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核酸、蛋白技术参数资料、分子量标准

  • 省部重点实验室
    2012/06/29
  • 私聊

生命科学仪器综合讨论

  • 核酸及蛋白质常用数据

    1.核苷三磷酸的物理常数



    化合物

    分子量

    λmax(pH7.0)

    1摩尔溶液(pH7.0)中λmax时的最大吸收值

    OD280/OD260

    ATP

    507

    259

    15400

    0.15

    CTP

    483

    271

    9000

    0.97

    GTP

    523

    253

    13700

    0.66

    UTP

    484

    262

    10000

    0.38

    dATP

    494

    259

    15200

    0.15

    dCTP

    467

    271

    9300

    0.98

    dGTP

    507

    253

    13700

    0.66

    dTTP

    482

    267

    9600

    0.71



    2.常用核酸的长度与分子量



    核酸

    核苷酸数

    分子量

    λDNA

    48502(双链环状)

    3.0×107

    pBR322

    4363(双链)

    2.8×106

    28SrRNA

    4800

    1.6×106

    23SrRNA

    3700

    1.2×106

    18SrRNA

    1900

    6.1×105

    19SrRNA

    1700

    5.5×105

    5SrRNA

    120

    3.6×104

    tRNA(大肠杆菌)

    75

    2.5×104



    3.常用核酸蛋白换算数据



      (1)重量换算

      1μg=10-6g      1pg=10-12g

      1ng=10-9g      1fg=10-15g

      (2)分光光度换算:

      1A260双链DNA=50μg/ml

      1A260单链DNA=30μg/ml

      1A260单链RNA=40μg/ml

      (3)DNA摩尔换算:

      1μg 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol末端

      1μg pBR322 DNA=0.36pmol

      1pmol 1000bp DNA=0.66μg

      1pmol pBR322=2.8μg

      1kb双链DNA(钠盐)=6.6×105道尔顿

      1kb单链DNA(钠盐)=3.3×105道尔顿

      1kb单链RNA(钠盐)=3.4×105道尔顿

      (4)蛋白摩尔换算:

      100pmol分子量100,000蛋白质=10μg

      100pmol分子量50,000蛋白质=5μg

      100pmol分子量10,000蛋白质=1μg

      氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿

      (5)蛋白质/DNA换算:

      1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.7×104MW蛋白质

      10,000MW蛋白质=270bp DNA

      30,000MW蛋白质=810bp DNA

      50,000MW蛋白质=1.35kb

      100,000MW蛋白质=2.7kb DNA
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    第1楼2012/06/29

    4.常用蛋白质分子量标准参照物



    (1)高分子量标准参照(2)中分子量标准参照(3)低分子量标准参照
    肌球蛋白分子量磷酸化酶B97,400碳酸酐酶31,00
    肌球蛋白212,000牛血清白蛋白66,200大豆脻蛋白酶21,500
    β-半乳糖甘酶B116,000谷氨酶脱氢酶55,000抑制剂
    磷酸化酶B97,400卵白蛋白42,700马心肌球蛋白16,900
    牛血清白蛋白66,200醛缩酶40,000溶菌酶14,400
    过氧化氢酶`57,000碳酸酐酶31,000肌球蛋白(F1)8,100
    醛缩酶40,000大豆脻蛋白酶21,500肌球蛋白(F2)6,200
    抑制剂 肌球蛋白(F3)2,500
    溶菌酶14,400


    5.常用DNA分子量标准参照物



    λDNA/HindⅢ

    λDNA/EcoRⅠ

    λ/HindⅢ+EcoRⅠ

    pBR322/HaeⅢ

    23130

    21226

    21227

    587

    123

    9416

    7421

    5148

    405

    104

    6557

    5804

    4973

    504

    89

    4361

    5643

    4268

    458

    80

    2322

    4843

    3530

    434

    64

    2027

    3530

    2027

    267

    57

    564

    1904

    234

    51

    125

    1584

    213

    21

    1375

    192

    18

    974

    184

    11

    831

    124

    7

    564

    125



    常用抗生素溶液


    抗生素

    贮存液a

    工作浓度

    浓度

    保存条件

    严紧型质粒

    松弛型质粒

    氨苄青霉素50mg/ml(溶于水)

    -20℃

    20μg/ml

    60μg/ml

    羧苄青霉素50mg/ml(溶于水)

    -20℃

    20μg/ml

    60μg/ml

    氯霉素34mg/ml(溶于乙醇)

    -20℃

    25μg/ml

    170μg/ml

    卡那霉素10mg/ml(溶于水)

    -20℃

    10μg/ml

    50μg/ml

    链霉素10mg/ml(溶于水)

    -20℃

    10μg/ml

    50μg/ml

    四环素b5mg/ml(溶于乙醇)

    -20℃

    10μg/ml

    50μg/ml



      a:以水为溶剂的抗生素贮存液通过0.22μm滤器过滤除菌。以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存。

      b:镁离子是四环素的拮抗剂,四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基(如LB培养基)。

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