从实验成本来讲,SYBR Green是经济的,基本上就是普通PCR加上SYBR Green I 荧光染料即可,其信号强度也很好,可以进行融解曲线分析等,但缺点是只能在一个反应管内进行一种PCR反应的检测,另一个问题是非特异性扩增会影响实验结果。对于研究人员来讲,如果需要检测的基因很多,而每个反应管中进行一种PCR反应的检测可以满足实验要求,则SYBR Green是最好的选择。
如果需要进行多通道实验,即在一个反应管中进行2种或以上的反应,则要选择其他的方法,最常用的是Taqman探针法,由于增加了探针的特异性,具有双重特异性。