【原创】用TOPAS分析黄老师"730.raw"的结晶度~应要求上传了一个小教程~

如果再配一个解说就更好了。

应助达人

无语了...论坛附件上传有问题啊...上传pdf到100%了就没有反应了....

我还是整个猪八戒网盘下载吧....
http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=110432280ypykx98jumnssa4

请斑竹帮忙传成附件吧~~貌似猪八戒只有7天有效期~~

我不是版主，但愿我可以成功上传附件。

结尾时间落款是2001年4月25日，推测属于笔误吧？

不错的原创。引两块砖供探讨：
1、背景抑或非晶？光凭结晶度未知的单个样品是不能说明什么的，更不能当作定量。
2、pdf中声称topas可以对各个峰进行不同的峰型描述，有没有可能增加人为随意性风险？
3、pdf中声称topas关于峰型形成的算法特色在于卷积(其他软件一般是简单相加)，根据我对卷积的数学物理图像的浅薄理解，在特征峰不重叠或特征区间内某个函数为恒值时，卷积除了引入算法的复杂度外并不能带来有益产出。不知楼主有没有阅读过关于此点的优势论证的文献？Anyway，如果同时提供多种选项，这是最理想的软件

应助达人

.....真的是笔误......是2011年4月25日.....谢谢指出~~

应助达人

---------------这是计算结晶度的例子, 不是QXRD定量的例子. TOPAS根据各相的cif结构采用Rietveld方法来定量. 如果有机会我会以后给出例子. 黄老师的这个谱730.raw这个谱包含非晶相,也包含晶相, 通常非晶馒头粉和背景是很难区分开的, 这个例子展示如何用软件拟合背景, 减少人为扣除背景的不确定度.


---------------任何软件都是根据用户的指令工作的, TOPAS根据用户的选择计算出的结果是唯一的, 这里面不存在"随意性". 你谈到的"随意性"在于使用者本身. TOPAS允许用户有更多的选择, 对于有经验的用户来说是好事. 对于初上手的用户,则需要他们认真阅读软件手册了.

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3、pdf中声称topas关于峰型形成的算法特色在于卷积(其他软件一般是简单相加)，根据我对卷积的数学物理图像的浅薄理解，在特征峰不重叠或特征区间内某个函数为恒值时，卷积除了引入算法的复杂度外并不能带来有益产出。不知楼主有没有阅读过关于此点的优势论证的文献？Anyway，如果同时提供多种选项，这是最理想的软件[/div]
---------------拿仪器峰宽的标定来说, Jade的处理仅仅是标定半高宽函数. 这只是一个很粗浅的标定, 并没有完全运用整个峰形的信息. 那么在实测的峰形中怎样区分哪部分是仪器峰形,哪部分是光源峰形, 哪部分才是样品峰形呢? 只有用卷积和去卷积才能做到. 据我所知新一代的Rietveld软件TOPAS, BGMN, MAUD都开始使用卷积计算峰形了.
请大陆老师指明"优势论证文献"的作者 期刊 期 卷 页码, 我一定会去拜读.

关于软件的算法部分, TOPAS作者Alan Coelho和Arnt Kern在近10年内发表了不少新算法.
Coelho, A.A. (2003): Indexing of powder diffraction patterns by iterative use of singular value decomposition. - J. Appl. Cryst, 36, 86–95.
Coelho, A. A. (2005): A bound constrained conjugate gradient solution method as applied to crystallographic refinement problems. - J. Appl. Cryst., 38, 455-461.
Coelho, A. A. (2007): A Charge Flipping algorithm incorporating the tangent formula for solving difficult structures. - Acta Cryst., A36, 400–406.
Coelho, A. A. & Cheary, R. W. (1997): A fast and simple method for calculating electrostatic potentials. - Computer Physics Communications, 104, 15-22
Coelho, A.A. (2000): Whole Profile Structure Solution from Powder Diffraction Data using Simulated Annealing. - J. Appl. Cryst., 33, 899-908.
Coelho, A.A. & Kern, A. (2005): Discussion of the indexing algorithms within TOPAS. - CPD Newsletter, 32, 43-45.

应助达人

谢谢大陆老师帮我传成附件...我上传的附件卡在100%就不动弹了~~

我是来观摩学习的，可不可以请楼主介绍一下emission profile选项中几个Cu靶光源信息文件各代表是什么意思？自学的孩纸各种悲催啊...