从安捷伦工作站截取色谱图和质谱图的一些方法技巧

symmacros

2018/02/27

私聊

气质联用（GCMS）

写气质文章时候可能会插入一些图谱示例，不免会遇到截取图谱的小活。下面介绍对比几种从工作站上面截取图谱方法和技巧：
1. 窗口拷贝（copy windows）
2. 截屏后画图软件粘贴
3. 数据转换成CSV格式后用excel重新绘制
4. 其它, 用Adobe Illustrator CS进行矢量重绘等
5. 微小宏程序（macro）截取
下面以安捷伦的evaldemo.d数据文件为例对比几种截取图谱的方法

图1
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1. 窗口拷贝（copy windows）
可能是最简单的办法。在tools工具菜单的copy windows里面，可选要复制哪个窗口，window2是总离子色谱图（TIC），window 1是所选的峰的质谱图。但感觉图谱质量不是很好，有时候time或abundance会部分看不到。

图2
实际上就是把这个图谱放在剪切板里，可以在画图板或word等软件里面直接黏贴使用。下图是TIC图：

图 3
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下图是9.772min的MS图：

图4
下面是另一个峰稍微多TIC

图5
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2. 截屏后画图软件粘贴
可以用Printscreen（PrtSc键），Greenshot，QQ上的剪切功能，搜狗拼音法上的剪切等其它截取图谱软件来复制色谱图，再打开图画软件粘。
下面是这种方法截取的TIC图

图6
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3. 数据转换成CSV格式后用excel重新绘制

在文件file菜单下面的ExportData to CSV file…

图 7
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3.1选择导出的路径
Current File With Data file
Current File Select destination
……..
………
等（请记住路径）
3.2选择要导出的数据，质谱图，色谱图，面积百分比报告，检索报告，定量结果（记住名称或重新命名CSV文件名）。

图8
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3.3绘制总离子色谱图
在所在的路径下面打开csv文件（例如CHROMTAB.CVS），利用excel的作图功能选择要绘图的数据部分来绘图（先选分散型，后调整纵横坐标范围，色谱图颜色等）。

Path	File	Date Acquired	Sample	Misc
C:\msdchem\1\data\	evaldemo.d	7 Sep 1989 13:59	demoscan sample	10 ng per component
TIC: evaldemo.d\data.ms
5.03	100147
5.038	76290
5.046	61531
5.054	48154
5.062	35989
5.07	27365
5.078	23252
5.086	18863
5.094	19291
5.102	16923
5.11	18104
5.118	15802
5.126	17760
5.134	13172
5.142	13382
5.15	13610
5.158	28180
5.166	17617
5.174	12928
5.182	14715
5.19	11745
5.198	14288
5.206	13484
5.214	13190
5.222	15802
5.23	13764

……………………………
下图是TIC图：

图9
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3.4 绘制质谱图
在所在的路径下面打开csv文件（例如SPECTTAB.CVS），利用excel的作图功能选择要绘图的数据部分来绘图（先选分散型，后选柱形图，也可以调整纵横坐标范围，色谱图颜色等）。
下面是一部分excel（csv）文件数据：

Path	File	Date Acquired	Sample	Misc
C:\msdchem\1\data\	evaldemo.d	7 Sep 1989 13:59	demoscan sample	10 ng per component
Scan 593 (9.772 min): evaldemo.d\data.ms
27.1	11480
28.1	9099
29.1	32032
30.1	966
31.0	2605
32.0	3278
39.1	12631
40.1	3371
41.1	105968
42.1	22440
43.1	151936
44.1	7110
45.1	5444
49.8	603
52.0	658
53.2	7511
54.1	9743
55.1	145088
56.1	24608
57.1	91536
58.1	6620
59.1	57888
60.0	2079
61.0	1094
65.1	2043
66.1	1286
67.1	17848

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下图是MS棒状图：

图10
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这种方法可以需要一些excel绘图的技巧（由于篇幅所限，就不一一说明了）。另外这种方法对于复杂的较多的色谱图的数据文件处理要麻烦一些，以为数据量太大，excel表格很长很大，选数据需要拉的很长。
和这种方法类似，DJ等的GCMS软件可以另存为txt文档，再导入excel软件，再重新作图。
4. 其它, 用Adobe Illustrator CS进行矢量重绘等
有网友讲，自己未用过，随后找个溶剂试试。
5. 微小宏程（macro）序截取
5.1 编写宏程序
5.1.1在windows的记事本（写字板也可以），或者macroPad下编写下面打印TIC的宏程序
NAME print_TIC
FILE _DATAPATH$ + _DATAFILE$
STARTPRINT
WINPRINT 1, 1, 4, 95, 38
ENDPRINT
RETURN
选另存为all file，存为print_TIC.mac
语句说明:
NAME print_TIC 命名宏名称print_TIC
FILE _DATAPATH$ + _DATAFILE$ 调用当前数据文件路径和文件
STARTPRINT 打印开始
WINPRINT 1, 1, 4, 95, 38 选窗口1（例如1 TIC， 2 MS），在第1个字符位置，第4行位置打印95个字符及38行的图片
ENDPRINT 打印结束
RETURN 宏结束
5.1.2编写下面打印MS的宏程序
NAME print_TIC
FILE _DATAPATH$ + _DATAFILE$
STARTPRINT
WINPRINT 1, 1, 4, 95, 38
ENDPRINT
RETURN
选另存为all file，存为print_MS.mac
语句说明参上例
下面是macroPad软件的图例

图11
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5.2在Tools菜单的Options选勾√CommandLine

图12
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5.3 输入并运行宏程序
打印机选PDF（亦可在打印机上面直接打印）。在command line里面输入上面宏程序的路径及文件名：例如macro “C:\J\print_TIC”,go，点击Excute或enter。可以得到较清晰pdf格式图片。