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生命之贵在于勤学-记录从事NIR建模工作

近红外光谱(NIR)

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    生命之贵在于勤学-记录从事NIR建模工作

    我这个人开始正题之前总是爱说些废话。

    这个生命之贵,在于勤学的题目既是对自己的勉励又是本文的引子。实际要讲给大家听的是我在中国农业科学院作物科学研究所重大工程楼开放实验室实习的全过程,实习和之后正式工作的内容都是NIR的数学建模和应用的研究。

    我实习是从08年10月15号开始的,一直到今天。我原本是学习制药工程专业的,北京化工大学工学学士学位,实习时刚上大四。学业内专业实验不多,除去分光光度计我从来没有接触过其它光谱分析仪器和技术。对于近红外我算是纯纯的初来乍到。真正的建模工作是从我拜读完严衍录教授的《近红外光谱分析基础与应用》一书后开始的,还专门在领导和众多师姐面前以PPT的形式“汇报”了学习成果。96页的演示文稿,回想当时真是太傻太可笑了,一本书刚刚读完就敢给众多的硕士和博士上课,简直是有些自不量力,知道不知道的都敢说,连“LED光源是不好的旧技术”都出来了。最后领导的评价是肯定的“你口才好,什么都敢说”。

    现在才知道读大书的精辟是要读出来而不是读进去,600页要先看成6000页再看成60页最后看成6页。动不动就粘贴90几页的PPT跑去汇报是有些“愣头青”,到时候领导一问问题就只能照着屏幕读上面的内容,一点真东西都没有。嘻嘻,不说以前的自己了!

    09年的6月底终于拿到两证,这回可是个纯纯的社会人了(有点后悔没去考研)。到今天再去回忆一下实习的全过程有一点困难,不过为了应上题目只能在电脑前绞尽脑汁了。我这个人用导员的话说就是“拥有充沛的感情”。所以现在最怕的就是回忆,目前为止我还不敢去回忆毕业的那一幕幕,7月1回来再上班的时候都是心虑憔悴,回校一周几乎每天都是大口的喝酒大声的痛哭然后就找厕所去吐。我绝无法找到别的方式来祭奠我即将逝去的大学生活了。跟朋友拥抱都是紧紧的生怕这么一毕业就再也见不着了。我记得回来后改QQ的个性签名“很多事情已经没有勇气再去回忆,泪水依旧难以冲洗掉心头的忧伤。对于一些朋友,从此人海世事两茫茫”。遇见QQ上的学妹聊了一些关于珍惜大学时光和毕业离校的话,当时就再也忍不住伤感躲到档案室的角落里独自掉泪去了。“请你珍惜大学这个美丽而又短暂的时光。等你毕业你就会发现,23岁以后的青春是光速的,生活和社会的压力会使你每天以惊人的速度变老。再没有纯纯的友情、再没有纯纯的青春、再也没有你可以肆无忌惮生活和学习的地方让你如此留恋”。谈到感情我告诉她大学期间一定要去恋爱,并给她讲了个酸楚的故事“我有个同年级不同专业的女性朋友,她爱玩学习也好每天都活得快快乐乐。毕业之际我们聚了一次,5男2女。酒醉之时彼此相视而泣,泪水就像决堤的堰塞湖一涌而出。她更是哭的泪人一般,之后她紧紧的拥抱我们每一个人告诉大家青春已逝梦已不再,最最后悔的是大学里没有谈一场真真正正的恋爱,青春之际彼此之间最真挚的时间里感情却是个空白。酒罢回校的路上她把满脸的热泪灌进了我的衣领”。哎!~~闲话太多了,还是书规正撰、言续正说吧。(*^__^*) 嘻嘻……先去抹泪。


    (持续未完)
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  • 睦惜

    第1楼2009/07/22

    2008年10月5号左右在校准备论文的时候就听说会有6个名额到农科院去实习,内容为核酸测序等,捎带手解决掉毕业论文实验拥堵的问题。我当时基本就已经打定主意到院长那里去请缨了。10月10号正式开始推荐的时候仗义的院长竟然在我没有积极报名的情况下推荐了我,这使我大感意外。最后书记主动打电话到我手机上询问我的意向和告知农科院方面对实习的待遇及学校对到农科院实习学生的论文安排等事宜,业已确定名额。连我5个人,农科院因为宿舍床位不够砍掉了一名。5人当中连我有3位校学生干部、1位干部“家属”、一位专业总成绩探花。时间无多则即刻打点行装准备上路。

    10月15号当天中午,校车早早的就发动了等着我们上路。我几乎把宿舍里属于我的可以移动的所有东西搬上了开往化大本部的班车。一路上班车狂奔不止除了运煤的“大十轮儿”没有它不敢超的。到化大的时候将近下午1点。指导老师简短节说后独自扬长而去。

    我们打车自农科院东门而入止于重大楼门口的大树旁。安排宿舍、见领导、分岗位、参观重大楼实习第一天就这样在下午3点前结束了。各人即成鸟兽状散去。

    实习刚开始的时候我分配的工作就是NIR(还有探花也是),开放实验室有一台比较久远的近红外仪器,是德国的布鲁克道尔顿公司出产的MPA型傅立叶近红外光谱分析仪。农科院的对应专业是分子生物学、生物学及生物化学。我是学习制药工程的课业内所学习的内容几乎没有与其相关的。近红外又隶属于光谱分析化学一类,我实在显得太像个门外汉了。10月份剩下的时间里我就是每天面对着这个机器度日的,没有相关资料,说明书和OPUS软件版本都是英文的,看到那些英文字母在我的眼皮底下排排站的时候我头脑里就只有一个字,那就是“吐”。先开始的前5天里就是闲着,领导(味精)从窗外经过的时候还会来鼓励一下。作物种子的近红外模型建立是味精的一个小愿望,“这个工作如果成功不会给实验室带来任何的盈利,相反实验室还会为此搭进去很多的时间和金钱。但是如果我们具备了成功的经验再把它编辑成文章推广到整个农口系统那将是一件非常有意义的事情”。显然最开始的认识还是很肤浅的,我们不了解NIR的真正意义,也不知道它的发展远比我们想象的要迅速和完善。


    (持续未完)

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  • 闲鹤野云

    第2楼2009/07/22

    仔细看了前言和第一章节,期待继续呢。每篇给你加分。
    “09年的6月底终于拿到两证”:结婚证,工作证,学位证,毕业证

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  • 睦惜

    第3楼2009/07/23

    (*^__^*) 嘻嘻……是毕业证和学位证书。这东西一到手就再也没有学校的保护了。纯纯的社会人。

    ruojun 发表:仔细看了前言和第一章节,期待继续呢。每篇给你加分。
    “09年的6月底终于拿到两证”:结婚证,工作证,学位证,毕业证

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  • 睦惜

    第4楼2009/07/23

    以后的数天中一种莫名的精神上的强大动力驱使着我开始给OPUS软件系统编写翻译手册,只要是目之所见能力所及的地方我都付出了相应的努力。无奈对NIR的了解少之又少,编写翻译手册的工作遇到了很大的阻力,那时就发现牛津字典和百度谷歌的确不是万能的。面对众多的英文缩写我只能表现的束手无策。开放实验室的工作是很繁复很忙碌的味精根本无暇顾及我们在NIR上是不是有前进,也许任何事情都是需要时间慢慢安排的吧。在08年的10月底我们终于迎来了一个工作的高峰期。味精为我们联系了国家种质库的当年玉米种子。2183份不同的玉米种子足够我们忙上3个月甚至更久的。于是实习的每一天都开始充实起来了。

    11月的一天NIR的服务站挂掉了,非常彻底,就连电脑开机都实现不了了。于是师姐只好给这台年久失修的服务站刷了系统。当然OPUS软件也请布鲁克的工程师重新安装了。这位来提供指导的工程师正是在严衍录教授书中提到的赵丽丽女士。渊博并且为人和善的她不但给服务站安装了崭新的OPUS 5.0中文操作系统还当场排解了我们在建模方面的一些困惑并给予了非常细致的软件运用指导。仅隔2天又给我们拷贝了一些NIR方面的资料,严衍录教授所著的《近红外光谱分析基础与应用》一书即是其中一册。得到资料如获至宝,但简单而又繁重的玉米种子光谱采集工作终究还是让我放弃了对这些资料的深入研究。以后的好长一阵时间里我都是伴随着这些玉米种子度过的。

    北京的冬天是一个很奇特的季节,干燥、阴冷、降水少的可怜。虽然实验室是通暖气的也可以开放空调但是屋内的气温仍然低的要命。100多平米的实验室常驻人口只有3位,每天开机的设备不超过4台。紧邻MPA的设备是一台放在通风橱里的“高龄”蛋白质测序仪,岛津品牌。除了往排气道里鼓风另外还得打开3面窗子,不然会死人的。并且倒霉就倒霉在光谱采集工作它太过简单了总是重复那些简单的操作就连暖身子的机会都没有,手指会冻得僵直,脚会冻麻,长时间在这样的环境里还会打哆嗦。一般的情况下我们都是把白大褂套在羽绒服的外面,空闲或者休息的时间就去人多的实验室串串门子。刮风的几天最痛苦。国家种质中心比较靠近农科院的西门,也就是面对理工大学的正门一侧。而作物所的重大工程楼比较靠近农科院的东门。我们每天早上8点半会拉着小车去种质中心提样本玉米,拉回重大楼进行光谱采集。下午5点半之前再拉回去点清数目入库,这些玉米在我们工作完成后将进行选拔,优质的会被送抵世界各地进行国家之间的农业技术交流,所以是不能留在中心之外保存的。刮风的天气里,前进的每一步都是艰辛的,每天200多份的玉米放在车上对一个一般的青壮年男人已经足以构成拖累了。可想而知一个冬天的傍晚当我面对一车的玉米时心中难免会升起一种懒惰或者抵触的情绪,但是工作就是工作,不能有任何的挑剔。完成它才是这一天结束的唯一标志。于是就这样的日日重复着。


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  • 睦惜

    第5楼2009/07/23

    哇!!我才发现,斑竹给我置顶了!!太谢谢了。
    不过也要在这里说明一下,由于现在也接触高效液相了工作比较忙,下班和周末都不能上网。所以没有固定的时间写作,不能每天一贴。不过我会尽快发新帖的。希望同行们支持和理解,万谢万谢。也请大家踊跃回复,多交流。

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  • 闲鹤野云

    第6楼2009/07/23

    你给你们领导起外号叫味精,为什么,这人喜欢吃味精还是有品位.近红外的光谱采集是比较单调,但要注意一致性,空间的温度\适度\样品的粉碎粒度.你们是整粒无损扫描的吧?

    capezx 发表:哇!!我才发现,斑竹给我置顶了!!太谢谢了。
    不过也要在这里说明一下,由于现在也接触高效液相了工作比较忙,下班和周末都不能上网。所以没有固定的时间写作,不能每天一贴。不过我会尽快发新帖的。希望同行们支持和理解,万谢万谢。也请大家踊跃回复,多交流。

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  • 睦惜

    第7楼2009/07/23

    我可不敢给领导起外号,是她自己这么叫的,新浪博客里的昵称。(*^__^*) 嘻嘻……对的我做无损大杯籽粒的扫描,现在看来是白扫了,下一阶段工作开展起来很难,我只能每天学文献丰富自己。后面的跟帖会慢慢讲的,这个建模的工作是路漫漫其修远兮~~~~

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  • doctor

    第8楼2009/07/23

    应助达人

    建模的工作确实有些枯燥,乏味,不是说近红外是一种“一劳永逸”的检测技术么,呵呵,本人从事近红外技术工作多年了,对此深有同感!
    光谱技术是一种需要细心的工作,开始繁重的工作前,一定要考虑全面,否则可能要做无用功

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  • 睦惜

    第9楼2009/07/23

    博士说的很对,我们先开始就犯过这样的错误。不过后来纠正了也晚了,玉米坐飞机去外国了。呜呜呜呜~~眼下还是尽量丰富自己吧。

    xiaovv 发表:建模的工作确实有些枯燥,乏味,不是说近红外是一种“一劳永逸”的检测技术么,呵呵,本人从事近红外技术工作多年了,对此深有同感!
    光谱技术是一种需要细心的工作,开始繁重的工作前,一定要考虑全面,否则可能要做无用功

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  • 闲鹤野云

    第10楼2009/07/23

    扫描的样品一定要提前计划好,注意保存,注意标记,把检测的其他指标记录好。不然扫了很多,条件不一致,模型的偏差会很大的。Xiaovv专家讲的很好,一定要计划和细心。劳动一次,今后就不麻烦了。但这第一次劳动很没乐趣的。

    capezx 发表:我可不敢给领导起外号,是她自己这么叫的,新浪博客里的昵称。(*^__^*) 嘻嘻……对的我做无损大杯籽粒的扫描,现在看来是白扫了,下一阶段工作开展起来很难,我只能每天学文献丰富自己。后面的跟帖会慢慢讲的,这个建模的工作是路漫漫其修远兮~~~~

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