])抗体技术是在细胞融合技术的基础上,将具有分泌特异性抗体能力的致敏[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞和具有无限繁殖能力的骨髓瘤细胞融合为[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞杂交瘤。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]1975[/font][font=宋体]年分子生物学家[/font][font=Calibri]G.J.F.[/font][font=宋体]克勒和[/font][font=Calibri]C.[/font][font=宋体]米尔斯坦在自然杂交技术的基础上,创建立杂交瘤技术,他们把可在体外培养和大量增殖的小鼠骨髓瘤细胞与经抗原免疫后的纯系小鼠[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞融合,成为杂交细胞系,既具有瘤细胞易于在体外无限增殖的特性,又具有抗体形成细胞的合成和分泌特异性抗体的特点。将这种杂交瘤作单个细胞培养,可形成单细胞系,即单克隆。利用培养或小鼠腹腔接种的方法,便能得到大量的、高浓度的、非常均一的抗体,其结构、氨基酸顺序、特异性等都是一致的,而且在培养过程中,只要没有变异,不同时间所分泌的抗体都能保持同样的结构与机能。这种单克隆抗体是用其他方法所不能得到的。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]单克隆抗体的优势和局限性[/b][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]1[/font][font=宋体].单克隆抗体的优点[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri](1)[/font][font=宋体]杂交瘤可以在体外“永久”地存活并传代,只要不发生细胞株的基因突变,就可以不断地生产高特异性、高均一性的抗体。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri](2)[/font][font=宋体]可以用相对不纯的抗原,获得大量高度特异的、均一的抗体。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri](3)[/font][font=宋体]由于可能得到“无限量”的均一性抗体,所以适用于以标记抗体为特点的免疫学分析方法,如[/font][font=Calibri]IRMA[/font][font=宋体]和[/font][font=Calibri]ELISA[/font][font=宋体]等。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri](4)[/font][font=宋体]由于单克隆抗体的高特异性和单一生物学功能,可用于体内的放射免疫显像和免疫导向治疗。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]2[/font][font=宋体].单克隆抗体的局限性[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri](1)[/font][font=宋体]单克隆抗体固有的亲和性和局限的生物活性限制了它的应用范围。由于单克隆抗体不能进行沉淀和凝集反应,所以很多检测方法不能用单克隆抗体完成。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri](2)[/font][font=宋体]单克隆抗体的反应强度不如多克隆抗体。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri](3)[/font][font=宋体]制备技术复杂,而且费时费工,所以单克隆抗体的价格也较高 。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]单克隆抗体的应用[/b][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]1[/font][font=宋体].检验医学诊断试剂[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]作为检验医学实验室的诊断试剂,单克隆抗体以其特异性强、纯度高、均一性好等优点,广泛应用于酶联免疫吸附试验、放射免疫分析、免疫组化和流式细胞仪等技术。并且单克隆抗体的应用,很大程度上促进了商品化试剂盒的发展。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]2[/font][font=宋体].蛋白质的提纯[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]单克隆抗体是亲和层析中重要的配体。将单克隆抗体吸附在一个惰性的固相基质(如[/font][font=Calibri]Speharose 2B[/font][font=宋体]、[/font][font=Calibri]4B[/font][font=宋体]、[/font][font=Calibri]6B[/font][font=宋体]等)上,并制备成层析柱。当样品流经层析柱时,待分离的抗原可与固相的单克隆抗体发生特异性结合,其余成分不能与之结合。将层析柱充分洗脱后,改变洗脱液的离子强度或[/font][font=Calibri]pH[/font][font=宋体],欲分离的抗原与抗体解离,收集洗脱液便可得到欲纯化的抗原。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]3[/font][font=宋体]. 肿瘤的导向治疗和放射免疫显像技术[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]将针对某一肿瘤抗原的单克隆抗体与化疗药物或放疗物质连接,利用单克隆抗体的导向作用,将药物或放疗物质携带至靶器官,直接杀伤靶细胞,称为肿瘤导向治疗。另外,将放射性标记物与单克隆抗体连接,注入患者体内可进行放射免疫显像,协助肿瘤的诊断。单克隆抗体主要为鼠源性抗体,异种动物血清可引起人体过敏反应。因此,制备人[/font][font=Calibri]-[/font][font=宋体]人单克隆抗体或人源化抗体更为重要,但此方面仍未取得明显进展。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]目前义翘神州提供[url=https://cn.sinobiological.com/services/monoclonal-antibody-production-services][b]单克隆抗体定制服务[/b][/url],有需求可查看详情[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/services/monoclonal-antibody-production-services[/font][/font][font=宋体][font=宋体][url=https://cn.sinobiological.com/resource/antibody-technical/monoclonal-antibody-technology][b]单克隆抗体技术[/b][/url]详情:[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/resource/antibody-technical/monoclonal-antibody-technology[/font][/font]

  • 单克隆抗体技术:基本原理与流程

    [font=宋体][font=宋体][url=https://cn.sinobiological.com/resource/antibody-technical/monoclonal-antibody-technology][b]单克隆抗体技术[/b][/url]的基本原理是利用单一的[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞克隆培养出具有高度一致性的抗体组织。通过将能产生特定抗体的单一[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]淋巴细胞与骨髓肿瘤细胞进行融合,生成一种既能产生所需抗体,又能无限增殖的杂交瘤细胞。这种技术所得到的抗体仅来自一种类型的细胞,这与多克隆抗体或由多种类型细胞产生的多株抗体形成了鲜明对比。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]当前常见的单克隆抗体制备技术主要有杂交瘤、噬菌体抗体库和单个[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞技术。其中,杂交瘤技术是将免疫小鼠的[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞与骨髓瘤细胞融合,筛选具有特异性抗体分泌功能的杂交瘤细胞,进而生产纯化获得单克隆抗体。噬菌体抗体库技术是利用基因工程技术将抗体的基因连接到噬菌体中,并以融合蛋白的形式展示在噬菌体的表面,通过与靶蛋白的结合,完成噬菌体展示抗体的筛选。单个[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞技术是根据每个[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞只含有一对功能性的重链和轻链,每个[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞只产生一种特异性抗体的特性,可以直接从单个[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞中扩增抗体基因获得单克隆抗体。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]单克隆抗体技术流程[/b][/font][font=宋体]①杂交瘤技术制备单克隆抗体[/font][font=宋体]杂交瘤技术是经典的单克隆抗体制备技术,具体流程为:[/font][font=宋体][font=Calibri]1) [/font][font=宋体]抗原制备;[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]2[/font][font=宋体])动物免疫;[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]3[/font][font=宋体])免疫动物的脾细胞与骨髓瘤细胞融合获得杂交瘤细胞;[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]4[/font][font=宋体])筛选杂交瘤细胞获得分泌目标抗体的阳性单克隆杂交瘤细胞;[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]5[/font][font=宋体])扩大培养阳性单克隆杂交瘤细胞;[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]6[/font][font=宋体])单克隆抗体大量制备。(点击了解杂交瘤技术的操作步骤)[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]义翘神州建立了杂交瘤开发技术平台,已成功开发了[/font][font=Calibri]19000[/font][font=宋体]株以上杂交瘤阳性克隆,可以根据客户的最终应用需求,制定个性化的抗原设计、动物免疫、克隆筛选及抗体鉴定方案,生产高质量的单克隆抗体,满足客户的不同需求。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]②噬菌体抗体库技术制备单克隆抗体[/b][/font][font=宋体][font=宋体][url=https://cn.sinobiological.com/resource/antibody-technical/phage-display-antibody][b]噬菌体抗体库技术[/b][/url]也是一种制备单克隆抗体的方法。通常首先是从外周血或脾、淋巴结等组织中分离[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]淋巴细胞,提取[/font][font=Calibri]mRNA[/font][font=宋体]并反转录为[/font][font=Calibri]cDNA[/font][font=宋体],以扩增所有的[/font][font=Calibri]VH[/font][font=宋体]和[/font][font=Calibri]VL[/font][font=宋体]片段。然后构建[/font][font=Calibri]Fab[/font][font=宋体]或[/font][font=Calibri]scFv[/font][font=宋体]等形式的抗体组合文库,使外源抗体基因表达的多肽以融合蛋白的形式展示在噬菌体外壳蛋白[/font][font=Calibri]pIII[/font][font=宋体]或[/font][font=Calibri]pVIII[/font][font=宋体]的[/font][font=Calibri]N[/font][font=宋体]端。 最后,经过“吸附[/font][font=Calibri]-[/font][font=宋体]洗涤[/font][font=Calibri]-[/font][font=宋体]扩增”过程筛选并富集特异性抗体。(点击了解噬菌体抗体库技术的操作步骤)[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]噬菌体抗体库开发平台包括噬菌体展示抗体库构建、淘洗、单克隆鉴定和阳性克隆重组表达等步骤,义翘神州能为客户提供个性化的抗体定制服务,包括鼠源单克隆抗体、兔源单克隆抗体、鸡源单克隆抗体和全人源抗体等多个种属的抗体发现服务。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b][font=宋体]③单[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞抗体技术制备单克隆抗体[/font][/b][/font][font=宋体][font=宋体]单个[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞抗体技术是独立于杂交瘤技术和噬菌体展示技术的、新一代的单克隆抗体开发技术。其技术流程是从免疫动物组织或外周血中分离抗原特异性[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞,通过单细胞[/font][font=Calibri][url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url][/font][font=宋体]技术从单个抗体分泌[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞中扩增[/font][font=Calibri]IgG[/font][font=宋体]重链和轻链可变区基因,然后在哺乳动物细胞内表达获得具有生物活性的单克隆抗体。该技术保留了轻重链可变区天然配对,具有基因多样性好、效率高和所需细胞数量少的优点。(点击了解单[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞技术的操作步骤)[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]义翘神州拥有流式单[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞和[/font][font=Calibri]Beacon[/font][font=宋体]单[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞两大技术平台,可提供一站式的单[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞抗体制备服务,包括从免疫原制备到单个[/font][font=Calibri]B[/font][font=宋体]细胞分选、鉴定、及抗体生产等步骤。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]详情可以关注[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/resource/antibody-technical/monoclonal-antibody-technology[/font][/font][font=Calibri] [/font]

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  • 质谱法对新冠病毒和流感单克隆抗体进行模板辅助从头测序
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Journal of Proteome Research上的文章,Template-Assisted De Novo Sequencing of SARS-CoV‑2 and Influenza Monoclonal Antibodies by Mass Spectrometry [1],文章的通讯作者是德克萨斯大学生物医学研究支持中心的Maria D. Person。抗体在对病毒和其他病原微生物的适应性免疫反应中起着重要作用。对病毒中和抗体的详细表征对于开发能够有效预防病毒疾病的新疫苗和单克隆抗体疗法至关重要。目前,仅从蛋白质中获得抗体的完整氨基酸序列仍然具有挑战性,且许多用于氨基酸从头测序的软件对计算、硬件及操作人员知识和经验的要求较高。另一种蛋白基因组学方法是使用来自DNA序列的数据库作为起点,以数据库序列和实验数据之间的最佳匹配作为模板。这种方法在分析抗体时特别有用,因为大部分抗体序列(不包括CDR3区域)通常与种系序列非常相似。此外,准确区分Ile和Leu在抗体CDR区测序时尤为重要,而大多数蛋白质从头测序软件都没有解决这个问题。Supernovo是从种系序列模板开始的测序程序之一,该模板可以利用ETD和EThcD片段数据来自动区分Ile/Leu。在这项研究中,作者利用SARS-CoV-1人类抗体来开发模板辅助从头测序的方案,对两株SARS-CoV-2人类单克隆抗体进行了测定,最终优化的方案使用四种蛋白酶、双片段化方法、优化补充激活归一化碰撞能量和Supernovo获得99%准确的氨基酸序列,并以该方案对25株流感人单抗进行了测序。一、模板辅助从头测序方法的建立Supernovo的工作原理是,首先将MS/MS数据与种系数据库中的序列进行匹配,在初始种系序列选择之后,使用通配符搜索来确定接合(J)区域,以与可变区和恒定区候选最佳结合,然后进行in silico重组以生成模板。接下来,限制的从头测序和Byonic通配符搜索通过在迭代过程中改变单个氨基酸来改进模板,实现实验数据最佳匹配。最初由种系序列确定的Ile和Leu残基通过蛋白酶切割特异性和w离子的存在进行修正。利用多种蛋白酶从基因组数据库中选择种系支架序列,并通过通配符搜索获得从头测序所需的各种肽。胰蛋白酶和糜蛋白酶是根据其不同的切割特异性选择的,并选择特异性较低的弹性蛋白酶和胃蛋白酶提供额外的切割位点。由于Supernovo利用来自特异性和非特异性裂解肽的所有信息来构建序列,因此具有许多重叠的裂解位点对于序列测定至关重要。作者首先用序列已知的重组单抗CR3022制定和优化方案。CR3022用胰蛋白酶、糜蛋白酶、弹性蛋白酶和胃蛋白酶酶切,用HCD和EThcD LC-MS/MS分析酶切溶液。实验显示使用EThcD可以在不针对选定的单个z离子的情况下全局碎裂肽混合物,并且产生足够的w离子来区分Ile/Leu。b、c、y、z和w离子的产率取决于SA-NCE, 35%的SA-NCE值产生了最高数量的高置信度Ile/Leu分配,并被选择用于最终方案。图1显示了两种含有Leu和Ile的重链肽,其中检测到w离子z-43(Leu)和z-29(Ile),从而允许Supernovo区分Ile和Leu。虽然在碎裂谱中可以检测到w离子,但使用单一SA-NCE值的宽带碎裂,其丰度较低,这是该方法的主要限制。将多重断裂能量相结合,可以提高对w离子的检测,而使用额外的蛋白酶增加切割位点的数量,有助于分离位置相近的Ile/Leu。图1 使用EThcD对Ile/Leu进行MS/MS分配图2显示了用胰蛋白酶、糜蛋白酶、胃蛋白酶和弹性蛋白酶酶切的重链Fab区域在HCD碎裂下的序列覆盖图。由于四种蛋白酶的不同切割特异性以及Supernovo对非特异性切割肽的匹配,可以观察到肽在许多氨基酸残基上的切割。除脯氨酸外,大多数残基的MS/MS中都观察到对应碎片离子。图3显示了DNA确定的参考CR3022序列(DNA sq)、通过将IMGT数据库中的序列片段与MS数据(SNO-gm)进行数据库匹配而识别的种系模板,以及通过对抗体可变区Fab的MS数据(SNO-MS)进行Supernovo分析而生成的最终从头序列之间的比较。所有CDR区域均实现100%正确的氨基酸序列(灰色高亮)覆盖,具有正确的Ile/Leu分配。Supernovo的错误分配(蓝色高亮)主要发生在HC和LC上的N-末端残基以及LC上的C-末端序列。与DNA衍生序列不匹配的外来N和 C-末端残基均与初始种系支架存在偏差,如图3中重链末端的洋红高亮所示。末端氨基酸具有较少的裂解和片段数据,并且可能具有混杂的修饰。半胱氨酸残基可导致附近氨基酸的错误分配,因为半胱氨酸硫的氧化修饰。总的来说,99%的单克隆抗体序列是通过这种方法正确测定的。结合HCD和EThcD数据,68个Ile/Leu中有67个被正确分配。图2 用胰蛋白酶(黑色)、糜蛋白酶(蓝色)、弹性蛋白酶(红色)和胃蛋白酶(黄色)酶切并用HCD裂解的CR3022重链Fab的肽覆盖图。图3 对CR3022 DNA衍生序列(DNA sq)、MS Supernovo种系模板(SNO-gm)和Fab区域的实验结果(SNO-MS)进行比对接着,作者使用两种具有DNA衍生序列的SARS-CoV-2抗体CM66和CM67来测试该方案的最终版本(即四蛋白酶酶切,HCD和EThcD活化,SA-NCE 35%)。表1总结了该方法对已知序列的三种抗体CR3022、CM66和CM67的测试结果。CDR区氨基酸在HC和LC中的分配均正确,只有两个Ile错误分配给Leu。在高通量方法中,产生足够强度的诊断性w离子仍然不一致,但当与蛋白水解切割偏好和种系模板结合使用时,该方法是有效的,至少提供97%的正确Ile/Leu分配。因此,四酶酶切双活化法被确定足以对抗体进行高度准确的序列测定。表1 受试单抗的氨基酸序列和Ile/Leu分配置信水平以及正确匹配的总结二、基于质谱的25种流感抗体分析产生高置信度序列作者用最终确定的方案分析了另外25种序列信息不确定的抗体,以评估该方法在更大规模的实验下是否能产生与SARS-CoV-1和2抗体相同水平的高置信度结果,并最终确定生成的序列是否可用于产生克隆和表达功能性抗体的基因。对于25株流感单克隆抗体,平均97%的序列和76%的Ile/Leu分配可在高置信度下确定。大多数置信度较低的氨基酸分配位于N端和C端,因此不太可能影响抗体结合。与半胱氨酸残基相邻的序列也有较高的中低置信度分配和偏离种系序列的发生率。在25株单克隆抗体中的24株中,两条链上三个CDR区域的所有残基都得到了高度可信的鉴定。由于该方法不总是在可检测水平上产生可区分的w离子,CDR区域具有一些中低置信度Ile/Leu分配。因此,当大规模应用于各种IgG抗体时,该方案提供了高置信度氨基酸序列。获得的流感单克隆抗体序列随后用于通过克隆和在HEK293细胞中表达产生抗体。三、流感病毒HA特异性人单克隆抗体的生物学活性及序列分析在克隆、表达和纯化后,通过ELISA评估原始25种流感病毒和相应重组表达的HA特异性单克隆抗体的生物活性。图4显示了25种单克隆抗体与原始和重组单克隆抗体的HA抗原的结合曲线。通过评估单克隆抗体对相应HA抗原的结合活性,证实了单克隆抗体对H1N1、H3N2和B型流感病毒HA的特异性。如图4所示,流感特异性单克隆抗体表现出与季节性和大流行性流感病毒株的重组HA(rHA)的差异结合,与原始抗体显示的结合活性相当。图4 原始MS测序(左曲线)和重组表达(右曲线)流感HA特异性单克隆抗体的ELISA结合曲线总的来说,作者通过对25个未知序列单克隆抗体进行测序,确认所采用的方法在不同单克隆抗体上产生的残基测定置信度与已知序列或商业来源的单克隆抗体相同。蛋白质组学方法可以用来检查基于DNA的方法,这些方法被认为更准确,或者可以用来清除样本处理和标记中的错误。通过ELISA结合试验观察并验证了CDR序列的多样性。这些分析证实,当克隆和重组表达时,质谱模板辅助从头测序产生的高置信度序列会产生与特异性流感病毒rHA抗原结合的重组单克隆抗体,从而对该方法进行生物学验证。撰稿:夏淑君 编辑:李惠琳文章引用: Template-Assisted De Novo Sequencing of SARS-CoV-2 and Influenza Monoclonal Antibodies by Mass Spectrometry.
  • 单克隆抗体制备的基本原理与过程
    单克隆抗体制备的原理:B淋巴细胞在抗原的刺激下,能够分化、增殖形成具有针对这种抗原分泌特异性抗体的能力、B细胞的这种能力和量是有限的,不可能持续分化增殖下去,因此产生免疫球蛋白的能力也是极其微小的、将这种B细胞与非分泌型的骨髓瘤细胞融合形成杂交瘤细胞,再进一步克隆化,这种克隆化的杂交瘤细胞是既具有瘤的无限生长的能力,又具有产生特异性抗体的B淋巴细胞的能力,将这种克隆化的杂交瘤细胞进行培养或注入小鼠体内即可获得大量的高效价、单一的特异性抗体.这种技术即称为单克隆抗体技术。单克隆抗体制备的过程:免疫动物免疫动物是用目的抗原免疫小鼠,使小鼠产生致敏B淋巴细胞的 过程。 一般选用6-8周龄雌性BALB/c小鼠,按照预先制定的免疫方案进行免疫注射。 抗原通过血液循环或淋巴循环进入外周免疫器官,刺激相应B淋巴细胞克隆,使其活化、增殖,并分化成为致敏B淋巴细胞。细胞融合采用二氧化碳气体处死小鼠,无菌操作取出脾脏,在平皿内挤压研磨,制备脾细胞悬液。 将准备好的同系骨髓瘤细胞与小鼠脾细胞按一定比例混合,并加入促融合剂聚乙二醇。在聚乙二醇作用下,各种淋巴细胞可与骨髓瘤细胞发生融合,形成杂交瘤细胞。选择性培养选择性培养的目的是筛选融合的杂交瘤细胞,一般采用HAT选择性培养基。在HAT培养基中,未融合的骨髓瘤细胞因缺乏次黄嘌呤-鸟嘌呤-磷酸核糖转移酶,不能利用补救途径合成DNA而死亡。 未融合的淋巴细胞虽具有次黄嘌呤-鸟嘌呤-磷酸核糖转移酶,但其本身不能在体外长期存活也逐渐死亡。 只有融合的杂交瘤细胞由于从脾细胞获得了次黄嘌呤-鸟嘌呤-磷酸核糖转移酶,并具有骨髓瘤细胞能无限增殖的特性,因此能在HAT培养基中存活和增殖。杂交瘤阳性克隆的筛选与克隆化在HAT培养基中生长的杂交瘤细胞,只有少数是分泌预定特异性单克隆抗体的细胞,因此,必须进行筛选和克隆化。通常采用有限稀释法进行杂交瘤细胞的克隆化培养。采用灵敏、快速、特异的免疫学方法,筛选出能产生所需单克隆抗体的阳性杂交瘤细胞,并进行克隆扩增。经过全面鉴定其所分泌单克隆抗体的免疫球蛋白类型、亚类、特异性、亲和力、识别抗原的表位及其分子量后,及时进行冻存。单克隆抗体的大量制备单克隆抗体的大量制备主要采用动物体内诱生法和体外培养法。(1)体内诱生法 取BALB/c小鼠,首先腹腔注射0.5ml液体石蜡或降植烷进行预处理。1-2周后,腹腔内接种杂交瘤细胞。杂交瘤细胞在小鼠腹腔内增殖,并产生和分泌单克隆抗体。约1-2周,可见小鼠腹部膨大。用注射器抽取腹水,即可获得大量单克隆抗体。(2)体外培养法 将杂交瘤细胞置于培养瓶中进行培养。在培养过程中,杂交瘤细胞产生并分泌单克隆抗体,收集培养上清液,离心去除细胞及其碎片,即可获得所需要的单克隆抗体。但这种方法产生的抗体量有限。各种新型培养技术和装置不断出现,大大提高了抗体的生产量。单克隆抗体制备的意义:用于以下各种生命科学实验并具有医用价值(1)沉淀反应:Precipitation reaction(2)凝集实验:haemaglutination(3)放射免疫学方法检测免疫复合物(4) 流式细胞仪:用于细胞的分型和细胞分离.(5)ELISA 等免疫学检测(6)BIAcore biosensor:检测Ab-Ag或与蛋白的亲和力 .(7)免疫印记(western blotting)(8) 免疫沉淀:(9) 亲和层析:分离蛋白质(10) 磁珠分离细胞(11)临床疾病的诊断和治疗;
  • 复杂单克隆抗体的对比分析
    p 来自Postnova Analytics英国实验室的讯息: /p p    strong Postnova Analytics发布了一份新海报,比较了两种用于测定单克隆抗体物理化学及生物物理学性质的测试方法——电场流及非对称场流分离色谱法(EAF4-Electrical Asymmetrical Flow Field Flow Fractionation)和体积排阻色谱法(SEC-Size Exclusion Chromatography)的适用性。 /strong /p p style=" text-align: center " strong img title=" 复杂单克隆抗体的对比分析.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/insimg/c124cda4-465c-4088-99f8-7208b46db509.jpg" / /strong /p p   据美国国家标准与技术研究院(NIST-U.S. National Institute of Standards and Technology)的工作所述,一种参比单克隆抗体(RM 8671 mAb),被用于比较EAF4-UV-MALS(多重散射聚焦系统Multi Astigmatism Lens System)与SEC-UV-MALS之间分离量化、聚合量化及恢复参数的差异。NIST的这种mAb为治疗用蛋白质表征这一新技术的发展提供了一种代表性的检测分子。 /p p   该海报阐述了EAF4模组如何将抗体及蛋白质分子大小与表面电荷特性(电泳迁移率)的同时测量变为可能。FFF(场流分离色谱Field Flow Fractionation)系统测量显示蛋白质/抗体的聚集只占注入总量的10%,且无聚集体被SEC检测到。研究人员总结到,FFF的开放通道设计会顾及相比SEC更好的注入物的复原,这对于追求量化少量聚集体而言至关重要。 /p p   Postnova Analytics的EAF4技术独创性地将电场流分离色谱和非对称场流分离色谱的原理融合在同一系统中。在EAF2000系统中,电场流和交叉场流被同时应用于FFF通道,通过粒子不同的电泳迁移率,使得按粒子大小与电荷进行色谱分离成为可能。这两种强大分离技术在一个单独平台上的结合,为表征复杂的蛋白质、抗体、病毒,以及环境和带电纳米粒子或高分子打开了大门,而其他技术已证明了这一问题是多么棘手。 /p
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