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关于NIST谱库的检索方式

  • chenlin_xy
    2022/07/28
  • 私聊

气质联用(GCMS)

  • NIST谱库的检索方式
    1.AMDIS检索,谱库格式为*.MSL;
    2.NIST MS Search检索,可选用库:mainlib、replib、nist_ri、nist_msms和nist_msms2;
    3.应用安捷伦Chemstation工作站进行PBM检索,数据库格式为*.L;
    4.采用AnalyzerPro等软件进行定性检索,可选用库:mainlib、replib、nist_ri、nist_msms和nist_msms2。

    由于使用的谱库包括的化合物条目数量不同,以及检索参数设置存在细节差异,对同一谱图可定性出的化合物数量有很大差别。
    阅读了symmacros版主发表的主题:【第十四届原创】AMDIS初步应用 (19) –如何利用Nist Search的结果弥补数据库局限性
    https://bbs.instrument.com.cn/topic/7907796_2?order=threadid

    问题1:应用AMDIS(谱库:NISTFF.MSL)在数量上远多于NIST MS Search检索(谱库:mainlib)可定性出的化合物数量。若NIST主库:mainlib已包括
    NISTFF.MSL的化合物条目,为何有这么大的数量差异?

    问题2:根据正构烷烃可计算出图谱各化合物的保留指数,为何设定的色谱条件检测正构烷烃(C7-C30),结果定性出C9-C24正构烷烃。应用该保留指数校正文件,为何在AMDIS中中也能自动计算出谱图中C9之前化合物中保留指数?

    问题3:用AMDIS自动计算获得各化合物的保留指数,随后可在NIST MS Search中手工搜索该化合物的保留指数,再根据保留指数差异(如小于20)对化合物进行确认。然而有无对化合物保留指数与NIST谱库提供的保留指数进行批量自动化比较的方法?在AMDIS中又该如何设置和使用谱库nist_ri提供的保留指数信息?

    上述问题欢迎大家交流探讨,不吝赐教!
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  • SkytheSg

    第1楼2022/10/03

    哇,最近也在头痛这个问题。 我是用MassHunter Unknown Analysis,Nist 2020, Library RI 部分会有显示,但是只有非极性柱。我自己做了一个小Library,放的是indonwax的 RI,在Masshunter里检索却显示不出来。有人知道为什么吗?

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  • symmacros

    第3楼2022/10/04

    应助达人

    请问你放在library的什么地方?是masshunter的格式还是chemstation格式?

    SkytheSg(Ins_43cfdd6d)发表:哇,最近也在头痛这个问题。 我是用MassHunter Unknown Analysis,Nist 2020, Library RI 部分会有显示,但是只有非极性柱。我自己做了一个小Library,放的是indonwax的 RI,在Masshunter里检索却显示不出来。有人知道为什么吗?

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  • symmacros

    第4楼2022/10/05

    应助达人

    问题1:应用AMDIS(谱库:NISTFF.MSL)在数量上远多于NIST MS Search检索(谱库:mainlib)可定性出的化合物数量。若NIST主库:mainlib已包括
    NISTFF.MSL的化合物条目,为何有这么大的数量差异?
    可能是MSL格式库优先,格式偏向,检索效果好,NIST格式差,可以考虑把NIST格式转换成MSL格式应用。我回头仔细看一下原因,再回答这个问题,假期没有带电脑。

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