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基于近红外光谱分析技术的人纤维蛋白原工艺过程流穿液中蛋白质含量的快速检测

  • qindong413
    2016/09/29
  • 私聊

近红外光谱(NIR)

  • 中文摘要: 目的 利用近红外光谱分析技术,建立原液中总蛋白及纤原含量的检测模型,实现原液的快速检定。 方法 选取层析过程流穿液为研究对象,收集流穿液制备了一系列不同浓度的样品,共60个,用透射模块采集其近红外光谱。建模过程中,首先用K-S方法将样品划分为40个校正集和20个验证集,简历模型,用R2、RMSEC、RMSECV、RMSEP对模型进行评价。 结果 建立模型的各项参数为:R2=0.995,RMSEC=0.1911,RMSECV=0.2245,RMSEP=0.1662。 结论 所建立的方法,可以快速准确的对层析流穿液的蛋白含量进行在线检测,如果应用于生产,还可以对层析过程进行饱和度分析,确定最优的层析方案。
    关键词:近红外光谱分析;人纤维蛋白原;层析流穿液; 蛋白质含量
    人纤维蛋白原(HumanFibrinogen,Fg)是血浆的主要成分,含量高达2~4 g/L。在人凝血反应的最后阶段在凝血酶与人凝血因子ⅩⅢ、Ca2+作用下形成纤维蛋白凝胶,将血液有形成分包绕其中,达到止血的目的。在纤维蛋白原的生产过程中,通过层析收集流穿液进行下一步的制备。当离子交换树脂吸附饱和时停止收集,目前填料饱和度的判断通过检测流穿液中纤原的纯度来进行,采用凯氏定氮法分别检测原液中总蛋白的含量,进而计算得出。在制药领域,NIRS作为一种重要的PAT工具,已成功用于药物的原辅料质量评价、关键过程的监测和控制、成品的快速放行和质量检测等各个环节,为保证产品质量、降低生产成本、革新生产过程发挥了重要的作用。利用近红外光谱分析技术,建立原液中总蛋白及纤原含量的检测模型,可以实现原液的快速检定以及在线监测,提高生产效率。
    1实验材料与仪器
    1.1试剂

    纤维蛋白原层析流穿液(山东泰邦生物制品有限公司,批号201409S05,蛋白含量9.70mg/mL);注射用水。
    1.2仪器
    Antaris Ⅱ傅里叶变换近红外光谱仪(美国Thermo Fisher scientific公司),附件配置:透射检测器,1mm光程玻璃比色皿;Result光谱采集软件;Matlab 2009化学计量学软件(美国Mathworks公司)。
    2方法
    2.1样品制备

    在纤原的生产过程中,对层析时的流穿液留样。按照不同的比例用注射用水将流穿液稀释,得到含有不同蛋白含量的样品共60个。
    2.2近红外光谱采集
    每个样品取适量装于光程4mm的比色皿中,采集其透射光谱,扫描范围为10000-4000cm-1,分辨率为8 cm-1,扫描次数32次,每小时扫描一次背景。
    2.3校正集和验证集的划分
    采用K-S分类的方法将样品划分为校正集和验证集,二者的比例为2:1,得到40个校正集样品和20个验证集样品。
    2.4预处理方法的选择
    本研究考察了Autoscale、均值中心化、一阶导数,以及两种方法联用等预处理方法对光谱数据进行处理后,对建模结果的影响,并以此选择最佳的预处理方法。
    2.5光谱区间的选择
    本研究中分别采用iPLS和GA筛选光谱变量,使用选择的谱区建立PLS模型,并依据模型结果的优劣确定最终使用的变量选择方法,从而更好地提高模型的性能。
    2.6重复性考察
    随机挑选3个验证集样品,每个样品重复测定10次光谱,用所建立的定量模型预测其蛋白含量,计算每个样品预测值的平均值和标准偏差。用χ2检验考察这些重复性标准偏差是否属于同一总体,若属于,则近红外方法的重复性按z××σ算出。
    3.结果
    3.1样品蛋白含量的分布

    共制备60个样品,其蛋白含量范围在0.2425 mg·mL-1~9.7000 mg·mL-1,且分布较为均匀。
    3.2样品的近红外光谱
    采集的60个样品的原始透射光谱如图1所示。


    图1 样品的原始近红外光谱



    3.3样品校正集和验证集划分结果
    采用K-S分类方法将样品进行划分,选择40个样品作为校正集,20个样品作为验证集。如图2所示,样品均匀的分布在主成分空间中,其中灰色的点代表校正集样品,红色的点代表验证集的样品,验证集样品较为均匀的分布在校正集样品之中,满足划分的要求。


    图2 样品集PC1&PC2得分图



    3.4预处理方法的选择结果
    分别采用Autoscale、均值中心化、一阶导数、Autoscale+一阶导数和均值中心化+一阶导数的方法对光谱数据进行预处理,然后建立PLS定量模型。用不同预处理方法处理后的光谱数据建模所得的模型参数如表1所示,通过对比发现,光谱经过Autoscale处理后,所建立的模型各项参数都是最好的,R2=0.994,RMSEC=0.1495,RMSECV=0.5671,RMSEP=0.3016,所以确定Autoscale为最佳的预处理方法。图3为用此法预处理后的光谱数据在全波段建立的PLS模型。

    表1 不同预处理方法对建模的影响

    预处理方法

    R2

    RMSEC

    RMSECV

    RMSEP

    PCs

    原始光谱

    0.957

    0.4892

    0.6743

    0.6945

    6

    Autoscale

    0.994

    0.1495

    0.5671

    0.3016

    7

    均值中心化

    0.977

    0.3227

    0.5040

    0.5573

    6

    一阶导数

    0.974

    0.1630

    1.0915

    0.7619

    8

    Autoscale+一阶导数

    0.941

    0.2682

    1.2523

    1.1317

    6

    均值中心化+一阶导数

    0.967

    0.1950

    1.3558

    0.8358

    7





    图3 Autoscale预处理全光谱建模结果图



    3.5光谱区间选择结果
    本研究分别采用iPLS和GA两种变量选择方法对光谱区间进行优选,通过对比模型参数的优劣确定最终使用的方法。
    3.5.1Forward iPLS选择结果
    采用Forward iPLS方法选择光谱区间,每个间隔宽度为100个变量,一个15个间隔,然后用每个间隔进行PLS模型的建立,根据每个子区间得到的RMSECV值选择一个或多个间隔用于最终PLS定量分析模型的建立。最终选择的结果如图4所示,绿色部分代表最终选择用来建模的区间,红色部分为没有参与建模的区间。图5显示了用选择的光谱区间进行建模的结果,模型的决定系数为0.995,RMSEC=0.1911,RMSECV=0.2245,RMSEP=0.1662,除RMSEC外各项参数都有一定程度的改善。


    图4 Forward iPLS选择波段图





    图5 iPLS选择光谱区间建模结果图



    3.5.2Reverse iPLS选择结果
    采用ReverseiPLS方法选择光谱区间。与ForwardiPLS方法类似,每个间隔宽度为100个变量,一共15个间隔,然后用每个间隔进行PLS模型的建立,根据每个子区间得到的RMSECV值选择一个或多个间隔用于最终PLS定量分析模型的建立。最终选择的结果如图6所示,绿色部分代表最终选择用来建模的区间,红色部分为没有参与建模的区间。图7显示了用选择的光谱区间进行建模的结果,模型的决定系数为0.995,RMSEC=0.1926,RMSECV=0.2475,RMSEP=0.1995,与Forward iPLS一样,除RMSEC略微上升外,各项参数较全光谱建模都有了改善。


    图6 Reverse iPLS选择波段图





    图7 iPLS选择光谱区间建模结果图



    3.5.3GA变量选择结果

    图8所示GA选择光谱区间结果图,图中颜色由红变蓝表示模型的RMSECV值逐渐变小。彩色部分为通过计算筛选出来的光谱区间,空白部分则予以剔除,建模结果如图9所示,决定系数为0.994,RMSEC=0.1620,RMSECV=0.3178,RMSEP=0.2577,模型的性能较全光谱建模也得到了一定程度的改善。

    图8 GA变量选择结果图





    图9 GA选择光谱区间建模结果图



    3.5.4小结
    通过采用两种iPLS和GA对用于建模的光谱变量进行筛选,将不同方法所建立的PLS模型的结果列于表2。可以发现,用每种方法筛选出来的变量建立模型,得到的结果都有一定程度的改善,虽然RMSEC有小幅上升,但是更为关键的参数RMSECV和RMSEP都有较为明显的下降,最终选择结果更好的ForwardiPLS方法。

    表2 不同变量筛选方法比较

    波段选择方法

    R2

    RMSEC

    RMSECV

    RMSEP

    PCs

    0.994

    0.1495

    0.5671

    0.3016

    7

    Forward iPLS

    0.995

    0.1911

    0.2245

    0.1662

    5

    Reverse iPLS

    0.995

    0.1926

    0.2475

    0.1995

    4

    GA

    0.994

    0.1620

    0.3178

    0.2577

    7



    3.6重复性试验结果
    在验证集样品中选取9号、22号和38号,每个样品重复测定10次光谱,用建立的模型对其蛋白含量进行预测,预测和统计结果列于表3。

    表3 重复性结果

    预测值

    测量次数

    9号(mg·mL-1

    22号(mg·mL-1

    38号(mg·mL-1

    1

    5.8178

    8.9833

    1.2343

    2

    5.8045

    8.9654

    1.2145

    3

    5.8142

    8.9765

    1.2234

    4

    5.8345

    8.9876

    1.2487

    5

    5.8277

    8.9732

    1.2178

    6

    5.8139

    8.9643

    1.2289

    7

    5.8098

    8.9677

    1.2308

    8

    5.8345

    8.9822

    1.2199

    9

    5.8401

    8.9734

    1.2308

    10

    5.8320

    8.9613

    1.2214

    平均值

    5.8229

    8.97349

    1.22705

    标准偏差

    0.012

    0.009

    0.010

    χ2

    1.06

    重复性

    ×σ=0.044



    对于给定95%置信水平,χ20.05,2临界值=5.99,所得的χ2值小于5.99,说明重复测定的所有方差属于同一总体,近红外方法测定样品纤原含量的重复性可按z××σ计算得出,为0.044。
    4讨论
    本实验采用近红外光谱分析技术,建立了纤维蛋白原生产的层析过程中,对流穿液中蛋白含量进行快速检测的PLS定量模型,可快速准确地预测流穿液中总蛋白的含量,证明了用近红外方法在线检测流穿液中纤原纯度的可行性。在研究过程中,首先制备了一系列不同浓度的样品,共60个,用透射模块采集其近红外光谱。建模过程中,首先用K-S方法将样品划分为40个校正集和20个验证集,然后确立了Autoscale作为光谱的预处理方法,最后通过考察,选择Forward iPLS方法进行光谱变量的筛选,最终建立的模型的各项参数为:R2=0.995,RMSEC=0.1911,RMSECV=0.2245,RMSEP=0.1662。
    参考文献
    倪道明. 血液制品 (第三版) . 北京: 人民卫生出版社, 2013.
    马会利, 冯军, 陈纪林等. 人纤维蛋白原结构和功能研究进展. 四川生理科学杂志, 2002, 24(2): 53-7.
    VELIK-SALCHNER C, HAAS T, INNERHOFER P, et al.The effect of fibrinogen concentrate on thrombocytopenia . Journal ofthrombosis and haemostasis : JTH, 2007, 5(5): 1019-25.
    何英武,吴瑞玲.血浆纤维蛋白原测定的方法进展及临床意义. 现代中西医结合杂志,2004, 13(18): 2511-2.
    Li L, DingB, Yang Q, et al. The relevance study of effective information between nearinfrared spectroscopy and chondroitin sulfate in ethanol precipitation process. J Innov Opt Heal Sci, 2014,07(06): 1450022.
    Wang P, ZhangH, Yang H, et al. Rapid determination of major bioactive isoflavonoid compoundsduring the extraction process of kudzu (Pueraria lobata) by near-infraredtransmission spectroscopy .Spectrochim Acta A Mol Biomol Spectrosc, 2015, 137: 1403-1408.

    Zhang XB, Feng YC, Hu CQ. Feasibility andextension of universal quantitative models for moisture content determinationin beta-lactam powder injections by near-infrared spectroscopy . Anal Chim Acta, 2008, 630(2): 131-140.
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