毛细管电泳仪可以检测钯原液中的次亚磷酸钠吗?

原则上是可以的，就看你怎么选择方法了

请问什么方法可以检测？目前我们没有可以参考的方法，请指点，十分感谢！

没做过，不过，一般只说检测什么离子这样，没有说直接检测一个化合物的。因为溶解到水中就只有钠离子和次磷酸根，因此就没有次磷酸钠这个说法了。所以，建议你可以自己查下文献，关键词用“次磷酸根”+“毛细管电泳”。

随便查了一下，看到一篇测磷含氧阴离子的综述，希望能帮到你：
http://web.calstatela.edu/faculty/ckhachi/phosphorous/Stover_1999.pdf

重点要看你的钯原液中都含有哪些成分，其中有没有会对你的分析造成干扰的，这一点非常关键。原则上讲你测得这个离子是弱酸根，需要高pH缓冲配合低波长或者间接紫外检测，这个时候很多物质都会存在干扰。