PETtrace和MINtrace加速器的真空系统不受加速器控制单元(Accelerator Control Unit ACU)控制,由独立的真空控制单元(Vacuum Control Unit VCU)来控制,独立的VCU保证了真空系统的安全和自动操作。真空系统24小时运行。在真空箱中连接了2个真空计,Pirani Gauge控制1bar~10-3mbar(0.1Pa~10-5Pa)的压力范围,Penning Gauge 控制<10-3mbar(0.1Pa)的高真空范围。高真空泵是带有阻尼栅板的油扩散泵,在油扩散泵和前级真空泵之间连接一个Pirani Gauge,用来监测油扩散泵的前级真空压力(Backing pressure)。