iangie
第5楼2021/01/22
很明显你这个cif不规范 不管你在哪里下载的
cif中用_atom_site_label表示"占位名" 而用_atom_site_type_symbol表示"原子或离子名"
你的cif中连_atom_site_type_symbol都没有
该物相正确的cif应该是:
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_U_iso_or_equiv
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_Wyckoff_symbol
_atom_site_occupancy
Si1 Si 0.415 0.113 0.182 . 4 e 1.0
Si2 Si 0.908 0.87 0.16 . 4 e 1.0
Al3 Al 0.097 0.113 0.17 . 4 e 1.0
Al4 Al 0.59 0.867 0.149 . 4 e 1.0
Ca5 Ca 0.72 0.077 0.354 . 4 e 1.0
O6 O 0.078 0.154 -0.001 . 4 e 1.0
O7 O 0.262 0.075 0.212 . 4 e 1.0
O8 O 0.438 0.145 0.026 . 4 e 1.0
O9 O 0.246 0.407 0.303 . 4 e 1.0
O10 O 0.0 -0.017 0.215 . 4 e 1.0
O11 O 0.044 0.242 0.261 . 4 e 1.0
O12 O 0.463 0.224 0.276 . 4 e 1.0
O13 O 0.511 -0.005 0.226 . 4 e 1.0
O14 O 0.257 0.107 0.505 . 4 e 1.0
O15 O 0.59 0.127 0.539 . 4 e 1.0
O16 O 0.911 0.119 0.501 . 4 e 1.0
O17 O 0.77 0.21 0.17 . 4 e 0.5
O18 O 0.74 0.18 0.895 . 4 e 0.5
或者你直接在导入后的TOPAS中添加
Apri2
第6楼2021/01/22
明白了!感谢!请问您的cif是在哪找的?
leiws
第9楼2021/02/15
我也来贴一个~~~
str
scale @ 1.0
r_bragg 1.0
PV_Peak_Type(
ha, 0.02,
!hb, 0.0,
!hc, 0.0,
lora, 0.5,
!lorb, 0.0,
!lorc, 0.0)
'Simple_Axial_Model(axial, 0.0)
Phase_Density_g_on_cm3( 1.0)
view_structure
'fourier_map 1
' fourier_map_formula = Fobs - Fcalc;
space_group "P121/c1(c,a,b)"
a @ 9.84300
b @ 10.02300
c @ 10.61600
al 90.0
be 90.0
ga @ 92.417
volume 1046.40
prm beqCa 2.0 min 1.0 max 5.0
prm beqO2-(H2O) 2.0 min 1.0 max 5.0
prm beqSi 2.0 min 1.0 max 5.0
prm beqO 2.0 min 1.0 max 5.0
prm beqAl 2.0 min 1.0 max 5.0
site CA num_posns 4 x 0.35370 y 0.71920 z 0.07640 occ Ca 1.0 beq =beqCa;
site SI1 num_posns 4 x 0.18142 y 0.41470 z 0.11288 occ Si 1.0 beq =beqSi;
site SI2 num_posns 4 x 0.16038 y 0.90820 z 0.87012 occ Si 1.0 beq =beqSi;
site SI3 num_posns 4 x 0.16921 y 0.09656 z 0.11329 occ Si 1.0 beq =beqSi;
site AL1 num_posns 4 x 0.16921 y 0.09656 z 0.11329 occ Al 1.0 beq =beqAl;
site AL2 num_posns 4 x 0.14900 y 0.59053 z 0.86690 occ Al 1.0 beq =beqAl;
site O1 num_posns 4 x 0.99960 y 0.07870 z 0.15620 occ O 1.0 beq =beqO ;
site O2 num_posns 4 x 0.21250 y 0.26240 z 0.07630 occ O 1.0 beq =beqO ;
site O3 num_posns 4 x 0.02540 y 0.43610 z 0.14850 occ O 1.0 beq =beqO ;
site O4 num_posns 4 x 0.30370 y 0.24500 z 0.40270 occ O 1.0 beq =beqO ;
site O5 num_posns 4 x 0.21360 y 0.99940 z 0.98610 occ O 1.0 beq =beqO ;
site O6 num_posns 4 x 0.25950 y 0.04490 z 0.24370 occ O 1.0 beq =beqO ;
site O7 num_posns 4 x 0.27770 y 0.46450 z 0.22880 occ O 1.0 beq =beqO ;
site O8 num_posns 4 x 0.22530 y 0.51070 z 0.99440 occ O 1.0 beq =beqO ;
site H2O1 num_posns 4 x 0.50230 y 0.25960 z 0.10480 occ O 1.0 beq =beqO ;
site H2O2 num_posns 4 x 0.54100 y 0.59140 z 0.12620 occ O 1.0 beq =beqO ;
site H2O3 num_posns 4 x 0.50200 y 0.91130 z 0.11740 occ O 1.0 beq =beqO ;
site H2O4 num_posns 4 x 0.23060 y 0.77320 z 0.23690 occ O 1.0 beq =beqO ;
site H2O5 num_posns 4 x 0.40280 y 0.74070 z 0.31800 occ O 1.0 beq =beqO ;
site H2O6 num_posns 4 x 0.13260 y 0.76200 z 0.17940 occ O 1.0 beq =beqO ;