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请各位老师帮我看看多肽质谱出现这样的情况是什么原因

液质联用(LCMS)

  • 我有一个多肽样品,分子量为1153.67,在7.5min分钟出峰,液相紫外图如下:

    质谱图如下:



    这组质谱峰判断为[M+2H]2+,与我们化合物的精确分子量和同位素丰度都匹配


    看到这组峰我就有点迷茫了,这组峰带3个电荷,难道是[2M+3H]3+?如果是这个情况的话,精确分子量和同位素丰度也是匹配的。

    看到这组我就看不懂了,既不像是[M+H]+,也不像是[2M+4H]+,中间丰度较低的1732.01,1733.01,1734.01等看不出是怎么形成的,如果是噪音的话好像也没道理这么大。

    各位老师专家有明白的请教我一下!非常感谢!
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  • netsking

    第1楼2012/07/04

    会不会是另有杂质啊?感觉象是有一丰度比较低的多肽化合物.

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  • 阿怪

    第2楼2012/07/04

    谢谢netsking老师,我也怀疑过有类似加氢的杂质,但是1.如果把小峰当成是杂质,那么剩下丰度高的一组峰同位素丰度比仍然是不对的,2.如果有这类杂质,866这个地方仍然应该看得出来这个杂质

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  • zdqzxy

    第3楼2012/07/05

    能不能给个仪器参数设置,流动相信息,色谱柱信息,学习下

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  • 阿怪

    第4楼2012/07/05

    哪位老师能解答一下啊

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  • phillyrin

    第5楼2012/07/05

    感觉就应该是杂质来的,另外能不能放数据文件出来看看。这么看比较费劲……

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  • maldiguy

    第6楼2012/09/06

    质谱图很好解释,但液相就不好说了
    867为2加,1733则是1价
    1155是3价,1733是2价
    这样,我们看到的1733是由两种不同成分构成的

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  • yzulcl

    第7楼2012/09/08

    应助达人



    这张图里面的1731.51,毫无疑问是已知多肽的 [M+H]+ 单同位素峰,多肽的单同位素分子量 1730.51,这样 [M+2H]2+ 就是 866.26,[2M+3H]3+ 就是 1154.67。都能对应。

    楼主的疑问就在这张图里面的 1732.01、1733.02、1734.01 等峰,要一眼看清楚不容易。
    我们先假设这是另一个物质的 [M‘+H]+ 峰,那么分子量就是 1731.01,比已知的 1730.51 多 0.5,会是什么呢?不好办。
    再假设是某物质的 [M‘+2H]2+ 峰,同位素峰之间间隔 0.5,正好有一半的同位素峰与已知物的峰重叠了,这样,这个某物质的 [M‘+2H]2+ 的单同位素峰就有可能是 1731.51 或者 1732.01 两个可能。于是,这个某物质的 M’ 的分子量就可能是 3461.02 或者 3462.02。我们算算:已知多肽的 2M 是多少? 1730.51*2 = 3461.02。找到了!
    于是,我们可以确认:这张图里面看似多出来的 1732.01 等峰,其实是已知多肽的 [2M+2H]2+ 峰,同位素峰间隔 0.5,只不过有一半的峰正好与 [M+H]+ 峰位置一样,被覆盖了。

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  • yzulcl

    第8楼2012/09/08

    应助达人

    其实,这张图上,还可以看到 [3M+3H]3+ 的峰,只不过信号特别小罢了。

    另外,赞一下楼主的多肽样品,纯度挺高。再赞一下高分辨液质联用的方法,液相分离得好,质谱图也好。

    不知楼主能否透露一下,在哪里做的LCMS实验吗?

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  • 阿怪

    第9楼2012/09/09

    谢谢参与讨论,液质是我自己做的。

    yzulcl(yzulcl) 发表:其实,这张图上,还可以看到 [3M+3H]3+ 的峰,只不过信号特别小罢了。

    另外,赞一下楼主的多肽样品,纯度挺高。再赞一下高分辨液质联用的方法,液相分离得好,质谱图也好。

    不知楼主能否透露一下,在哪里做的LCMS实验吗?

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  • yjihicvtkd

    第10楼2012/09/13

    老师们,我现在也在做一个多肽的纯化,先是样品液过液相色谱柱,收集的峰拿去打质谱
    但是对于图如何解析却无从下手!!
    我的目标多肽是472 6分子量,43个氨基酸,其中8个半胱氨酸,
    这是其中收集的一个峰打出的质谱图,大家帮看看怎么解谱呢???怎么判断是不是我要的多肽呢?

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