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纳米孔测序仪开放试用公布部分参数

省部重点实验室

2013/11/28

生命科学仪器综合讨论

MinION试用计划于本周一（11月25日）启动，将延续到2014年初，具体截止日期未定。根据这项试用计划，参与者须支付1,000美元的押金以及运费，而后将收到一台MinION测序仪，包括测序USB装置、流动槽和软件。

在上个月的美国人类遗传学协会年会上，英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布将启动MinION测序仪的试用计划。这次，它果然没有食言。MinION试用计划于本周一（11月25日）启动，将延续到2014年初，具体截止日期未定。

根据这项试用计划，参与者须支付1,000美元的押金以及运费，而后将收到一台MinION测序仪，包括测序USB装置、流动槽和软件。

除了MinION测序仪，Oxford Nanopore还在开发GridION测序仪。之前，该公司一直没有公布这两款测序仪的具体性能参数，但鉴于许多客户有意了解，它最近在网站上回答了一些常见问题。

GridION和MinION系统的通量如何？

据介绍，GridION系统是可以扩展的。它既可以单独作为一台仪器工作，又可以多台连接，带来更快的结果。至于仪器的通量，它会受到各种因素的影响，包括DNA的处理速度以及芯片上同时开展的实验数量。第一代商业化的仪器每天可产生几十Gb。目前的cartridge每次可开展2000个纳米孔实验，而更高配置（每次开展8000个实验）正在开发中。

MinION系统是个一次性的设备，每次可开展数百个纳米孔实验，运行时间为数小时。

运行时间如何？

Oxford Nanopore表示没有固定的运行时间，这要取决于实验需求。由于全长的读取数据是实时流出的，故也能实时分析。初步分析可在每台仪器（节点）上本地开展，而二次分析可在用户的网络上并行开展。因此，MinION和GridION节点可持续运行，直到收集了足够的数据来回答实验问题。

系统的读长是多少？

据介绍，纳米孔测序仪是处理提交给它的DNA，而不是“产生”读长。它能够处理非常长的读长，大约几十kb。

GridION和MinION系统的费用如何？

相信这也是大家最关心的问题。Oxford Nanopore表示，GridION技术的定价不同于传统的系统。它是一个套餐，包括节点和cartridge耗材。这些套餐可满足不同需求及不同预算的客户。例如，有些客户可能有比较多的经费，而另一些则在耗材花费上更为自由；定价将让这两种类型的客户都能使用。

此外，GridION系统的定价将比目前市场上的其他系统都要低。此系统是模块化的，用户可不断添加。无需服务器，因为每个节点都包含了所需的计算硬件。而且，定价透明，可在线下单。大的套餐也会有透明的折扣。

对于MinION系统，零售价预计在900美元以下。不过，目前还未开始接受订单。

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