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iTRAQ样品检测结果包括哪几个方面？

xx-niu

2013/03/31

我想问一下ITRAQ方面的问题。请大牛们多多指教！

就是如果我在服务机构做8标ITRAQ样品的话，我能要到原始的DATA和各标记对应的蛋白么（比如114 发现多少蛋白，蛋白名称是什么？；115发现多少蛋白蛋白名称是什么？）能给我后期的信号通路的生物信息学分析么？

还有我还能得到什么数据？

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小猪飞飞

第1楼2013/03/31

这个版面大多是搞小分子，帮你转到生物质谱看看

0

xx-niu

第2楼2013/04/01

谢谢啊

0

liufeilzu

第3楼2013/04/13

软件中会提供相对定量数据，这个数据根据报告质量端（你说的114,115）强度比值，原始数据经过处理后，每个条目下有发现的蛋白质名称，我不知道你用的质谱公司软件有没有生物信息学功能，但是你可以把蛋白质名称文件倒出来利用一些平台进行计算，做GO，结果的解释啊，你想获取是蛋白功能啊，分布啊，相互作用的分析啊看你的目的和生物学功底了
xx-niu(xx-niu) 发表:我想问一下ITRAQ方面的问题。请大牛们多多指教！

就是如果我在服务机构做8标ITRAQ样品的话，我能要到原始的DATA和各标记对应的蛋白么（比如114 发现多少蛋白，蛋白名称是什么？；115发现多少蛋白蛋白名称是什么？）能给我后期的信号通路的生物信息学分析么？

还有我还能得到什么数据？

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maldiguy

第4楼2013/04/14

做iTRAQ标记，关注的是差异表达的蛋白。如果你想做全蛋白表达谱，干嘛还要花这个钱呢
做质谱分析前，会将不同标记的样品混合，然后对混合样品进行分析。所以要单独看某个试剂标记上的蛋白种类比较麻烦。或许具有可做性，但我还真没这样想

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