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六氟异丙醇HFIP作为寡核苷酸流动相，每天MS响应减弱，如何解决？

Ins_818fd7cb

2023/08/11

液质联用（LCMS）

寡核苷酸分析用离子对胺+HFIP作为流动相，B相为乙腈，流动相过一段时间(几个小时或者每天)，MS响应减弱，如何解决？

分
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hujiangtao

第1楼2023/08/11

应助达人

离子对做流动相对液质灵敏度影响很大，尽量不要用

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lyp7788

第2楼2023/08/11

换新鲜的流动相。如果一个序列内需要比较TIC强度，可以每隔几针走一次QC（具体看你们实验室用什么作为QC），通过QC的强度进行校正

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Ins_818fd7cb

第3楼2023/08/14

隔两天换一次流动相觉得太麻烦了，所以想解决一下这个问题，每天Ms响应减弱是因为HFIP六氟异丙醇挥发的原因吗
lyp7788(Insp_ca0736a3) 发表:换新鲜的流动相。如果一个序列内需要比较TIC强度，可以每隔几针走一次QC（具体看你们实验室用什么作为QC），通过QC的强度进行校正

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Ins_818fd7cb

第4楼2023/08/14

做的寡核苷酸，不用离子对保留不住。想请问下为什么离子对对液质灵敏度影响很大？
hujiangtao(hujiangtao) 发表:离子对做流动相对液质灵敏度影响很大，尽量不要用

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lyp7788

第5楼2023/08/14

你用的胺应该是三乙胺吧，三乙胺和六氟异丙醇挥发性都比较强，是有可能因为挥发导致流动相配比改变的
Ins_818fd7cb(Ins_818fd7cb) 发表:隔两天换一次流动相觉得太麻烦了，所以想解决一下这个问题，每天Ms响应减弱是因为HFIP六氟异丙醇挥发的原因吗

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Ins_818fd7cb

第6楼2023/08/15

请问如何改善呢，用过好几种胺都是这样
lyp7788(Insp_ca0736a3) 发表:你用的胺应该是三乙胺吧，三乙胺和六氟异丙醇挥发性都比较强，是有可能因为挥发导致流动相配比改变的

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Ins_5e649cb5

第7楼2023/08/28

使用前，新鲜配吧，我这的寡核苷酸项目还蛮多的，我们还专门挪了七八台质谱专门用来做寡核苷酸的项目，要是溶剂挥发的这个问题，如果可以解决，我这应该早就解决了，而不是说一直都是建议新鲜配

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Insm_e7b941b2

第8楼2023/09/06

用HILIC吧，不知道你做的分子量是多大的
Ins_818fd7cb(Ins_818fd7cb) 发表:做的寡核苷酸，不用离子对保留不住。想请问下为什么离子对对液质灵敏度影响很大？

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墨羽

第9楼2023/10/08

我们这边给的解释是，做RNA不用离子对，没办法解卷积（多点带点，加23个H和加1个Na，如何区分？还得是离子对试剂让图谱中只看到加H的，然后就可以计算了），且响应弱。做RNA的质谱基本上专用的了。三乙胺之类的试剂在质谱上高残留，很难冲洗干净，导致其他离子响应变差。但是做RNA又必须使用三乙胺和六氟异丙醇之类的离子对试剂。
Ins_818fd7cb(Ins_818fd7cb) 发表:做的寡核苷酸，不用离子对保留不住。想请问下为什么离子对对液质灵敏度影响很大？

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