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【讨论】大家帮忙看看我这个分子量小于10000的混合小肽检测方法有什么问题

前处理综合讨论

  • 这是我们的检测方法,但是我感觉有一些问题,请大家帮忙给分析分析,提提建议。我的检测目的是要知道样品的全部分子量分布情况。

    样品是分子量在10000以下的混合小肽(大豆蛋白酶解物),分子量分布主要集中在2000-300,少量在3000-5000。样品里面有小部分的氨基酸、盐类、总糖等杂质大约占10%的比例吧,还有残留的大分子蛋白,分子量20000左右,比例比较小,1%左右。
    色谱条件:waters515泵,tsk柱子(swxl-gel 2000,7.8*30),紫外检测器,gpc处理软件。
    流动相:乙腈-0.1%三氟乙酸的水(45:55)
    检测波长:220nm
    流速:0.5ml/min
    标样采用12384、6512、1423、451、189五种。混合后进样。

    校正曲线中,12384校正后是17000,6512校正后是3972。其他三种小分子量的标样校正后还算可以1482、514、200左右。

    我的问题如下:
    1 校正曲线中两个大分子标样偏离这么大,应该不行吧,不过当初请大学里的老师来做的方法,曲线就这样,不知是什么原因。这样的曲线是否符合要求?

    2 我的样品并不能全溶于水,也不能全溶于流动相,可是样品的前处理方法就是用流动相溶解后过滤进样。
    但是我的目的是相知道整个样品的分子量分布情况,这种情况下得到的检测结果应该不能满足我的要求是吧?光前面就滤掉了很多东西。

    3 我想优化一下色谱条件,gpc的流动相是不是必须能将样品完全溶解才行?
    其实我的样品先用少量氢氧化钠溶液就可溶解,然后用水或流动相就能配成溶液。
    4 现在用的是紫外检测器,应该是考虑到利用肽键的220nm紫外吸收。我们有配示差检测器,不知道为什么不用示差。
    这种分子量集中在2000和300之间的混合小肽样品可不可以用多角度光散射检测器来做做?
    5 我是这样计算的:5000以上,5000-3000,3000-1000,1000-300,300以下。计算各个切片的百分比例。

    但是实际上,我用现在的方法作样,同一个样品,不同浓度进样时,得到的各部分切片的分子量分布比例区别比较大。按道理不应该这样啊。

    还请各位多多指点迷津。这是我今年的重头任务,头都大了。
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  • tianru的爸爸

    第1楼2007/10/09

    你的实验过程写的很详细,这样好分析。

    如果你的样品在现有的流动相中不能全溶,可以试试降低乙腈的含量。(不太明白为什么要用乙腈,蛋白类物质应该可以用盐溶液直接溶解的。)

    你的目标小肽的分子量在“主要集中在2000-300,少量在3000-5000”范围内,那你不应该选用G3000SWXL柱,该柱子的分离范围(球型分子)是1万到50万,大了,所以标准曲线有问题是正常的。
    选用G2000SWXL能好些,它的分离范围是:5000到1.5万。
    能分析分子量到几百的凝胶一般选用:SephadexG-15或G-10等。

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  • tianru的爸爸

    第2楼2007/10/09

    这个时候最好用示差检测器;
    对于分子量如此小,我没有使用过多角度光散射检测器,不知道能否用。

    we-july 发表:4 现在用的是紫外检测器,应该是考虑到利用肽键的220nm紫外吸收。我们有配示差检测器,不知道为什么不用示差。
    这种分子量集中在2000和300之间的混合小肽样品可不可以用多角度光散射检测器来做做?

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  • tianru的爸爸

    第3楼2007/10/09

    说明你的实验条件不合适:稳定性太差;解决方法——调整实验条件直至实验稳定。

    we-july 发表:5 我是这样计算的:5000以上,5000-3000,3000-1000,1000-300,300以下。计算各个切片的百分比例。

    但是实际上,我用现在的方法作样,同一个样品,不同浓度进样时,得到的各部分切片的分子量分布比例区别比较大。按道理不应该这样啊。

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  • we-july

    第4楼2007/10/09

    谢谢楼上各位的回复。

    我的柱子写错了。不是3000,是2000。我已经更正了。

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  • we-july

    第5楼2007/10/09

    我也觉得乙腈的比例太大。当初参考的方法流动相是乙腈-水(0.1%三氟乙酸)=10:90的,不过用这种流动相条件进样,5个混合标准品根本就分不开。所以来给作方法的老师就给调整成了45:55了。

    我以前没作过蛋白的液相,不过样品处理时就觉得不对劲:加上流动相后明显看出样品不能溶解性比较差,根本就没有考虑过滤时不溶部分的损失。
    不过因为不熟悉凝胶柱,没敢随便调整流动相组成。

    lxdongzi2003 发表:你的实验过程写的很详细,这样好分析。

    如果你的样品在现有的流动相中不能全溶,可以试试降低乙腈的含量。(不太明白为什么要用乙腈,蛋白类物质应该可以用盐溶液直接溶解的。)

    你的目标小肽的分子量在“主要集中在2000-300,少量在3000-5000”范围内,那你不应该选用G3000SWXL柱,该柱子的分离范围(球型分子)是1万到50万,大了,所以标准曲线有问题是正常的。
    选用G2000SWXL能好些,它的分离范围是:5000到1.5万。
    能分析分子量到几百的凝胶一般选用:SephadexG-15或G-10等。

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  • tianru的爸爸

    第6楼2007/10/09

    TSK-GEL SW型填料性能和分离范围


    这里的流动相一般为盐溶液。

    所以要分离你的五个标样,TSK-GEL系列的柱子在用水溶液(盐溶液)作流动相是不能分开的。而调整为有机溶液做流动相是可以分开的,但可能不完全再以分子筛的原理来分离的。——所以你的标准曲线有两个点相差较多。

    最好换柱子。

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  • we-july

    第7楼2007/10/09

    参考许多资料,好像作反相C18柱作蛋白含量的流动相大多采用乙腈-水(0.1%三氟乙酸)=10:90的,估计当初开发方法时就参考的这类材料。

    我的样品水溶性并不很好,但是在碱液中易溶,所以我也考虑用缓冲盐来试试。但是不知道tsk的这种凝胶柱用什么样的缓冲盐效果比较好?


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  • we-july

    第8楼2007/10/09

    谢谢。
    可是我看了一些凝胶柱,根据我的样品综合考虑,好像就现在这种柱子算是最适合了。
    能不能推荐一下。。。。

    lxdongzi2003 发表:TSK-GEL SW型填料性能和分离范围


    这里的流动相一般为盐溶液。

    所以要分离你的五个标样,TSK-GEL系列的柱子在用水溶液(盐溶液)作流动相是不能分开的。而调整为有机溶液做流动相是可以分开的,但可能不完全再以分子筛的原理来分离的。——所以你的标准曲线有两个点相差较多。

    最好换柱子。

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  • viscotektegent

    第9楼2007/10/09

    搂主可能对液相色谱比较熟,其实一般蛋白质就用水加少量盐即可作溶剂/流动相,如果样品溶解不好,可以考虑换一种盐以便解蒂和(aggregation),蛋白质样品往往蒂和较多。或者适当升温,甚至50--60摄氏度,也可得到较好的谱图。在GPC中,升温往往被忽略,特别是水相的应用。不过最好还是先确定方法,或查文献找方法。否则自己摸索方法很费劲。
    如果样品溶解不好,那么做GPC就没有太大意义了。
    带光散射检测器,需要示差折光仪以便测定dn/dc值以计算分子量,尤其是多角外推法,否则查找dn/dc值也很麻烦。waters的示差折光检测器也不能测dn/dc值。
    现在测到的分子量虽然小,但是不一定是绝对分子量!因为样品可能有支化。所以可能用光散射测到的绝对分子量很大呢。
    另外,色谱柱也是方法的一部分,一般GPC柱分为水相和有机相的两大类,水相柱也分为一般水相、阳离子型、阴离子型等几种。如果像HPLC那样用乙腈和水混合溶液做流动相,那么可能会对水相柱的寿命和效果有影响,所以最好是要么用有机溶剂/流动相,要么就用水和无机盐做溶剂/流动相。

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  • zhz1285

    第10楼2007/10/23

    楼主,看了你的详细的条件及你的实验过程,感觉你介绍的很详细!
    个人认为你们的方法不合适! 首先用紫外吸收测定分子量本身就不合适,因为紫外吸收有很多方面的限制,吸收的强弱不一定和你的分子量成比例!(即使你的肽链是直链).而折光系数是稳定的,所以GPC原理是说的用示差做检测器,但从没讲过用紫外来做检测器测分子量.
    再就是部分溶解的样品做分子量测定得到的数据没有意义,因为有可能有些分子量较大的部分没有溶解,建议楼主换成盐溶液做流动相,用流动相溶解样品,如样品暂时不溶解,可放置过夜看看!

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